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The map label for this gene is glyS [H]

Identifier: 78779151

GI number: 78779151

Start: 713121

End: 715283

Strand: Direct

Name: glyS [H]

Synonym: PMT9312_0767

Alternate gene names: 78779151

Gene position: 713121-715283 (Clockwise)

Preceding gene: 78779149

Following gene: 78779153

Centisome position: 41.72

GC content: 29.08

Gene sequence:

>2163_bases
TTGTCTAAATATTTACTTGAGATAGGAACAGAGGAGTTGCCCGCAAAATTTTCTCATTCTGTTCTAGAGCAATTTAAATC
TCTAATAGAATTTGAATTGGATAAAAAGTTAATCAAATTCAATAATATTGTTGTTACCTCTACGCCCAGGAGAATAGTTC
TACTTCTTGAAGGTTTAGTCGATTATGGAGAAGATAAGACGATAGTTAGAAAAGGACCTAAGGCAAATTCAGCTTTTTTA
AATGGATCTCCTACTAATGCTGCTTTAGGATTCGCTAATAGTTTAGGTATAGATGTAGATGATCTAGAAATAAAAAATAC
GGAAAAGGGTGAATTTGTTTTTGGAAAAAAAATTGAGAAGGGACAATCAACAAGAATTTCTTTGTCTTCAATTATTCCTA
AAGTAGTGAAGAGTCTCCAAGGCACTCGATTTATGAAATGGGGGGCTGGGAACATTAAGTTTTCAAGACCTATTAGGTGG
ATTACCTCTATCTATAATGATGATATTCTTGATTTCGCATTTAATGAATGTGATCCAAATATTCAAATAAGTAATAAATC
AAAAAGTCATAGACTAATCAATGAAGTTTTTGAAGTTCAGAATCCTGATAATTTTTTTGAATTATTGAAACAAAATAGAG
TATTAGTTAAGCGGCACGAGAGACAAGAACAAATTGAAACTCTAATACATCAGGCTTCTAAATTACTAAATCTGAAACCT
GACCTTTCTAAAGAATTGCTTAATGAACTAACTGATTTAGTTGAATGGCCAGACTTAGTTATTGGTAAATTTAGTGAAGA
ATTTCTTGATCTTCCTGTTGAAGTTCTCTCAACAGTAATGAAAAGTCATCAGAGATATGTGCCTCTTTTGTTAAAAAATA
ATACTTTCTCAAAACTAGATTTAAGCTCTGAAAAAAACATTAGTACAAATTTTTTCGTTATTTCAAATGGTCTTGAAGAA
TCAAATAATAATATTGCCAAGGGTAATGAGAAAGTATTGAGAGCAAGGTTCTCAGATGCAAAGTTTTTTGTAGAAAGTGA
TAAAAAAGTTTCTTCAATTGAAAGAAATGAAAAACTTAAATCTGTTTCTTATTTGAAGGGATTGGGAAATATTTTCCAGA
GAGTAGAGAGAATACAGGAAGTTACTAAAAAAATCCTTACATTTTTAAATGATAAGTCTTTAGAAGATAAAAAAATAATA
GAAGCTGCCAGATATTGTAAAAATGACTTATGTAGCGAAATTGTTTTCGAATTCCCAGAGTTGCAAGGAATAATGGGTGG
TAAATATCTCAAAAATGAAGGATTTAGTGAGGATGTTTGTTTAGCTGTAGCTGAACATTATTTACCTTCTTTTTATAAAG
ATGCTTTGCCATCTTCAAAATATGGTGCAATAGTTTCTATTGCAGATAAGGTTGAAACTTTAATAAGTATATTTATTTCC
GGTAAGCGTCCAAGTGGATCATCTGATCCTTATGCTTTGAGAAGAAATTTAAATGGAGTGATTAAAATAATTTGGGATTA
TGAACTTGATTTACCTTTAGATAATTTATTCAAGGAACTTTTTGATTTTTGGAAAATCTCATTCCCTAATTTGGACTTCT
CAAAAGATAAAGTTTTAAATGATTTAAATGAATTTTTAGTTCAAAGAATTGTTAGTCATCTCGAAGAAATATCGCTAAGT
AAAGAATTAATAAAGGCTATTTGCTCTTCTGATGAACTTTATCAAAAAAGAATATTGAATATTGTTGATCTAAAAAATAG
GATTAAATCTATTGTCAACTTTAAAGAGAAAGAAACTTTTGTTGAAATCCAGAAGGTCATTACTAGGGTTAGCAAATTAG
CTAATAGCAGTAATCTTTCAACAGATGTTTTCTTAACAGGAGATTATGTAAACACAAAAATTTTTGAAAAAGAATGTGAA
TTGAAAGTTTTTGAATTTATTAGAGAATTAGAAAAACTCTTTTCAACTGGTTATTGCAATTATTTGAAACTTCTAAATTT
GTTCGAGATTAATAAAAATACTATTGAGGATTTGTTTGATAATGAAAAGGGTGTTCTGGTAATGTCAGAAGATATAAAAA
TAAGAAATAATAGACTTAACTTATTGAGCCTAATTAGAAATTATTCTCTACTGATCGCTGACTTTACACTTTTGAACTCT
TAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACCTTGATCAAAGGACCAAAACATATCTCTTTTTATACATTAGCGGAAAGCTTATTTAACTGGTAGTAAATTATAGTA
ATAGAAGTTATATTTTTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTTAATACCACCTTTAATTGAATACTTTTTAAGCATTGTTTCAACTTCTTTCTCTTCTCTCACAGCACTATCAACAGGT
TTGTACTTTAATGGAGCAAG

Product: glycyl-tRNA synthetase, beta subunit

Products: NA

Alternate protein names: Glycine--tRNA ligase beta subunit; GlyRS [H]

Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 719

Protein sequence:

>720_residues
MSKYLLEIGTEELPAKFSHSVLEQFKSLIEFELDKKLIKFNNIVVTSTPRRIVLLLEGLVDYGEDKTIVRKGPKANSAFL
NGSPTNAALGFANSLGIDVDDLEIKNTEKGEFVFGKKIEKGQSTRISLSSIIPKVVKSLQGTRFMKWGAGNIKFSRPIRW
ITSIYNDDILDFAFNECDPNIQISNKSKSHRLINEVFEVQNPDNFFELLKQNRVLVKRHERQEQIETLIHQASKLLNLKP
DLSKELLNELTDLVEWPDLVIGKFSEEFLDLPVEVLSTVMKSHQRYVPLLLKNNTFSKLDLSSEKNISTNFFVISNGLEE
SNNNIAKGNEKVLRARFSDAKFFVESDKKVSSIERNEKLKSVSYLKGLGNIFQRVERIQEVTKKILTFLNDKSLEDKKII
EAARYCKNDLCSEIVFEFPELQGIMGGKYLKNEGFSEDVCLAVAEHYLPSFYKDALPSSKYGAIVSIADKVETLISIFIS
GKRPSGSSDPYALRRNLNGVIKIIWDYELDLPLDNLFKELFDFWKISFPNLDFSKDKVLNDLNEFLVQRIVSHLEEISLS
KELIKAICSSDELYQKRILNIVDLKNRIKSIVNFKEKETFVEIQKVITRVSKLANSSNLSTDVFLTGDYVNTKIFEKECE
LKVFEFIRELEKLFSTGYCNYLKLLNLFEINKNTIEDLFDNEKGVLVMSEDIKIRNNRLNLLSLIRNYSLLIADFTLLNS

Sequences:

>Translated_720_residues
MSKYLLEIGTEELPAKFSHSVLEQFKSLIEFELDKKLIKFNNIVVTSTPRRIVLLLEGLVDYGEDKTIVRKGPKANSAFL
NGSPTNAALGFANSLGIDVDDLEIKNTEKGEFVFGKKIEKGQSTRISLSSIIPKVVKSLQGTRFMKWGAGNIKFSRPIRW
ITSIYNDDILDFAFNECDPNIQISNKSKSHRLINEVFEVQNPDNFFELLKQNRVLVKRHERQEQIETLIHQASKLLNLKP
DLSKELLNELTDLVEWPDLVIGKFSEEFLDLPVEVLSTVMKSHQRYVPLLLKNNTFSKLDLSSEKNISTNFFVISNGLEE
SNNNIAKGNEKVLRARFSDAKFFVESDKKVSSIERNEKLKSVSYLKGLGNIFQRVERIQEVTKKILTFLNDKSLEDKKII
EAARYCKNDLCSEIVFEFPELQGIMGGKYLKNEGFSEDVCLAVAEHYLPSFYKDALPSSKYGAIVSIADKVETLISIFIS
GKRPSGSSDPYALRRNLNGVIKIIWDYELDLPLDNLFKELFDFWKISFPNLDFSKDKVLNDLNEFLVQRIVSHLEEISLS
KELIKAICSSDELYQKRILNIVDLKNRIKSIVNFKEKETFVEIQKVITRVSKLANSSNLSTDVFLTGDYVNTKIFEKECE
LKVFEFIRELEKLFSTGYCNYLKLLNLFEINKNTIEDLFDNEKGVLVMSEDIKIRNNRLNLLSLIRNYSLLIADFTLLNS
>Mature_719_residues
SKYLLEIGTEELPAKFSHSVLEQFKSLIEFELDKKLIKFNNIVVTSTPRRIVLLLEGLVDYGEDKTIVRKGPKANSAFLN
GSPTNAALGFANSLGIDVDDLEIKNTEKGEFVFGKKIEKGQSTRISLSSIIPKVVKSLQGTRFMKWGAGNIKFSRPIRWI
TSIYNDDILDFAFNECDPNIQISNKSKSHRLINEVFEVQNPDNFFELLKQNRVLVKRHERQEQIETLIHQASKLLNLKPD
LSKELLNELTDLVEWPDLVIGKFSEEFLDLPVEVLSTVMKSHQRYVPLLLKNNTFSKLDLSSEKNISTNFFVISNGLEES
NNNIAKGNEKVLRARFSDAKFFVESDKKVSSIERNEKLKSVSYLKGLGNIFQRVERIQEVTKKILTFLNDKSLEDKKIIE
AARYCKNDLCSEIVFEFPELQGIMGGKYLKNEGFSEDVCLAVAEHYLPSFYKDALPSSKYGAIVSIADKVETLISIFISG
KRPSGSSDPYALRRNLNGVIKIIWDYELDLPLDNLFKELFDFWKISFPNLDFSKDKVLNDLNEFLVQRIVSHLEEISLSK
ELIKAICSSDELYQKRILNIVDLKNRIKSIVNFKEKETFVEIQKVITRVSKLANSSNLSTDVFLTGDYVNTKIFEKECEL
KVFEFIRELEKLFSTGYCNYLKLLNLFEINKNTIEDLFDNEKGVLVMSEDIKIRNNRLNLLSLIRNYSLLIADFTLLNS

Specific function: Unknown

COG id: COG0751

COG function: function code J; Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789982, Length=723, Percent_Identity=30.2904564315353, Blast_Score=332, Evalue=4e-92,

Paralogues:

None

Copy number: 80 Molecules/Cell In: Growth Phase, Minimal Media (Based on E. coli). 400 Molecules/Cell In: Growth-Phase, Minimal-Media (Based on E. coli). 1,800 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008909
- InterPro:   IPR006194
- InterPro:   IPR015944
- InterPro:   IPR002311 [H]

Pfam domain/function: PF05746 DALR_1; PF02092 tRNA_synt_2f [H]

EC number: =6.1.1.14 [H]

Molecular weight: Translated: 82648; Mature: 82517

Theoretical pI: Translated: 6.88; Mature: 6.88

Prosite motif: PS50861 AA_TRNA_LIGASE_II_GLYAB

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKYLLEIGTEELPAKFSHSVLEQFKSLIEFELDKKLIKFNNIVVTSTPRRIVLLLEGLV
CCCCHHCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHH
DYGEDKTIVRKGPKANSAFLNGSPTNAALGFANSLGIDVDDLEIKNTEKGEFVFGKKIEK
HCCCCCCCEECCCCCCCCEECCCCCCHHHCCHHHCCCCCCCCEECCCCCCCEEECCCCCC
GQSTRISLSSIIPKVVKSLQGTRFMKWGAGNIKFSRPIRWITSIYNDDILDFAFNECDPN
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCC
IQISNKSKSHRLINEVFEVQNPDNFFELLKQNRVLVKRHERQEQIETLIHQASKLLNLKP
EEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DLSKELLNELTDLVEWPDLVIGKFSEEFLDLPVEVLSTVMKSHQRYVPLLLKNNTFSKLD
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEECEEEECCCCCCCC
LSSEKNISTNFFVISNGLEESNNNIAKGNEKVLRARFSDAKFFVESDKKVSSIERNEKLK
CCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHH
SVSYLKGLGNIFQRVERIQEVTKKILTFLNDKSLEDKKIIEAARYCKNDLCSEIVFEFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
LQGIMGGKYLKNEGFSEDVCLAVAEHYLPSFYKDALPSSKYGAIVSIADKVETLISIFIS
HHHHCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GKRPSGSSDPYALRRNLNGVIKIIWDYELDLPLDNLFKELFDFWKISFPNLDFSKDKVLN
CCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
DLNEFLVQRIVSHLEEISLSKELIKAICSSDELYQKRILNIVDLKNRIKSIVNFKEKETF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
VEIQKVITRVSKLANSSNLSTDVFLTGDYVNTKIFEKECELKVFEFIRELEKLFSTGYCN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YLKLLNLFEINKNTIEDLFDNEKGVLVMSEDIKIRNNRLNLLSLIRNYSLLIADFTLLNS
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SKYLLEIGTEELPAKFSHSVLEQFKSLIEFELDKKLIKFNNIVVTSTPRRIVLLLEGLV
CCCHHCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHHHHHHHHHHH
DYGEDKTIVRKGPKANSAFLNGSPTNAALGFANSLGIDVDDLEIKNTEKGEFVFGKKIEK
HCCCCCCCEECCCCCCCCEECCCCCCHHHCCHHHCCCCCCCCEECCCCCCCEEECCCCCC
GQSTRISLSSIIPKVVKSLQGTRFMKWGAGNIKFSRPIRWITSIYNDDILDFAFNECDPN
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEECCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCC
IQISNKSKSHRLINEVFEVQNPDNFFELLKQNRVLVKRHERQEQIETLIHQASKLLNLKP
EEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
DLSKELLNELTDLVEWPDLVIGKFSEEFLDLPVEVLSTVMKSHQRYVPLLLKNNTFSKLD
CHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEECEEEECCCCCCCC
LSSEKNISTNFFVISNGLEESNNNIAKGNEKVLRARFSDAKFFVESDKKVSSIERNEKLK
CCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHH
SVSYLKGLGNIFQRVERIQEVTKKILTFLNDKSLEDKKIIEAARYCKNDLCSEIVFEFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
LQGIMGGKYLKNEGFSEDVCLAVAEHYLPSFYKDALPSSKYGAIVSIADKVETLISIFIS
HHHHCCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHC
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CCCCCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHH
DLNEFLVQRIVSHLEEISLSKELIKAICSSDELYQKRILNIVDLKNRIKSIVNFKEKETF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
VEIQKVITRVSKLANSSNLSTDVFLTGDYVNTKIFEKECELKVFEFIRELEKLFSTGYCN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YLKLLNLFEINKNTIEDLFDNEKGVLVMSEDIKIRNNRLNLLSLIRNYSLLIADFTLLNS
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA