| Definition | Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007799 |
| Length | 1,176,248 |
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The map label for this gene is 88657948
Identifier: 88657948
GI number: 88657948
Start: 963760
End: 967809
Strand: Reverse
Name: 88657948
Synonym: ECH_0945
Alternate gene names: NA
Gene position: 967809-963760 (Counterclockwise)
Preceding gene: 88658523
Following gene: 88658549
Centisome position: 82.28
GC content: 32.32
Gene sequence:
>4050_bases ATGTTAAAATATTGTGTTACTGATAGTAGTAGAGAACGTTCTATCCCGCAATGTACTACTCAATGTGATAAAACAAGCCG TACTATTACTGATTTTAATGGTCGAAAGCCGTATATGATAAAAAGATATTTTGTTCAATTTGGTTCTCATAAAGAGATTA TAAAAGACTTAAATGATAGGGTAAGACACGTATATATTGAAATGTGTGATCTTATTAATCAGTTGTCTAAAGAAGATAGT AGGGCTTTCTTTTCTACTTTGTGCTCTTCTTGTATGACAAGTTTTTTTTATGACTTGAGCTATCTTCAATATGACTTGAG TATTTTTCTTGGATGTCAATCGCGTTTATTGGAAAAGGTACCTAATATTGTAATCAGTGAAGATACGCTGTGTAAATTGT GTGAAGATCTTGTATCGAATTACTTTAGTATTAATAATATTTTGTTATCAGATGCAGCTGTTTCTTCAGAACAAGCAATA GAAAGTGCAGGTAGTGCTACTGCTTCTACTGGGGTAGGCTCTGTAAGTAAACAGCAAGATATGGGTGGTGGTCTTGGTGT TGTTAGTGATGGTAACACATTGTTGATAGGCGGACAGATGGAATCTGTATTATGTGTAATGAGACAGACGCAAAATATTT TACTAAGATTGCAACGGCAATGTCATAGTTCTAATCAATTTATGGCGAGTTCTGTAGATTTTCCTTCTGAACAATTTAGC GATGTAAAAGTAGGGATACATAATTTTCAAATATCTCTGGATAATATGTTTAGGATATTGAAAAGGTTAAATAGTGTGTT GAATATAATATTATTGGAAAATGAAGAAAAAAAGTCGGAATTTTCAGCCATAGAATCAAGCATATGTCAGAATGGTAGTG ACCCTAGATTGGTTAAAGTATTGATTCTAAATCATATGTTAAATCAAAAGAGATCTAGATTATCTAGGATGAGTTATCAA AGTGTGTCTAGCTCAAGAGAAAGAGAATCGTGTGATTCTATAGATATGAATGAAACGGTTGAACATGTGGTACTAACGAG TGAAGAATATAGTACTCAATTCTCAGAGATTAGTTATGGTAGTGATGAATGTTTTGAGGAAAATAAATCAGGTAGTGCTA GCAGTGTAGCAGATGGCAGAAGTATAGCAGATGGCTTAAGATATGATATTCCTTTGAAAAAGCCTATACCTGTGAATGTT GTTGATCAGAAGATGAGTGGTACGGATGTTCCATCATGTGGTGGGGAATGCGATATCCATTCTTCAAAAATTAATGATAG TAGTAGTCAACGTTTTGGAAAGTATAAGTTGAATAGTACTAGTAGTGTAGCAGATGGCTTAAGATATGATATTCCTTTGA AAAAGCCTATACCTGTGAATGTTGTTGATCAGAAGATGAGTGGTACGGATGTTCCATCATGTGGTGAGGAATGCGATATC CATTCTTCAAAAATTAATGATAGTAGTAGTCAACGTTTTGGAAAGTATAAATTGAATAGTACTAGTAGTGTAGCAGATGG CTCAAGATATGATGTTCCTTTAAAGATGCCTATGCCTGTGAATATTGTTGATCAGAAGATGAGTGGTATGAATGTTCCAT CATGTGGTGAGGAATGCAATATCCATTCTTCAAAAATTGATGATAGTAGTAGTCAACATTTTGGAAAGGACAAATTGAAT AGTACTAGCAGTGTAGCAGATGGCTCAAGATATGATGTTCCTTTAAAAAAGCCTATACCTGTGAATGTTGTTGATCAAAG AATAACTGATATGAGTGTTCCATCAACTAGTGGAGAAACTAACGTTGATTTCTTTTCGTCAATAGATGGTCATTTTACTA TTACAAGTGAATCTGGTCAGCTGGTGGAGTCTGCAACGTTACACTTTGGTTCAGATGTTAAGGTAGAATGCGGTCAGAGT ATCTCAAGTAATATCCAAAGTAGCTTTGTTGTACAAGATGGAGTGACTAGTGAAAGAGATTGTATTTCTGATAAGATGTG TACGCTTGTAAATCATCAAGTATTTCAGTACATGAAAAGTGAAGAAGGTAGGAATGATTTGTTAAAAATATTGATTGATG ATGTGGGTGGTATTGATCGATTAGTTAAGGTATTAGTTCCAGAAATAGGTAAGGATGCTCTTATAGATATGTTCCCTACT ATGTCTTTATTTGATATTGAAAGTAACCTAAGTGATGTTGTTATGAAAGATGATGAAGGTGTTTTTATAAGGTATTGTAA GGATGGTAAATTGAAGCCAATGCATTTATTACAAGAGTTTATCTCTTATGTGAATACCAGAAATCAGGGGGAAATTGAAG AGACTGTAGTATCAGAACAATTGCATGGTACTATAAGTAAGCATTTGAGATCTAATATAAGAAGCTACAGTAGAAGTAGA GACGTTGTTTTAAGAAGAAGTAATTCGGCTAGAATAAGTGGTGAACAACGTTTTGAAAATATTATGGTTTGTCAAGATAT TAATGTCACAGATGATATTGCTGGTCATATAAAATGTAAAAGTTCGGATGTTGTGTTAACAAATAGTGGGACTAGAAAAT CACAGTCTTTTAGAGGTGTATCTCAATTGTATTCTAAAGAACGCCCTTTACTTGTTGATTATGCAAGATCATATGACTGT TCAAGTAGACAAGATGTTTCACTTGGTTGTGTTTCAAGTTTGAAGAGATCTATATTTAACAAAGGGAGTAATTTAAGCTG TAGGTATGTAATTTATAATGATGTTATGTTAGGGGATTTTGTAAAAAATACATTTGATAATTTGCGTAAATCTGTCAGCA CGGTTTTAAAGTTTACAGATAAACTATCTATGCAAGATGATAGTATCTTATTGCATTGGGTCTTGTTCTGTATAATAAAT AACCCAAATTTTGATAAGTGTGAATCTGTTATTATGAACGATTTAAAGTCGTGTCGTTTGTATTATAAAATGATTATTTC AGTATATCATTTGTATTATAACAAAATTACTTCAGTGCCTAATTGTCAAAATTTACTTTTACATGTTAAGAATCTACAAG ATATGTGCTGGGTAGGTTCTTATGTGAAACCTATTCATACTTTATTTCATAAAGGAGAAATGAAGGGTGTATATTTTTGT GTTGGTAAGGATTATGTAAAATGTAAAATACAACAATATATAGGTACGATAAATGTAAGTAGTGTTGCTAAGTTAAGAGA GGTCTTTAAGGTTATCGATTTAGAAAGTATTACTCAAGAGAATCTTGATTCATTTGTAGTAAAGGATAATTTAATTGTCT CGTTTAAGTATTTTAAATCTGCTAGTGGTAATTGTCGGTTAGATGCATCTAAATATAGTAATGTAATTATAAAAGGTGAC ATTCCTGTACATGTGACTTTGCATTGTAATAATGTTTTTGTATATGGTAATGTGAAGGGAAGATTGTTGTCGTGTCGTGA TTCAGTAAGAATTGAGGGATCAGTTAGTGGGAGTATTGAAGCTAAACACAGTGGAATAGATACATCTATGGTTTTCATTG CAGGTAATGTAGAAAAATCTTCAATAGTAAAAGTTGAAAACAGTGTAGTGGAAGTTTGTGGCAATGTTTATGGTAATATT GAAGTAAGAAGTAGTAATGTCATACTAAGGGGAAATGTATATAAAGGAAGTTGTGTAGTTGTTATGCTTGGAATGTATTT ATATTTTTCTTCCATTGCTAAGGGTAATTTTTTTCTAAGGGGAATAAAGCACGTATTTATTAATGGAATTATTGACACTA GTAATTTATGTGCGCATGAATGTAATTTTTATATTAAAGAAAATAGAATATTTAAACTTAGTAATGCATGTATAGATTGT GAAGTCAAGTTTTTATCTCGTGACCTTGATGTACTAGAGTTACAAAGTGTAATGAATAAAAAAGTGCTTGAGAGAGATAC TGAAAGTATACAAACCAAAGCTCTGTGTAATCAAGCAATTAACATAGATCAGGGTAGTCATATGCAGCAAGTTAGTCACT GTGTTCATGATGTCAAAATTAATCACTTGTCAGATTTAATGACAATATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GACAATTGTTTAATGGAAAATAGATGAGGGAACTTTTGTATAAAAATAGTAAAGATATTAATTATCATAGTAAAATTTTT GATAATTTGAGTTTGTGCTG
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTACAACTTTAGATTATTTCTATGACAATTACTAAATTGTTGTATGAACACCAAAGGATATATTATTGTCTATTATTA CGAGTATTTATTGAAGATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1349; Mature: 1349
Protein sequence:
>1349_residues MLKYCVTDSSRERSIPQCTTQCDKTSRTITDFNGRKPYMIKRYFVQFGSHKEIIKDLNDRVRHVYIEMCDLINQLSKEDS RAFFSTLCSSCMTSFFYDLSYLQYDLSIFLGCQSRLLEKVPNIVISEDTLCKLCEDLVSNYFSINNILLSDAAVSSEQAI ESAGSATASTGVGSVSKQQDMGGGLGVVSDGNTLLIGGQMESVLCVMRQTQNILLRLQRQCHSSNQFMASSVDFPSEQFS DVKVGIHNFQISLDNMFRILKRLNSVLNIILLENEEKKSEFSAIESSICQNGSDPRLVKVLILNHMLNQKRSRLSRMSYQ SVSSSRERESCDSIDMNETVEHVVLTSEEYSTQFSEISYGSDECFEENKSGSASSVADGRSIADGLRYDIPLKKPIPVNV VDQKMSGTDVPSCGGECDIHSSKINDSSSQRFGKYKLNSTSSVADGLRYDIPLKKPIPVNVVDQKMSGTDVPSCGEECDI HSSKINDSSSQRFGKYKLNSTSSVADGSRYDVPLKMPMPVNIVDQKMSGMNVPSCGEECNIHSSKIDDSSSQHFGKDKLN STSSVADGSRYDVPLKKPIPVNVVDQRITDMSVPSTSGETNVDFFSSIDGHFTITSESGQLVESATLHFGSDVKVECGQS ISSNIQSSFVVQDGVTSERDCISDKMCTLVNHQVFQYMKSEEGRNDLLKILIDDVGGIDRLVKVLVPEIGKDALIDMFPT MSLFDIESNLSDVVMKDDEGVFIRYCKDGKLKPMHLLQEFISYVNTRNQGEIEETVVSEQLHGTISKHLRSNIRSYSRSR DVVLRRSNSARISGEQRFENIMVCQDINVTDDIAGHIKCKSSDVVLTNSGTRKSQSFRGVSQLYSKERPLLVDYARSYDC SSRQDVSLGCVSSLKRSIFNKGSNLSCRYVIYNDVMLGDFVKNTFDNLRKSVSTVLKFTDKLSMQDDSILLHWVLFCIIN NPNFDKCESVIMNDLKSCRLYYKMIISVYHLYYNKITSVPNCQNLLLHVKNLQDMCWVGSYVKPIHTLFHKGEMKGVYFC VGKDYVKCKIQQYIGTINVSSVAKLREVFKVIDLESITQENLDSFVVKDNLIVSFKYFKSASGNCRLDASKYSNVIIKGD IPVHVTLHCNNVFVYGNVKGRLLSCRDSVRIEGSVSGSIEAKHSGIDTSMVFIAGNVEKSSIVKVENSVVEVCGNVYGNI EVRSSNVILRGNVYKGSCVVVMLGMYLYFSSIAKGNFFLRGIKHVFINGIIDTSNLCAHECNFYIKENRIFKLSNACIDC EVKFLSRDLDVLELQSVMNKKVLERDTESIQTKALCNQAINIDQGSHMQQVSHCVHDVKINHLSDLMTI
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 150872; Mature: 150872
Theoretical pI: Translated: 6.78; Mature: 6.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
3.5 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 6.3 %Cys+Met (Translated Protein) 3.5 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 6.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKYCVTDSSRERSIPQCTTQCDKTSRTITDFNGRKPYMIKRYFVQFGSHKEIIKDLNDR CEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH VRHVYIEMCDLINQLSKEDSRAFFSTLCSSCMTSFFYDLSYLQYDLSIFLGCQSRLLEKV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PNIVISEDTLCKLCEDLVSNYFSINNILLSDAAVSSEQAIESAGSATASTGVGSVSKQQD CCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHH MGGGLGVVSDGNTLLIGGQMESVLCVMRQTQNILLRLQRQCHSSNQFMASSVDFPSEQFS CCCCEEEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHCC DVKVGIHNFQISLDNMFRILKRLNSVLNIILLENEEKKSEFSAIESSICQNGSDPRLVKV CEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH LILNHMLNQKRSRLSRMSYQSVSSSRERESCDSIDMNETVEHVVLTSEEYSTQFSEISYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHCCCC SDECFEENKSGSASSVADGRSIADGLRYDIPLKKPIPVNVVDQKMSGTDVPSCGGECDIH CHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC SSKINDSSSQRFGKYKLNSTSSVADGLRYDIPLKKPIPVNVVDQKMSGTDVPSCGEECDI CCCCCCCHHHCCCCEECCCCHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC HSSKINDSSSQRFGKYKLNSTSSVADGSRYDVPLKMPMPVNIVDQKMSGMNVPSCGEECN CCCCCCCCHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCC IHSSKIDDSSSQHFGKDKLNSTSSVADGSRYDVPLKKPIPVNVVDQRITDMSVPSTSGET CCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCC NVDFFSSIDGHFTITSESGQLVESATLHFGSDVKVECGQSISSNIQSSFVVQDGVTSERD CCHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHHCEEEECCCCCHHH CISDKMCTLVNHQVFQYMKSEEGRNDLLKILIDDVGGIDRLVKVLVPEIGKDALIDMFPT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCC MSLFDIESNLSDVVMKDDEGVFIRYCKDGKLKPMHLLQEFISYVNTRNQGEIEETVVSEQ CEEEECCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH LHGTISKHLRSNIRSYSRSRDVVLRRSNSARISGEQRFENIMVCQDINVTDDIAGHIKCK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEC SSDVVLTNSGTRKSQSFRGVSQLYSKERPLLVDYARSYDCSSRQDVSLGCVSSLKRSIFN CCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC KGSNLSCRYVIYNDVMLGDFVKNTFDNLRKSVSTVLKFTDKLSMQDDSILLHWVLFCIIN 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CEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH VRHVYIEMCDLINQLSKEDSRAFFSTLCSSCMTSFFYDLSYLQYDLSIFLGCQSRLLEKV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PNIVISEDTLCKLCEDLVSNYFSINNILLSDAAVSSEQAIESAGSATASTGVGSVSKQQD CCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHH MGGGLGVVSDGNTLLIGGQMESVLCVMRQTQNILLRLQRQCHSSNQFMASSVDFPSEQFS CCCCEEEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHCC DVKVGIHNFQISLDNMFRILKRLNSVLNIILLENEEKKSEFSAIESSICQNGSDPRLVKV CEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH LILNHMLNQKRSRLSRMSYQSVSSSRERESCDSIDMNETVEHVVLTSEEYSTQFSEISYG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHCCCC SDECFEENKSGSASSVADGRSIADGLRYDIPLKKPIPVNVVDQKMSGTDVPSCGGECDIH CHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC SSKINDSSSQRFGKYKLNSTSSVADGLRYDIPLKKPIPVNVVDQKMSGTDVPSCGEECDI CCCCCCCHHHCCCCEECCCCHHHHCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC HSSKINDSSSQRFGKYKLNSTSSVADGSRYDVPLKMPMPVNIVDQKMSGMNVPSCGEECN CCCCCCCCHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCC IHSSKIDDSSSQHFGKDKLNSTSSVADGSRYDVPLKKPIPVNVVDQRITDMSVPSTSGET CCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCC NVDFFSSIDGHFTITSESGQLVESATLHFGSDVKVECGQSISSNIQSSFVVQDGVTSERD CCHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHCCCCCCEEECCCHHHHHHHHCEEEECCCCCHHH CISDKMCTLVNHQVFQYMKSEEGRNDLLKILIDDVGGIDRLVKVLVPEIGKDALIDMFPT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCC MSLFDIESNLSDVVMKDDEGVFIRYCKDGKLKPMHLLQEFISYVNTRNQGEIEETVVSEQ CEEEECCCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH LHGTISKHLRSNIRSYSRSRDVVLRRSNSARISGEQRFENIMVCQDINVTDDIAGHIKCK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEC SSDVVLTNSGTRKSQSFRGVSQLYSKERPLLVDYARSYDCSSRQDVSLGCVSSLKRSIFN CCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHC KGSNLSCRYVIYNDVMLGDFVKNTFDNLRKSVSTVLKFTDKLSMQDDSILLHWVLFCIIN CCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCC NPNFDKCESVIMNDLKSCRLYYKMIISVYHLYYNKITSVPNCQNLLLHVKNLQDMCWVGS 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PDB accession: NA
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General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
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References: NA