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Definition Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome, complete genome.
Accession NC_007681
Length 1,767,403

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The map label for this gene is 84489424

Identifier: 84489424

GI number: 84489424

Start: 719072

End: 720880

Strand: Direct

Name: 84489424

Synonym: Msp_0615

Alternate gene names: NA

Gene position: 719072-720880 (Clockwise)

Preceding gene: 84489423

Following gene: 84489425

Centisome position: 40.69

GC content: 25.21

Gene sequence:

>1809_bases
ATGATAAATAGTTTTAAAAAAGTTATTAAAGATAATAAAATAGAATTATTCTACATTACATTTCTAATAATTTCTCTACT
AGTTATTAGTATTCCTAGATTATTTACACAATACTCTATAGGAATTGGTAATTGGGATACGTATCTTTATTTAGAAAATG
CTCGTAGTTTTGCTAGTATGGGATGGGGTGATGTTGCTAGTATTTCACCTGTTGTTCCATATATATTATCATTATTCTTT
AGAATAATAAATAGTACACCTCAAGAGGCAATATTTAATCTAAGTGTATTGATGTACATAGTAGGAACTGTTAGTTTATA
TTTAATATTTAGATTCAAGTTTAATCATATGATAAGTTATGTTGGAAGTATAATTTATGCAACATTTACCCTACTTTATT
CATGGGTTGCCATTGGAGGTAATGATATAACAGGTGTTTCATTAACATTACTTACAATATATCTTATATTATTAGCACAT
GAAAAAAACAATAAATACTATTATATTGCCATGCCAATAGCGGCATTTGCATTTTTATCAAGATACACAGCAGGAGTAAT
GATTTTTGCAATAATCTTTTATTTATTAATTAATAAAATAAGTAAAAATGAATTTAAAACCTTCATTAAAGGTAGTGTTC
TTGGAGTATTATGTGTTAGTCCATTTCTGTATCATTTCTATAGAATTTTATCCACACCTTTTCCATTTCTGGGACAATTT
AGTGGTACTGTAAATAATACAAAAGTTCTTGATGCAGGATATCTTCCAGATACAATGTATTATATTAAACATATACCTAA
CTACATTACAAGTTATATACCACATACTGGTGCTACCTTTGAAAATGTAGTAAATCCTATGGGTAACATTCCATCTGTTA
TAAGCTATGTTTTTATAATATTATGTATAATTGGAATTTTTTTAATATTCTACAATAGTTATAAATATGTAATTAAAAGT
AATAGAAGACTTTTAACAGGAAATAATCAAATCAATATAATAATAGCACTAATACTTACAATAATATGTCTTATTAGTAT
TAACAGTGTATCATATATCATTACAACAATACTTACACTTTCAGTATTATACATAATAAAGCATATACTGGAGGATTATG
ATATTTGGTACTTAAATTATGATTTATTGATGTTATCCTTGCTACTGGTTTATATAATATTCCAATCAATACTCTCTACT
AAAAATGATCGTTACTTTATCACAGTATTACCATTTATAGCATACTTCATTACAAATGCCCTATATTATATCTATAATTT
CATTGACTTTAAAATTGAAATAAAAAATATTAAAATATCAACAATAATATCTATAGTGATTGTATTGTTCCTTCTTGGAA
ATTCATTATGTTATAATAATAATATTCCAGAAGAAAATCATTTTAATAACATTCAACAGGCATGTAAATGGTTTGATGAT
AATTGTGAATTTGATAATACAACAGTAATTTATTCTGATAATTGGCCTGCAGTATCATGGTATTTGAATGTGTATTGTCG
TAGAGGTGTTCCTGATGTTACTATGGAAAATACTACATGGACATTTACTAAGAATATATTAAAAAGTAATGATGAGCATG
AACCTGCATCATTTTATATTGATACAAATAATGAAAATAAGATGGATTATGTTGGACTTAGTAAGATTAAAAGTATTAAT
GATGTGCAAATCTATCAAAATACCTATGAAAAGGAATATAACATACGAAGTCGTGGTTTACTAGAATATAAAGATTATTA
TAACATGCTATTTAAAGAACATATGAATGAAAGTGATTATTATGATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATATTAAAAAATATAATTTCAATTAGAAACATATGTATAATATAATAAAAAAGAAAAATGTCTTTTGACATTTTAATAA
TTTTTTAGGAGTTTATCTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAACTTTAATTTAAAAAATAAATTATTGATTTTACTTATTATAATATCAAGTATATATACAGCAATTCTAGTACATATTC
AATCAATTATTGGTGTTAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 602; Mature: 602

Protein sequence:

>602_residues
MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASMGWGDVASISPVVPYILSLFF
RIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISYVGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAH
EKNNKYYYIAMPIAAFAFLSRYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF
SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFIILCIIGIFLIFYNSYKYVIKS
NRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTLSVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILST
KNDRYFITVLPFIAYFITNALYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD
NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYIDTNNENKMDYVGLSKIKSIN
DVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDYYD

Sequences:

>Translated_602_residues
MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASMGWGDVASISPVVPYILSLFF
RIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISYVGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAH
EKNNKYYYIAMPIAAFAFLSRYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF
SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFIILCIIGIFLIFYNSYKYVIKS
NRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTLSVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILST
KNDRYFITVLPFIAYFITNALYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD
NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYIDTNNENKMDYVGLSKIKSIN
DVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDYYD
>Mature_602_residues
MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASMGWGDVASISPVVPYILSLFF
RIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISYVGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAH
EKNNKYYYIAMPIAAFAFLSRYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF
SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFIILCIIGIFLIFYNSYKYVIKS
NRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTLSVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILST
KNDRYFITVLPFIAYFITNALYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD
NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYIDTNNENKMDYVGLSKIKSIN
DVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDYYD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70035; Mature: 70035

Theoretical pI: Translated: 7.22; Mature: 7.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASM
CCCHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHC
GWGDVASISPVVPYILSLFFRIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAHEKNNKYYYIAMPIAAFAFLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHH
RYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCC
SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFII
CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LCIIGIFLIFYNSYKYVIKSNRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTL
HHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
SVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILSTKNDRYFITVLPFIAYFITNA
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
LYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD
HHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYI
CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE
DTNNENKMDYVGLSKIKSINDVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDY
ECCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
YD
CC
>Mature Secondary Structure
MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASM
CCCHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHC
GWGDVASISPVVPYILSLFFRIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISY
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAHEKNNKYYYIAMPIAAFAFLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHH
RYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCC
SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFII
CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LCIIGIFLIFYNSYKYVIKSNRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTL
HHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
SVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILSTKNDRYFITVLPFIAYFITNA
HHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
LYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD
HHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYI
CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE
DTNNENKMDYVGLSKIKSINDVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDY
ECCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
YD
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA