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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 108563290

GI number: 108563290

Start: 901105

End: 902487

Strand: Direct

Name: mviN [H]

Synonym: HPAG1_0865

Alternate gene names: 108563290

Gene position: 901105-902487 (Clockwise)

Preceding gene: 108563286

Following gene: 108563291

Centisome position: 56.45

GC content: 38.32

Gene sequence:

>1383_bases
ATGGCCAATATTCTAGGGGCTGGGGTGTATAGCGATATTTTCTTTGTGGCTTTCAAATTGCCTAATTTGTTCAGGCGTAT
TTTTGCGGAGGGCTCTTTTTCTCAAAGCTTTTTACCGAGCTTCATACGAAGTTCCATTAAAGGGAGCTTTGCGAGTTTGG
TGGGGCTTATTTTTTGTGGCGTTTTATTGGTATGGTGCTTATTGGTGGCATTAAATCCCTTATGGCTAGCTAAACTCCTA
GCTTACGGCTTTGATGAAGAAAAAATCAAACTATGCGCCCCTATTGTAGCGATCAATTTTTGGTATCTTTTATTGGTGTT
TATCACCACTTTTTTAGGCGCGCTTCTGCAATACAAACACAGCTTTTTTGCCAGCGCTTATAGCACAAGCTTACTCAATT
TATGCATGATTTTAGCCCTTTTATTTTCTAAAGAAAAAACGCATTTAGAAGCGTTGTATTATTTGAGTTATGGCGTGCTT
TTAGGGGGCGTGGCTCAAATTTTATTGCACTTTTATCCTTTAGTGAAATTGGGCTTATTGAATTTATTGTGGAAAGGATT
TTTGAGCTTTAAGACCAAAAACGCCACCAAAAAAAAATACCGCTCTAAAAGAGTTAAAAAGGACCTAAAAGCGTTTTTCA
AGCAATTCCTCCCCAGCGTTTTAGGCAATTCTAGCGCTCAGATCGCTTCTTTTTTAGACACCACAATCGCCTCTTTTCTG
GCGAGCGGGAGCGTGTCTTATTTGTATTACGCTAATAGAGTCTTCCAGCTCCCTTTAGCTTTATTTGCTATCGCTATCTC
TAGCGCCCTTTTCCCTAGCATTGCGATCGCGCTTAAAAACAACCAGCAGGATTTAATCTTACAACGCTTGCAAAAGGCGT
GGTTTTTTTTGGTGGGGGTTTTGCTTCTTTGCAGCATTGGGGGGATAATGTTAAGCAAAGAAATCACCGAGCTTTTATTT
GAAAGGGGGCAATTTAGCCCTAAAGACACCCTAATCACTTCGCAAGTCTTTTCGCTCTATCTTTTAGGCTTGCTCCCTTT
TGGGCTAACTAAACTCTTTTCTTTGTGGCTTTATGCGAAATTAGAGCAAAAAAAAGCGGCTAAAATCTCTTTAATTTCGC
TTTTTTTAGGTTTAGCGGCTTCTTTGAGTTTAATGCCTTTGTTAGGGGTTTTGGGTTTAGCGTTAGCGAATAGTTTGAGC
GGGTTATTTTTATTTGTTTTAACGATAAAAGCGTTTGGCTTTCAACCATTCTTGGGTATAATTAAAAATTTAAAATCATG
GCTTGTAATCTTTTTTCTCGCTTGCGTGGAAATCTTATTACTCTTAGCGTTCAAATCGTGGGTTACACATTTATATTTAT
TTTATTATTTTCAAGGTTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAGGTAATAAATACAACTAGTATGCTAAAAAAAATATTTTTAACCAACAGCTTAGGGATTTTATGCTCTAGGATTTTTG
GCTTTTTACGGGATTTGATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGTTTATTTATGATACCAAATCAAAACAAAAAGTCCCTTTTGAGCCTTTAGTTAAAAATAAGGCGAATATTTATGTGTG
CGGGCCTACGGTGTATGATG

Product: virulence factor mviN protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 460; Mature: 459

Protein sequence:

>460_residues
MANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLVGLIFCGVLLVWCLLVALNPLWLAKLL
AYGFDEEKIKLCAPIVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSTSLLNLCMILALLFSKEKTHLEALYYLSYGVL
LGGVAQILLHFYPLVKLGLLNLLWKGFLSFKTKNATKKKYRSKRVKKDLKAFFKQFLPSVLGNSSAQIASFLDTTIASFL
ASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISSALFPSIAIALKNNQQDLILQRLQKAWFFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLF
ERGQFSPKDTLITSQVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISLFLGLAASLSLMPLLGVLGLALANSLS
GLFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKSWLVIFFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLFYYFQGF

Sequences:

>Translated_460_residues
MANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLVGLIFCGVLLVWCLLVALNPLWLAKLL
AYGFDEEKIKLCAPIVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSTSLLNLCMILALLFSKEKTHLEALYYLSYGVL
LGGVAQILLHFYPLVKLGLLNLLWKGFLSFKTKNATKKKYRSKRVKKDLKAFFKQFLPSVLGNSSAQIASFLDTTIASFL
ASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISSALFPSIAIALKNNQQDLILQRLQKAWFFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLF
ERGQFSPKDTLITSQVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISLFLGLAASLSLMPLLGVLGLALANSLS
GLFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKSWLVIFFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLFYYFQGF
>Mature_459_residues
ANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLVGLIFCGVLLVWCLLVALNPLWLAKLLA
YGFDEEKIKLCAPIVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKHSFFASAYSTSLLNLCMILALLFSKEKTHLEALYYLSYGVLL
GGVAQILLHFYPLVKLGLLNLLWKGFLSFKTKNATKKKYRSKRVKKDLKAFFKQFLPSVLGNSSAQIASFLDTTIASFLA
SGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISSALFPSIAIALKNNQQDLILQRLQKAWFFLVGVLLLCSIGGIMLSKEITELLFE
RGQFSPKDTLITSQVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAKLEQKKAAKISLISLFLGLAASLSLMPLLGVLGLALANSLSG
LFLFVLTIKAFGFQPFLGIIKNLKSWLVIFFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLFYYFQGF

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=409, Percent_Identity=33.0073349633252, Blast_Score=172, Evalue=5e-44,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51478; Mature: 51346

Theoretical pI: Translated: 10.26; Mature: 10.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.7 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLVGLIFCG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
VLLVWCLLVALNPLWLAKLLAYGFDEEKIKLCAPIVAINFWYLLLVFITTFLGALLQYKH
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFFASAYSTSLLNLCMILALLFSKEKTHLEALYYLSYGVLLGGVAQILLHFYPLVKLGLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLLWKGFLSFKTKNATKKKYRSKRVKKDLKAFFKQFLPSVLGNSSAQIASFLDTTIASFL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ASGSVSYLYYANRVFQLPLALFAIAISSALFPSIAIALKNNQQDLILQRLQKAWFFLVGV
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLCSIGGIMLSKEITELLFERGQFSPKDTLITSQVFSLYLLGLLPFGLTKLFSLWLYAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEQKKAAKISLISLFLGLAASLSLMPLLGVLGLALANSLSGLFLFVLTIKAFGFQPFLGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
IKNLKSWLVIFFLACVEILLLLAFKSWVTHLYLFYYFQGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
ANILGAGVYSDIFFVAFKLPNLFRRIFAEGSFSQSFLPSFIRSSIKGSFASLVGLIFCG
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9252185 [H]