Definition | Legionella pneumophila str. Lens, complete genome. |
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Accession | NC_006369 |
Length | 3,345,687 |
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The map label for this gene is 54295150
Identifier: 54295150
GI number: 54295150
Start: 2546271
End: 2549750
Strand: Reverse
Name: 54295150
Synonym: lpl2230
Alternate gene names: NA
Gene position: 2549750-2546271 (Counterclockwise)
Preceding gene: 54295152
Following gene: 54295149
Centisome position: 76.21
GC content: 39.05
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases ATAATAATGACTTTGGCTCTCATTTTTGGTAGTACGAAGCTATTTTGCCAAATAAGAGAGCCAGGAAATAAATGACAAGA AGGAGTAATCAATTGAACTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1159; Mature: 1158
Protein sequence:
>1159_residues MAKNKEFFDALKEIAETAKDDETLRNDTINVLDDILKTDPSDPDAFREIIADNQEFWDEYDTGLMEFNEGWFFGKSRKQY LESDDFLDSNDTTDSFQKLHQFAAEQRVKFDLVKSDVDTLVAILKNNPDECRAYIASKKPALGNFSEENVHGWKKDEYTP TIPPVTINKSTDVLPDEAINRIKKEAGELLLIKLINSSENTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGVLFLSREVV DALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHDALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPESEWERAKGVLGARYLQAVLS SGTQNLKDALNAKDANALIAELKKPALLGPHDYIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKALDGAKNLD KFKEVLGKLGITPEDWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTQLPVEKQREILAKPQQLRHLMNA YESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVVAINQALTTANSNPNTYTQVTDYK TLIDAIKTQSGPVNQKDFYNAFNLNDDGSAFTSSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNPGNKKLLAVLLSIEKPVTFS KDIVNRFLRPLKDSETPQEYADRLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRRQELLDTNPAHVMAAIKDLNTE FEAIKKITGPIRANADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCELVVDQLRRQVIALEGHLKSLPQD SQFKAAGLTLEQKEEIKKLRTDLQTELDAVRKDLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHPPVSRDQIP PLPNVPNPSLRSTTTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVTSKKGEIGK VPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGSNPEELEYLYTALVILGEKNP KFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKEREKVDSKVQE ITDKQSKMKKELNPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK
Sequences:
>Translated_1159_residues MAKNKEFFDALKEIAETAKDDETLRNDTINVLDDILKTDPSDPDAFREIIADNQEFWDEYDTGLMEFNEGWFFGKSRKQY LESDDFLDSNDTTDSFQKLHQFAAEQRVKFDLVKSDVDTLVAILKNNPDECRAYIASKKPALGNFSEENVHGWKKDEYTP TIPPVTINKSTDVLPDEAINRIKKEAGELLLIKLINSSENTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGVLFLSREVV DALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHDALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPESEWERAKGVLGARYLQAVLS SGTQNLKDALNAKDANALIAELKKPALLGPHDYIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKALDGAKNLD KFKEVLGKLGITPEDWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTQLPVEKQREILAKPQQLRHLMNA YESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVVAINQALTTANSNPNTYTQVTDYK TLIDAIKTQSGPVNQKDFYNAFNLNDDGSAFTSSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNPGNKKLLAVLLSIEKPVTFS KDIVNRFLRPLKDSETPQEYADRLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRRQELLDTNPAHVMAAIKDLNTE FEAIKKITGPIRANADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCELVVDQLRRQVIALEGHLKSLPQD SQFKAAGLTLEQKEEIKKLRTDLQTELDAVRKDLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHPPVSRDQIP PLPNVPNPSLRSTTTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVTSKKGEIGK VPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGSNPEELEYLYTALVILGEKNP KFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKEREKVDSKVQE ITDKQSKMKKELNPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK >Mature_1158_residues AKNKEFFDALKEIAETAKDDETLRNDTINVLDDILKTDPSDPDAFREIIADNQEFWDEYDTGLMEFNEGWFFGKSRKQYL ESDDFLDSNDTTDSFQKLHQFAAEQRVKFDLVKSDVDTLVAILKNNPDECRAYIASKKPALGNFSEENVHGWKKDEYTPT IPPVTINKSTDVLPDEAINRIKKEAGELLLIKLINSSENTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGVLFLSREVVD ALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHDALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPESEWERAKGVLGARYLQAVLSS GTQNLKDALNAKDANALIAELKKPALLGPHDYIDKAVTEENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKALDGAKNLDK FKEVLGKLGITPEDWVKDTDLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTQLPVEKQREILAKPQQLRHLMNAY ESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVVAINQALTTANSNPNTYTQVTDYKT LIDAIKTQSGPVNQKDFYNAFNLNDDGSAFTSSTPRKDEMSKQQQHNQHIYAEYNSTSNPGNKKLLAVLLSIEKPVTFSK DIVNRFLRPLKDSETPQEYADRLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRRQELLDTNPAHVMAAIKDLNTEF EAIKKITGPIRANADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCELVVDQLRRQVIALEGHLKSLPQDS QFKAAGLTLEQKEEIKKLRTDLQTELDAVRKDLDFYKKIQGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHPPVSRDQIPP LPNVPNPSLRSTTTATTGSNGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVTSKKGEIGKV PGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGSNPEELEYLYTALVILGEKNPK FKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTNTGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKEREKVDSKVQEI TDKQSKMKKELNPVHKTTERTIEQEGPAPESPSTGMRK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 130231; Mature: 130100
Theoretical pI: Translated: 6.23; Mature: 6.23
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAKNKEFFDALKEIAETAKDDETLRNDTINVLDDILKTDPSDPDAFREIIADNQEFWDEY CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH DTGLMEFNEGWFFGKSRKQYLESDDFLDSNDTTDSFQKLHQFAAEQRVKFDLVKSDVDTL CCCCEEECCCEEECCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAILKNNPDECRAYIASKKPALGNFSEENVHGWKKDEYTPTIPPVTINKSTDVLPDEAIN HHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHH RIKKEAGELLLIKLINSSENTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGVLFLSREVV HHHHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECHHHH DALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHDALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPE HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCC SEWERAKGVLGARYLQAVLSSGTQNLKDALNAKDANALIAELKKPALLGPHDYIDKAVTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH ENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKALDGAKNLDKFKEVLGKLGITPEDWVKDT HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCC DLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTQLPVEKQREILAKPQQLRHLMNA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH YESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVVAIN HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEEEEEH QALTTANSNPNTYTQVTDYKTLIDAIKTQSGPVNQKDFYNAFNLNDDGSAFTSSTPRKDE HHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHH MSKQQQHNQHIYAEYNSTSNPGNKKLLAVLLSIEKPVTFSKDIVNRFLRPLKDSETPQEY HHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH ADRLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRRQELLDTNPAHVMAAIKDLNTE HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHH FEAIKKITGPIRANADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCELVV HHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH DQLRRQVIALEGHLKSLPQDSQFKAAGLTLEQKEEIKKLRTDLQTELDAVRKDLDFYKKI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHPPVSRDQIPPLPNVPNPSLRSTTTATTGS HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC NGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVTSKKGEIGK CCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCC VPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGS CCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCC NPEELEYLYTALVILGEKNPKFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTN CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCEEECCEEECCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHC TGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKEREKVDSKVQEITDKQSKMKKELNPVHKTTE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RTIEQEGPAPESPSTGMRK HHHHHCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure AKNKEFFDALKEIAETAKDDETLRNDTINVLDDILKTDPSDPDAFREIIADNQEFWDEY CCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH DTGLMEFNEGWFFGKSRKQYLESDDFLDSNDTTDSFQKLHQFAAEQRVKFDLVKSDVDTL CCCCEEECCCEEECCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAILKNNPDECRAYIASKKPALGNFSEENVHGWKKDEYTPTIPPVTINKSTDVLPDEAIN HHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHH RIKKEAGELLLIKLINSSENTQLLKDLRDAMSKPEAERAANALGFPTEGNGVLFLSREVV HHHHHHCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECHHHH DALEERVEKLEQEAAKRGFDSYVQSLSHDALLAKKNGLESTTAAGFKNSLDEPYKTYLPE HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCC SEWERAKGVLGARYLQAVLSSGTQNLKDALNAKDANALIAELKKPALLGPHDYIDKAVTE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH ENLGSLKKNMMKSFINNIKDETNLKALDALKALDGAKNLDKFKEVLGKLGITPEDWVKDT HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCC DLKDMKQWARARQFELEINRVSSLGSGAHSKLMSTLTQLPVEKQREILAKPQQLRHLMNA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH YESHVAEHYLGKNASGIAELLTENKRLEGFRAIHNAEVARVLANFKPEITLNDKQVVAIN HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCEEEEEH QALTTANSNPNTYTQVTDYKTLIDAIKTQSGPVNQKDFYNAFNLNDDGSAFTSSTPRKDE HHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHH MSKQQQHNQHIYAEYNSTSNPGNKKLLAVLLSIEKPVTFSKDIVNRFLRPLKDSETPQEY HHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH ADRLFGENPTNPANKKFKDDLLRELTPTVFNEIKNDLRRQELLDTNPAHVMAAIKDLNTE HHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCHH FEAIKKITGPIRANADKLKFINDIDPVHLYNPTFQGTARSKAAQMKERYEGLSRDCELVV HHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH DQLRRQVIALEGHLKSLPQDSQFKAAGLTLEQKEEIKKLRTDLQTELDAVRKDLDFYKKI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QGKLETIVKEVDVAAKGKMHYYYNSEGIKRHPPVSRDQIPPLPNVPNPSLRSTTTATTGS HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC NGRIQEFLVGEKIPEGQIVVVDVSHKTAPKSGAPVETIGRYTQDNNVPDQVTSKKGEIGK CCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCC VPGSKFEILQFPTQVPPPNPPSGDPLVEAKVNFSMAMAADILASLDSPPTKDKPIRLRGS CCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEECCC NPEELEYLYTALVILGEKNPKFKFNRDAIEVNSAVFHPDNVKGRLWGFSSNSLYSQVFTN CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCEEECCEEECCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHC TGLTETQNIIQSKIKHMQQMTDEKFSPQKEREKVDSKVQEITDKQSKMKKELNPVHKTTE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RTIEQEGPAPESPSTGMRK HHHHHCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA