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Definition Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome, complete genome.
Accession NC_007880
Length 1,895,994

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The map label for this gene is 89255996

Identifier: 89255996

GI number: 89255996

Start: 584777

End: 586006

Strand: Direct

Name: 89255996

Synonym: FTL_0598

Alternate gene names: NA

Gene position: 584777-586006 (Clockwise)

Preceding gene: 89255995

Following gene: 89255997

Centisome position: 30.84

GC content: 22.52

Gene sequence:

>1230_bases
GTGTACATAAAAAAAGTGTCTTTTAAAATTTTATATTTATATTTACTAGCTTTTTGTATTATTTTTAGTTTAGAATTTAA
ATTTGCTATATTGAATATTATAGTTTATCTTCCGGCTTGTATTTTGGGTTTTTTAGCTCTTAAAAAACTATTTGTCGGAA
ATATTGTTAAGAAACAATTAGCTTTCCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTATCAATGATTTATTTAATAATAGTCCAAATAATC
TTACTTGATGCAGCATCATTGTTTCCTCAGTTTTTATTTAACATTTTGATCGCGATAGGTTTTTGTAACTTTATTTTTGT
TTCATATGATAATAATGAAAATTATTTTTTTAATATGTCTAAAATAATATTTTTTGTTACTTTCTTACAATCTATTTTTG
TATTTCTTTCAAGGTATTATATATTTTTAAATGATTGGATATTCTTTTTTTTAGTGAAAAAAGGGAATATTGAGATTTCG
AATGTTATTGAATATAAGTTAAGAGTATTCGGACTTAGTAACGCTGGAGGGGATGGTTTAGGATTTTCAATTACTATAGG
ATTATGTTTTTCTATATTTTATTTTATCAAATATATTAAAGGTAAATCTATATTTACCAAACTTATGCTGTTTGTACCTT
TAATTCTTATTGTGTTTTCTAATATTTTCATATCTAGAACATCACTCTTAACTTCTTCACTTATATTGTTAATAACAATA
TTTTATATATATATTAAAAAAGAAAAATTACTGTTTATTATAATATTGGCGCTATTCTTTTTATCAATATGGATATTGTT
CAAATTAAATTTGAATTTGAGTTGGGCTTTTGAAAATATTTACTCGTACATTCAATCTGGCGATTTTTCACATGGAAGTC
TAAGTGTTTTAATCAATAAAATGCTTTTTGTGCCAGATAACCTTTTGACTTGGATATTTGGTTGTGAGGATGTTAGTAAT
ACTGATATTGGTTATATTAAATATTTATACTATTATGGGATTATATTTAGTATGTTTTTTTATATTCTTATTATTTTCTT
GTACTTTGAAATGAGAAAATGTTTTATATCTTCAGAGTATCGATCATTATTTCTATTGTTGTTAATAGTATGTTTAGTTT
TTCAAGCAAAAATAATTTTTTTGACAGTAGGATTATTTACTAAATTAACCATTATATTATTTATTTTTTCTCTTAAAGAA
AACAGCTTTACAACTAGGAGTGTGATTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTAGGAATATGCTCGGATATAATCCGGAATATGATTTTGAATTAGGCATAAAGCATGCTGTTGAGTGGTATTTAATTAA
TTAAATGGTATTTTAATCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGGTTTGTACATTTAATAATAAACCTTAACCAAGGTGGTGCTGAAACAATGCTTTATAAACTTTGCAAATCTATGGAT
AAGTCAATATATCATATTAC

Product: membrane protein/O-antigen protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 409; Mature: 409

Protein sequence:

>409_residues
MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQLAFLFFFFFLSMIYLIIVQII
LLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMSKIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEIS
NVIEYKLRVFGLSNAGGDGLGFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI
FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINKMLFVPDNLLTWIFGCEDVSN
TDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEYRSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKE
NSFTTRSVI

Sequences:

>Translated_409_residues
MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQLAFLFFFFFLSMIYLIIVQII
LLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMSKIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEIS
NVIEYKLRVFGLSNAGGDGLGFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI
FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINKMLFVPDNLLTWIFGCEDVSN
TDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEYRSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKE
NSFTTRSVI
>Mature_409_residues
MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQLAFLFFFFFLSMIYLIIVQII
LLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMSKIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEIS
NVIEYKLRVFGLSNAGGDGLGFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI
FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINKMLFVPDNLLTWIFGCEDVSN
TDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEYRSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKE
NSFTTRSVI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48060; Mature: 48060

Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.7 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLFFFFFLSMIYLIIVQIILLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEHH
KIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEISNVIEYKLRVFGLSNAGGDGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCC
GFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
MLFVPDNLLTWIFGCEDVSNTDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEY
HHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKENSFTTRSVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure
MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLFFFFFLSMIYLIIVQIILLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEHH
KIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEISNVIEYKLRVFGLSNAGGDGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCC
GFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
MLFVPDNLLTWIFGCEDVSNTDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEY
HHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKENSFTTRSVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA