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The map label for this gene is 54020448

Identifier: 54020448

GI number: 54020448

Start: 355286

End: 356428

Strand: Reverse

Name: 54020448

Synonym: mhp310

Alternate gene names: NA

Gene position: 356428-355286 (Counterclockwise)

Preceding gene: 54020449

Following gene: 54020447

Centisome position: 39.92

GC content: 26.07

Gene sequence:

>1143_bases
ATGCGTTATTTAATTAATTTAAAAATGAATACAAAATTTAATTATGGTAATTCCATAAAATTTATATTAGTTTTTTTGTT
GTCGATTCTTAAAATAATACTTCTTGTTATATTTGCTTTTTTAATTAGTATTACCGGTGTTGATGACAGACAAACAACTG
GATTAGATTTGTCAACACCAATTGGAAGATTAAAAGCCGCAATAGGTGGCATATTTTGATTGTTAATTTTTGCCTCATTG
GTTTTGCGTATCATTTTTGCTTGAAAATTAAGGGATGATGAAGTCTTTAGACAAACTGGGCTAGATGTTAAGCAATATTC
GATTGGCTTTGCCCTTATTCCTTTACTTACTTCAATTTTATTAATTACTAAGTCACTTAGAGACAAAATTTCAATTGGCA
ATGATTGAACTACAAGGCAATTAATACTTAAATGAAAAATCATTAACTTTATTAAGGATTTGGTTGTTTTTCTTTGACTT
TCCTCGATTGTACTTGCTGTTGTTTCGTTAATTCTTCGCTCTCGCACAAATAATACAATGTTTGAAGAATTTAATGATGT
TGTGATTATAACAATCTTTGTTGGGATTTTCTATTTTTTAATTCCATTTTATTTTTTGGTTTCCTATTCTCTTAAAATAT
ACAGATTAATCAACAAAAGAGAAAAAACTTATTGGAAATCAGCTAGTTACGTTTTTTTCATGCCATTTTTTTACTTCAAT
GCTTGAAAAAATGTTTTGAGACTTTCTAAAAAATTAAAAATTGCAGAAAATACACTAGCAGGTCAAAATGAAGTAGAAAA
ACAAGTAATTAATAACAAAATTAGTCGACAATTTTATCAATTTACAGTTGTAAAAAATATATTCCATTTAATTTTTCTTA
TAGTTTTTACAACGACAATGTGGCTAGTTATAACTAAAAATGAAATTCTTCGTAACACTGGTGTTAGTCTAATTTTCTTT
AATTTATTTAATATTTCAACTATGACTTACCTTATATACATTGGGCCACGTTATTTAGCAGATTCTGTTAATATGCATTC
CAAACGAACTTCACTAATTTTATATATCTTAGACATTTTTATACCTACAGTTTCTATTTATAACCTAATAAAATATAAGC
AAAACAAGACTATTTTAGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTGAGCAAATTACATCTATTATTACAATTTATATTGAGGAGTAAATAGGGAGAATTAATTAATATTCATAAGTGTA
TATTAAAAAATGGGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTATCATAATTTTATATACTACTATTAATTTTTTATTAAGGAATTGTAAAAAAAATATCTTATTTTAAAATACTTTT
TTTACATATACTGGTTTTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 380; Mature: 380

Protein sequence:

>380_residues
MRYLINLKMNTKFNYGNSIKFILVFLLSILKIILLVIFAFLISITGVDDRQTTGLDLSTPIGRLKAAIGGIFWLLIFASL
VLRIIFAWKLRDDEVFRQTGLDVKQYSIGFALIPLLTSILLITKSLRDKISIGNDWTTRQLILKWKIINFIKDLVVFLWL
SSIVLAVVSLILRSRTNNTMFEEFNDVVIITIFVGIFYFLIPFYFLVSYSLKIYRLINKREKTYWKSASYVFFMPFFYFN
AWKNVLRLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKNEILRNTGVSLIFF
NLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFIPTVSIYNLIKYKQNKTILV

Sequences:

>Translated_380_residues
MRYLINLKMNTKFNYGNSIKFILVFLLSILKIILLVIFAFLISITGVDDRQTTGLDLSTPIGRLKAAIGGIF*LLIFASL
VLRIIFA*KLRDDEVFRQTGLDVKQYSIGFALIPLLTSILLITKSLRDKISIGND*TTRQLILK*KIINFIKDLVVFL*L
SSIVLAVVSLILRSRTNNTMFEEFNDVVIITIFVGIFYFLIPFYFLVSYSLKIYRLINKREKTYWKSASYVFFMPFFYFN
A*KNVLRLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKNEILRNTGVSLIFF
NLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFIPTVSIYNLIKYKQNKTILV
>Mature_380_residues
MRYLINLKMNTKFNYGNSIKFILVFLLSILKIILLVIFAFLISITGVDDRQTTGLDLSTPIGRLKAAIGGIF*LLIFASL
VLRIIFA*KLRDDEVFRQTGLDVKQYSIGFALIPLLTSILLITKSLRDKISIGND*TTRQLILK*KIINFIKDLVVFL*L
SSIVLAVVSLILRSRTNNTMFEEFNDVVIITIFVGIFYFLIPFYFLVSYSLKIYRLINKREKTYWKSASYVFFMPFFYFN
A*KNVLRLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKNEILRNTGVSLIFF
NLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFIPTVSIYNLIKYKQNKTILV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43311; Mature: 43311

Theoretical pI: Translated: 10.60; Mature: 10.60

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRYLINLKMNTKFNYGNSIKFILVFLLSILKIILLVIFAFLISITGVDDRQTTGLDLSTP
CCEEEEEEEECEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
IGRLKAAIGGIFLLIFASLVLRIIFAKLRDDEVFRQTGLDVKQYSIGFALIPLLTSILLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TKSLRDKISIGNDTTRQLILKKIINFIKDLVVFLLSSIVLAVVSLILRSRTNNTMFEEFN
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHC
DVVIITIFVGIFYFLIPFYFLVSYSLKIYRLINKREKTYWKSASYVFFMPFFYFNAKNVL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEHHHHHHCHHHHH
RLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEH
NEILRNTGVSLIFFNLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFIPTVSI
HHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNLIKYKQNKTILV
HHHHHHCCCCEEEC
>Mature Secondary Structure
MRYLINLKMNTKFNYGNSIKFILVFLLSILKIILLVIFAFLISITGVDDRQTTGLDLSTP
CCEEEEEEEECEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
IGRLKAAIGGIFLLIFASLVLRIIFAKLRDDEVFRQTGLDVKQYSIGFALIPLLTSILLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TKSLRDKISIGNDTTRQLILKKIINFIKDLVVFLLSSIVLAVVSLILRSRTNNTMFEEFN
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHC
DVVIITIFVGIFYFLIPFYFLVSYSLKIYRLINKREKTYWKSASYVFFMPFFYFNAKNVL
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEHHHHHHCHHHHH
RLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITK
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEH
NEILRNTGVSLIFFNLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFIPTVSI
HHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNLIKYKQNKTILV
HHHHHHCCCCEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA