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Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113477217

Identifier: 113477217

GI number: 113477217

Start: 5754717

End: 5762189

Strand: Reverse

Name: 113477217

Synonym: Tery_3753

Alternate gene names: NA

Gene position: 5762189-5754717 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113477218

Following gene: 113477211

Centisome position: 74.35

GC content: 33.21

Gene sequence:

>7473_bases
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ACCTCATCTAACCTTTTTTCGATTTTGTCAGGAGTTATTAGATATATATCAAGATAATAATAAAGTAATGGCTATATCTG
GGGATAATTTTCAGTTTGGTAATAATTCAATAGAATATAGTTATTATTTCTCTCGTTATCCTCATTGTTGGGGTTGGGCA
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GGTGAGGAAGCTACCCACACTTTAAGTATCAATAAATTTGCCAATATGTCTACAGAAGAAATGATTTTTCCTCTGAATCA
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TTTCAATGTTCTAATTGTGGGTTTGTACAAACGGAAAATCCTTATTGGTTAGCTGAAGCTTATAAAGAAGCAATTGCTAG
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ATAGTAAATTCCTAGATTATGGTTGTGGATATGGTTTATTTGTCCGCATGATGCGTGACTTAGGGTTAGATTTTTATGGA
TATGATAAGTATTGCCAAAATATTTTTTATCAAGGATGGGAAGGAGAAATAAATAAGCAGCAGAAATATGAAATAATTAC
AGCTTTTGAAGTATTTGAACATTTCATAAATCCTCTGGCAGAAATTGAGAATATACTGCAACACACTAGAAATATTTTAT
TTAGTACAAAGCTACTACCACCTAATAATCCTCATCCTAATGATTGGTGGTATTATGCTCTGGAAGAAGGTCAACATATT
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CCTGTTAACAGAGAAAAGTTTATCACATAGCGAGTTTCAAAACATCTTTAAGGTGGCTAGATATAAACCTGAGAACAGGA
AAAAAACTTTAACTCAACTAGACCATGAAAAAGTTACAGAAAAAAAGAAAAAAAATCAGCAGCAATTGGATTTAAAACTT
CTTATAGATGGTGTATTTTTCCAAATCAATAATACAGGTATTGCCCGTGTTTGGAAATCTTTATTAGAAGTATGGTCAAA
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CAAAAATCTTAATAACCCTTCATGGCAAGAAAAACATCGTAGTATTCGACAGGCAATTTCTTATGTTGCAATTTCAGAAA
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AAATTTTCCAGAACAACTCCTCAAGAAGTTGCTAGTTTTAAGTCAAAATATCACATTAATAAGCCATACTTTTTAATAGT
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AATTTAAAATAAATCATGGACAGTTAGAAATGCAGCGCCATTTTTGGAATGTAAATTCTCTAGATGAAGCTATGTTTGGG
CGGGTGTTAGCTTATAACGGAATGGATACGCTTTCCCCAGAAGAAAAAAAGCAAGCTTGGGAAAAGTCAATAGAAAATTG
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CAACGTATTCAGGTTGTGGGAATGGTTGTTAAACGTGAGGTTTATGAACATTTGGGTGGTTTTTGTTCCCAAGCTGCTTC
GGCTGCTGACTGGGAAATTTGGAAGCGAATAGCTGCTTTTTATCCTATTTGGTTTGAACCAGAAATTTTGGCCTGTTTCC
GTTTACATTCTTCTTCGGAAACTTCCCGCTTAATGCAGTCTGGAGGTAATATAGAAAATGCGAGGAAAGCTATAGAAATT
ACTCAAACTTATTTACCAAGAAATATGGCTGCTGAATTATCAAATCAAGCTAGGGAACATTATGGAATTGAAGCAATGAA
AATGGCTGCTTCGATGTTGAAAATAGGTAATAATAATGGAGCGATCGCTCAAATGCGCGAAGGTCTTAAATGCAGTAATT
CTTCCTCGGTAATTAATTTATTGGTTTCTATTTTGATTAATGCAGAAACGGAGGCTGAAACTTCTTTAATTCAAGCAACA
AGTCAGCATCTACTATCTTTAGAACCTCAGTTAATAGAATCAAAAAAAACCCCACATAAAGTTGAAACTAATTTATTACC
TTCTCTGGCAGAAATCAACAAAGAGATTGAGCTTTACAAACAAAACCAGTTGGATAAATCTGCTTTAGTTAAGTTGCAGG
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TGTCAAATACATAAAGCCTTATTAACAAGCAGTATTACAGATGAAAGCTTAACCGAAACTGAGAAAAAAATTGTCACTCA
AATAAAAGCTAATATTGTTAAAGGATTTAAGGAACCTTTAGACATTAAGTATCTTTTGGCAGGTATGCTTTATCAAAGAG
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TCTCCTCAGGTTTTCCAGGAAATAGGAGAAACAGATAATTACTATCATTTTATGACTGGATGGTTGAGTTATGTTCATAA
TAACATATCGATTAATTCAGAGTCGGAATTATGGCAAGCGATCGCTAGGATTTTTGTCGAAAATGCTAATTGGATACCTC
TATATTTTACGACTCGGCCAAATTTAAAAAATCTCTACATCAAACGGGCAGAAATTATTGAATTTGCTCTAAAAAAACTT
GGGTTAGAGCTAAATTATACTATGCCTCCTTATCAATTTAACCGCTCAAAAATTCGCTTAGGAATTATCAAAGATCACTA
TACTCCTCAAACAGAAACATACTCTTTACTCCCAGTATTTGAACATTTAGATCGGAGTAAATTTGAGATATTTCTTTATG
CAATAAAATCTAACGGACACCCCTTAGAACAATATTGCCAAAGTCGTGCTGATAAATTCCTGCAACTACCAAATGAACTA
AAAAATCAAGTACAAACCATTCGTGATGACAATCTCGATATTTTGTTCTTCGGTTCTAATATTACTGCTACTATCAAAAA
TTCTACCTTACTAGCAACTCACCGATTAGCAAGAGTTCAAGTAACATCCATTAATTCTCCCACTACTACCGGGATGGCAT
CTATAGACTATTACATTTCTGGCAAATTAACCGCCCCAACAGAAATGACCAAGGAACACTATACAGAAAAATTGGTCAAC
CTAGAAGGTTCCGGACTATGTTTCCAAGATCCCATCGCCGAAACTCTTCCAGTAGTGCAACCCCTCCGCTCCAGTTGGGG
GGCAACAAACGAAACTACCATTTTTATTTCAGGTGCCAATTTCTACAAAATTATACCCGAGATACGGGAGACTTGGGCCA
AAATTCTCCGTGCCGTGCCCAATTCGATTTTAGTTTTGTATCCTTTTAACCCCAATTGGACAAATTCTTATCCAGTTGGA
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TACTAGATCCCTTAATGCTAGGACTACCACCAGTTGTTGTGGAAGGAAATGCCTTAAGGTTTAGGCAAGGGCCCGCTTTG
TTGCGGGAAATTAATATAGAGGATCTTATTGCTGATGGAGAAGAGAGTTATATTAATTTGGCAGTAAAATTGGCAACTAA
TTCCGAGTGGCGACAACAAAAACGGCAAGAAATTAAGGAAAAAATGCAGCAAAACCCGGCATTTTTAGACAGTCGTAGTT
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TTTAATAGAAAGTGAACAGGAATTTTTACAACAGTTAGCTACCCAACTTTCTCAAGGAATAGAAGCGCCGAAAGCTATAA
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CTTTCAGACTATCAAAAGTTTATTGGAAACTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGGGGAGATTAAATATTGAAGTAATTATAGAATTATAAATATATACCGTATAATATAACCGGGTGATATATAAGATTTG
AGGGTGAAAGAAAGCTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTTTTTTTTGCAATTATATTATTCTGGTATGGTTAACTAACATACTAATTGTAGTAGAAAATTAACTATGAGTATAATG
TACTGGTATTACTGATTATT

Product: type 11 methyltransferase

Products: NA

Alternate protein names: Group 1 Glycosyl Transferase; Hemolytic Protein HlpA-Like Protein; Glycosyl Transferase Group 1 Family Protein; TPR Domain-Containing Protein; Methyltransferase FkbM; Tetratricopeptide TPR_2 Repeat Protein; Mannosyltransferase; O-Linked N-Acetylglucosamine Transferase; Glycosyl Transferase; Glycosyltransferase; Methyltransferase Type; Glycosyl Transferase Group 1 Protein; Glyocosyltransferase Protein; Mannosyltransferase B; Hemolysin Hemolytic Protein; Mannosyl Transferase; Tetratricopeptide Repeat Domain Protein; TPR Repeat Protein; SPINDLY Family O-Linked N-Acetylglucosamine Transferase; Tetratricopeptide Repeat Family Protein; Glycosyltransferase Family; A-Glycosyltransferase; TPR Domain Protein; TPR Domain/SEC-C Motif Domain Protein; A-Glycosyltransferase Glycosyltransferase Family 4 Protein; Mannosyltransferase-Like Protein; Tetratricopeptide Repeat-Containing Protein; Glycosyltransferase WbpY; Tetratricopeptide Repeat Protein; O-Linked Acetylglucosamine Transferase; Mannosyl Transferase B; SPY Protein; Glycosyl Transferase Group 1/2 Family Protein; TPR Repeat-Containing Glycosyl Transferase; Glycosyl Transferase Family Protein; Glycosyl Transferase TPR Repeat Protein; TPR Repeat-Containing SPINDLY Family Protein

Number of amino acids: Translated: 2490; Mature: 2489

Protein sequence:

>2490_residues
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Sequences:

>Translated_2490_residues
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SDYQKFIGN

Specific function: Unknown

COG id: COG3914

COG function: function code O; Predicted O-linked N-acetylglucosamine transferase, SPINDLY family

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI32307150, Length=222, Percent_Identity=26.1261261261261, Blast_Score=85, Evalue=9e-16,
Organism=Homo sapiens, GI32307148, Length=222, Percent_Identity=26.1261261261261, Blast_Score=85, Evalue=1e-15,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI115532692, Length=225, Percent_Identity=24.8888888888889, Blast_Score=70, Evalue=1e-11,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI115532690, Length=225, Percent_Identity=24.8888888888889, Blast_Score=70, Evalue=2e-11,
Organism=Drosophila melanogaster, GI17647755, Length=224, Percent_Identity=28.5714285714286, Blast_Score=93, Evalue=2e-18,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24585827, Length=224, Percent_Identity=28.5714285714286, Blast_Score=93, Evalue=2e-18,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24585829, Length=224, Percent_Identity=28.5714285714286, Blast_Score=93, Evalue=2e-18,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 286915; Mature: 286784

Theoretical pI: Translated: 6.94; Mature: 6.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

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Metal ions: NA

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Specific activity: NA

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Specific reaction: NA

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Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA