Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
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Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020242
Identifier: 54020242
GI number: 54020242
Start: 675374
End: 681295
Strand: Direct
Name: 54020242
Synonym: mhp539
Alternate gene names: NA
Gene position: 675374-681295 (Clockwise)
Preceding gene: 54020241
Following gene: 54020243
Centisome position: 75.65
GC content: 24.54
Gene sequence:
>5922_bases ATGCAAAAACCTGATTTTTCTAAAGCTTTTAAAATCTTTTTATCATATTCTTCTTGCTTAACTTCAAGTCTAGCTCTTTT ATCCTGTTATTCTTCCTTAACTTCAAATCGAGATAGCAGAACACCAAATCAAAATGAAAACGAGTTAACTGACAAAAAAA ACACAAATACTTCCAATAGATTTAAAAATAACGTAATTTTGAGCGAAATTAAATATTTAACACTTGGCGATTCAATTTCT GCAGGGTTCAACTGGGACTATAGTTTTGATTTTCGGGGTAATATTAACAAAAATTTGAAAATTAAAGGACTTTCATATGC AGCATTTTTTGCCGATTTTATTCAAAAAATTAAACCAAATGCAATAAAATCCTTTGATAATCTTGCTCTTTCTTGAACAA CAATTAAAGACTGGCTTTATCTTTTAGATTCTGAAAATGAAAAATTTCAAAATTTTGACAAGATACGTTTGAATTTTAAT TACGAACTTGATAAACTAACAAAATCACCTTATGGAAAGCAAATTCGTGATGTTTTTGGTAATTTTTCTGCTAAAAATTA CCCAAAATTAAAAGAAAAAATTAAAAGCGCTAATCTTTTAACAGTCTCTCTTGGCGCAAATGATTTAATGGAATCAATTG ATTTTAAAACAATTGCAAAACCCAACCAAAAAATTGCCACTAAAGCCGAAGCTGCTGCTGAATTTGTTGCAAAAATTAAT TTAGCTATTGTTAAATTAGAAAAAAATTTAAATATATTTATTGAAAAAATCCGAAAAATTAACCCTAATTTAGAAATAGT TTTAGTTGGTTATAACATTTTGTTTTCATCTTCAATGAAATTTTTTGATAAATTATTGACAAACGAGCTCGGTCTTCCTA ATAATTACACAATTATTGCACTTAAGCAGTTAAATGAAGCAGTTAAAAAAGTAGCTCAAAAACAAGGGATTAATTTTGTT 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Upstream 100 bases:
>100_bases GTTAAAATTATGCTAAACAAAGGGAAAAAGTCACAAATTTTATTACCCTACAATAAATCATTATAAAAATAATAAAATAA TCAATAGAAAAAAGAGAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GAAAAATTATACACTAAAAAAATTTATTTCAAAAATAAAAAACTTCAGAATAAACTGAAGTTTTTTTATGAATATTTTAA ATTATTTTTAAATATTAAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1973; Mature: 1973
Protein sequence:
>1973_residues MQKPDFSKAFKIFLSYSSCLTSSLALLSCYSSLTSNRDSRTPNQNENELTDKKNTNTSNRFKNNVILSEIKYLTLGDSIS AGFNWDYSFDFRGNINKNLKIKGLSYAAFFADFIQKIKPNAIKSFDNLALSWTTIKDWLYLLDSENEKFQNFDKIRLNFN YELDKLTKSPYGKQIRDVFGNFSAKNYPKLKEKIKSANLLTVSLGANDLMESIDFKTIAKPNQKIATKAEAAAEFVAKIN LAIVKLEKNLNIFIEKIRKINPNLEIVLVGYNILFSSSMKFFDKLLTNELGLPNNYTIIALKQLNEAVKKVAQKQGINFV DLYNERSWLDKTNKFAKNEFDIHPSTKGYKKMAQDLLFKLALEQGPNFKTDYFEKLDWNQEYFEKDSNCYKRVLNLGPNS EIFKTLSIDNSVNKFITNKSEIEEISSAEIEKVKNSQLAILSRIWYEVSFGTFIDGFLRSNTQISEKLREMLINFWQQNA KNNPSFSKLLHQFLQSDFWLEIIGRFQNYINDVIINQNLEKATISGLTSFLFTDFSEKKLISVFKDAVNSDFASQNINKI KELIFICVFGQSAIQELLINSIIGISAEYKSDLQVIFSFESTRNLFTKIINDFVLESAKYENVNNFLDILKIFLDKPKNY ENIVKFSRNFISESLKHRKTVNFLVQIINSNFNLNLSEDDKNALISLLLSVSDTIIRTKTWEKLNNEGAKSFLNIVKNTD FRHTSKKISTILGSQVQGTYALFFKNTTNLINLLHELLSFDLSNYQIEVLKRLLTKLYPLISKFKLSYFISTDSPNYNNF SVFFNSVKGFLIENSFQIFNKIISEAINDFVVNKLLYQKIGNLNRFGFEFLRNNLEKFEENIFDFLAKCVNNIDFFTNLS DLINKSLQSEGLSQKSVLTFSKIIKTIFDDFGEKYKNKQLNKNEQDENLIFILVKEAIKSFKNFTNDNFNKYNELKVNLE KAEDEKNNSKINFYKTKIDELENNLSIINFSNFFLKNLIETDIKYKILKNIAKINLKNKIGSQDLILFFKDLFSKSFLHK QIVSNLENNRIFGKEGVKNSLLELLVNFFNSNQVEKLLEKFVDYFFESKKFEKTTDFTGFVTNFIKEHAELIEKIFGLFL GDTATWNSLSNFLMSIFQASKINLSEKATTTILTLVRNIFTKWKNSTLNFENNQKKESPLVIQALIKIIFDSFSDKHTLT KSIFESIIDSLSVDIANNYYKKNENSWSTSDQISQNEIANLFAEIAQTEAISEKIKSNFINIHLEYREKIQQIFDAFLKS NALVELFDGYFKIIAKAEINEPLNNFSLVKSLFENQYFTKIIGKFIIKLENNVNLKQNFTLLLSKIFNVNFEENEFEPLF KLIKYIIQDNINNYYSNEEDPKNFLYKKLTNNSNLSSENTSQNNENLGAENSENTIKYGIYFKKNALLTKLVSLISKLAN TNLSTANINFILENEIGNEEFIIEFLKQIGCVFDKITKTDQEKIWEILVKIFKSNFLKKGIEFFKFSNFNKYKLFEELSI QKKEQINSALRSAMENFLPNPVNKLLIFRIFNFINQNPDKFKEIRKFSGLLTEFLKDNQTSSNMQENQKLTEKIDNSAFL KSYLWYLINFLVKNEEFSQLIVSQILEYLHLDIKDEKNYYLKTKGISNPEEIIKNFLNHFINLGFENKIIEKILEQIINS VKSAHLEAKSNFFDNILTNLKLSEVLNLDLLVNLEEKITDEKTLNNKLPQLEPKIDEHNLIINLPQNQQIPIDSFVDFLD LIFLASPKWNKEKQAEVSPLLKELNNITYTGISFADLLKSNQRDLKLEAISKLFSKIYSENITKENYKNSARGRNLYRFL LMLLFYAYESRIKNSPLRTSAFYGSILSSSTASEMILNSLKNAGKNEKNSQKYSEFIDFLKGNPIKVKGWLINTWYTAKD VRLDDMLTLIYYNNEDNRFKNETGQEKYKDQILEQIRQGHFPDNFENPKIISK
Sequences:
>Translated_1973_residues MQKPDFSKAFKIFLSYSSCLTSSLALLSCYSSLTSNRDSRTPNQNENELTDKKNTNTSNRFKNNVILSEIKYLTLGDSIS AGFNWDYSFDFRGNINKNLKIKGLSYAAFFADFIQKIKPNAIKSFDNLALS*TTIKDWLYLLDSENEKFQNFDKIRLNFN YELDKLTKSPYGKQIRDVFGNFSAKNYPKLKEKIKSANLLTVSLGANDLMESIDFKTIAKPNQKIATKAEAAAEFVAKIN LAIVKLEKNLNIFIEKIRKINPNLEIVLVGYNILFSSSMKFFDKLLTNELGLPNNYTIIALKQLNEAVKKVAQKQGINFV DLYNERSWLDKTNKFAKNEFDIHPSTKGYKKMAQDLLFKLALEQGPNFKTDYFEKLD*NQEYFEKDSNCYKRVLNLGPNS EIFKTLSIDNSVNKFITNKSEIEEISSAEIEKVKNSQLAILSRI*YEVSFGTFIDGFLRSNTQISEKLREMLINFWQQNA KNNPSFSKLLHQFLQSDF*LEIIGRFQNYINDVIINQNLEKATISGLTSFLFTDFSEKKLISVFKDAVNSDFASQNINKI KELIFICVFGQSAIQELLINSIIGISAEYKSDLQVIFSFESTRNLFTKIINDFVLESAKYENVNNFLDILKIFLDKPKNY ENIVKFSRNFISESLKHRKTVNFLVQIINSNFNLNLSEDDKNALISLLLSVSDTIIRTKT*EKLNNEGAKSFLNIVKNTD FRHTSKKISTILGSQVQGTYALFFKNTTNLINLLHELLSFDLSNYQIEVLKRLLTKLYPLISKFKLSYFISTDSPNYNNF SVFFNSVKGFLIENSFQIFNKIISEAINDFVVNKLLYQKIGNLNRFGFEFLRNNLEKFEENIFDFLAKCVNNIDFFTNLS DLINKSLQSEGLSQKSVLTFSKIIKTIFDDFGEKYKNKQLNKNEQDENLIFILVKEAIKSFKNFTNDNFNKYNELKVNLE KAEDEKNNSKINFYKTKIDELENNLSIINFSNFFLKNLIETDIKYKILKNIAKINLKNKIGSQDLILFFKDLFSKSFLHK QIVSNLENNRIFGKEGVKNSLLELLVNFFNSNQVEKLLEKFVDYFFESKKFEKTTDFTGFVTNFIKEHAELIEKIFGLFL GDTAT*NSLSNFLMSIFQASKINLSEKATTTILTLVRNIFTK*KNSTLNFENNQKKESPLVIQALIKIIFDSFSDKHTLT KSIFESIIDSLSVDIANNYYKKNENS*STSDQISQNEIANLFAEIAQTEAISEKIKSNFINIHLEYREKIQQIFDAFLKS NALVELFDGYFKIIAKAEINEPLNNFSLVKSLFENQYFTKIIGKFIIKLENNVNLKQNFTLLLSKIFNVNFEENEFEPLF KLIKYIIQDNINNYYSNEEDPKNFLYKKLTNNSNLSSENTSQNNENLGAENSENTIKYGIYFKKNALLTKLVSLISKLAN TNLSTANINFILENEIGNEEFIIEFLKQIGCVFDKITKTDQEKIWEILVKIFKSNFLKKGIEFFKFSNFNKYKLFEELSI QKKEQINSALRSAMENFLPNPVNKLLIFRIFNFINQNPDKFKEIRKFSGLLTEFLKDNQTSSNMQENQKLTEKIDNSAFL KSYL*YLINFLVKNEEFSQLIVSQILEYLHLDIKDEKNYYLKTKGISNPEEIIKNFLNHFINLGFENKIIEKILEQIINS VKSAHLEAKSNFFDNILTNLKLSEVLNLDLLVNLEEKITDEKTLNNKLPQLEPKIDEHNLIINLPQNQQIPIDSFVDFLD LIFLASPK*NKEKQAEVSPLLKELNNITYTGISFADLLKSNQRDLKLEAISKLFSKIYSENITKENYKNSARGRNLYRFL LMLLFYAYESRIKNSPLRTSAFYGSILSSSTASEMILNSLKNAGKNEKNSQKYSEFIDFLKGNPIKVKG*LINTWYTAKD VRLDDMLTLIYYNNEDNRFKNETGQEKYKDQILEQIRQGHFPDNFENPKIISK >Mature_1973_residues MQKPDFSKAFKIFLSYSSCLTSSLALLSCYSSLTSNRDSRTPNQNENELTDKKNTNTSNRFKNNVILSEIKYLTLGDSIS AGFNWDYSFDFRGNINKNLKIKGLSYAAFFADFIQKIKPNAIKSFDNLALS*TTIKDWLYLLDSENEKFQNFDKIRLNFN YELDKLTKSPYGKQIRDVFGNFSAKNYPKLKEKIKSANLLTVSLGANDLMESIDFKTIAKPNQKIATKAEAAAEFVAKIN LAIVKLEKNLNIFIEKIRKINPNLEIVLVGYNILFSSSMKFFDKLLTNELGLPNNYTIIALKQLNEAVKKVAQKQGINFV DLYNERSWLDKTNKFAKNEFDIHPSTKGYKKMAQDLLFKLALEQGPNFKTDYFEKLD*NQEYFEKDSNCYKRVLNLGPNS EIFKTLSIDNSVNKFITNKSEIEEISSAEIEKVKNSQLAILSRI*YEVSFGTFIDGFLRSNTQISEKLREMLINFWQQNA KNNPSFSKLLHQFLQSDF*LEIIGRFQNYINDVIINQNLEKATISGLTSFLFTDFSEKKLISVFKDAVNSDFASQNINKI KELIFICVFGQSAIQELLINSIIGISAEYKSDLQVIFSFESTRNLFTKIINDFVLESAKYENVNNFLDILKIFLDKPKNY ENIVKFSRNFISESLKHRKTVNFLVQIINSNFNLNLSEDDKNALISLLLSVSDTIIRTKT*EKLNNEGAKSFLNIVKNTD FRHTSKKISTILGSQVQGTYALFFKNTTNLINLLHELLSFDLSNYQIEVLKRLLTKLYPLISKFKLSYFISTDSPNYNNF SVFFNSVKGFLIENSFQIFNKIISEAINDFVVNKLLYQKIGNLNRFGFEFLRNNLEKFEENIFDFLAKCVNNIDFFTNLS DLINKSLQSEGLSQKSVLTFSKIIKTIFDDFGEKYKNKQLNKNEQDENLIFILVKEAIKSFKNFTNDNFNKYNELKVNLE KAEDEKNNSKINFYKTKIDELENNLSIINFSNFFLKNLIETDIKYKILKNIAKINLKNKIGSQDLILFFKDLFSKSFLHK QIVSNLENNRIFGKEGVKNSLLELLVNFFNSNQVEKLLEKFVDYFFESKKFEKTTDFTGFVTNFIKEHAELIEKIFGLFL GDTAT*NSLSNFLMSIFQASKINLSEKATTTILTLVRNIFTK*KNSTLNFENNQKKESPLVIQALIKIIFDSFSDKHTLT KSIFESIIDSLSVDIANNYYKKNENS*STSDQISQNEIANLFAEIAQTEAISEKIKSNFINIHLEYREKIQQIFDAFLKS NALVELFDGYFKIIAKAEINEPLNNFSLVKSLFENQYFTKIIGKFIIKLENNVNLKQNFTLLLSKIFNVNFEENEFEPLF KLIKYIIQDNINNYYSNEEDPKNFLYKKLTNNSNLSSENTSQNNENLGAENSENTIKYGIYFKKNALLTKLVSLISKLAN TNLSTANINFILENEIGNEEFIIEFLKQIGCVFDKITKTDQEKIWEILVKIFKSNFLKKGIEFFKFSNFNKYKLFEELSI QKKEQINSALRSAMENFLPNPVNKLLIFRIFNFINQNPDKFKEIRKFSGLLTEFLKDNQTSSNMQENQKLTEKIDNSAFL KSYL*YLINFLVKNEEFSQLIVSQILEYLHLDIKDEKNYYLKTKGISNPEEIIKNFLNHFINLGFENKIIEKILEQIINS VKSAHLEAKSNFFDNILTNLKLSEVLNLDLLVNLEEKITDEKTLNNKLPQLEPKIDEHNLIINLPQNQQIPIDSFVDFLD LIFLASPK*NKEKQAEVSPLLKELNNITYTGISFADLLKSNQRDLKLEAISKLFSKIYSENITKENYKNSARGRNLYRFL LMLLFYAYESRIKNSPLRTSAFYGSILSSSTASEMILNSLKNAGKNEKNSQKYSEFIDFLKGNPIKVKG*LINTWYTAKD VRLDDMLTLIYYNNEDNRFKNETGQEKYKDQILEQIRQGHFPDNFENPKIISK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 227362; Mature: 227362
Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 0.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 0.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQKPDFSKAFKIFLSYSSCLTSSLALLSCYSSLTSNRDSRTPNQNENELTDKKNTNTSNR CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHH FKNNVILSEIKYLTLGDSISAGFNWDYSFDFRGNINKNLKIKGLSYAAFFADFIQKIKPN HHCCHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCH AIKSFDNLALSTTIKDWLYLLDSENEKFQNFDKIRLNFNYELDKLTKSPYGKQIRDVFGN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCEEEEEECCCHHHHHCCCCHHHHHHHHCC FSAKNYPKLKEKIKSANLLTVSLGANDLMESIDFKTIAKPNQKIATKAEAAAEFVAKINL CCCCCCHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIVKLEKNLNIFIEKIRKINPNLEIVLVGYNILFSSSMKFFDKLLTNELGLPNNYTIIAL EEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEH KQLNEAVKKVAQKQGINFVDLYNERSWLDKTNKFAKNEFDIHPSTKGYKKMAQDLLFKLA HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LEQGPNFKTDYFEKLDNQEYFEKDSNCYKRVLNLGPNSEIFKTLSIDNSVNKFITNKSEI HHCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHEECCCHHHHHHHCCHHHH EEISSAEIEKVKNSQLAILSRIYEVSFGTFIDGFLRSNTQISEKLREMLINFWQQNAKNN 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