Definition | Helicobacter acinonychis str. Sheeba chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_008229 |
Length | 1,553,927 |
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The map label for this gene is 109947159
Identifier: 109947159
GI number: 109947159
Start: 504345
End: 506780
Strand: Direct
Name: 109947159
Synonym: Hac_0572
Alternate gene names: NA
Gene position: 504345-506780 (Clockwise)
Preceding gene: 109947158
Following gene: 109947160
Centisome position: 32.46
GC content: 33.21
Gene sequence:
>2436_bases ATGGCGATCAACCTTAAAAAGATAAAATCTCTTAACGCGTTTTGTGGTTTAGACACGATTGAAACGGATGGGTTTGGGGA CTACAATGTTATTTTTGGGAATAATGGGTGTGGAAAAACCAGCTTGACGAGGGCTTTTGAGTTACTAAAACACCCACACC ACATTGAAAAGTATCGCACTATTTCTGCTGATAAATCCCCAAGCGTTGGATTTGAGTGTAGAAATCAAAGCTATACAATA GAGCCAAACAGCAAGATTGAAGCGCCCTTTAAAGTTGAAATCTATAATAGCGATTTTTTGCACGATAATGCACCTTTTAA TGGCGAGTTTGGGCTTAAAAAACTGGATGATGGCGCAATCATTTTGGATATTCCGGCTTTAGGCAAAGAAACGCAAGCAA TCAATCAATTAAAGGGTTGTAGAGAGAAAGTAGAAAAAAGACAAAAGGAAATTAGAGATAAAAACAATGAGAACACCTTC AGCGCCAAGCAAGAAAGTGAAATTAAAAAATGCAAGGGAGAAATAGAAACAATACGAAAAGGTGTGAGCTCAAAGATTAT TCCAATAAAACCAGATGAGATTGAAATAGAGAATATCTGTAAGGTGTCAAAGGATGAGTTTAAAGATGAAGAAAATGCAT TAACGGAGTTGGAAAACGATTTTGAGAGATTGAATGGAGCCATGAAAACATTTGATGGTTTAAAAGAGATAGAATTGCCT GAATATGACCAAACGATACAAGATGGTTTGAAGTTTTTATTTGACTTTGATACAGACAAAGAGGTAGGAAAAGTTTCAGA AAAAATTAAAGAGCATATTAACAGGGTTGGAAGAGATTTTATTGAGAAAGGAAGGGAATTGCAAAAAGCGATAAACGATC ATGCATGCCCTTTTTGCACTCAAAAAATACCCGATAAGATTGTTCAAGAATATACAGATTACTTTAATGAGAGGGTTGAA ACATTCAGCCAGCGTTCTTTAAAAATGAGTGAAACTTTGCAAAAGATTTTAGGGCAATGGAATACCAAAGAAATATTGCA AGCGTTTGAGCGGTTTAAACCTTTCATACAGGATTTTCCACAAAAACAAGAAAGTTTAGAAAAGGCGTTAGAGCGAATAA AAGGTTTATTAGAAAAACTTCAAAAAGAGGTGGTTAAAAAGGAAGGCGTTAAAAATAAAGAAGAGTTTCAAAAGACAGAT GAAGAGTTGTCAGAAATCTATAAAAAGATCCAACAAGATGTCAAAGAGACTGCAGAGATCTTAAGCGGCAAGGAACAGCA AGAAGAGAAATTAAAAAAATTAAAAATTGATTTAAGAGAAGCAAGGATTAAAAAGGCTAAACATGATAGTTATGATTTGC AAAAACGCCAAAAAGAAGCTGAGAGAAAATTATCCGTTTTTGATCGTGGGCATGAAAGATTAGAACGCCTTTTAACAAAA ATTGATAATCAACTTAAGGGGTTATATGAGCAAGAACGCCCCGATATTGAAGTTATTAATCATTATCTTAAGGTTTTCAA TTTGCCTCAATATTCTTTGAATAAAGATTATCAAATTGTTTTAAACTCTAAGGCTTTAGAACATAGTGCGGCTAAAATGA TTTTAAGCGATGGCGAAAAAAACACGCTTGCATTCGCGTATTTTTTAGCGCGTTTAAAATTATTTTACAAAAAAGAGAAT TTAAAAGATTTAGTTATTGCCATAGATGATCCTGTATCCAGTTTGGATGAACAAAGGATTTATAACATTTCTGATAGAGT GGCAAGAATCAATCAAGAACTAGCAGAGGAAAGATTGAAAAATGAAGAGAAAGCGCAAATATTCGTTTTAACTCATAACC ATACTTTTATGGCGTGTTTAATCAACATGGTAGGCACATGTGCTCGCTATTTCCAATTAGAACGCGATCAAAATCAATTA AAAATTGTTTGTAAAGATAAAGTGTTTGGTTATTTTGACACTTTCTACTTGCTTTTATTTAAAGAAGTGTATGGGTTTGC GAAAAAAGAAAAAGTGCACGATAATCATAGTGAAGCCATAAATTATGGGAATAAAGTAAGGATTTTATTAGAAAGTTTTT TAAAGATTAATTTCATTGACTCTTTTCTTGAAAAAAAACATGCTAGTGTTTTGGATAGAGATAAGATTGAAGGTTTGATA GAAACAGCAAATGGGGAAGTTGGATTAAATTTTTCAAAGCTGCCTTTTAATGAGGATAATTGCAATATAAAGGATAAAGG TATGCTTCTTGAGAAACTTTTAGGGATTAGAAAAGGCTTGCATTCAGAGAGCCATGGAAGCGTTACGGATGTTTTTAGCC CTTATAAAATCCCACTTAAAAATGTCCAAGAATTTGCCAGAATAGCTATTAATGCTATGAAAATTTTAAGTCCTTATCAA ACACAATCTTATATGAGGAGTGTGGATAAAAATTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGGCGTTAGAGCTTGGGTATGATGGGGGTTTGGGGGATTAGTTTTGTATCCAATTTATGAGTGTGGAAAGTGGGGGAATT AAAGAAAAAAGCGAGAAAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases AAACAAGGAATAACATGCGCATCGTATTTATGGGAACGCCTGGTTTTGCTGAAGTGATCTTAAGGGCGTTAATTGAAAAT CAAAACAACAATATAGAAGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 811; Mature: 810
Protein sequence:
>811_residues MAINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRTISADKSPSVGFECRNQSYTI EPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAIILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTF SAKQESEIKKCKGEIETIRKGVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELP EYDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCTQKIPDKIVQEYTDYFNERVE TFSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFPQKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTD EELSEIYKKIQQDVKETAEILSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK IDNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEKNTLAFAYFLARLKLFYKKEN LKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLKNEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQL KIVCKDKVFGYFDTFYLLLFKEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI ETANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLKNVQEFARIAINAMKILSPYQ TQSYMRSVDKN
Sequences:
>Translated_811_residues MAINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRTISADKSPSVGFECRNQSYTI EPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAIILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTF SAKQESEIKKCKGEIETIRKGVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELP EYDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCTQKIPDKIVQEYTDYFNERVE TFSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFPQKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTD EELSEIYKKIQQDVKETAEILSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK IDNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEKNTLAFAYFLARLKLFYKKEN LKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLKNEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQL KIVCKDKVFGYFDTFYLLLFKEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI ETANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLKNVQEFARIAINAMKILSPYQ TQSYMRSVDKN >Mature_810_residues AINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRTISADKSPSVGFECRNQSYTIE PNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAIILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTFS AKQESEIKKCKGEIETIRKGVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELPE YDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCTQKIPDKIVQEYTDYFNERVET FSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFPQKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTDE ELSEIYKKIQQDVKETAEILSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTKI DNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEKNTLAFAYFLARLKLFYKKENL KDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLKNEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQLK IVCKDKVFGYFDTFYLLLFKEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLIE TANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLKNVQEFARIAINAMKILSPYQT QSYMRSVDKN
Specific function: Unknown
COG id: COG4694
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 94134; Mature: 94002
Theoretical pI: Translated: 7.24; Mature: 7.24
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRT CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH ISADKSPSVGFECRNQSYTIEPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAI CCCCCCCCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEE ILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTFSAKQESEIKKCKGEIETIRK EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELP CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC EYDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCT CHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH QKIPDKIVQEYTDYFNERVETFSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC QKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTDEELSEIYKKIQQDVKETAEI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCC NTLAFAYFLARLKLFYKKENLKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLK CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQLKIVCKDKVFGYFDTFYLLLF CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH KEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLK HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHH NVQEFARIAINAMKILSPYQTQSYMRSVDKN HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AINLKKIKSLNAFCGLDTIETDGFGDYNVIFGNNGCGKTSLTRAFELLKHPHHIEKYRT CCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH ISADKSPSVGFECRNQSYTIEPNSKIEAPFKVEIYNSDFLHDNAPFNGEFGLKKLDDGAI CCCCCCCCCCCEECCCEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEE ILDIPALGKETQAINQLKGCREKVEKRQKEIRDKNNENTFSAKQESEIKKCKGEIETIRK EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVSSKIIPIKPDEIEIENICKVSKDEFKDEENALTELENDFERLNGAMKTFDGLKEIELP CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCC EYDQTIQDGLKFLFDFDTDKEVGKVSEKIKEHINRVGRDFIEKGRELQKAINDHACPFCT CHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH QKIPDKIVQEYTDYFNERVETFSQRSLKMSETLQKILGQWNTKEILQAFERFKPFIQDFP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC QKQESLEKALERIKGLLEKLQKEVVKKEGVKNKEEFQKTDEELSEIYKKIQQDVKETAEI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSGKEQQEEKLKKLKIDLREARIKKAKHDSYDLQKRQKEAERKLSVFDRGHERLERLLTK HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDNQLKGLYEQERPDIEVINHYLKVFNLPQYSLNKDYQIVLNSKALEHSAAKMILSDGEK HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCC NTLAFAYFLARLKLFYKKENLKDLVIAIDDPVSSLDEQRIYNISDRVARINQELAEERLK CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NEEKAQIFVLTHNHTFMACLINMVGTCARYFQLERDQNQLKIVCKDKVFGYFDTFYLLLF CCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHH KEVYGFAKKEKVHDNHSEAINYGNKVRILLESFLKINFIDSFLEKKHASVLDRDKIEGLI HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETANGEVGLNFSKLPFNEDNCNIKDKGMLLEKLLGIRKGLHSESHGSVTDVFSPYKIPLK HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHH NVQEFARIAINAMKILSPYQTQSYMRSVDKN HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA