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The map label for this gene is 84489425

Identifier: 84489425

GI number: 84489425

Start: 720873

End: 722495

Strand: Direct

Name: 84489425

Synonym: Msp_0616

Alternate gene names: NA

Gene position: 720873-722495 (Clockwise)

Preceding gene: 84489424

Following gene: 84489426

Centisome position: 40.79

GC content: 24.89

Gene sequence:

>1623_bases
ATGATTAATAACTTTAATTTAAAAAATAAATTATTGATTTTACTTATTATAATATCAAGTATATATACAGCAATTCTAGT
ACATATTCAATCAATTATTGGTGTTAGTTATTGGGATATCTTTGTTTATCTGCAAAATTCAATGTTATTTGCTCATATTA
ATATTGGTAGTCAACTTAGTGTTCCTCCAGTATTATCTCTATTAACATCAATACCCTTCAGGATGGGATTTATTTCTGAA
ACAACATTGTTTTGTGTTTCAGGAATATTATTTATTCTATTGATTGTTGGAATTTACTTGTTATTTAATGAGAAATTTTC
ACCAGAACTATCATTTATTGGAAGTTTATTCTTTTCAATGTTATCATTAGTTGTAACATGGGCTGTAACAGGATCAAATG
ATATTCCCTCATTAACATTTAGTGTATGGGCATTATATTTCACTATAAAAGGTTTAAATAAGAGTTTTAACTACTATTAT
CTTGCATTCACATGTTTTCTAATGGCTTTTTTCACTAGATTTACAGAGGGCTTTATTTTAATTGTAATGATAAGTTACAT
ACTTATGAATAAAGATAAATTCAAAGTACAAATAAATAAAAATGATATTTTAAAGCTATTCATGTTCATTGTCTTTCTAT
GTGCTATTATAGGAGGATTTTATCTATATAAACAACATACAATTCCATTTCTAAGTCAATTTATGGAGGTATCTAGTAGT
AGTCAAGTATCTTCAGTTAATATTGGTTATGATTTAAATCCATACTATTATATTGAATATATTCCACAATTATTAACAAG
TACTAATGTAAGTTTGTTGTATGATAAAACACTAACAACAATATACAACACACCTACACTTCTTTCATATGTAATTTTAG
TATTAATGTGTGGTGGTGTTATTTTATCATTTAAAGGAGTATATAAAAAAGAGAATATTCATAATTTCTCCTTTATATTA
GCAGTGATTTTAGGTATTATAACAATAATAACATATCTTCATGTATCTTATATATTTACAGAAATATTATTTACAATAAC
ATTACTGTTATTATATAAATCATCATTAAACAAAATAAATCAAATGGATTTACTTATGATTTTATGGATGGGAATTTTTA
TTATATTACATTCATATCATCCTGTGAAAGTTGATAGATATATTTTACCAACATTCATACCAATAACATACTTCATGATA
AATGGAATAAAAAACATAACAATAAAAAATAAGAAAACACCACTAATAATACTAACAATATTGCTTGTTATACTAATACC
AATTAACTACAGCTACATAAACTCAATAACACATCCAAATCCACAAAGCTATGAAGAAAAACAAGCAGCAACCTGGTTAG
AGGCATATGATAATCAGCTAACAAACTACAATATATCCTCAGATAGGGGAGTAGCATTTAGTTGGTACTTAAAAAAGTAC
ACCTACACAACAATACCAAGAGTATTAGAACAAAACAATGAAACACTAGAAAATAAACTAAAAACAATAAATGCTAAGTA
TTATATTGATGCAACAAGTAACACCACATCAATAGATGGATATCATATAATATACACAAATAATAAAGAGAAATATGGAA
TAAAAATATATCAAAAAGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACCTATGAAAAGGAATATAACATACGAAGTCGTGGTTTACTAGAATATAAAGATTATTATAACATGCTATTTAAAGAACA
TATGAATGAAAGTGATTATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAAAAAAAAATAATATGTATACAAAAGAAGAATTAATAGAAAAAATCATTAAAATAAGAGAAGATATTGGACATGATCA
TGTTCAACCAGAAATAAAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 540; Mature: 540

Protein sequence:

>540_residues
MINNFNLKNKLLILLIIISSIYTAILVHIQSIIGVSYWDIFVYLQNSMLFAHINIGSQLSVPPVLSLLTSIPFRMGFISE
TTLFCVSGILFILLIVGIYLLFNEKFSPELSFIGSLFFSMLSLVVTWAVTGSNDIPSLTFSVWALYFTIKGLNKSFNYYY
LAFTCFLMAFFTRFTEGFILIVMISYILMNKDKFKVQINKNDILKLFMFIVFLCAIIGGFYLYKQHTIPFLSQFMEVSSS
SQVSSVNIGYDLNPYYYIEYIPQLLTSTNVSLLYDKTLTTIYNTPTLLSYVILVLMCGGVILSFKGVYKKENIHNFSFIL
AVILGIITIITYLHVSYIFTEILFTITLLLLYKSSLNKINQMDLLMILWMGIFIILHSYHPVKVDRYILPTFIPITYFMI
NGIKNITIKNKKTPLIILTILLVILIPINYSYINSITHPNPQSYEEKQAATWLEAYDNQLTNYNISSDRGVAFSWYLKKY
TYTTIPRVLEQNNETLENKLKTINAKYYIDATSNTTSIDGYHIIYTNNKEKYGIKIYQKD

Sequences:

>Translated_540_residues
MINNFNLKNKLLILLIIISSIYTAILVHIQSIIGVSYWDIFVYLQNSMLFAHINIGSQLSVPPVLSLLTSIPFRMGFISE
TTLFCVSGILFILLIVGIYLLFNEKFSPELSFIGSLFFSMLSLVVTWAVTGSNDIPSLTFSVWALYFTIKGLNKSFNYYY
LAFTCFLMAFFTRFTEGFILIVMISYILMNKDKFKVQINKNDILKLFMFIVFLCAIIGGFYLYKQHTIPFLSQFMEVSSS
SQVSSVNIGYDLNPYYYIEYIPQLLTSTNVSLLYDKTLTTIYNTPTLLSYVILVLMCGGVILSFKGVYKKENIHNFSFIL
AVILGIITIITYLHVSYIFTEILFTITLLLLYKSSLNKINQMDLLMILWMGIFIILHSYHPVKVDRYILPTFIPITYFMI
NGIKNITIKNKKTPLIILTILLVILIPINYSYINSITHPNPQSYEEKQAATWLEAYDNQLTNYNISSDRGVAFSWYLKKY
TYTTIPRVLEQNNETLENKLKTINAKYYIDATSNTTSIDGYHIIYTNNKEKYGIKIYQKD
>Mature_540_residues
MINNFNLKNKLLILLIIISSIYTAILVHIQSIIGVSYWDIFVYLQNSMLFAHINIGSQLSVPPVLSLLTSIPFRMGFISE
TTLFCVSGILFILLIVGIYLLFNEKFSPELSFIGSLFFSMLSLVVTWAVTGSNDIPSLTFSVWALYFTIKGLNKSFNYYY
LAFTCFLMAFFTRFTEGFILIVMISYILMNKDKFKVQINKNDILKLFMFIVFLCAIIGGFYLYKQHTIPFLSQFMEVSSS
SQVSSVNIGYDLNPYYYIEYIPQLLTSTNVSLLYDKTLTTIYNTPTLLSYVILVLMCGGVILSFKGVYKKENIHNFSFIL
AVILGIITIITYLHVSYIFTEILFTITLLLLYKSSLNKINQMDLLMILWMGIFIILHSYHPVKVDRYILPTFIPITYFMI
NGIKNITIKNKKTPLIILTILLVILIPINYSYINSITHPNPQSYEEKQAATWLEAYDNQLTNYNISSDRGVAFSWYLKKY
TYTTIPRVLEQNNETLENKLKTINAKYYIDATSNTTSIDGYHIIYTNNKEKYGIKIYQKD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62341; Mature: 62341

Theoretical pI: Translated: 9.17; Mature: 9.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MINNFNLKNKLLILLIIISSIYTAILVHIQSIIGVSYWDIFVYLQNSMLFAHINIGSQLS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCCCC
VPPVLSLLTSIPFRMGFISETTLFCVSGILFILLIVGIYLLFNEKFSPELSFIGSLFFSM
CHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LSLVVTWAVTGSNDIPSLTFSVWALYFTIKGLNKSFNYYYLAFTCFLMAFFTRFTEGFIL
HHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
IVMISYILMNKDKFKVQINKNDILKLFMFIVFLCAIIGGFYLYKQHTIPFLSQFMEVSSS
HHHHHHHHHCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCC
SQVSSVNIGYDLNPYYYIEYIPQLLTSTNVSLLYDKTLTTIYNTPTLLSYVILVLMCGGV
CCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
ILSFKGVYKKENIHNFSFILAVILGIITIITYLHVSYIFTEILFTITLLLLYKSSLNKIN
HHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QMDLLMILWMGIFIILHSYHPVKVDRYILPTFIPITYFMINGIKNITIKNKKTPLIILTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHH
LLVILIPINYSYINSITHPNPQSYEEKQAATWLEAYDNQLTNYNISSDRGVAFSWYLKKY
HHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHH
TYTTIPRVLEQNNETLENKLKTINAKYYIDATSNTTSIDGYHIIYTNNKEKYGIKIYQKD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MINNFNLKNKLLILLIIISSIYTAILVHIQSIIGVSYWDIFVYLQNSMLFAHINIGSQLS
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCCCC
VPPVLSLLTSIPFRMGFISETTLFCVSGILFILLIVGIYLLFNEKFSPELSFIGSLFFSM
CHHHHHHHHHCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LSLVVTWAVTGSNDIPSLTFSVWALYFTIKGLNKSFNYYYLAFTCFLMAFFTRFTEGFIL
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IVMISYILMNKDKFKVQINKNDILKLFMFIVFLCAIIGGFYLYKQHTIPFLSQFMEVSSS
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ILSFKGVYKKENIHNFSFILAVILGIITIITYLHVSYIFTEILFTITLLLLYKSSLNKIN
HHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHH
LLVILIPINYSYINSITHPNPQSYEEKQAATWLEAYDNQLTNYNISSDRGVAFSWYLKKY
HHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHH
TYTTIPRVLEQNNETLENKLKTINAKYYIDATSNTTSIDGYHIIYTNNKEKYGIKIYQKD
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA