| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_007295 |
| Length | 897,405 |
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The map label for this gene is 71893818
Identifier: 71893818
GI number: 71893818
Start: 591486
End: 593267
Strand: Reverse
Name: 71893818
Synonym: MHJ_0467
Alternate gene names: NA
Gene position: 593267-591486 (Counterclockwise)
Preceding gene: 71893823
Following gene: 71893817
Centisome position: 66.11
GC content: 27.22
Gene sequence:
>1782_bases TTGACTTTGTTACAAGTCAGGACAAATATTTTTAGATCTAATCAATATTTTAGATTTCTATTCAAGTTAAGTTTTAAAAA AAAAGTAATTTATGTTTTCATTACTCTTTCCTTCTTAATGACAATGATGCTTGCTTTAATTGCAAAATTCTATGCAACTG AGAAAAGTTTTAGTTTGTTCTCATTTATTATTTTATTTATAAATCTCTCTTTGACAATAATTATTGCCTCTTATATGTTT TTATCAATTTTTAAGGATTTATCAACTTCAAGTGTTGATATAATAACTTTTATAAAACCTTATTCGCGGCAATATTTTAT TCTTACAAAACTTTTGTTTTTAACTTTTTTTGGGATTTTATGGTCAGTTTTTATCAGCTTTTTACTTGTTTCCTTTTATA TGATAAATTTTAAATATTTAGGTCAGGTAAATTCGCCTTTATTATGAGGTTTTTTATCTTCTTTTTTTTCTTTTATGATT TTTGGGGCAATGACAGCTTTATTTGGCAATAAATTTAGTTCAAAATTATCGCTTTCAATTGCAGTTTTTTCATTTTCTCC TTTTATTCTAATTGGATCTAGTTCAGCTTTTAGTGCAACATCAACTATTAACCGTTTTGCAGAAATTCTTAATTTAGAAC ATCAAAATTATGATTCAAATACAATTGTAGATGTTGAAAAATTCTACCTTAATCAAAAAAAAGACCAATTTTTCCTTATA CCAAAACAAGTAGATAACCCAAATTTTTCAAAAAGGCAAGTAGAATATATCCAACAGGCTTGAAATGATAGCTCAGCTGC AGCTCAAGCTTGACAGGCGGCTTCTTATTTATTGATTCCTTATCAGTTAATTAATGTTTTTGAGCCAAATGATCGGGATG CAATTGAAAATGCAGTCGGAATCCCCGAAAGTTTCCTAAAAAATTATATTTATTCCAATAATTTGGCATCAAAAAAAAAT AATTACCTTTTATCTACAAGTCCAGAATTAAAAAAATATAAATTATCGACATCACAGGAAGTTTTTTTAGTCCCGGGATC GCTTAAAAATGATTCCCATTTTGAAAATCTAGAAAACCGCGAAATTATTTATGCAAGTGAAAATGCTGCTAATTTTGCCA AAATTTTACCTCAGGACTCCCAGACTTTTGGTCTTACTTCTGATCTTGTTGGGAAATTAAAGTGAAATTTAATAAAAGAA CTTTTATCTTCACCAATTTTTGATAAATTTGCAAATAAATTTTTTGCAAATTTTAGCAATAAAGTAAGTCAGAAAGAAAT TCTTGAAAAAATTTCGGATACAATTTCAGCTAATAAAGAGCTTTTGGAACTAAATGATGAAAATACTGCGGTTTTAGCAA AAAAACTTGATATTAAAAAAGTTGAAAATCAAGTCCAAAAAAAAATCTATCTTGCAACTGCGCTAATTTATTGACTTTAT TTTAATAGACAAAACACGGAAATACTTGATAATTTTTTAAAAAATGAGCAAAATAATTACGATCCGGGTCCAATTTTTAT CAAAATTGATAAAGAAAACTACCAAATCGGCGGCTTTTCCTCATTTAGTTCTGAACAACGAGTGCTTGAGAATAAAGTAA TTAAACGTTTTAACTTGTCAAAAAGCAATAATTTTTTATTTCAGCCAGTTTTACAGATGATGGAAATCAAAAGCCACTAT CAGGTCGTCTCAAAAAAAATTTATCCAGTAATCTGGGCCCTAATTTCTGCAATTTTATTATTTTTTATCTTTATTATTTA TTCAAGAAAGGACTATAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTTAAAAGTGGTTTTCCGCTTTTTAATTTAGTAAAAATTTTAAAATTTTACAAATTATTATCTAATATTATACAACAA TATTAGATAAGTAGAAGAGG
Downstream 100 bases:
>100_bases TGTCTGATTGGATTTTGGAAGTAGAAAATCTAACAAAAATTTATTCAAAATCAGAAGCAGGGGTTAAAAATGTTAGTTTT AAGGTTAAAAAAAAACCAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 593; Mature: 592
Protein sequence:
>593_residues MTLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLFSFIILFINLSLTIIIASYMF LSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGILWSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLLWGFLSSFFSFMI FGAMTALFGNKFSSKLSLSIAVFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLI PKQVDNPNFSKRQVEYIQQAWNDSSAAAQAWQAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPESFLKNYIYSNNLASKKN NYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREIIYASENAANFAKILPQDSQTFGLTSDLVGKLKWNLIKE LLSSPIFDKFANKFFANFSNKVSQKEILEKISDTISANKELLELNDENTAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIYWLY FNRQNTEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNFLFQPVLQMMEIKSHY QVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK
Sequences:
>Translated_593_residues MTLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLFSFIILFINLSLTIIIASYMF LSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGILWSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLL*GFLSSFFSFMI FGAMTALFGNKFSSKLSLSIAVFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLI PKQVDNPNFSKRQVEYIQQA*NDSSAAAQA*QAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPESFLKNYIYSNNLASKKN NYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREIIYASENAANFAKILPQDSQTFGLTSDLVGKLK*NLIKE LLSSPIFDKFANKFFANFSNKVSQKEILEKISDTISANKELLELNDENTAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIY*LY FNRQNTEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNFLFQPVLQMMEIKSHY QVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK >Mature_592_residues TLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLFSFIILFINLSLTIIIASYMFL SIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGILWSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLL*GFLSSFFSFMIF GAMTALFGNKFSSKLSLSIAVFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLIP KQVDNPNFSKRQVEYIQQA*NDSSAAAQA*QAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPESFLKNYIYSNNLASKKNN YLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREIIYASENAANFAKILPQDSQTFGLTSDLVGKLK*NLIKEL LSSPIFDKFANKFFANFSNKVSQKEILEKISDTISANKELLELNDENTAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIY*LYF NRQNTEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNFLFQPVLQMMEIKSHYQ VVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK
Specific function: Unknown
COG id: COG1277
COG function: function code R; ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67802; Mature: 67670
Theoretical pI: Translated: 9.86; Mature: 9.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLF CCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH SFIILFINLSLTIIIASYMFLSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH WSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLLGFLSSFFSFMIFGAMTALFGNKFSSKLSLSIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE VFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLIP EEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCEEEEC KQVDNPNFSKRQVEYIQQANDSSAAAQAQAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPE CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCH SFLKNYIYSNNLASKKNNYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREII HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEE YASENAANFAKILPQDSQTFGLTSDLVGKLKNLIKELLSSPIFDKFANKFFANFSNKVSQ EECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KEILEKISDTISANKELLELNDENTAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIYLYFNRQN HHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNF HHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC LFQPVLQMMEIKSHYQVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure TLLQVRTNIFRSNQYFRFLFKLSFKKKVIYVFITLSFLMTMMLALIAKFYATEKSFSLF CHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH SFIILFINLSLTIIIASYMFLSIFKDLSTSSVDIITFIKPYSRQYFILTKLLFLTFFGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH WSVFISFLLVSFYMINFKYLGQVNSPLLGFLSSFFSFMIFGAMTALFGNKFSSKLSLSIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE VFSFSPFILIGSSSAFSATSTINRFAEILNLEHQNYDSNTIVDVEKFYLNQKKDQFFLIP EEECCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHHHHHHCCCCCCEEEEC KQVDNPNFSKRQVEYIQQANDSSAAAQAQAASYLLIPYQLINVFEPNDRDAIENAVGIPE CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCH SFLKNYIYSNNLASKKNNYLLSTSPELKKYKLSTSQEVFLVPGSLKNDSHFENLENREII HHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHEECCCCCEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCEEE YASENAANFAKILPQDSQTFGLTSDLVGKLKNLIKELLSSPIFDKFANKFFANFSNKVSQ EECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KEILEKISDTISANKELLELNDENTAVLAKKLDIKKVENQVQKKIYLATALIYLYFNRQN HHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC TEILDNFLKNEQNNYDPGPIFIKIDKENYQIGGFSSFSSEQRVLENKVIKRFNLSKSNNF HHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC LFQPVLQMMEIKSHYQVVSKKIYPVIWALISAILLFFIFIIYSRKDYK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA