| Definition | Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007969 |
| Length | 3,059,876 |
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The map label for this gene is ppc [H]
Identifier: 93006646
GI number: 93006646
Start: 2248085
End: 2250865
Strand: Direct
Name: ppc [H]
Synonym: Pcryo_1822
Alternate gene names: 93006646
Gene position: 2248085-2250865 (Clockwise)
Preceding gene: 93006644
Following gene: 93006648
Centisome position: 73.47
GC content: 43.98
Gene sequence:
>2781_bases ATGATAATAGATAATGACATATTACGTGAACGCATTAGTTTATTAGGTTCCTTCCTAGGGGATGCGATTTCTCGCCAGAC TGGTGAACAAACGCTGCATACTATTGAAACGCTGCGCAAAGGTTTTATTCAACAGCGCCGTGAGCCTAATGAAGCTCATA AGCAGAAGCTCATCGATTTTATTGCCTCTTTGGACAATCAATCCTTAAAAAATGTCATCCGCAGCTTTTCTATCTACTTT TTCTTAGCCAATCTAAGTGAAGAGAATTATCTACGTGAAGAGCGCCATGCATTACGTATGCAATCAGAGCAGAGCTGGGA AGGATCGTTTCGCCGTACTTTACTAGAGTGTCGTGAGCGCAATATTGAGCCAGCACAGATGCAAGAGCTCATTGAGCAAC TAAAATTCATCCCTGTATTTACCGCCCATCCTACTGAAGCGCGTCGACGTACAACGATGAACTTATTACAAGGTTTATTT ACGCATAGCGATGCCTTAAATAACGTTGCACAAAACAGTTTTGCCTACGAGCAAGCCAGAGAAAAAACGGCGCAAACGAT TGATCTGCTATGGTCGTCTGATGAAGTGCGGACGCGTAAGCCTTTGGTCTATGACGAAATAAATAATGGTCTGCATTATT TCAATGCCAGTTTATTCAACGCCATTCCCAAGGTTTATCGTAATATTAAAAACGCTATTATTGATATCTATCCTGAGCTA ACAGACTACCCTCTACCTGCTATCATAAGCTTTGGCTCTTGGATCGGTGGCGATAGAGATGGCAATCCCTTTGTCACTCA TGACACTACAGAAATGGCCGTATTGATGCATGCAGATACTGTATTGCGTCACTATCAAGTGTTGCTTAAGAAACTACGTC GTCAGCTTATTCATAGTGATACGATTGTTACTATCGAACCTGATGTGTATGCCAAGATTGAAAGTTATAGTGAGCTCGAC AGACGAGTCTTTGATTACAATCTTGATGATTACGGCAATGAACCTTATCGCAGATTCCTCTCCTTAATCCTGAATAAAGT CAAAGCCACCAATCTTTTAATCCAAAGCAAAGGGAGTGATACTGAGGCTAAAAAAGATGCCTACGCCAATCCACAAGAAC TATTAGAAGACTTACGCATCATCCGTCAAAGTGTGAATACTCATGATACTGCACATGGCGAAGGCTTACTACTCGATATA ATACGTTTGGTCAAAACCTGTGGCTTCCATTTGGCAGCGCTCGATATTCGCCAAGAGTCGTCTTATCATAGCGAAGTGAT TGCCGATATTTTTGCCAATGCTTCTAACTTGCCTGACTATCAAAGCCTCAATGAAACCGAGCGCCAAGAATGGCTAACGC GCCTGCTTGAGAAACCAGGCACACCGCTTATTTATACCGATAATTTAACGGATAAAACCCGTGAACAATTGGCCTTGATG CACTCAGTAGCGACTTTACGCAAACTGGTTGGGCAAGATACTTTTGGCAGTTATGTTATCTCAATGACCAATAACGCCAG TCAATTATTAGAAGTATTGCTACTCATGCGCTTTGCAGGCTTATGTAGAGTGGATGACGAAGGGCGACTGTCTGCCGACT TGCCCGTAGCACCGTTATTTGAGACCATCGAAGATCTTAAAAACATCGATCAGATCCTGCCTGCGGTTTTAGATAATCCG CTGTATCGAGGGTTGCTACGACACTCAGATAACACTCAAGAAATCATGCTGGGCTATTCAGATTCATCAAAGGATGGTGG CATCATTACTTCTGCATGGCAGCTTTATAGCGCGCAGCAGACCATAAATAGTATTGCTGAAAAATACGGTATCAAAACCC GCCTATTTCATGGTCGCGGTGGCTCAGTAAGTCGTGGTGGCGGCTCAACTCATAAAGCGATTGCCGCGCAACCCGCTGGT ACACTGCATGGGCAAATCAAAGTGACCGAACAAGGCGAAGTCCTTTATGCCAAATATGCCAACACTGATACCGCTGTATT TGAGCTGACCATGGGCATCACTGGCACGCTTAAAGCTTGCTCCTCAAGATTCGTGGTGCAACCGCCTGAACTGCCACATT ATGAAGCGCTCTTTGCGCGTTTAGCAGATGCAGGTGAGCAGCGTTATCGCAAGCTAACGGATCATACCGAAGGGTTTTAT CAGTTCTACTCTCAAGCGACGCCAGTGGCAGAAATCTCTTTATTAAATATTGGCTCACGCCCAGCACATCGTAATAAAGG CTTACCAAGCAAAACAACCTTGCGCGCAATTCCTTGGGTATTTGGCTGGTCATTAGCGCGCTTTACACTGCCCGCTTGGT ATGGTGTCGGCAGTGCGTTGCATAGCGTCATCGATGATGAAGCACTGATGAAAGAAATGATTGACTGCTGGCCATTTTTT AACGTGTTTATTAGCAATATTGAAATGGCGTTTACCAAGTCTGATATGAGTATTGCTCATGCTTATAGCCAATTATGTGA CGATGAGAGGTTACGTGAACAGATTATGACAGCGGTGACGGATGAGCACGAGCTTACCCATTCAGGTTTAAACTCTTTGC TTAACCAAGAGTCGTTATTGGAGCATCAGCAGAATCTTGCCGCTTCTCTTGAATGGCGTAATGCGTATTTAGATCCAACC AACTATATCCAAATTGAGCTATTGAAGCGTGCCAGACAAAAAGACGCTACAAGCGATACCAATCATGGTGACCTCGACGT TGAAGATCCATTAATCCGTAGTATTAATGCCTTGGCAGCAGGTCTACGCAATACAGGGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCTCATTACTAAACATTATATTAAGCAGTATTTTTCTTTATACAACATTACAGATTTGCTGCTTCACTATTTTTTAATTA ATTTAAGGAGAAGGTCAAGG
Downstream 100 bases:
>100_bases TGGATAACACAGAAAAATATATGCAAAAAAGACAGTACTTTTAGTATTTCCTAAAGGTACTGTCTTTTAATGTGTTTATC TCAAACGGTTACTTAATTAT
Product: phosphoenolpyruvate carboxylase
Products: NA
Alternate protein names: PEPC; PEPCase [H]
Number of amino acids: Translated: 926; Mature: 926
Protein sequence:
>926_residues MIIDNDILRERISLLGSFLGDAISRQTGEQTLHTIETLRKGFIQQRREPNEAHKQKLIDFIASLDNQSLKNVIRSFSIYF FLANLSEENYLREERHALRMQSEQSWEGSFRRTLLECRERNIEPAQMQELIEQLKFIPVFTAHPTEARRRTTMNLLQGLF THSDALNNVAQNSFAYEQAREKTAQTIDLLWSSDEVRTRKPLVYDEINNGLHYFNASLFNAIPKVYRNIKNAIIDIYPEL TDYPLPAIISFGSWIGGDRDGNPFVTHDTTEMAVLMHADTVLRHYQVLLKKLRRQLIHSDTIVTIEPDVYAKIESYSELD RRVFDYNLDDYGNEPYRRFLSLILNKVKATNLLIQSKGSDTEAKKDAYANPQELLEDLRIIRQSVNTHDTAHGEGLLLDI IRLVKTCGFHLAALDIRQESSYHSEVIADIFANASNLPDYQSLNETERQEWLTRLLEKPGTPLIYTDNLTDKTREQLALM HSVATLRKLVGQDTFGSYVISMTNNASQLLEVLLLMRFAGLCRVDDEGRLSADLPVAPLFETIEDLKNIDQILPAVLDNP LYRGLLRHSDNTQEIMLGYSDSSKDGGIITSAWQLYSAQQTINSIAEKYGIKTRLFHGRGGSVSRGGGSTHKAIAAQPAG TLHGQIKVTEQGEVLYAKYANTDTAVFELTMGITGTLKACSSRFVVQPPELPHYEALFARLADAGEQRYRKLTDHTEGFY QFYSQATPVAEISLLNIGSRPAHRNKGLPSKTTLRAIPWVFGWSLARFTLPAWYGVGSALHSVIDDEALMKEMIDCWPFF NVFISNIEMAFTKSDMSIAHAYSQLCDDERLREQIMTAVTDEHELTHSGLNSLLNQESLLEHQQNLAASLEWRNAYLDPT NYIQIELLKRARQKDATSDTNHGDLDVEDPLIRSINALAAGLRNTG
Sequences:
>Translated_926_residues MIIDNDILRERISLLGSFLGDAISRQTGEQTLHTIETLRKGFIQQRREPNEAHKQKLIDFIASLDNQSLKNVIRSFSIYF FLANLSEENYLREERHALRMQSEQSWEGSFRRTLLECRERNIEPAQMQELIEQLKFIPVFTAHPTEARRRTTMNLLQGLF THSDALNNVAQNSFAYEQAREKTAQTIDLLWSSDEVRTRKPLVYDEINNGLHYFNASLFNAIPKVYRNIKNAIIDIYPEL TDYPLPAIISFGSWIGGDRDGNPFVTHDTTEMAVLMHADTVLRHYQVLLKKLRRQLIHSDTIVTIEPDVYAKIESYSELD RRVFDYNLDDYGNEPYRRFLSLILNKVKATNLLIQSKGSDTEAKKDAYANPQELLEDLRIIRQSVNTHDTAHGEGLLLDI IRLVKTCGFHLAALDIRQESSYHSEVIADIFANASNLPDYQSLNETERQEWLTRLLEKPGTPLIYTDNLTDKTREQLALM HSVATLRKLVGQDTFGSYVISMTNNASQLLEVLLLMRFAGLCRVDDEGRLSADLPVAPLFETIEDLKNIDQILPAVLDNP LYRGLLRHSDNTQEIMLGYSDSSKDGGIITSAWQLYSAQQTINSIAEKYGIKTRLFHGRGGSVSRGGGSTHKAIAAQPAG TLHGQIKVTEQGEVLYAKYANTDTAVFELTMGITGTLKACSSRFVVQPPELPHYEALFARLADAGEQRYRKLTDHTEGFY QFYSQATPVAEISLLNIGSRPAHRNKGLPSKTTLRAIPWVFGWSLARFTLPAWYGVGSALHSVIDDEALMKEMIDCWPFF NVFISNIEMAFTKSDMSIAHAYSQLCDDERLREQIMTAVTDEHELTHSGLNSLLNQESLLEHQQNLAASLEWRNAYLDPT NYIQIELLKRARQKDATSDTNHGDLDVEDPLIRSINALAAGLRNTG >Mature_926_residues MIIDNDILRERISLLGSFLGDAISRQTGEQTLHTIETLRKGFIQQRREPNEAHKQKLIDFIASLDNQSLKNVIRSFSIYF FLANLSEENYLREERHALRMQSEQSWEGSFRRTLLECRERNIEPAQMQELIEQLKFIPVFTAHPTEARRRTTMNLLQGLF THSDALNNVAQNSFAYEQAREKTAQTIDLLWSSDEVRTRKPLVYDEINNGLHYFNASLFNAIPKVYRNIKNAIIDIYPEL TDYPLPAIISFGSWIGGDRDGNPFVTHDTTEMAVLMHADTVLRHYQVLLKKLRRQLIHSDTIVTIEPDVYAKIESYSELD RRVFDYNLDDYGNEPYRRFLSLILNKVKATNLLIQSKGSDTEAKKDAYANPQELLEDLRIIRQSVNTHDTAHGEGLLLDI IRLVKTCGFHLAALDIRQESSYHSEVIADIFANASNLPDYQSLNETERQEWLTRLLEKPGTPLIYTDNLTDKTREQLALM HSVATLRKLVGQDTFGSYVISMTNNASQLLEVLLLMRFAGLCRVDDEGRLSADLPVAPLFETIEDLKNIDQILPAVLDNP LYRGLLRHSDNTQEIMLGYSDSSKDGGIITSAWQLYSAQQTINSIAEKYGIKTRLFHGRGGSVSRGGGSTHKAIAAQPAG TLHGQIKVTEQGEVLYAKYANTDTAVFELTMGITGTLKACSSRFVVQPPELPHYEALFARLADAGEQRYRKLTDHTEGFY QFYSQATPVAEISLLNIGSRPAHRNKGLPSKTTLRAIPWVFGWSLARFTLPAWYGVGSALHSVIDDEALMKEMIDCWPFF NVFISNIEMAFTKSDMSIAHAYSQLCDDERLREQIMTAVTDEHELTHSGLNSLLNQESLLEHQQNLAASLEWRNAYLDPT NYIQIELLKRARQKDATSDTNHGDLDVEDPLIRSINALAAGLRNTG
Specific function: Through the carboxylation of phosphoenolpyruvate (PEP) it forms oxaloacetate, a four-carbon dicarboxylic acid source for the tricarboxylic acid cycle [H]
COG id: COG2352
COG function: function code C; Phosphoenolpyruvate carboxylase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the PEPCase type 1 family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790393, Length=938, Percent_Identity=32.089552238806, Blast_Score=410, Evalue=1e-115,
Paralogues:
None
Copy number: 3,500 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR021135 - InterPro: IPR018129 - InterPro: IPR022805 - InterPro: IPR015813 [H]
Pfam domain/function: PF00311 PEPcase [H]
EC number: =4.1.1.31 [H]
Molecular weight: Translated: 105054; Mature: 105054
Theoretical pI: Translated: 5.82; Mature: 5.82
Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE ; PS00781 PEPCASE_1 ; PS00393 PEPCASE_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIDNDILRERISLLGSFLGDAISRQTGEQTLHTIETLRKGFIQQRREPNEAHKQKLIDF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH IASLDNQSLKNVIRSFSIYFFLANLSEENYLREERHALRMQSEQSWEGSFRRTLLECRER HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC NIEPAQMQELIEQLKFIPVFTAHPTEARRRTTMNLLQGLFTHSDALNNVAQNSFAYEQAR CCCHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKTAQTIDLLWSSDEVRTRKPLVYDEINNGLHYFNASLFNAIPKVYRNIKNAIIDIYPEL HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TDYPLPAIISFGSWIGGDRDGNPFVTHDTTEMAVLMHADTVLRHYQVLLKKLRRQLIHSD CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TIVTIEPDVYAKIESYSELDRRVFDYNLDDYGNEPYRRFLSLILNKVKATNLLIQSKGSD CEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCC TEAKKDAYANPQELLEDLRIIRQSVNTHDTAHGEGLLLDIIRLVKTCGFHLAALDIRQES CCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHHCC SYHSEVIADIFANASNLPDYQSLNETERQEWLTRLLEKPGTPLIYTDNLTDKTREQLALM HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH HSVATLRKLVGQDTFGSYVISMTNNASQLLEVLLLMRFAGLCRVDDEGRLSADLPVAPLF HHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCHHHHH ETIEDLKNIDQILPAVLDNPLYRGLLRHSDNTQEIMLGYSDSSKDGGIITSAWQLYSAQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH TINSIAEKYGIKTRLFHGRGGSVSRGGGSTHKAIAAQPAGTLHGQIKVTEQGEVLYAKYA HHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEC NTDTAVFELTMGITGTLKACSSRFVVQPPELPHYEALFARLADAGEQRYRKLTDHTEGFY CCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFYSQATPVAEISLLNIGSRPAHRNKGLPSKTTLRAIPWVFGWSLARFTLPAWYGVGSAL HHHHCCCCHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HSVIDDEALMKEMIDCWPFFNVFISNIEMAFTKSDMSIAHAYSQLCDDERLREQIMTAVT HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC DEHELTHSGLNSLLNQESLLEHQQNLAASLEWRNAYLDPTNYIQIELLKRARQKDATSDT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NHGDLDVEDPLIRSINALAAGLRNTG CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MIIDNDILRERISLLGSFLGDAISRQTGEQTLHTIETLRKGFIQQRREPNEAHKQKLIDF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH IASLDNQSLKNVIRSFSIYFFLANLSEENYLREERHALRMQSEQSWEGSFRRTLLECRER HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC NIEPAQMQELIEQLKFIPVFTAHPTEARRRTTMNLLQGLFTHSDALNNVAQNSFAYEQAR CCCHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKTAQTIDLLWSSDEVRTRKPLVYDEINNGLHYFNASLFNAIPKVYRNIKNAIIDIYPEL HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TDYPLPAIISFGSWIGGDRDGNPFVTHDTTEMAVLMHADTVLRHYQVLLKKLRRQLIHSD CCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TIVTIEPDVYAKIESYSELDRRVFDYNLDDYGNEPYRRFLSLILNKVKATNLLIQSKGSD CEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCC TEAKKDAYANPQELLEDLRIIRQSVNTHDTAHGEGLLLDIIRLVKTCGFHLAALDIRQES CCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHHCC SYHSEVIADIFANASNLPDYQSLNETERQEWLTRLLEKPGTPLIYTDNLTDKTREQLALM HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH HSVATLRKLVGQDTFGSYVISMTNNASQLLEVLLLMRFAGLCRVDDEGRLSADLPVAPLF HHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCCHHHHH ETIEDLKNIDQILPAVLDNPLYRGLLRHSDNTQEIMLGYSDSSKDGGIITSAWQLYSAQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH TINSIAEKYGIKTRLFHGRGGSVSRGGGSTHKAIAAQPAGTLHGQIKVTEQGEVLYAKYA HHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEC NTDTAVFELTMGITGTLKACSSRFVVQPPELPHYEALFARLADAGEQRYRKLTDHTEGFY CCCCEEEEEECCCCHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QFYSQATPVAEISLLNIGSRPAHRNKGLPSKTTLRAIPWVFGWSLARFTLPAWYGVGSAL HHHHCCCCHHHEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HSVIDDEALMKEMIDCWPFFNVFISNIEMAFTKSDMSIAHAYSQLCDDERLREQIMTAVT HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHC DEHELTHSGLNSLLNQESLLEHQQNLAASLEWRNAYLDPTNYIQIELLKRARQKDATSDT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC NHGDLDVEDPLIRSINALAAGLRNTG CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11823852 [H]