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The map label for this gene is tsgA [H]

Identifier: 89256459

GI number: 89256459

Start: 1077263

End: 1078471

Strand: Reverse

Name: tsgA [H]

Synonym: FTL_1134

Alternate gene names: 89256459

Gene position: 1078471-1077263 (Counterclockwise)

Preceding gene: 89256460

Following gene: 89256458

Centisome position: 56.88

GC content: 31.51

Gene sequence:

>1209_bases
ATGGAAAATATAACACACGATTCATCATCACTGAAAAATAAATTGCTTATAACATTTATCTGTTATCTTTGTTACTTTTA
TACTGCAAATATAGTGCTAGTAACAGGCGCGGTAATGCAGCCATTATCAGAATATTTTCATAACAGCAATATTGGCTTTG
CTTTTACATTTATTAATGTCGCAATGTGGTTTGCGATATTGATTATAGGTATTTTGATGAATAGATTCTCTATAAAATTA
TTACTAATTGCTGCTACCGCAATAGGGATTATATCATCATTAATCACTACTTTAACTCCATCAATGCTTACTCTTAAAAT
ACTACTTACTTGTGTAGGTATCACTGGGGGTCTTTTTATGGCTATCGCAAGCTATATGATTGTGCATATCTATAATGACC
ATAAAATAAGAGCGATGAATGTGATTTTTACTGACTTTTTCTTTAGCTTCGGTGGTGCTTTGATACCAATATTTGCTGCT
TATCTTATAACTCAAAACTTTGAATGGTACACTATTTATCTAATATTACAAGTAACTGCTGTAATTATCTTAGTCTTAGT
AATATTTTCAGATTTCACAATACTTAATCGTCACAATATTGCTAAAAAGATAAAACCAAGTTTAAGTTTCTCAACATGGA
ATTTTAGCTTGTATTGTGTAGCTTTTGCAGCTTTCTTATTCTTGTTGGCTCAATTAACTATGACTAGTTACGCTCAATCA
TATTTCCAAGAAATATTAGGTTGGGGCACTATCGATGCAAACAAACCTCTTTCTTATTTCTGGACAGCACAATGTGTAGG
TCTGTTTATTAGCCCAATAATAACTAGATTTATCCCATTAAAATATATTCTACTAACATTTATACTGATAGGACTAGCTG
TTTTATCTTGTATTTTATATATCCCTGATATGAGTACAGTCTTTAAAGCCGCAATTATTTTTGGATTATTCAACTGTTAT
ATTTATGCAGGTCTACTAGCTTATGGAACTTTCCAAATGGAAAATGCCCCGCCAACACTAATTACAACCATTCTTTTATT
TGGTACAACAGGCACTGCTCTTTCTACTACAACCGGAGCTTTTATAAACCAATACTTTGGACTTACTAGTGTAATGCATG
CCGTGGTAATCTTTTATATAATATCTATTAGCTGTTCTATTCTCAAAAGAACAAAAGAATGCCTAACACTCAAACTATCA
TTTTCCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCTATTATTTGCATAAAAGAATAGCAGATCAGAAGCTTGCTAAAAATAGCTGTATATGCAAAAATAATACTTTAATATC
TTAATTATGCAAAATTTGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATAGATATAAGTTCTTTTAGTTATAAAATAGCTAACTAATAATGTATATTTATATAAAACTTAATTAAAACAGCATAT
TGATAAATTATGAAAAAACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 402; Mature: 402

Protein sequence:

>402_residues
MENITHDSSSLKNKLLITFICYLCYFYTANIVLVTGAVMQPLSEYFHNSNIGFAFTFINVAMWFAILIIGILMNRFSIKL
LLIAATAIGIISSLITTLTPSMLTLKILLTCVGITGGLFMAIASYMIVHIYNDHKIRAMNVIFTDFFFSFGGALIPIFAA
YLITQNFEWYTIYLILQVTAVIILVLVIFSDFTILNRHNIAKKIKPSLSFSTWNFSLYCVAFAAFLFLLAQLTMTSYAQS
YFQEILGWGTIDANKPLSYFWTAQCVGLFISPIITRFIPLKYILLTFILIGLAVLSCILYIPDMSTVFKAAIIFGLFNCY
IYAGLLAYGTFQMENAPPTLITTILLFGTTGTALSTTTGAFINQYFGLTSVMHAVVIFYIISISCSILKRTKECLTLKLS
FS

Sequences:

>Translated_402_residues
MENITHDSSSLKNKLLITFICYLCYFYTANIVLVTGAVMQPLSEYFHNSNIGFAFTFINVAMWFAILIIGILMNRFSIKL
LLIAATAIGIISSLITTLTPSMLTLKILLTCVGITGGLFMAIASYMIVHIYNDHKIRAMNVIFTDFFFSFGGALIPIFAA
YLITQNFEWYTIYLILQVTAVIILVLVIFSDFTILNRHNIAKKIKPSLSFSTWNFSLYCVAFAAFLFLLAQLTMTSYAQS
YFQEILGWGTIDANKPLSYFWTAQCVGLFISPIITRFIPLKYILLTFILIGLAVLSCILYIPDMSTVFKAAIIFGLFNCY
IYAGLLAYGTFQMENAPPTLITTILLFGTTGTALSTTTGAFINQYFGLTSVMHAVVIFYIISISCSILKRTKECLTLKLS
FS
>Mature_402_residues
MENITHDSSSLKNKLLITFICYLCYFYTANIVLVTGAVMQPLSEYFHNSNIGFAFTFINVAMWFAILIIGILMNRFSIKL
LLIAATAIGIISSLITTLTPSMLTLKILLTCVGITGGLFMAIASYMIVHIYNDHKIRAMNVIFTDFFFSFGGALIPIFAA
YLITQNFEWYTIYLILQVTAVIILVLVIFSDFTILNRHNIAKKIKPSLSFSTWNFSLYCVAFAAFLFLLAQLTMTSYAQS
YFQEILGWGTIDANKPLSYFWTAQCVGLFISPIITRFIPLKYILLTFILIGLAVLSCILYIPDMSTVFKAAIIFGLFNCY
IYAGLLAYGTFQMENAPPTLITTILLFGTTGTALSTTTGAFINQYFGLTSVMHAVVIFYIISISCSILKRTKECLTLKLS
FS

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily. TsgA family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789764, Length=402, Percent_Identity=27.6119402985075, Blast_Score=135, Evalue=4e-33,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44990; Mature: 44990

Theoretical pI: Translated: 8.71; Mature: 8.71

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
2.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENITHDSSSLKNKLLITFICYLCYFYTANIVLVTGAVMQPLSEYFHNSNIGFAFTFINV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
AMWFAILIIGILMNRFSIKLLLIAATAIGIISSLITTLTPSMLTLKILLTCVGITGGLFM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIASYMIVHIYNDHKIRAMNVIFTDFFFSFGGALIPIFAAYLITQNFEWYTIYLILQVTA
HHHHHHHHEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
VIILVLVIFSDFTILNRHNIAKKIKPSLSFSTWNFSLYCVAFAAFLFLLAQLTMTSYAQS
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFQEILGWGTIDANKPLSYFWTAQCVGLFISPIITRFIPLKYILLTFILIGLAVLSCILY
HHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPDMSTVFKAAIIFGLFNCYIYAGLLAYGTFQMENAPPTLITTILLFGTTGTALSTTTGA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
FINQYFGLTSVMHAVVIFYIISISCSILKRTKECLTLKLSFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MENITHDSSSLKNKLLITFICYLCYFYTANIVLVTGAVMQPLSEYFHNSNIGFAFTFINV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
AMWFAILIIGILMNRFSIKLLLIAATAIGIISSLITTLTPSMLTLKILLTCVGITGGLFM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIASYMIVHIYNDHKIRAMNVIFTDFFFSFGGALIPIFAAYLITQNFEWYTIYLILQVTA
HHHHHHHHEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
VIILVLVIFSDFTILNRHNIAKKIKPSLSFSTWNFSLYCVAFAAFLFLLAQLTMTSYAQS
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFQEILGWGTIDANKPLSYFWTAQCVGLFISPIITRFIPLKYILLTFILIGLAVLSCILY
HHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPDMSTVFKAAIIFGLFNCYIYAGLLAYGTFQMENAPPTLITTILLFGTTGTALSTTTGA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
FINQYFGLTSVMHAVVIFYIISISCSILKRTKECLTLKLSFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA