Definition | Staphylococcus aureus RF122, complete genome. |
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Accession | NC_007622 |
Length | 2,742,531 |
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The map label for this gene is mnhA2 [H]
Identifier: 82750326
GI number: 82750326
Start: 636957
End: 639359
Strand: Direct
Name: mnhA2 [H]
Synonym: SAB0573
Alternate gene names: 82750326
Gene position: 636957-639359 (Clockwise)
Preceding gene: 82750325
Following gene: 82750327
Centisome position: 23.23
GC content: 32.13
Gene sequence:
>2403_bases ATGAGTTTGGTTTATTTATTAATTGCCATACTTGTGATTATGGCGATGATACTTCTAATGTCTAAACGTAGAGCATTGGC TAAATATGCCGGGTACATAGCGTTGATTGCACCTGTAATTTCATCTATCTATTTTATGATTCAAATACCATCAGTAGCTA AACTGCAATATCTTTCTACCTCTATTCCATGGATTAAGACATTAGATATTAATTTAGATTTACGTTTAGATGGTTTAAGT TTAATGTTTTCTCTTATTATTTCACTTATTGGAATTGCAGTATTCTTCTATGCAACTCAATATTTATCCTCTCGAAAAGA CAATTTACCAAGGTTTTATTTTTATTTAACGTTATTTATGTTCAGTATGATTGGTATTGTATTATCAGACAATACGATAT TGATGTACATTTTTTGGGAATTAACGAGTGTATCATCATTTTTATTGATTTCATATTGGTATAACAATGGTGACAATCAA TTTGGTGCAATTCAATCATTTATGATTACAGTATTTGGTGGATTGGCGTTATTAGTTGGTTTTATAATGCTGTATATCAT GACAGGAACGAATAACATCACTGACATATTAGGACAGGCAGATCATATTAAGAATCATGGATTGTTTATGCCTATGATTT TTATGTTTTTATTAGGTGCATTTACAAAATCAGCACAATTTCCATTTCATATTTGGCTACCTAGAGCGATGGCTGCACCT ACACCTGTAAGTGCTTATTTACATTCAGCCACGATGGTAAAAGCTGGTATCTTTTTATTACTTCGATTTACACCATTATT AGGTCTTAGCAATATGTACATATATATCGTAACCTTTGTCGGATTAATAACTATGTTATTTGGTTCAATCACAGCTTTAA AACAATGGGATTTAAAGGGAATTTTAGCATATTCAACAATCAGTCAACTAGGAATGATTATGGTAATGGTCGGTATCGGT GGTGGATATGCTCAACACCAACAAGACGCAATAGCATCTATTTATACATTTGTATTATTTGGTGCGCTATTTCATCTAAT GAATCATGCCATCTTTAAATGTGCGCTTTTCATGGGAGTAGGTATTTTAGATCATGAAGCAGGTTCAAGGGACATACGAA TTTTAAGTGAAATGCGTCAACTATTTCCTAAAATGAATCTAGTCATGACGATAGCGGCTCTATCTATGGCTGGAGTACCA TTTTTAAATGGATTTTTAAGTAAAGAAATGTTCTTAGATGCATTAACACAAACTGGACAATTATCCCAATTTAGTTTGAT TTCAATGATAGCTATCGTATTTGTTGGTGTTATTGCGAGTGTTTTTACATTCACATATGCACTATACATGGTAAAAGAGG TATTTTGGACAAAATATGATTCTAAGGTTTTTACTAAAAAAAATATCCACGAACCATGGTTGTTTAGTTTACCATCTCTT ATATTAATGGTGCTAGTACCTGTAATCTTTTTTGTACCAAATATATTTGGGAAGGGGATTATCGTTCCAGCATTAAGAGC TGTATCAGCTGGTAATCATCAAATTGATCAATTGGCACCACATGTTTCTCAATGGCATGGATTTAACATACCGCTTCTTT TAACCATCATCATTATTTTATTGGGTAGTGTACTAGCAATCAAAGTAGATTGGAAAAAAGTGTTCACGGGTAAAATCAGA CAGATTTCAGTTTCAAAAAGCTATGAGATGGTATATCGACATTTTGAAAAGTTTGCTACGAAGCGATTTAAACGTGTTAT GCAAGATCGTTTAAACCAATACATTATTATGACACTGGGCATATTTATGGTAATTATCGGATACGGTTATATTCGTATAG GACTACCAAAAGTCCATCAGTTACATGTTTCCGAATTTGGACCGTTAGAAGTTATATTAGCAATCGTAACTGTCACAATT GGTATTTCTTTAATTTTTATACGTCAACGACTAACCATGGTAATTTTAAATGGAGTCATCGGTTTTGTTGTGACCTTATT ATTTATAGCAATGAAAGCCCCTGATTTAGCATTGACTCAGCTAGTAGTTGAAACAATAACGACGATACTATTTATTGTCA GTTTTTCAAGATTACCAAACGTGCCAAGATCTAACGCTAACAAAAAAAGAGAAATAATTAAAATTTCTGTATCACTCTTG ATGGCACTTATTGTTGTATCATTAATTTTTATTACACAACAAACAGATGGTTTATCATCAATATCAGACTTTTATTTAAA AGCTGACAAACTAACAGGTGGTAAAAATATTGTAAATGCGATACTTGGTGACTTTAGAGCATTAGATACATTATTTGAAG GATTAGTGTTAATTATTACTGGGCTAGGTATTTACACATTATTAAATTATCAAGATCGGAGGGGACAAGATGAAAGAGAA TGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCAATCTGCTATTGAAACACTAAATTTTATCGGTTTAGAAAATGAGTGTGAACATAGTATTTATATTTCATTACAATTAT AGAAACAAAGGAGGCTAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTCGTGTTAAGAACGGTCACGAAACTTGTTGTATTTATTTTATTGACTTTCGGATTCTATGTCTTCTTCGCAGGTCATA ATAATCCTGGTGGTGGCTTT
Product: monovalent cation/H+ antiporter subunit A
Products: NAD+; ubiquinol [C]
Alternate protein names: Mrp complex subunit A2; Putative NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit mnhA2 [H]
Number of amino acids: Translated: 800; Mature: 799
Protein sequence:
>800_residues MSLVYLLIAILVIMAMILLMSKRRALAKYAGYIALIAPVISSIYFMIQIPSVAKLQYLSTSIPWIKTLDINLDLRLDGLS LMFSLIISLIGIAVFFYATQYLSSRKDNLPRFYFYLTLFMFSMIGIVLSDNTILMYIFWELTSVSSFLLISYWYNNGDNQ FGAIQSFMITVFGGLALLVGFIMLYIMTGTNNITDILGQADHIKNHGLFMPMIFMFLLGAFTKSAQFPFHIWLPRAMAAP TPVSAYLHSATMVKAGIFLLLRFTPLLGLSNMYIYIVTFVGLITMLFGSITALKQWDLKGILAYSTISQLGMIMVMVGIG GGYAQHQQDAIASIYTFVLFGALFHLMNHAIFKCALFMGVGILDHEAGSRDIRILSEMRQLFPKMNLVMTIAALSMAGVP FLNGFLSKEMFLDALTQTGQLSQFSLISMIAIVFVGVIASVFTFTYALYMVKEVFWTKYDSKVFTKKNIHEPWLFSLPSL ILMVLVPVIFFVPNIFGKGIIVPALRAVSAGNHQIDQLAPHVSQWHGFNIPLLLTIIIILLGSVLAIKVDWKKVFTGKIR QISVSKSYEMVYRHFEKFATKRFKRVMQDRLNQYIIMTLGIFMVIIGYGYIRIGLPKVHQLHVSEFGPLEVILAIVTVTI GISLIFIRQRLTMVILNGVIGFVVTLLFIAMKAPDLALTQLVVETITTILFIVSFSRLPNVPRSNANKKREIIKISVSLL MALIVVSLIFITQQTDGLSSISDFYLKADKLTGGKNIVNAILGDFRALDTLFEGLVLIITGLGIYTLLNYQDRRGQDERE
Sequences:
>Translated_800_residues MSLVYLLIAILVIMAMILLMSKRRALAKYAGYIALIAPVISSIYFMIQIPSVAKLQYLSTSIPWIKTLDINLDLRLDGLS LMFSLIISLIGIAVFFYATQYLSSRKDNLPRFYFYLTLFMFSMIGIVLSDNTILMYIFWELTSVSSFLLISYWYNNGDNQ FGAIQSFMITVFGGLALLVGFIMLYIMTGTNNITDILGQADHIKNHGLFMPMIFMFLLGAFTKSAQFPFHIWLPRAMAAP TPVSAYLHSATMVKAGIFLLLRFTPLLGLSNMYIYIVTFVGLITMLFGSITALKQWDLKGILAYSTISQLGMIMVMVGIG GGYAQHQQDAIASIYTFVLFGALFHLMNHAIFKCALFMGVGILDHEAGSRDIRILSEMRQLFPKMNLVMTIAALSMAGVP FLNGFLSKEMFLDALTQTGQLSQFSLISMIAIVFVGVIASVFTFTYALYMVKEVFWTKYDSKVFTKKNIHEPWLFSLPSL ILMVLVPVIFFVPNIFGKGIIVPALRAVSAGNHQIDQLAPHVSQWHGFNIPLLLTIIIILLGSVLAIKVDWKKVFTGKIR QISVSKSYEMVYRHFEKFATKRFKRVMQDRLNQYIIMTLGIFMVIIGYGYIRIGLPKVHQLHVSEFGPLEVILAIVTVTI GISLIFIRQRLTMVILNGVIGFVVTLLFIAMKAPDLALTQLVVETITTILFIVSFSRLPNVPRSNANKKREIIKISVSLL MALIVVSLIFITQQTDGLSSISDFYLKADKLTGGKNIVNAILGDFRALDTLFEGLVLIITGLGIYTLLNYQDRRGQDERE >Mature_799_residues SLVYLLIAILVIMAMILLMSKRRALAKYAGYIALIAPVISSIYFMIQIPSVAKLQYLSTSIPWIKTLDINLDLRLDGLSL MFSLIISLIGIAVFFYATQYLSSRKDNLPRFYFYLTLFMFSMIGIVLSDNTILMYIFWELTSVSSFLLISYWYNNGDNQF GAIQSFMITVFGGLALLVGFIMLYIMTGTNNITDILGQADHIKNHGLFMPMIFMFLLGAFTKSAQFPFHIWLPRAMAAPT PVSAYLHSATMVKAGIFLLLRFTPLLGLSNMYIYIVTFVGLITMLFGSITALKQWDLKGILAYSTISQLGMIMVMVGIGG GYAQHQQDAIASIYTFVLFGALFHLMNHAIFKCALFMGVGILDHEAGSRDIRILSEMRQLFPKMNLVMTIAALSMAGVPF LNGFLSKEMFLDALTQTGQLSQFSLISMIAIVFVGVIASVFTFTYALYMVKEVFWTKYDSKVFTKKNIHEPWLFSLPSLI LMVLVPVIFFVPNIFGKGIIVPALRAVSAGNHQIDQLAPHVSQWHGFNIPLLLTIIIILLGSVLAIKVDWKKVFTGKIRQ ISVSKSYEMVYRHFEKFATKRFKRVMQDRLNQYIIMTLGIFMVIIGYGYIRIGLPKVHQLHVSEFGPLEVILAIVTVTIG ISLIFIRQRLTMVILNGVIGFVVTLLFIAMKAPDLALTQLVVETITTILFIVSFSRLPNVPRSNANKKREIIKISVSLLM ALIVVSLIFITQQTDGLSSISDFYLKADKLTGGKNIVNAILGDFRALDTLFEGLVLIITGLGIYTLLNYQDRRGQDERE
Specific function: Ndh-1 Shuttles Electrons From NADH, Via Fmn And Iron- Sulfur (Fe-S) Centers, To Quinones In The Respiratory Chain. The Immediate Electron Acceptor For The Enzyme In This Species Is Believed To Be Ubiquinone. Couples The Redox Reaction To Proton Translocat
COG id: COG1009
COG function: function code CP; NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/Multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the CPA3 antiporters (TC 2.A.63) subunit A family [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI251831117, Length=389, Percent_Identity=34.1902313624679, Blast_Score=187, Evalue=3e-47, Organism=Homo sapiens, GI251831116, Length=294, Percent_Identity=25.5102040816327, Blast_Score=67, Evalue=5e-11, Organism=Escherichia coli, GI1788614, Length=454, Percent_Identity=31.9383259911894, Blast_Score=202, Evalue=7e-53, Organism=Escherichia coli, GI1788829, Length=411, Percent_Identity=29.9270072992701, Blast_Score=163, Evalue=5e-41, Organism=Escherichia coli, GI1788831, Length=376, Percent_Identity=29.7872340425532, Blast_Score=127, Evalue=2e-30, Organism=Escherichia coli, GI1788827, Length=345, Percent_Identity=29.8550724637681, Blast_Score=124, Evalue=3e-29, Organism=Escherichia coli, GI1788613, Length=424, Percent_Identity=25.2358490566038, Blast_Score=105, Evalue=8e-24, Organism=Escherichia coli, GI145693160, Length=351, Percent_Identity=25.9259259259259, Blast_Score=95, Evalue=2e-20, Organism=Escherichia coli, GI2367154, Length=395, Percent_Identity=25.5696202531646, Blast_Score=84, Evalue=5e-17,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001750 - InterPro: IPR001516 [H]
Pfam domain/function: PF00361 Oxidored_q1; PF00662 Oxidored_q1_N [H]
EC number: 1.6.99.5 [C]
Molecular weight: Translated: 89829; Mature: 89698
Theoretical pI: Translated: 10.03; Mature: 10.03
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 4.9 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 4.8 %Met (Mature Protein) 4.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSLVYLLIAILVIMAMILLMSKRRALAKYAGYIALIAPVISSIYFMIQIPSVAKLQYLST CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHC SIPWIKTLDINLDLRLDGLSLMFSLIISLIGIAVFFYATQYLSSRKDNLPRFYFYLTLFM CCCEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH FSMIGIVLSDNTILMYIFWELTSVSSFLLISYWYNNGDNQFGAIQSFMITVFGGLALLVG HHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIMLYIMTGTNNITDILGQADHIKNHGLFMPMIFMFLLGAFTKSAQFPFHIWLPRAMAAP HHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHCCC TPVSAYLHSATMVKAGIFLLLRFTPLLGLSNMYIYIVTFVGLITMLFGSITALKQWDLKG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH ILAYSTISQLGMIMVMVGIGGGYAQHQQDAIASIYTFVLFGALFHLMNHAIFKCALFMGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GILDHEAGSRDIRILSEMRQLFPKMNLVMTIAALSMAGVPFLNGFLSKEMFLDALTQTGQ CCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSQFSLISMIAIVFVGVIASVFTFTYALYMVKEVFWTKYDSKVFTKKNIHEPWLFSLPSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHH ILMVLVPVIFFVPNIFGKGIIVPALRAVSAGNHQIDQLAPHVSQWHGFNIPLLLTIIIIL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LGSVLAIKVDWKKVFTGKIRQISVSKSYEMVYRHFEKFATKRFKRVMQDRLNQYIIMTLG HCCHHEEEEHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFMVIIGYGYIRIGLPKVHQLHVSEFGPLEVILAIVTVTIGISLIFIRQRLTMVILNGVI HHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFVVTLLFIAMKAPDLALTQLVVETITTILFIVSFSRLPNVPRSNANKKREIIKISVSLL HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH MALIVVSLIFITQQTDGLSSISDFYLKADKLTGGKNIVNAILGDFRALDTLFEGLVLIIT HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLGIYTLLNYQDRRGQDERE HHHHHHHHCCHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure SLVYLLIAILVIMAMILLMSKRRALAKYAGYIALIAPVISSIYFMIQIPSVAKLQYLST HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHC SIPWIKTLDINLDLRLDGLSLMFSLIISLIGIAVFFYATQYLSSRKDNLPRFYFYLTLFM CCCEEEEEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH FSMIGIVLSDNTILMYIFWELTSVSSFLLISYWYNNGDNQFGAIQSFMITVFGGLALLVG HHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIMLYIMTGTNNITDILGQADHIKNHGLFMPMIFMFLLGAFTKSAQFPFHIWLPRAMAAP HHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHCCC TPVSAYLHSATMVKAGIFLLLRFTPLLGLSNMYIYIVTFVGLITMLFGSITALKQWDLKG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH ILAYSTISQLGMIMVMVGIGGGYAQHQQDAIASIYTFVLFGALFHLMNHAIFKCALFMGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GILDHEAGSRDIRILSEMRQLFPKMNLVMTIAALSMAGVPFLNGFLSKEMFLDALTQTGQ CCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LSQFSLISMIAIVFVGVIASVFTFTYALYMVKEVFWTKYDSKVFTKKNIHEPWLFSLPSL CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHH ILMVLVPVIFFVPNIFGKGIIVPALRAVSAGNHQIDQLAPHVSQWHGFNIPLLLTIIIIL HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LGSVLAIKVDWKKVFTGKIRQISVSKSYEMVYRHFEKFATKRFKRVMQDRLNQYIIMTLG HCCHHEEEEHHHHHHCCHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFMVIIGYGYIRIGLPKVHQLHVSEFGPLEVILAIVTVTIGISLIFIRQRLTMVILNGVI HHHHHHHCCHHEECCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GFVVTLLFIAMKAPDLALTQLVVETITTILFIVSFSRLPNVPRSNANKKREIIKISVSLL HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH MALIVVSLIFITQQTDGLSSISDFYLKADKLTGGKNIVNAILGDFRALDTLFEGLVLIIT HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLGIYTLLNYQDRRGQDERE HHHHHHHHCCHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: Iron [C]
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NADH; ubiquinone [C]
Specific reaction: NADH + ubiquinone = NAD+ + ubiquinol [C]
General reaction: Redox reaction [C]
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA