Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 59711204

Identifier: 59711204

GI number: 59711204

Start: 656046

End: 658292

Strand: Reverse

Name: 59711204

Synonym: VF_0597

Alternate gene names: NA

Gene position: 658292-656046 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59711205

Following gene: 59711203

Centisome position: 22.72

GC content: 34.67

Gene sequence:

>2247_bases
ATGGTTGTTTTTTTGTGGATCCTTTACATGTCTTTCCGTCAGTGTCTTCTTTTTATTTTTGTGTTTTTCCCACTTTCTGC
ATGGGCTAAATTTTTCTCAGCCCCAATTCTAAATGATGCTTATCAACTTTTAGATACCAAACCTGCGCAATCACTTAGAA
TCGTTAACCAATATCTTGAGCAAAGACAAATCTCGCCAGGTCAAAATCCCAATCAAATTCCAATTAACAATGATTCTGAA
CGTACCATCAGAACACCAATAAGTACTGTTGAAGCATTTCAAATCAAAGCACTCGCTAATAAAAGATTAAATAAAAATAG
AGAAGCGATTGAAGCCATCAAAGAAGCGATATCTCTAGCTAAAGACTTTCAATTAAAGTCAGGCTATTTAGAATCTAAAT
TAATCTATGCTTATTTATGGTGGAATTTAACCAAAGATGTAGATGAAACAAATAGTATTTTAGCCATTATTGAGCAAGAG
TTACTTGAAACAGGCAATACCATTGGCATTCACGACAAACTGTATTTTGGTTTTGCGTTAATTCATGCTGAAGTTGAGTC
TGAGCAAGGAAATAACAGTAAAGCACAAAAATATTACAAACAAGCAATGACTCATGGGGCAAAACTAAAAGATCCAAGCA
GCCTCATTTTCTATCATATTTCCTATGGTCGACACTTTTTAAAGAACAAACAATTTGATCAAGCATTAACAGAATTATTA
AGTGCTTACTGGCAATCAATTGAAGCAGATCAAAGTGGTCAACTAGCTCGAGCTAACTTCTTATTAGGTGAGCTTTTTTT
CCAAAGAAAGGTACTGGATAAAGCGCTTGAACACGCCTCGCAATCAGCCGAATTTTACGGGCGTTACAATAACAGCGAAC
AACTATCTAACGTTTTAACCCTAATCGCTCAGATACACCTTAAGCAAGGTCGATTCAACTTAGCGCTAGTGCAGTACTTT
AACGCTCTGGATCAAGAGAAAGAAAAAAATAACGTTAATAAATTAATCTCATTACGATTAGATATCGCAAATACTTATTT
CTTACTCTACAACTACGCATTAAGTGAGCATTACTTAAAACAAGCCAACAACCTTAATGAATACGTAAAACTACCAAAGC
AAAAAGCAAGAGCGGCTCTTCTACAAGCAAAACTTAACCTAATAAACAATAAACCGGATCTGGCTATTAATGATATTCAG
ACCGCGATTGTGTATAGCAAAAAAGACAATGATAAACCGCTCAAATTACAGTCTCAAAAATTACTTTCTGAAACCTATGA
AAAAATGGGATTATTTGAAGCGGCATTAAAAGCCCAGCGTGAATACGAAACACTGAACTCGTCTATTCAAGCGGTTCAAA
ACGAAATCAATGAAGAAGTATTTAGACAACAAAAAAGCATTATTGAACAATCTCTGCATTACCAAGGGTTAGAAGCTCAA
TTAAAAGAAAATCATTTACAAACGCTTAAAATTCAAAAGATTGCAGGATTTTTAGTTGCATTACTAACTATCATTTCAAT
TTATGCATTTAGAAAACAGCAAGTGAATCGTTTCTTGAAAAAACGTCTCCATCTGTTACTAAATAAATATTACACCCACC
CTCGCAGTGGATTACGTAACTTACGTCTGCTAACAGAAAGATTACCATCATCACTACAACAAAGTAGCTCTAATATTGAA
CAATGGCATTTAGGTGAATTAATCAATGAACCACTAAGTGATAGATTGAGATTTACGCTATTCCATATTCCTATGTTACA
AGAGCTATATCTAACTCATGGCTACCAAGAAGGCTTATCAATTGAAAAAGCCTTTGGGGATTACTTATCTTCTGTAGTGA
CTTCTCCGAGCCGTATTTATCATTTTTCAGATGCCAGTTTTCTCTATATCGAGCATAAATCGGACTCAACCTGTAGTGTT
CAAGAAATGGCTGAAACCGTTCAAAGTTGGATAAATAATTTCGATTCGAATATTTTAACTGATAAAACTGTTAATATAGG
AATGGTTGAATACCCATTTTTACCACGGGCCTACACTGCAATTAATGATAGAGAATTAATTGATATTCTATTAATGGCAA
CTAATGCAGCTCAACATTTGAGTGAAGAACTATCAAGCAGCCAATGGGTAAACTATCGAGCGATAGATAATGCACCAGCC
GCAAGTTTTGCAAGTAATAATATACGCTTAGCTTGTGAACAAGCGATTAACCAAGGCTTAATAAAGGTAATAACATCAAG
AAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAGACAATTTACGTTTAGCTCGCCAGTAAGACATTTTGATTAATTTTGTCTACAAAGAACGTTTCTTTGTAGACAAATCC
CCTCACAACGATAGTATGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAACAAAAATGAATAATGCATCACAAAATTAACATTAACGGTATAGTAATGATTATCAATTAAACAAATTTGATACTTTA
TTTTAGTCAGTTACTAATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: TPR Repeat-Containing Protein

Number of amino acids: Translated: 748; Mature: 748

Protein sequence:

>748_residues
MVVFLWILYMSFRQCLLFIFVFFPLSAWAKFFSAPILNDAYQLLDTKPAQSLRIVNQYLEQRQISPGQNPNQIPINNDSE
RTIRTPISTVEAFQIKALANKRLNKNREAIEAIKEAISLAKDFQLKSGYLESKLIYAYLWWNLTKDVDETNSILAIIEQE
LLETGNTIGIHDKLYFGFALIHAEVESEQGNNSKAQKYYKQAMTHGAKLKDPSSLIFYHISYGRHFLKNKQFDQALTELL
SAYWQSIEADQSGQLARANFLLGELFFQRKVLDKALEHASQSAEFYGRYNNSEQLSNVLTLIAQIHLKQGRFNLALVQYF
NALDQEKEKNNVNKLISLRLDIANTYFLLYNYALSEHYLKQANNLNEYVKLPKQKARAALLQAKLNLINNKPDLAINDIQ
TAIVYSKKDNDKPLKLQSQKLLSETYEKMGLFEAALKAQREYETLNSSIQAVQNEINEEVFRQQKSIIEQSLHYQGLEAQ
LKENHLQTLKIQKIAGFLVALLTIISIYAFRKQQVNRFLKKRLHLLLNKYYTHPRSGLRNLRLLTERLPSSLQQSSSNIE
QWHLGELINEPLSDRLRFTLFHIPMLQELYLTHGYQEGLSIEKAFGDYLSSVVTSPSRIYHFSDASFLYIEHKSDSTCSV
QEMAETVQSWINNFDSNILTDKTVNIGMVEYPFLPRAYTAINDRELIDILLMATNAAQHLSEELSSSQWVNYRAIDNAPA
ASFASNNIRLACEQAINQGLIKVITSRN

Sequences:

>Translated_748_residues
MVVFLWILYMSFRQCLLFIFVFFPLSAWAKFFSAPILNDAYQLLDTKPAQSLRIVNQYLEQRQISPGQNPNQIPINNDSE
RTIRTPISTVEAFQIKALANKRLNKNREAIEAIKEAISLAKDFQLKSGYLESKLIYAYLWWNLTKDVDETNSILAIIEQE
LLETGNTIGIHDKLYFGFALIHAEVESEQGNNSKAQKYYKQAMTHGAKLKDPSSLIFYHISYGRHFLKNKQFDQALTELL
SAYWQSIEADQSGQLARANFLLGELFFQRKVLDKALEHASQSAEFYGRYNNSEQLSNVLTLIAQIHLKQGRFNLALVQYF
NALDQEKEKNNVNKLISLRLDIANTYFLLYNYALSEHYLKQANNLNEYVKLPKQKARAALLQAKLNLINNKPDLAINDIQ
TAIVYSKKDNDKPLKLQSQKLLSETYEKMGLFEAALKAQREYETLNSSIQAVQNEINEEVFRQQKSIIEQSLHYQGLEAQ
LKENHLQTLKIQKIAGFLVALLTIISIYAFRKQQVNRFLKKRLHLLLNKYYTHPRSGLRNLRLLTERLPSSLQQSSSNIE
QWHLGELINEPLSDRLRFTLFHIPMLQELYLTHGYQEGLSIEKAFGDYLSSVVTSPSRIYHFSDASFLYIEHKSDSTCSV
QEMAETVQSWINNFDSNILTDKTVNIGMVEYPFLPRAYTAINDRELIDILLMATNAAQHLSEELSSSQWVNYRAIDNAPA
ASFASNNIRLACEQAINQGLIKVITSRN
>Mature_748_residues
MVVFLWILYMSFRQCLLFIFVFFPLSAWAKFFSAPILNDAYQLLDTKPAQSLRIVNQYLEQRQISPGQNPNQIPINNDSE
RTIRTPISTVEAFQIKALANKRLNKNREAIEAIKEAISLAKDFQLKSGYLESKLIYAYLWWNLTKDVDETNSILAIIEQE
LLETGNTIGIHDKLYFGFALIHAEVESEQGNNSKAQKYYKQAMTHGAKLKDPSSLIFYHISYGRHFLKNKQFDQALTELL
SAYWQSIEADQSGQLARANFLLGELFFQRKVLDKALEHASQSAEFYGRYNNSEQLSNVLTLIAQIHLKQGRFNLALVQYF
NALDQEKEKNNVNKLISLRLDIANTYFLLYNYALSEHYLKQANNLNEYVKLPKQKARAALLQAKLNLINNKPDLAINDIQ
TAIVYSKKDNDKPLKLQSQKLLSETYEKMGLFEAALKAQREYETLNSSIQAVQNEINEEVFRQQKSIIEQSLHYQGLEAQ
LKENHLQTLKIQKIAGFLVALLTIISIYAFRKQQVNRFLKKRLHLLLNKYYTHPRSGLRNLRLLTERLPSSLQQSSSNIE
QWHLGELINEPLSDRLRFTLFHIPMLQELYLTHGYQEGLSIEKAFGDYLSSVVTSPSRIYHFSDASFLYIEHKSDSTCSV
QEMAETVQSWINNFDSNILTDKTVNIGMVEYPFLPRAYTAINDRELIDILLMATNAAQHLSEELSSSQWVNYRAIDNAPA
ASFASNNIRLACEQAINQGLIKVITSRN

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86139; Mature: 86139

Theoretical pI: Translated: 8.70; Mature: 8.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVVFLWILYMSFRQCLLFIFVFFPLSAWAKFFSAPILNDAYQLLDTKPAQSLRIVNQYLE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
QRQISPGQNPNQIPINNDSERTIRTPISTVEAFQIKALANKRLNKNREAIEAIKEAISLA
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
KDFQLKSGYLESKLIYAYLWWNLTKDVDETNSILAIIEQELLETGNTIGIHDKLYFGFAL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHH
IHAEVESEQGNNSKAQKYYKQAMTHGAKLKDPSSLIFYHISYGRHFLKNKQFDQALTELL
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
SAYWQSIEADQSGQLARANFLLGELFFQRKVLDKALEHASQSAEFYGRYNNSEQLSNVLT
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LIAQIHLKQGRFNLALVQYFNALDQEKEKNNVNKLISLRLDIANTYFLLYNYALSEHYLK
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QANNLNEYVKLPKQKARAALLQAKLNLINNKPDLAINDIQTAIVYSKKDNDKPLKLQSQK
HHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHH
LLSETYEKMGLFEAALKAQREYETLNSSIQAVQNEINEEVFRQQKSIIEQSLHYQGLEAQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
LKENHLQTLKIQKIAGFLVALLTIISIYAFRKQQVNRFLKKRLHLLLNKYYTHPRSGLRN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LRLLTERLPSSLQQSSSNIEQWHLGELINEPLSDRLRFTLFHIPMLQELYLTHGYQEGLS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCH
IEKAFGDYLSSVVTSPSRIYHFSDASFLYIEHKSDSTCSVQEMAETVQSWINNFDSNILT
HHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DKTVNIGMVEYPFLPRAYTAINDRELIDILLMATNAAQHLSEELSSSQWVNYRAIDNAPA
CCCCCCCEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCC
ASFASNNIRLACEQAINQGLIKVITSRN
CHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MVVFLWILYMSFRQCLLFIFVFFPLSAWAKFFSAPILNDAYQLLDTKPAQSLRIVNQYLE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
QRQISPGQNPNQIPINNDSERTIRTPISTVEAFQIKALANKRLNKNREAIEAIKEAISLA
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
KDFQLKSGYLESKLIYAYLWWNLTKDVDETNSILAIIEQELLETGNTIGIHDKLYFGFAL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHH
IHAEVESEQGNNSKAQKYYKQAMTHGAKLKDPSSLIFYHISYGRHFLKNKQFDQALTELL
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
SAYWQSIEADQSGQLARANFLLGELFFQRKVLDKALEHASQSAEFYGRYNNSEQLSNVLT
HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LIAQIHLKQGRFNLALVQYFNALDQEKEKNNVNKLISLRLDIANTYFLLYNYALSEHYLK
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QANNLNEYVKLPKQKARAALLQAKLNLINNKPDLAINDIQTAIVYSKKDNDKPLKLQSQK
HHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHHH
LLSETYEKMGLFEAALKAQREYETLNSSIQAVQNEINEEVFRQQKSIIEQSLHYQGLEAQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
LKENHLQTLKIQKIAGFLVALLTIISIYAFRKQQVNRFLKKRLHLLLNKYYTHPRSGLRN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LRLLTERLPSSLQQSSSNIEQWHLGELINEPLSDRLRFTLFHIPMLQELYLTHGYQEGLS
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCH
IEKAFGDYLSSVVTSPSRIYHFSDASFLYIEHKSDSTCSVQEMAETVQSWINNFDSNILT
HHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DKTVNIGMVEYPFLPRAYTAINDRELIDILLMATNAAQHLSEELSSSQWVNYRAIDNAPA
CCCCCCCEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCC
ASFASNNIRLACEQAINQGLIKVITSRN
CHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA