| Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006360 |
| Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020449
Identifier: 54020449
GI number: 54020449
Start: 356467
End: 357333
Strand: Reverse
Name: 54020449
Synonym: mhp311
Alternate gene names: NA
Gene position: 357333-356467 (Counterclockwise)
Preceding gene: 54020450
Following gene: 54020448
Centisome position: 40.03
GC content: 28.03
Gene sequence:
>867_bases ATGAAATACTCATTTATAAAATCGAATAAGTTTAAAATTTTTTCATCAGGATTAATGCTAACAACGTTGGCCAGTCCATT ATTATTTACTTCAATCGCACCACTACAACAAAAACAAATTGCTCCAGAAATCAAGATTCAAAGCAATGAATTTTCAAGCA CCGAGATTTTAAAAAATAATGTTATTAAATATGTTTTTGAAAATGATAAAAAAAACATTGATTCTATCAAATTTGAACTA AATAAACTCGTAAAATTAAATAAACTCAATGATCTTTCAGAAGAAGATCTAAATAAATTTGCTGAAAATTTAGTTTCTTT TACCAAAGATCATTTTAAGGATAAAGAACTTCTCGAAGAAGCATGATATCATTGATTTCCAATGGCATTTTGATATGGCC TTTATGGAGTTGCTACTGTTTTTGATGCTGGATTATCTTTGCTAGGCGAAGTATTCAATAACCTGCCTACCATTATAGAT ATTGCTCAAATTGCTTGAGATACATTATCCGGTAACTATGTAACAGCAACTATAAATGCTTTTATTCTAGCAACTAAATT ACTATCCTCAATGTATGCGGACGAAAAAGATATTATTCGTAAGTCAATTGGTGAAACAGAAATTGGTCTTGTTAATGATC TTATATTAAATCGCGACCCAGATAAAATAATTAATAATGTTCTTAAAAGTTTAAGTATTAGCCTTGCTATTAACTCAACT ATGAATTTAGCTTTTGATCCTATTAACTCGTTAATACAAAAAGGTATTAGTGTACTTAGGGAAAAGATTAGCTTTGACAA AGTTAAAATTTGAGCAAATTACATCTATTATTACAATTTATATTGAGGAGTAAATAGGGAGAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAAAATAAGGATTTTTTTAAGCATTTGATGTTTGTATAATTCTTATATATTTATGGTATAATAAATTATACAAAATATTT AAGTCTTATGGAGGAAAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATATTCATAAGTGTATATTAAAAAATGGGATAAATATGCGTTATTTAATTAATTTAAAAATGAATACAAAATTTAAT TATGGTAATTCCATAAAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 288; Mature: 288
Protein sequence:
>288_residues MKYSFIKSNKFKIFSSGLMLTTLASPLLFTSIAPLQQKQIAPEIKIQSNEFSSTEILKNNVIKYVFENDKKNIDSIKFEL NKLVKLNKLNDLSEEDLNKFAENLVSFTKDHFKDKELLEEAWYHWFPMAFWYGLYGVATVFDAGLSLLGEVFNNLPTIID IAQIAWDTLSGNYVTATINAFILATKLLSSMYADEKDIIRKSIGETEIGLVNDLILNRDPDKIINNVLKSLSISLAINST MNLAFDPINSLIQKGISVLREKISFDKVKIWANYIYYYNLYWGVNREN
Sequences:
>Translated_288_residues MKYSFIKSNKFKIFSSGLMLTTLASPLLFTSIAPLQQKQIAPEIKIQSNEFSSTEILKNNVIKYVFENDKKNIDSIKFEL NKLVKLNKLNDLSEEDLNKFAENLVSFTKDHFKDKELLEEA*YH*FPMAF*YGLYGVATVFDAGLSLLGEVFNNLPTIID IAQIA*DTLSGNYVTATINAFILATKLLSSMYADEKDIIRKSIGETEIGLVNDLILNRDPDKIINNVLKSLSISLAINST MNLAFDPINSLIQKGISVLREKISFDKVKI*ANYIYYYNLY*GVNREN >Mature_288_residues MKYSFIKSNKFKIFSSGLMLTTLASPLLFTSIAPLQQKQIAPEIKIQSNEFSSTEILKNNVIKYVFENDKKNIDSIKFEL NKLVKLNKLNDLSEEDLNKFAENLVSFTKDHFKDKELLEEA*YH*FPMAF*YGLYGVATVFDAGLSLLGEVFNNLPTIID IAQIA*DTLSGNYVTATINAFILATKLLSSMYADEKDIIRKSIGETEIGLVNDLILNRDPDKIINNVLKSLSISLAINST MNLAFDPINSLIQKGISVLREKISFDKVKI*ANYIYYYNLY*GVNREN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 31778; Mature: 31778
Theoretical pI: Translated: 5.92; Mature: 5.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKYSFIKSNKFKIFSSGLMLTTLASPLLFTSIAPLQQKQIAPEIKIQSNEFSSTEILKNN CCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH VIKYVFENDKKNIDSIKFELNKLVKLNKLNDLSEEDLNKFAENLVSFTKDHFKDKELLEE HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH AYHFPMAFYGLYGVATVFDAGLSLLGEVFNNLPTIIDIAQIADTLSGNYVTATINAFILA HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHH TKLLSSMYADEKDIIRKSIGETEIGLVNDLILNRDPDKIINNVLKSLSISLAINSTMNLA HHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEHEEECCCHHHH FDPINSLIQKGISVLREKISFDKVKIANYIYYYNLYGVNREN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHEEEEEEEEECCCCC >Mature Secondary Structure MKYSFIKSNKFKIFSSGLMLTTLASPLLFTSIAPLQQKQIAPEIKIQSNEFSSTEILKNN CCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH VIKYVFENDKKNIDSIKFELNKLVKLNKLNDLSEEDLNKFAENLVSFTKDHFKDKELLEE HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHH AYHFPMAFYGLYGVATVFDAGLSLLGEVFNNLPTIIDIAQIADTLSGNYVTATINAFILA HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHH TKLLSSMYADEKDIIRKSIGETEIGLVNDLILNRDPDKIINNVLKSLSISLAINSTMNLA HHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEHEEECCCHHHH FDPINSLIQKGISVLREKISFDKVKIANYIYYYNLYGVNREN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHEEEEEEEEECCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA