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The map label for this gene is 54295262

Identifier: 54295262

GI number: 54295262

Start: 2675381

End: 2677642

Strand: Reverse

Name: 54295262

Synonym: lpl2345

Alternate gene names: NA

Gene position: 2677642-2675381 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54295264

Following gene: 54295261

Centisome position: 80.03

GC content: 37.98

Gene sequence:

>2262_bases
ATGAGTACATCCGAAAAAGACGTTCGTGAACAAAAAGTAAAAACAGTCACATTAAGTTTTCTGGGTACAGGACAACATCG
TGAAAAGGTTCATCATATTCTCACGAGTTTTCATAATACAATCTCGGAAGTAAATAAAGACAATCCTACAGTGGCAATGA
GAATGTTTGATGGTCCTGGTTCAGAACCAAAATCAGGCGACAGCAAGGATCCAATTCCTGGGACTTATATTTATAACCCA
AAAGATAATTCCAAGATATTAATTAGTCCTGTAATCTCCCAAACGATTACCAATGCCATACAAAAACTGACTGGAAATTT
GGCGGGAGAAGGTATAGAGCATTTATTATTTGAAGCAGTACTTTACCTTAATGACATCATTGAAAAAAATGGAGGTCAAC
TGCCTGAAACAGTTAATTTGCATGGGTTTAGCCGAGGGGCTGATACCTGTATGCGAATGGCGAATCTCCTTTATCAATTA
CATCCAGACATCAAAGTTAATTTATTTTTAATCGATCAGGTACCTGGGCCTGGGAAACGCGATGATCCACATTCTTATAC
TGTCCCTCCTAATGTAGCACATTTTGAGTCGACATTGATGTTACATGAATACAGGCCTGGATTTGACCCTCAACATTCTG
GAAGGTATGTGATTGCAGATCCTGAAAAAACAAAAGTGGTTGTTAAACCTTACTATGGGGAACACAATACCGGTAACCGT
GTTACTGAAGATCCTAACACGAATCAAACTGCCATTTTATTACATGATGATATGAATCGTTTTTGCAGGGAAACTGGCTC
ACTCCCTTCTGTTGGGATTTCCCCACCAATTATTGCCAGAGTAGGAGATAAAAAAGAGGAAGTTCGAACTTATTCAGAAC
TATCCCCAGAAAAACGCTTTGAGTTGTTATGTGGTATGAAGGAAAACGAATGGGGCTATGCCAAACTGACCAAAAAATAT
CATGAGCGCAGTATTCTGTCGAAGCGGGAAGATTACGTACAAGACTCCAGATTGTTTGTCAACCAGGAACACAGGGAATT
GTTTAAACAATTGTATCCCAAATCATTTAATTGGTTTTTTGAAAAAAATCATGGCGGTCAAACAAAAAAGGAAGAAGTCA
TCGCTGAATTAAAATCACTATCCGAAGATCCAAGGTATGAGCATTTTTTTTCATCATTAGCGAAACACTTTCAAATTAAT
GAGAATAATATTGCAGGAACTTTGCCAGAACCATCGGGCGTTGATAGGATCGAAAAAAGTAGCTTCAGACAACCGCCAGT
CAGGGACAGGCTTTCTTATTTACAACATTCCCTGACCTCCATTGCGAATTATTATCACTATCATTGTGATGAGAAGAGCT
CAACTAATGAATCAGTTAAAAATTTGCTGTTAGAACGTGTAAAAGAGTCAAGGACAAAACCGGATAGCGAAGCAATCAAA
CATTTGGAACAGACCATGGACGAGGTAAGACAGACACTTGAGTCCAAAAATGAAAAAGGTTTCCTCTGGCAACAGATTAA
TCATATTTCCCCCAATGCTCGACAATATTGTGAACAAGTGAAAGCAGCACTCCGGGAACACCTTGAGCATAATCAGGTAC
TATCCGATACTCAAAAAGAAGAAATTCGTAAGGCTATGGATAGAATGGATAATATAGTCAATGATAGTAGCAAAGACAGT
CAACAGAAATATAGGGAAATAAGAAGAGAGGTGATTGAGTTAAATGCCAAAGCCACCACACCGGAAGATGATAATCAATT
AACAAGAAGTCATTTCCAAAAAGCTTATTTTGAATTATCAGGGGATACGCAAAAAACCCTGAATTTAGAATCTCTGTCTC
AAACATTGAATCAACTATCGAAAGCTCATTATGGTGAAACCAACATGACGGACAAAATTACTCAGAGATTGGATGGGTAT
AAAAATCGAAATTGGTTTTGGAATTCAGTCAAGGAAGTTTTGAATTTTTTCAATATTCCTCTTCCCAAACTGCATTCGGA
GGTTAAAGAGCAAATTGCTGACAAGCTCAAAGAAAGACTTGTTGATCTCAAGGAAAAGGGCATGGGTAATGATGTGAATG
CAATCACCAGAGAGCTTGGCAAAGCTCGCGAAGATTTAATTGAACATTATAAGAAAACTTCAAAACTGGAAATGGGAGAA
TTGGATAAGATTATCAATAAATCAATGGAAGAACTCCTTGTGGCACGCAAAGTCACCAAAGACTTGGTCCACGAGGAAGT
TAGTCAGGTTAAATTAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTTTTAATAAAGACATTCATTTTAAGCAATTATGGAGCATTTATTGTTCGCATGGTTTAAAATTATATCAAGGACCAT
TTTTAGTTGATATTCCTGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCACTGTTCTGTTTTGGCAAAGTTATCATAAGAGCAGAGAGTAGCTCCTGTTAACCAGCTTGCCTCAAACTAAAATATTT
ATTAAAAATTATACTATACT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 753; Mature: 752

Protein sequence:

>753_residues
MSTSEKDVREQKVKTVTLSFLGTGQHREKVHHILTSFHNTISEVNKDNPTVAMRMFDGPGSEPKSGDSKDPIPGTYIYNP
KDNSKILISPVISQTITNAIQKLTGNLAGEGIEHLLFEAVLYLNDIIEKNGGQLPETVNLHGFSRGADTCMRMANLLYQL
HPDIKVNLFLIDQVPGPGKRDDPHSYTVPPNVAHFESTLMLHEYRPGFDPQHSGRYVIADPEKTKVVVKPYYGEHNTGNR
VTEDPNTNQTAILLHDDMNRFCRETGSLPSVGISPPIIARVGDKKEEVRTYSELSPEKRFELLCGMKENEWGYAKLTKKY
HERSILSKREDYVQDSRLFVNQEHRELFKQLYPKSFNWFFEKNHGGQTKKEEVIAELKSLSEDPRYEHFFSSLAKHFQIN
ENNIAGTLPEPSGVDRIEKSSFRQPPVRDRLSYLQHSLTSIANYYHYHCDEKSSTNESVKNLLLERVKESRTKPDSEAIK
HLEQTMDEVRQTLESKNEKGFLWQQINHISPNARQYCEQVKAALREHLEHNQVLSDTQKEEIRKAMDRMDNIVNDSSKDS
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KNRNWFWNSVKEVLNFFNIPLPKLHSEVKEQIADKLKERLVDLKEKGMGNDVNAITRELGKAREDLIEHYKKTSKLEMGE
LDKIINKSMEELLVARKVTKDLVHEEVSQVKLN

Sequences:

>Translated_753_residues
MSTSEKDVREQKVKTVTLSFLGTGQHREKVHHILTSFHNTISEVNKDNPTVAMRMFDGPGSEPKSGDSKDPIPGTYIYNP
KDNSKILISPVISQTITNAIQKLTGNLAGEGIEHLLFEAVLYLNDIIEKNGGQLPETVNLHGFSRGADTCMRMANLLYQL
HPDIKVNLFLIDQVPGPGKRDDPHSYTVPPNVAHFESTLMLHEYRPGFDPQHSGRYVIADPEKTKVVVKPYYGEHNTGNR
VTEDPNTNQTAILLHDDMNRFCRETGSLPSVGISPPIIARVGDKKEEVRTYSELSPEKRFELLCGMKENEWGYAKLTKKY
HERSILSKREDYVQDSRLFVNQEHRELFKQLYPKSFNWFFEKNHGGQTKKEEVIAELKSLSEDPRYEHFFSSLAKHFQIN
ENNIAGTLPEPSGVDRIEKSSFRQPPVRDRLSYLQHSLTSIANYYHYHCDEKSSTNESVKNLLLERVKESRTKPDSEAIK
HLEQTMDEVRQTLESKNEKGFLWQQINHISPNARQYCEQVKAALREHLEHNQVLSDTQKEEIRKAMDRMDNIVNDSSKDS
QQKYREIRREVIELNAKATTPEDDNQLTRSHFQKAYFELSGDTQKTLNLESLSQTLNQLSKAHYGETNMTDKITQRLDGY
KNRNWFWNSVKEVLNFFNIPLPKLHSEVKEQIADKLKERLVDLKEKGMGNDVNAITRELGKAREDLIEHYKKTSKLEMGE
LDKIINKSMEELLVARKVTKDLVHEEVSQVKLN
>Mature_752_residues
STSEKDVREQKVKTVTLSFLGTGQHREKVHHILTSFHNTISEVNKDNPTVAMRMFDGPGSEPKSGDSKDPIPGTYIYNPK
DNSKILISPVISQTITNAIQKLTGNLAGEGIEHLLFEAVLYLNDIIEKNGGQLPETVNLHGFSRGADTCMRMANLLYQLH
PDIKVNLFLIDQVPGPGKRDDPHSYTVPPNVAHFESTLMLHEYRPGFDPQHSGRYVIADPEKTKVVVKPYYGEHNTGNRV
TEDPNTNQTAILLHDDMNRFCRETGSLPSVGISPPIIARVGDKKEEVRTYSELSPEKRFELLCGMKENEWGYAKLTKKYH
ERSILSKREDYVQDSRLFVNQEHRELFKQLYPKSFNWFFEKNHGGQTKKEEVIAELKSLSEDPRYEHFFSSLAKHFQINE
NNIAGTLPEPSGVDRIEKSSFRQPPVRDRLSYLQHSLTSIANYYHYHCDEKSSTNESVKNLLLERVKESRTKPDSEAIKH
LEQTMDEVRQTLESKNEKGFLWQQINHISPNARQYCEQVKAALREHLEHNQVLSDTQKEEIRKAMDRMDNIVNDSSKDSQ
QKYREIRREVIELNAKATTPEDDNQLTRSHFQKAYFELSGDTQKTLNLESLSQTLNQLSKAHYGETNMTDKITQRLDGYK
NRNWFWNSVKEVLNFFNIPLPKLHSEVKEQIADKLKERLVDLKEKGMGNDVNAITRELGKAREDLIEHYKKTSKLEMGEL
DKIINKSMEELLVARKVTKDLVHEEVSQVKLN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86815; Mature: 86684

Theoretical pI: Translated: 7.01; Mature: 7.01

Prosite motif: PS00867 CPSASE_2

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSTSEKDVREQKVKTVTLSFLGTGQHREKVHHILTSFHNTISEVNKDNPTVAMRMFDGPG
CCCCHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCC
SEPKSGDSKDPIPGTYIYNPKDNSKILISPVISQTITNAIQKLTGNLAGEGIEHLLFEAV
CCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYLNDIIEKNGGQLPETVNLHGFSRGADTCMRMANLLYQLHPDIKVNLFLIDQVPGPGKR
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCC
DDPHSYTVPPNVAHFESTLMLHEYRPGFDPQHSGRYVIADPEKTKVVVKPYYGEHNTGNR
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
VTEDPNTNQTAILLHDDMNRFCRETGSLPSVGISPPIIARVGDKKEEVRTYSELSPEKRF
CCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH
ELLCGMKENEWGYAKLTKKYHERSILSKREDYVQDSRLFVNQEHRELFKQLYPKSFNWFF
HHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
EKNHGGQTKKEEVIAELKSLSEDPRYEHFFSSLAKHFQINENNIAGTLPEPSGVDRIEKS
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHH
SFRQPPVRDRLSYLQHSLTSIANYYHYHCDEKSSTNESVKNLLLERVKESRTKPDSEAIK
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
HLEQTMDEVRQTLESKNEKGFLWQQINHISPNARQYCEQVKAALREHLEHNQVLSDTQKE
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIRKAMDRMDNIVNDSSKDSQQKYREIRREVIELNAKATTPEDDNQLTRSHFQKAYFELS
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
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CCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
LPKLHSEVKEQIADKLKERLVDLKEKGMGNDVNAITRELGKAREDLIEHYKKTSKLEMGE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
LDKIINKSMEELLVARKVTKDLVHEEVSQVKLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
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ELLCGMKENEWGYAKLTKKYHERSILSKREDYVQDSRLFVNQEHRELFKQLYPKSFNWFF
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SFRQPPVRDRLSYLQHSLTSIANYYHYHCDEKSSTNESVKNLLLERVKESRTKPDSEAIK
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CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
LDKIINKSMEELLVARKVTKDLVHEEVSQVKLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA