Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_008312 |
Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113477217
Identifier: 113477217
GI number: 113477217
Start: 5754717
End: 5762189
Strand: Reverse
Name: 113477217
Synonym: Tery_3753
Alternate gene names: NA
Gene position: 5762189-5754717 (Counterclockwise)
Preceding gene: 113477218
Following gene: 113477211
Centisome position: 74.35
GC content: 33.21
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TGTTTTTTTTGCAATTATATTATTCTGGTATGGTTAACTAACATACTAATTGTAGTAGAAAATTAACTATGAGTATAATG TACTGGTATTACTGATTATT
Product: type 11 methyltransferase
Products: NA
Alternate protein names: Group 1 Glycosyl Transferase; Hemolytic Protein HlpA-Like Protein; Glycosyl Transferase Group 1 Family Protein; TPR Domain-Containing Protein; Methyltransferase FkbM; Tetratricopeptide TPR_2 Repeat Protein; Mannosyltransferase; O-Linked N-Acetylglucosamine Transferase; Glycosyl Transferase; Glycosyltransferase; Methyltransferase Type; Glycosyl Transferase Group 1 Protein; Glyocosyltransferase Protein; Mannosyltransferase B; Hemolysin Hemolytic Protein; Mannosyl Transferase; Tetratricopeptide Repeat Domain Protein; TPR Repeat Protein; SPINDLY Family O-Linked N-Acetylglucosamine Transferase; Tetratricopeptide Repeat Family Protein; Glycosyltransferase Family; A-Glycosyltransferase; TPR Domain Protein; TPR Domain/SEC-C Motif Domain Protein; A-Glycosyltransferase Glycosyltransferase Family 4 Protein; Mannosyltransferase-Like Protein; Tetratricopeptide Repeat-Containing Protein; Glycosyltransferase WbpY; Tetratricopeptide Repeat Protein; O-Linked Acetylglucosamine Transferase; Mannosyl Transferase B; SPY Protein; Glycosyl Transferase Group 1/2 Family Protein; TPR Repeat-Containing Glycosyl Transferase; Glycosyl Transferase Family Protein; Glycosyl Transferase TPR Repeat Protein; TPR Repeat-Containing SPINDLY Family Protein
Number of amino acids: Translated: 2490; Mature: 2489
Protein sequence:
>2490_residues MTQFQLTTPVVIIIFNRPDTTEKVFQRIRQVKPPQLLVIADAPRPDKPGEVEKCIAARKIVDLVDWKCEVLTNYAEVNLG CRERIYSGLNWAFSLVESAIILEDDCVPHLTFFRFCQELLDIYQDNNKVMAISGDNFQFGNNSIEYSYYFSRYPHCWGWA TWRRAWKNYDNQMQLWPKLRDSKWLENILQNSHAVQYWSKIFQNNYQGFNSWAYAWIFASWNHHSLIILPKVNLVSNIGF GEEATHTLSINKFANMSTEEMIFPLNHPPSIIRNIEADEFTEKTMFSGSLQLQNVHCKVCGSISCKFDDAKVLNKYNVEY FQCSNCGFVQTENPYWLAEAYKEAIASSDVGLVSRNQNFSLITENLILNLFNTNSKFLDYGCGYGLFVRMMRDLGLDFYG YDKYCQNIFYQGWEGEINKQQKYEIITAFEVFEHFINPLAEIENILQHTRNILFSTKLLPPNNPHPNDWWYYALEEGQHI SIYTTKALSVIGQKFKLNLYSDGESLHLLTEKSLSHSEFQNIFKVARYKPENRKKTLTQLDHEKVTEKKKKNQQQLDLKL LIDGVFFQINNTGIARVWKSLLEVWSKDSFAKNILVLDRAKTAPKIPGINYRSVPGYNYGKIDADRQMLQTICDEENADI FISTYYTTPILTPSVFMAYDMIPEVLAKNLNNPSWQEKHRSIRQAISYVAISENTARDLIKYFPQIPANYIRVAPCGIEA KFSRTTPQEVASFKSKYHINKPYFLIVGERIGWLGYKNTILFFQAFSKLKKSTEFDIVCIGGNRKLEPELSKYISGSKIH LLQLSDQELKSAYSAAIALVYPSKYEGFGLPILEAMACGCPVITCKNSSIPEVAGTAALYINDNDINSLVNALGEVQKSE VQQKLITAGLAQAQKFSWSQMAKIMSDVFIQTFNQIKAKRLSTMEDRKNLGEIQFKINHGQLEMQRHFWNVNSLDEAMFG RVLAYNGMDTLSPEEKKQAWEKSIENWVPQIMEGIPTKPEWKVLEIGCGVGRLIKYLRAKFARVDGVDISENMIQFARQY LADGKQNGEVYVNNGYDLQQLPDENYDFVFSTIVFQHIRSISIVKNYFREIFRVLKMGGYFRIQVHDYSAESLGKFDEEG AKDQQYYFSGNAYTEEQLKDLLIAAGFNLVSLKSAKPWIWATARREQQVEVGVEKIPQIVTLKNNQMGIEYPEINRLSYN KDRPFWSVMIPTYKKVKYLEQTLKSVLQQAPPPEEMQIEVVNDCPDYKIQAEIEAIVRKVGGERINCYRHFPQDIGQAPI FNICLQRAKGYWVHLLHDDDFVLPGFYEKLRRGIEKNTTLGAAFCRHYYIDENDHKKYLSVLERDTPGVIEKFIEKITVE QRIQVVGMVVKREVYEHLGGFCSQAASAADWEIWKRIAAFYPIWFEPEILACFRLHSSSETSRLMQSGGNIENARKAIEI TQTYLPRNMAAELSNQAREHYGIEAMKMAASMLKIGNNNGAIAQMREGLKCSNSSSVINLLVSILINAETEAETSLIQAT SQHLLSLEPQLIESKKTPHKVETNLLPSLAEINKEIELYKQNQLDKSALVKLQEIRKKIAYFWLSIDTLENLKIAYLGDF CQIHKALLTSSITDESLTETEKKIVTQIKANIVKGFKEPLDIKYLLAGMLYQRADQLEVKYEKAPIPKWFAIDYLNFMFA SPQVFQEIGETDNYYHFMTGWLSYVHNNISINSESELWQAIARIFVENANWIPLYFTTRPNLKNLYIKRAEIIEFALKKL GLELNYTMPPYQFNRSKIRLGIIKDHYTPQTETYSLLPVFEHLDRSKFEIFLYAIKSNGHPLEQYCQSRADKFLQLPNEL KNQVQTIRDDNLDILFFGSNITATIKNSTLLATHRLARVQVTSINSPTTTGMASIDYYISGKLTAPTEMTKEHYTEKLVN LEGSGLCFQDPIAETLPVVQPLRSSWGATNETTIFISGANFYKIIPEIRETWAKILRAVPNSILVLYPFNPNWTNSYPVG SFIQQMRGTLERHGIHSKRLVVIKPLPSKSDIKKCLELADIYLDSFPYGGATSLLDPLMLGLPPVVVEGNALRFRQGPAL LREINIEDLIADGEESYINLAVKLATNSEWRQQKRQEIKEKMQQNPAFLDSRSYSAEIGKLFQELFQKWQNIHAPKTIES QDNNSLTSEFINRLVGCVNLYKIDPNDQSLIEELRQIRKQIANFWLDTNPQKLEIIYQGKVRQAYLSLLSSGIQNEPQTE KEEKFIKELTDISMGLTNSKSINALLGGMLYFLPGKMLVRDAKNRLPEWLINDYQQVFESREVVQKLEKDFQTKLPHFSE DSISRDLVSKPIKIAEVQTEKNIFLTENKADNLDFVISKFLNQLLGNVNLYYIDPSDESVVKELRQLRKQMADFWINLEP QKLENFYLGEMGKAYQALLNSEIQNQSLIESEQEFLQQLATQLSQGIEAPKAINYLLAAILYCRPEQLRIEDATKLPQWL LSDYQKFIGN
Sequences:
>Translated_2490_residues MTQFQLTTPVVIIIFNRPDTTEKVFQRIRQVKPPQLLVIADAPRPDKPGEVEKCIAARKIVDLVDWKCEVLTNYAEVNLG CRERIYSGLNWAFSLVESAIILEDDCVPHLTFFRFCQELLDIYQDNNKVMAISGDNFQFGNNSIEYSYYFSRYPHCWGWA TWRRAWKNYDNQMQLWPKLRDSKWLENILQNSHAVQYWSKIFQNNYQGFNSWAYAWIFASWNHHSLIILPKVNLVSNIGF GEEATHTLSINKFANMSTEEMIFPLNHPPSIIRNIEADEFTEKTMFSGSLQLQNVHCKVCGSISCKFDDAKVLNKYNVEY FQCSNCGFVQTENPYWLAEAYKEAIASSDVGLVSRNQNFSLITENLILNLFNTNSKFLDYGCGYGLFVRMMRDLGLDFYG YDKYCQNIFYQGWEGEINKQQKYEIITAFEVFEHFINPLAEIENILQHTRNILFSTKLLPPNNPHPNDWWYYALEEGQHI SIYTTKALSVIGQKFKLNLYSDGESLHLLTEKSLSHSEFQNIFKVARYKPENRKKTLTQLDHEKVTEKKKKNQQQLDLKL LIDGVFFQINNTGIARVWKSLLEVWSKDSFAKNILVLDRAKTAPKIPGINYRSVPGYNYGKIDADRQMLQTICDEENADI FISTYYTTPILTPSVFMAYDMIPEVLAKNLNNPSWQEKHRSIRQAISYVAISENTARDLIKYFPQIPANYIRVAPCGIEA KFSRTTPQEVASFKSKYHINKPYFLIVGERIGWLGYKNTILFFQAFSKLKKSTEFDIVCIGGNRKLEPELSKYISGSKIH LLQLSDQELKSAYSAAIALVYPSKYEGFGLPILEAMACGCPVITCKNSSIPEVAGTAALYINDNDINSLVNALGEVQKSE VQQKLITAGLAQAQKFSWSQMAKIMSDVFIQTFNQIKAKRLSTMEDRKNLGEIQFKINHGQLEMQRHFWNVNSLDEAMFG 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Specific function: Unknown
COG id: COG3914
COG function: function code O; Predicted O-linked N-acetylglucosamine transferase, SPINDLY family
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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