Definition | Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_007880 |
Length | 1,895,994 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 89256270
Identifier: 89256270
GI number: 89256270
Start: 893900
End: 895159
Strand: Reverse
Name: 89256270
Synonym: FTL_0919
Alternate gene names: NA
Gene position: 895159-893900 (Counterclockwise)
Preceding gene: 89256271
Following gene: 89256269
Centisome position: 47.21
GC content: 25.71
Gene sequence:
>1260_bases ATGAGAAATTCTATAAAAATTTCAAAAGTAAATATTAATTTTAATCAGCCTAAAGGTTTACATATCATTGCTTTTATGAT TTTTTGCCTATGTTTATGTATTGCTCCTTTTATGACTATATTAAATGGCTATGGTAATATCAACTTCTTCTATAATCGTA ATGATCATCTTTTTGTGATATTTTTTGCTGGAATTTTTGGCTGTATTAGTAACTATATTTTTGGTTCAACTAAATCAATT ATTCATGGCTTACAATTCATAATAGTAGCAATCGTTTTATCTTTTATTCACAATATGGTTTTATTTAGTTGTGCTACATT ATGGATTGGTCTTGCAATAGTTATCGTTAATCTACTTTTTAACTTAAGTGCTTTTTATCTAAAGACAGATATTCGCAGAA TATATGGTTTTATTGGTGTATACTCAAGTGCTTTACTTGGAATTGCTACGGGAATTATTATTTACTTCTTAGTTCTTAAA AATATGTACCATTTTAAAATTCTTTACCTTTTAATAATAATATTTTTATTATTATTTTTCCTTAAAAACAGTTATAAGCT TAATACCTCATTAACAAGCCAAACAGAAAGGATCAACATAAGCTTTTATGGCGTACTGTTGATTTTCTTTATATTTGCAT TTATACTTTTTTATCTACTTGTTAATCTAAATGTTTTTAGCAGTCTAAACTTAGTTATATTACCCTTATCACTAATATAC TTACATGTTATTACGGTTACTAATAACAAAGAGAACGGTAAAAATCTCTTAAAATACATTTACTTTAGCCTAGCACTTAT AGTCATTAACAAAATCTTTTATCTTAGTTTTCTCCGATACGAAGATGTAGTAGATCCAATATATCTAAATTCTGCTATTA GTACTTTTTTATTTTTACTAGCTGAATATTTGTTATGCATAATAATATATTTTGGCTGGAGGTTTAAATTTATAGCTCTG CGCATTGAGTCAATCACTAACTCACATATCATCAAAACGATGTTGTATATCGAAGCTATCCGAGTGTTTATCTTGATAAC AGCTATTTTTACAAATAATATTCTTATCAGTAATATAATCCTTATATTTGCTACAATTTTATCTTTGGTTTTAAATATTT TTATCGTGCCAATATATTTTTCTCTTGGTAAAATACTCGCCAGTGGCAAAAATGAAATTATTACTACAACTCTAATATAT CTAATATTCTCGTCACTAATATTTGTATCTTTCTTGTATGATATTTCTATTAGTTTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGACTATCTTGCAGAAGAAATGTGGAAATCACAAAAATATAATACTCTCCCAGACGAACAAAACTATTTAACCAAACTA CAAGAGTTAACACTTATATA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAATTTTCTTGTAAATTCAGCTTTATTCCCCATATTTAACGTTATGTAATTATGTTATAATTAGTTGCTAATAAAACTT TATTGACTATACAAGATAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 419
Protein sequence:
>419_residues MRNSIKISKVNINFNQPKGLHIIAFMIFCLCLCIAPFMTILNGYGNINFFYNRNDHLFVIFFAGIFGCISNYIFGSTKSI IHGLQFIIVAIVLSFIHNMVLFSCATLWIGLAIVIVNLLFNLSAFYLKTDIRRIYGFIGVYSSALLGIATGIIIYFLVLK NMYHFKILYLLIIIFLLLFFLKNSYKLNTSLTSQTERINISFYGVLLIFFIFAFILFYLLVNLNVFSSLNLVILPLSLIY LHVITVTNNKENGKNLLKYIYFSLALIVINKIFYLSFLRYEDVVDPIYLNSAISTFLFLLAEYLLCIIIYFGWRFKFIAL RIESITNSHIIKTMLYIEAIRVFILITAIFTNNILISNIILIFATILSLVLNIFIVPIYFSLGKILASGKNEIITTTLIY LIFSSLIFVSFLYDISISL
Sequences:
>Translated_419_residues MRNSIKISKVNINFNQPKGLHIIAFMIFCLCLCIAPFMTILNGYGNINFFYNRNDHLFVIFFAGIFGCISNYIFGSTKSI IHGLQFIIVAIVLSFIHNMVLFSCATLWIGLAIVIVNLLFNLSAFYLKTDIRRIYGFIGVYSSALLGIATGIIIYFLVLK NMYHFKILYLLIIIFLLLFFLKNSYKLNTSLTSQTERINISFYGVLLIFFIFAFILFYLLVNLNVFSSLNLVILPLSLIY LHVITVTNNKENGKNLLKYIYFSLALIVINKIFYLSFLRYEDVVDPIYLNSAISTFLFLLAEYLLCIIIYFGWRFKFIAL RIESITNSHIIKTMLYIEAIRVFILITAIFTNNILISNIILIFATILSLVLNIFIVPIYFSLGKILASGKNEIITTTLIY LIFSSLIFVSFLYDISISL >Mature_419_residues MRNSIKISKVNINFNQPKGLHIIAFMIFCLCLCIAPFMTILNGYGNINFFYNRNDHLFVIFFAGIFGCISNYIFGSTKSI IHGLQFIIVAIVLSFIHNMVLFSCATLWIGLAIVIVNLLFNLSAFYLKTDIRRIYGFIGVYSSALLGIATGIIIYFLVLK NMYHFKILYLLIIIFLLLFFLKNSYKLNTSLTSQTERINISFYGVLLIFFIFAFILFYLLVNLNVFSSLNLVILPLSLIY LHVITVTNNKENGKNLLKYIYFSLALIVINKIFYLSFLRYEDVVDPIYLNSAISTFLFLLAEYLLCIIIYFGWRFKFIAL RIESITNSHIIKTMLYIEAIRVFILITAIFTNNILISNIILIFATILSLVLNIFIVPIYFSLGKILASGKNEIITTTLIY LIFSSLIFVSFLYDISISL
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 48201; Mature: 48201
Theoretical pI: Translated: 9.65; Mature: 9.65
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRNSIKISKVNINFNQPKGLHIIAFMIFCLCLCIAPFMTILNGYGNINFFYNRNDHLFVI CCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEH FFAGIFGCISNYIFGSTKSIIHGLQFIIVAIVLSFIHNMVLFSCATLWIGLAIVIVNLLF HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLSAFYLKTDIRRIYGFIGVYSSALLGIATGIIIYFLVLKNMYHFKILYLLIIIFLLLFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKNSYKLNTSLTSQTERINISFYGVLLIFFIFAFILFYLLVNLNVFSSLNLVILPLSLIY HCCCCEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LHVITVTNNKENGKNLLKYIYFSLALIVINKIFYLSFLRYEDVVDPIYLNSAISTFLFLL HHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH AEYLLCIIIYFGWRFKFIALRIESITNSHIIKTMLYIEAIRVFILITAIFTNNILISNII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LIFATILSLVLNIFIVPIYFSLGKILASGKNEIITTTLIYLIFSSLIFVSFLYDISISL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MRNSIKISKVNINFNQPKGLHIIAFMIFCLCLCIAPFMTILNGYGNINFFYNRNDHLFVI CCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEH FFAGIFGCISNYIFGSTKSIIHGLQFIIVAIVLSFIHNMVLFSCATLWIGLAIVIVNLLF HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLSAFYLKTDIRRIYGFIGVYSSALLGIATGIIIYFLVLKNMYHFKILYLLIIIFLLLFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKNSYKLNTSLTSQTERINISFYGVLLIFFIFAFILFYLLVNLNVFSSLNLVILPLSLIY HCCCCEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LHVITVTNNKENGKNLLKYIYFSLALIVINKIFYLSFLRYEDVVDPIYLNSAISTFLFLL HHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH AEYLLCIIIYFGWRFKFIALRIESITNSHIIKTMLYIEAIRVFILITAIFTNNILISNII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LIFATILSLVLNIFIVPIYFSLGKILASGKNEIITTTLIYLIFSSLIFVSFLYDISISL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA