Definition | Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence. |
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Accession | NC_006156 |
Length | 904,246 |
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The map label for this gene is ntpJ [H]
Identifier: 51598976
GI number: 51598976
Start: 764154
End: 765473
Strand: Direct
Name: ntpJ [H]
Synonym: BG0746
Alternate gene names: 51598976
Gene position: 764154-765473 (Clockwise)
Preceding gene: 51598974
Following gene: 51598977
Centisome position: 84.51
GC content: 29.85
Gene sequence:
>1320_bases TTGAAATTTGAATTTAGCGACAGGTTTTTACTTTTTAGTTATTTTGTTTTAATTATGCTTATAGGCTCTCTTTTATTAAT GCTGCCTATTTCTTGGGGAGGTGATGGCAAATTAGCATACATTGATGCGCTTTTTACTGCTGTTTCTGCTGTAAGCATTA CAGGTCTTATAACAGTTAAAATAGAAAGTTTTTCTACTTTTGGATTTATTTTGATAATGTTACTAGTCCAGCTTGGGGGA TTGGGATTTATAAGTATTACTACTTTTTATTTGCTTATACCTAAAAAGAAAATGAATTTAACAGATGCAAGAATAATAAA GCAGTATTCTCTTTCAAATATAGAATATAATCCTATTAGAATTTTAAAAGGCATACTGTTTATAACCTTTTCAATTGAAA TGATAGGTTTAATATTGATACTTATTTGTTTTAAGCTTAGGGGAGTTAATATTTCATTTTTAGAAGCTTTGTTTACGACA ATTTCTGCTTTTTGCAATGCAGGTTTTTCCATGCATTCTGAGAGTATTTATGCATGGCGAGATGTTCCTGAAGCTATAGT TGTGGTTTCTGTTTTAATAATTTGTGGTGGGCTTGGGTTTATGGTCTATAGGGATGTAAATAATACTATTAAAAACAAAA AAAAACTATCACTTCATGCTAAAATAGTTTTTTCTTTAAGTTTCTTTTTAATTATGATTGGTGCAATTTTATTCTTTTTT ACAGAGATGCATAAATTAAAAGATGGTTATTCAATAGGTACTCTAATATTTAATTCAATTTTTTATTCGATTAGTACCAG AACAGCTGGGTTTAATTATCTTGATAATTCTTTAATAAGTGGAAGAACTCAAATAGTTTCTCTACCATTTATGTTTATTG GTGGGGCACCTGGATCAACTGCAGGAGGAATTAAGATTACAACATTTTTTTTAATTGTATTAGCTGTTGTTAAAAATCAA AACGGCAATGGATATATTATTGGGTCTTACAAGGTTTCAATAGATAGTATAAGATTCGCACTTTTATTCTTTGCAAGAGC TATTTTTATTGTAAGTTTTTCCTTTTTTATGCTTCTTTTTTTTGAAGGAGGATCTGGCAATTGGAAAGTTATTGATTTAG GTTATGAGGTGTTTTCTGCTTTTGGAACAGTTGGTCTTTCGGTTGGAGTAACTCAGGATTTGTCATTTTGGGGTAAAGTT ATTATAATCTTTACTATGTTTTCAGGACGAATAGGACTTTTTTCAATGGCTGTTTTTGTTTCAAGAAAGTCGCGTTTTGA AGAATTTACAAGGCCAAGGCAAGATATTTTGGTTGGTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TATATTAAAAATAATGTAATTATGATAATATTTCAATGTTAAAATATTATGCTATATAAAATGGATTTTTAATAATTTAA ACAACTTTTTGTATGATATG
Downstream 100 bases:
>100_bases AGCATATGAAAACATTTGTTATTATTGGACTGAGTAATTTAGGAATTCACTTGCTTGAAGATTTAAGCAGACTTGATTGT CAAATTATTATTATAGATAC
Product: K+ transport protein
Products: NA
Alternate protein names: K(+)-uptake protein ktrB [H]
Number of amino acids: Translated: 439; Mature: 439
Protein sequence:
>439_residues MKFEFSDRFLLFSYFVLIMLIGSLLLMLPISWGGDGKLAYIDALFTAVSAVSITGLITVKIESFSTFGFILIMLLVQLGG LGFISITTFYLLIPKKKMNLTDARIIKQYSLSNIEYNPIRILKGILFITFSIEMIGLILILICFKLRGVNISFLEALFTT ISAFCNAGFSMHSESIYAWRDVPEAIVVVSVLIICGGLGFMVYRDVNNTIKNKKKLSLHAKIVFSLSFFLIMIGAILFFF TEMHKLKDGYSIGTLIFNSIFYSISTRTAGFNYLDNSLISGRTQIVSLPFMFIGGAPGSTAGGIKITTFFLIVLAVVKNQ NGNGYIIGSYKVSIDSIRFALLFFARAIFIVSFSFFMLLFFEGGSGNWKVIDLGYEVFSAFGTVGLSVGVTQDLSFWGKV IIIFTMFSGRIGLFSMAVFVSRKSRFEEFTRPRQDILVG
Sequences:
>Translated_439_residues MKFEFSDRFLLFSYFVLIMLIGSLLLMLPISWGGDGKLAYIDALFTAVSAVSITGLITVKIESFSTFGFILIMLLVQLGG LGFISITTFYLLIPKKKMNLTDARIIKQYSLSNIEYNPIRILKGILFITFSIEMIGLILILICFKLRGVNISFLEALFTT ISAFCNAGFSMHSESIYAWRDVPEAIVVVSVLIICGGLGFMVYRDVNNTIKNKKKLSLHAKIVFSLSFFLIMIGAILFFF TEMHKLKDGYSIGTLIFNSIFYSISTRTAGFNYLDNSLISGRTQIVSLPFMFIGGAPGSTAGGIKITTFFLIVLAVVKNQ NGNGYIIGSYKVSIDSIRFALLFFARAIFIVSFSFFMLLFFEGGSGNWKVIDLGYEVFSAFGTVGLSVGVTQDLSFWGKV IIIFTMFSGRIGLFSMAVFVSRKSRFEEFTRPRQDILVG >Mature_439_residues MKFEFSDRFLLFSYFVLIMLIGSLLLMLPISWGGDGKLAYIDALFTAVSAVSITGLITVKIESFSTFGFILIMLLVQLGG LGFISITTFYLLIPKKKMNLTDARIIKQYSLSNIEYNPIRILKGILFITFSIEMIGLILILICFKLRGVNISFLEALFTT ISAFCNAGFSMHSESIYAWRDVPEAIVVVSVLIICGGLGFMVYRDVNNTIKNKKKLSLHAKIVFSLSFFLIMIGAILFFF TEMHKLKDGYSIGTLIFNSIFYSISTRTAGFNYLDNSLISGRTQIVSLPFMFIGGAPGSTAGGIKITTFFLIVLAVVKNQ NGNGYIIGSYKVSIDSIRFALLFFARAIFIVSFSFFMLLFFEGGSGNWKVIDLGYEVFSAFGTVGLSVGVTQDLSFWGKV IIIFTMFSGRIGLFSMAVFVSRKSRFEEFTRPRQDILVG
Specific function: Integral membrane subunit of the KtrAB potassium uptake transporter. The 2 major potassium transporter complexes KtrAB and KtrCD confer resistance to both suddenly imposed and prolonged osmotic stress [H]
COG id: COG0168
COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family. Ktr (TC 2.A.38.4) subfamily [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003445 - InterPro: IPR004772 [H]
Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 48908; Mature: 48908
Theoretical pI: Translated: 10.02; Mature: 10.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKFEFSDRFLLFSYFVLIMLIGSLLLMLPISWGGDGKLAYIDALFTAVSAVSITGLITVK CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE IESFSTFGFILIMLLVQLGGLGFISITTFYLLIPKKKMNLTDARIIKQYSLSNIEYNPIR EECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH ILKGILFITFSIEMIGLILILICFKLRGVNISFLEALFTTISAFCNAGFSMHSESIYAWR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHH DVPEAIVVVSVLIICGGLGFMVYRDVNNTIKNKKKLSLHAKIVFSLSFFLIMIGAILFFF CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEMHKLKDGYSIGTLIFNSIFYSISTRTAGFNYLDNSLISGRTQIVSLPFMFIGGAPGST HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHCCCHHEEEECEEEEECCCCCC AGGIKITTFFLIVLAVVKNQNGNGYIIGSYKVSIDSIRFALLFFARAIFIVSFSFFMLLF CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE FEGGSGNWKVIDLGYEVFSAFGTVGLSVGVTQDLSFWGKVIIIFTMFSGRIGLFSMAVFV EECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHCEECCCCHHHHHHHHHHHEEEHHCCCHHHHHHHHHH SRKSRFEEFTRPRQDILVG HHHHHHHHHCCCHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKFEFSDRFLLFSYFVLIMLIGSLLLMLPISWGGDGKLAYIDALFTAVSAVSITGLITVK CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEE IESFSTFGFILIMLLVQLGGLGFISITTFYLLIPKKKMNLTDARIIKQYSLSNIEYNPIR EECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH ILKGILFITFSIEMIGLILILICFKLRGVNISFLEALFTTISAFCNAGFSMHSESIYAWR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEHH DVPEAIVVVSVLIICGGLGFMVYRDVNNTIKNKKKLSLHAKIVFSLSFFLIMIGAILFFF CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEECHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TEMHKLKDGYSIGTLIFNSIFYSISTRTAGFNYLDNSLISGRTQIVSLPFMFIGGAPGST HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCHHHCCCHHEEEECEEEEECCCCCC AGGIKITTFFLIVLAVVKNQNGNGYIIGSYKVSIDSIRFALLFFARAIFIVSFSFFMLLF CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE FEGGSGNWKVIDLGYEVFSAFGTVGLSVGVTQDLSFWGKVIIIFTMFSGRIGLFSMAVFV EECCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHCEECCCCHHHHHHHHHHHEEEHHCCCHHHHHHHHHH SRKSRFEEFTRPRQDILVG HHHHHHHHHCCCHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]