Definition | Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri), complete genome. |
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Accession | NC_008513 |
Length | 416,380 |
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The map label for this gene is nuoN
Identifier: 116515050
GI number: 116515050
Start: 124666
End: 126111
Strand: Direct
Name: nuoN
Synonym: BCc_109
Alternate gene names: 116515050
Gene position: 124666-126111 (Clockwise)
Preceding gene: 116515049
Following gene: 116515052
Centisome position: 29.94
GC content: 16.94
Gene sequence:
>1446_bases ATGATTAGATTATTTAATGATATTATTCCTATTTTTCCTATTTTAATGTTAATTTTTTCAATTATAATTCTGTTTTTTAT TCTTAATAATAAGAATAAGGTAAAATCTGGTTGTATTGTTACTACAATAAGTATTTTTTTTTCAATAATATATATTTTAT ATATAAAAAGGTTTTTTTTTAATTATTCTTCAGATTTAATTCGAATTGATCAATATTCTTTTTATTTTATGATTTTATTA TTAATTTCTAGTTTTTTTACATGTATATTTTCATATTCTTGGTTATTACTAGAAGATAACTATTCGATTGAATTTTATTT TTTTGTTTTATTATCTACAATAGGTGGTATGTTAATAATTATATCCAATCATTTTCTTTCTTTATTTTTAGGAATAGAGT TATTATTTCTTCCAATTTTAGGAATATTAAATTTTTTTTCTAATTCAAGAAAAAATTTGTTTTCTATTGTAAATTATATG ATTTTATCTGTTTTTTCATCAGCTTTATTATTATTAGGTGTTTCTTTTATATATTTTGTTTCTGGAAGATTATCATTTTC TTTTTTTCCTTTAATATTTATGTATTATCCGTCAATTATTTTGAATAGTATGATGATATTTGGTATATGTATGATATTAT TATCTCTTTTTTTTAAATTATCACTTTTTCCTTTACATACTTGGTCTCCAAATATTTATCAGTATTCTAATCCTTGCTCT CTTATTTTTTTTTCAACTGCTGTTAAAATTTCTATTTTTTCTTTTTTATTACGTTTTTTAAATTTTTTTCCTTATATTTA TAAAATAAAATCTATATATTATATTATATATCTTATATCTATGTTTTCTGTTTTTTTTGGAAATATTATTGGAATTATAC AAAATAATGTACAAAGATTGATTGGATATTTATCTATTTCTAATATTGGATTCTTATTAATTATTATAATTACTCAATCA TATTCATTTGTTTTTTTAAATAAATTATTTATAATTTATTTATTTATTTATATATTTGGATTAATTGGTTTTTTTAGTAT TAAAAGTATTATTGATATAAATTTTATTGAACGAAAAAATAATTTATTAAAAGAAAACTCTTTAATTGGTTTGTTTTGGT ATAATCCTATATTAGGCATTTTAATGTCTATAATTTTGTTATCTTTATCAGGTTTTCCTATTACCTTAGGTTTTTGGGGA AAATTTTTTATTTTTAAACATTTAATTCAAAAAAAATTTTTTATAACAACTTTATTAATTATGTTAAGTAATATAGTTGG TATGCAAAATTATTTATATATTATTAGAAGTTTATATATCAAACCTATTAAATTTTCGAATACGAGTTTAGTAAATAATT TATATATTTCAATATTACAAAAATTTTTACTAATTAGTATCGGTTTTTTATTTGTAATATTAGGATTTTTTCCATATATT TTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTAGGTTTATATCCTAGTTTAATTTTAAATTTTTCTTTTAATATTCAAAAAAATATATTTCAACATTATATATTTATAA AATAATTAGGTAATAAAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATTTATTAAATTTTAAAATTATCTTTATAATATAATGTTGGAATATTTTCCAACATTTATTATTTAACATTTTGAAAT GATGTTATTATAACAATAAA
Product: NADH dehydrogenase I chain N
Products: NA
Alternate protein names: NADH dehydrogenase I subunit N; NDH-1 subunit N
Number of amino acids: Translated: 481; Mature: 481
Protein sequence:
>481_residues MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFFNYSSDLIRIDQYSFYFMILL LISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLIIISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYM ILSVFSSALLLLGVSFIYFVSGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRLIGYLSISNIGFLLIIIITQS YSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKNNLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWG KFFIFKHLIQKKFFITTLLIMLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI F
Sequences:
>Translated_481_residues MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFFNYSSDLIRIDQYSFYFMILL LISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLIIISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYM ILSVFSSALLLLGVSFIYFVSGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRLIGYLSISNIGFLLIIIITQS YSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKNNLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWG KFFIFKHLIQKKFFITTLLIMLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI F >Mature_481_residues MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFFNYSSDLIRIDQYSFYFMILL LISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLIIISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYM ILSVFSSALLLLGVSFIYFVSGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRLIGYLSISNIGFLLIIIITQS YSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKNNLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWG KFFIFKHLIQKKFFITTLLIMLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI F
Specific function: NDH-1 shuttles electrons from NADH, via FMN and iron- sulfur (Fe-S) centers, to quinones in the respiratory chain. The immediate electron acceptor for the enzyme in this species is believed to be ubiquinone. Couples the redox reaction to proton translocat
COG id: COG1007
COG function: function code C; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 2 (chain N)
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the complex I subunit 2 family
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=473, Percent_Identity=29.3868921775898, Blast_Score=236, Evalue=2e-63,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NUON_BUCCC (Q057W3)
Other databases:
- EMBL: CP000263 - RefSeq: YP_802679.1 - STRING: Q057W3 - EnsemblBacteria: EBBUCT00000001376 - GeneID: 4440819 - GenomeReviews: CP000263_GR - KEGG: bcc:BCc_109 - GeneTree: EBGT00050000007699 - HOGENOM: HBG747830 - OMA: ILSISYN - BioCyc: BAPH372461:BCC_109-MONOMER - GO: GO:0006810 - HAMAP: MF_00445 - InterPro: IPR010096 - InterPro: IPR001750
Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1
EC number: =1.6.99.5
Molecular weight: Translated: 56465; Mature: 56465
Theoretical pI: Translated: 9.93; Mature: 9.93
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
HASH(0xff4dd40)-; HASH(0x11d5c4cc)-; HASH(0x11cce944)-; HASH(0x11dea4c0)-; HASH(0x11e198dc)-; HASH(0x11e19900)-; HASH(0x11e0918c)-; HASH(0x11cce908)-; HASH(0x11e092d0)-; HASH(0x11d5c58c)-; HASH(0x11e09318)-; HASH(0x10da0328)-; HASH(0x1178beb4)-; HASH(0x11cce7dc)-;
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.7 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.7 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NYSSDLIRIDQYSFYFMILLLISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLII CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEH ISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYMILSVFSSALLLLGVSFIYFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCCEEECCCCE LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRL EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGYLSISNIGFLLIIIITQSYSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKN HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWGKFFIFKHLIQKKFFITTLLI CHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC F H >Mature Secondary Structure MIRLFNDIIPIFPILMLIFSIIILFFILNNKNKVKSGCIVTTISIFFSIIYILYIKRFFF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NYSSDLIRIDQYSFYFMILLLISSFFTCIFSYSWLLLEDNYSIEFYFFVLLSTIGGMLII CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEH ISNHFLSLFLGIELLFLPILGILNFFSNSRKNLFSIVNYMILSVFSSALLLLGVSFIYFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGRLSFSFFPLIFMYYPSIILNSMMIFGICMILLSLFFKLSLFPLHTWSPNIYQYSNPCS HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCCCCEEECCCCE LIFFSTAVKISIFSFLLRFLNFFPYIYKIKSIYYIIYLISMFSVFFGNIIGIIQNNVQRL EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IGYLSISNIGFLLIIIITQSYSFVFLNKLFIIYLFIYIFGLIGFFSIKSIIDINFIERKN HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NLLKENSLIGLFWYNPILGILMSIILLSLSGFPITLGFWGKFFIFKHLIQKKFFITTLLI CHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MLSNIVGMQNYLYIIRSLYIKPIKFSNTSLVNNLYISILQKFLLISIGFLFVILGFFPYI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC F H
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA