Definition | Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007295 |
Length | 897,405 |
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The map label for this gene is 71893688
Identifier: 71893688
GI number: 71893688
Start: 407543
End: 409399
Strand: Reverse
Name: 71893688
Synonym: MHJ_0334
Alternate gene names: NA
Gene position: 409399-407543 (Counterclockwise)
Preceding gene: 71893689
Following gene: 71893687
Centisome position: 45.62
GC content: 22.19
Gene sequence:
>1857_bases ATTTTTTCTATTATTGGCGCTAGTTTGGGATCAATTGCTATAAGTGTGCCATTAATTTATTATGGTTTTAATAGCTTTAT TGCGGTTGAAATAAATAGATTCGAGCCTAAAACATTAACTAGTAATTCAAAATCTGCATCTATTTTTTCTAATTCCGATC AAGAAAAAATAAACAGTTTTATTTTAGAAGACGAATTAAAAAAAGGTACACAAAAGAGTGACTATGCTCTAAAAAATAAT TTTCAGGGAGAGTATAATTACGAATATGCAAATGAATTTTTAGCAATTTTAAAAATTACAAATAATATTAAGCAATTTGA GAAACTTAAATCAATATTAAAAACTACGCCTAATTTATCACGAAGAATACAATTTAGTTTGAGCGATGTATACCAAATAA GCAATATTTATTTTAATATTGACCCAATTAATAACGTTCCTAAACTCGTTAATTTTATTTCAAAATATTATGACAAAAAC AAAAGGGAATTTATTAATATTAATGATGAGGATTTTCAAGCTCTAGCATGAAATATTTTATATTTTAAATTAAATGGGCA TGATTTTCAAAAATATTTCGATATTAAAGATTGAATTAAAAATGAATTTAAGAAAGCAAATTTTGAAAGTGAAGAGGTAC TAATAAGTGATAATGAACCTCATGAAACTTCAGAAAAAAAATCTTTTCTACTTTTTAGAAAATATATCGCTATTTTAACA ATAATTAATAATTTAGATAAGGATTATTTTGTAGACATTATAAATGAAAAACAAAAATCAATAAATGTTTTAATTAAAAA ATGAGATAACCATTTTAGACAAATTATTGAAAATAAAGATAGAAAAGAAAACCAAAGCAATTTGGTTATCACACCAATGG TTAGTTTTTACTATTTTAGCAAGAATTTTTATAACTACTCATCAGAGTATTTGTCAAAAATAAATGACTTTACTAAAAAT TGGTTAATAAATTTTAGCTTATCAAGCGATCCAAGTTTTTATGGTTCAGGTCTTCTTTACTATTATTTTGGAAATAATAA AAAAATAGAGCCCGAATTACTTAAAAAAAGTGAAGAAATTGTAGATTATGGCATTGAAAATGGTTTATTTGCTCACGAAC CTGACATCACAAAAACTATTTTTGTAAAACAGATTTTAGACTTGAGTGAGAAAAAAGATAATCAAGTGCAAAAAATAAAT CAAACAATAGAAACCTTATTTAAGCAAACAACTGAAAAACCAGAAAATAATCCTGATTTTTTTGAGGACTTATATAATTA TGTATTTTTTTCAATTAAGAATCATCCCGATTTTTTTAAGAGTCAAAAAGATTTTTTAAATACAATAATTGATTATAGTA AATTTGTAAAAAAACCAATTGATTTTTTTTATTTGTTTAAAACAATTGCGCTATTAAATAGTTTTTATAATACAGACAAG CCAACAAAAATTAATGTTTCCAAGCAAATTTTTGACAATATTATAAATGTAAAACTAGAAAAAAATGCTCCATTTTTTTT AAAATTTATTAACTTATTTATTAAGTTTATTTTTAAAAATGAATTAGACGACAACAAGGAAATTGTTGAATTTATAAACC AAAATCTTAATGAAAAAAATATAAATAACGCTGAATTTTTAAAACATCTTTTTTGGTATATTGAATTTCAAAGTACAATT AAATCAAAATTAGAGCACCAAATAGATTCTACTAAATTAGAAAAATTTATTTCATTGTTAAAAAAAGATATTTTATCTAA AATTGATAAAAAAATAGGTAAAACACACTTTTTGAATATTAAAACTATTTATATGACTTATCAAATAGATTGGCTACTTA AAAATGGTAAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAAGTATATTGTCTGATTCTTCTTATCATAGAGTTTCATGATTGTCCGAAAGTTTAGAAGAATAGGTATGATACCTAAAA TTTTTACAAAAAAATGAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATTTGACTAAAAATTTTAATCAAAGAGCTATTTTTACAAATTTTAGCCTAGATATTCCATCTAATGAGTTGGTCTTTG TCGTTGGACCTTCTGGAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 618; Mature: 618
Protein sequence:
>618_residues MFSIIGASLGSIAISVPLIYYGFNSFIAVEINRFEPKTLTSNSKSASIFSNSDQEKINSFILEDELKKGTQKSDYALKNN FQGEYNYEYANEFLAILKITNNIKQFEKLKSILKTTPNLSRRIQFSLSDVYQISNIYFNIDPINNVPKLVNFISKYYDKN KREFININDEDFQALAWNILYFKLNGHDFQKYFDIKDWIKNEFKKANFESEEVLISDNEPHETSEKKSFLLFRKYIAILT IINNLDKDYFVDIINEKQKSINVLIKKWDNHFRQIIENKDRKENQSNLVITPMVSFYYFSKNFYNYSSEYLSKINDFTKN WLINFSLSSDPSFYGSGLLYYYFGNNKKIEPELLKKSEEIVDYGIENGLFAHEPDITKTIFVKQILDLSEKKDNQVQKIN QTIETLFKQTTEKPENNPDFFEDLYNYVFFSIKNHPDFFKSQKDFLNTIIDYSKFVKKPIDFFYLFKTIALLNSFYNTDK PTKINVSKQIFDNIINVKLEKNAPFFLKFINLFIKFIFKNELDDNKEIVEFINQNLNEKNINNAEFLKHLFWYIEFQSTI KSKLEHQIDSTKLEKFISLLKKDILSKIDKKIGKTHFLNIKTIYMTYQIDWLLKNGKN
Sequences:
>Translated_618_residues MFSIIGASLGSIAISVPLIYYGFNSFIAVEINRFEPKTLTSNSKSASIFSNSDQEKINSFILEDELKKGTQKSDYALKNN FQGEYNYEYANEFLAILKITNNIKQFEKLKSILKTTPNLSRRIQFSLSDVYQISNIYFNIDPINNVPKLVNFISKYYDKN KREFININDEDFQALA*NILYFKLNGHDFQKYFDIKD*IKNEFKKANFESEEVLISDNEPHETSEKKSFLLFRKYIAILT IINNLDKDYFVDIINEKQKSINVLIKK*DNHFRQIIENKDRKENQSNLVITPMVSFYYFSKNFYNYSSEYLSKINDFTKN WLINFSLSSDPSFYGSGLLYYYFGNNKKIEPELLKKSEEIVDYGIENGLFAHEPDITKTIFVKQILDLSEKKDNQVQKIN QTIETLFKQTTEKPENNPDFFEDLYNYVFFSIKNHPDFFKSQKDFLNTIIDYSKFVKKPIDFFYLFKTIALLNSFYNTDK PTKINVSKQIFDNIINVKLEKNAPFFLKFINLFIKFIFKNELDDNKEIVEFINQNLNEKNINNAEFLKHLFWYIEFQSTI KSKLEHQIDSTKLEKFISLLKKDILSKIDKKIGKTHFLNIKTIYMTYQIDWLLKNGKN >Mature_618_residues MFSIIGASLGSIAISVPLIYYGFNSFIAVEINRFEPKTLTSNSKSASIFSNSDQEKINSFILEDELKKGTQKSDYALKNN FQGEYNYEYANEFLAILKITNNIKQFEKLKSILKTTPNLSRRIQFSLSDVYQISNIYFNIDPINNVPKLVNFISKYYDKN KREFININDEDFQALA*NILYFKLNGHDFQKYFDIKD*IKNEFKKANFESEEVLISDNEPHETSEKKSFLLFRKYIAILT IINNLDKDYFVDIINEKQKSINVLIKK*DNHFRQIIENKDRKENQSNLVITPMVSFYYFSKNFYNYSSEYLSKINDFTKN WLINFSLSSDPSFYGSGLLYYYFGNNKKIEPELLKKSEEIVDYGIENGLFAHEPDITKTIFVKQILDLSEKKDNQVQKIN QTIETLFKQTTEKPENNPDFFEDLYNYVFFSIKNHPDFFKSQKDFLNTIIDYSKFVKKPIDFFYLFKTIALLNSFYNTDK PTKINVSKQIFDNIINVKLEKNAPFFLKFINLFIKFIFKNELDDNKEIVEFINQNLNEKNINNAEFLKHLFWYIEFQSTI KSKLEHQIDSTKLEKFISLLKKDILSKIDKKIGKTHFLNIKTIYMTYQIDWLLKNGKN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 72790; Mature: 72790
Theoretical pI: Translated: 9.08; Mature: 9.08
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.5 %Met (Translated Protein) 0.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.5 %Met (Mature Protein) 0.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFSIIGASLGSIAISVPLIYYGFNSFIAVEINRFEPKTLTSNSKSASIFSNSDQEKINSF CCEECCCCHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH ILEDELKKGTQKSDYALKNNFQGEYNYEYANEFLAILKITNNIKQFEKLKSILKTTPNLS HHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH RRIQFSLSDVYQISNIYFNIDPINNVPKLVNFISKYYDKNKREFININDEDFQALANILY HEEEEHHHHHHEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHE FKLNGHDFQKYFDIKDIKNEFKKANFESEEVLISDNEPHETSEKKSFLLFRKYIAILTII EEECCCCHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNLDKDYFVDIINEKQKSINVLIKKDNHFRQIIENKDRKENQSNLVITPMVSFYYFSKNF HHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH YNYSSEYLSKINDFTKNWLINFSLSSDPSFYGSGLLYYYFGNNKKIEPELLKKSEEIVDY CCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GIENGLFAHEPDITKTIFVKQILDLSEKKDNQVQKINQTIETLFKQTTEKPENNPDFFED CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH LYNYVFFSIKNHPDFFKSQKDFLNTIIDYSKFVKKPIDFFYLFKTIALLNSFYNTDKPTK HHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE INVSKQIFDNIINVKLEKNAPFFLKFINLFIKFIFKNELDDNKEIVEFINQNLNEKNINN ECHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCH AEFLKHLFWYIEFQSTIKSKLEHQIDSTKLEKFISLLKKDILSKIDKKIGKTHFLNIKTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEE YMTYQIDWLLKNGKN EEEEEEEEEECCCCC >Mature Secondary Structure MFSIIGASLGSIAISVPLIYYGFNSFIAVEINRFEPKTLTSNSKSASIFSNSDQEKINSF CCEECCCCHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH ILEDELKKGTQKSDYALKNNFQGEYNYEYANEFLAILKITNNIKQFEKLKSILKTTPNLS HHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH RRIQFSLSDVYQISNIYFNIDPINNVPKLVNFISKYYDKNKREFININDEDFQALANILY HEEEEHHHHHHEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHE FKLNGHDFQKYFDIKDIKNEFKKANFESEEVLISDNEPHETSEKKSFLLFRKYIAILTII EEECCCCHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NNLDKDYFVDIINEKQKSINVLIKKDNHFRQIIENKDRKENQSNLVITPMVSFYYFSKNF HHCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH YNYSSEYLSKINDFTKNWLINFSLSSDPSFYGSGLLYYYFGNNKKIEPELLKKSEEIVDY CCCHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GIENGLFAHEPDITKTIFVKQILDLSEKKDNQVQKINQTIETLFKQTTEKPENNPDFFED CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH LYNYVFFSIKNHPDFFKSQKDFLNTIIDYSKFVKKPIDFFYLFKTIALLNSFYNTDKPTK HHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE INVSKQIFDNIINVKLEKNAPFFLKFINLFIKFIFKNELDDNKEIVEFINQNLNEKNINN ECHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCH AEFLKHLFWYIEFQSTIKSKLEHQIDSTKLEKFISLLKKDILSKIDKKIGKTHFLNIKTI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEE YMTYQIDWLLKNGKN EEEEEEEEEECCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA