Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is nhaC-2 [H]

Identifier: 51598893

GI number: 51598893

Start: 678399

End: 679754

Strand: Direct

Name: nhaC-2 [H]

Synonym: BG0661

Alternate gene names: 51598893

Gene position: 678399-679754 (Clockwise)

Preceding gene: 51598891

Following gene: 51598899

Centisome position: 75.02

GC content: 29.72

Gene sequence:

>1356_bases
TTGGAAAGAGAAACTAATATAGTTCCAAATTTTTGGGGACTTACGCCTTTTTTTCTTTTTATAGGGATTTATATTGGTAC
AGGACTTGTTCTTTATTTTAATGGTGTAGAAAGGGCATTTTATCAAATGCCCCCCATATTTGCTATGTTTATTGCTATTG
TTTTGACATTTATTGTTTTTAGGGGATCTTTTTTAGCAAAAATGAATAAATTTATTGAAGGTTGTGCTCAGCAAGATGTT
ATTTTTATATCTTTAATATTTATGTTATCCGGTGCTTTTTCTGCTGTTTGCAAAGAAATAGGAAGTGTTGAGGCTGTAGT
AAATATTGGCCTTAAATATGTTCCATTTAATTTACTAGTATGTGGCATTTTTTTAATTACTCTTTTTTTGTCTTTTTCTA
CTGGAAGTTTTATGGGGACTATTGTTGCTGTTGCTCCTATTGCTTTGGAACTTGCAGATAAGGTGAACATTTCTCTTCCA
TTGGTTGCTGGCGCTATTCTTAGCGCTGGTGCATTTGGAGACAATATGTCTTTAATATCAGATACTCCTATTATTTCAAG
TCATACTCAAAAGGTTAATATTGTTGATGTTTTTAAAAATGGAGCTTTTTATACGTTTCCAGCAGCAATTTTAGCAAGCA
TTGTTTTTGCATTTTTAGGTTCTTATTATAGTAAGACTGCTAATTTTATTATTGAGCCTAGTGATATAAATTTTTTTAAA
ATTGTTCCATATGTTTTTGTTATGGCTTTTGCAATTTCAGGCTTTAATGTATTTTTAGCCTTGTTTTTAGGGATTTTTGT
TGCTGGTATTATTGGAATTTATTACTCAGATATTACTTTTTTATTGCTGGCTAAAAAAATCAATGAGGGATTTTTAGGCT
TAGGAGAAATGTTTATTCTTGTTGTTTTTACAGGCGGAATTTCTTATATGGCAATTAAGTATGGGGGGTTTGATTGGTTA
CTGTTAAAATTGCAAAAAATGTCAAAGTCTAAAAGAACTTCGGAATTTGTAATTGTGTTTTTGGTTGGCATTTTGACAGT
GTTTCTTGCAAATAATGGACTTGCTATTTTAATGAGTGGTTCTGTTGTAAGATCAATAACTCAAGAGAATAATTTAAATT
CAAAACGTATTGCAGCTTTACTTTGTATGTCTTCGTGCTTTTTTTTAAGTATTTTGCCCCATAGTATGCATGTTATAGCT
CTTGTAGATTTTACAAAAGGCAAGCTTTCTCCTTTTGACATTTTTCCATTTTTAATTTATCAAGGATTTTTAGTTTTATT
GATTGTTTTGTCTATAATTGGACTTGATATAAGATTAGTATTTAGATCTTTTTTAAATAATAGCCAAAAATCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATTTTGAAAATTTTAAGATTTGTCTTGTTCAATTTTTATTTGTTTTATTTAGAATAAATTGCTTTTAATTGTGCTAT
ATGATTTAGGAGGTTTAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGCTTTTAAAATGAAAGCTTTTAAGATTTTTTTTTGCATTTAAATATTTAAGAAGATAGATTTAAATATATTTTTAGGA
TTTCCTCTTTTATTTTTTTA

Product: Na+/H+ antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 451; Mature: 451

Protein sequence:

>451_residues
MERETNIVPNFWGLTPFFLFIGIYIGTGLVLYFNGVERAFYQMPPIFAMFIAIVLTFIVFRGSFLAKMNKFIEGCAQQDV
IFISLIFMLSGAFSAVCKEIGSVEAVVNIGLKYVPFNLLVCGIFLITLFLSFSTGSFMGTIVAVAPIALELADKVNISLP
LVAGAILSAGAFGDNMSLISDTPIISSHTQKVNIVDVFKNGAFYTFPAAILASIVFAFLGSYYSKTANFIIEPSDINFFK
IVPYVFVMAFAISGFNVFLALFLGIFVAGIIGIYYSDITFLLLAKKINEGFLGLGEMFILVVFTGGISYMAIKYGGFDWL
LLKLQKMSKSKRTSEFVIVFLVGILTVFLANNGLAILMSGSVVRSITQENNLNSKRIAALLCMSSCFFLSILPHSMHVIA
LVDFTKGKLSPFDIFPFLIYQGFLVLLIVLSIIGLDIRLVFRSFLNNSQKS

Sequences:

>Translated_451_residues
MERETNIVPNFWGLTPFFLFIGIYIGTGLVLYFNGVERAFYQMPPIFAMFIAIVLTFIVFRGSFLAKMNKFIEGCAQQDV
IFISLIFMLSGAFSAVCKEIGSVEAVVNIGLKYVPFNLLVCGIFLITLFLSFSTGSFMGTIVAVAPIALELADKVNISLP
LVAGAILSAGAFGDNMSLISDTPIISSHTQKVNIVDVFKNGAFYTFPAAILASIVFAFLGSYYSKTANFIIEPSDINFFK
IVPYVFVMAFAISGFNVFLALFLGIFVAGIIGIYYSDITFLLLAKKINEGFLGLGEMFILVVFTGGISYMAIKYGGFDWL
LLKLQKMSKSKRTSEFVIVFLVGILTVFLANNGLAILMSGSVVRSITQENNLNSKRIAALLCMSSCFFLSILPHSMHVIA
LVDFTKGKLSPFDIFPFLIYQGFLVLLIVLSIIGLDIRLVFRSFLNNSQKS
>Mature_451_residues
MERETNIVPNFWGLTPFFLFIGIYIGTGLVLYFNGVERAFYQMPPIFAMFIAIVLTFIVFRGSFLAKMNKFIEGCAQQDV
IFISLIFMLSGAFSAVCKEIGSVEAVVNIGLKYVPFNLLVCGIFLITLFLSFSTGSFMGTIVAVAPIALELADKVNISLP
LVAGAILSAGAFGDNMSLISDTPIISSHTQKVNIVDVFKNGAFYTFPAAILASIVFAFLGSYYSKTANFIIEPSDINFFK
IVPYVFVMAFAISGFNVFLALFLGIFVAGIIGIYYSDITFLLLAKKINEGFLGLGEMFILVVFTGGISYMAIKYGGFDWL
LLKLQKMSKSKRTSEFVIVFLVGILTVFLANNGLAILMSGSVVRSITQENNLNSKRIAALLCMSSCFFLSILPHSMHVIA
LVDFTKGKLSPFDIFPFLIYQGFLVLLIVLSIIGLDIRLVFRSFLNNSQKS

Specific function: Couples proton uptake and Na(+) efflux to the substrate- product malate/lactate antiport, in an electroneutral malate- 2H(+)/Na(+)-lactate exchange. Plays a role in supporting growth to high density on malate at reduced protonmotive force [H]

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004770
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49610; Mature: 49610

Theoretical pI: Translated: 8.85; Mature: 8.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MERETNIVPNFWGLTPFFLFIGIYIGTGLVLYFNGVERAFYQMPPIFAMFIAIVLTFIVF
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RGSFLAKMNKFIEGCAQQDVIFISLIFMLSGAFSAVCKEIGSVEAVVNIGLKYVPFNLLV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHH
CGIFLITLFLSFSTGSFMGTIVAVAPIALELADKVNISLPLVAGAILSAGAFGDNMSLIS
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
DTPIISSHTQKVNIVDVFKNGAFYTFPAAILASIVFAFLGSYYSKTANFIIEPSDINFFK
CCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHH
IVPYVFVMAFAISGFNVFLALFLGIFVAGIIGIYYSDITFLLLAKKINEGFLGLGEMFIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VVFTGGISYMAIKYGGFDWLLLKLQKMSKSKRTSEFVIVFLVGILTVFLANNGLAILMSG
HHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECC
SVVRSITQENNLNSKRIAALLCMSSCFFLSILPHSMHVIALVDFTKGKLSPFDIFPFLIY
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
QGFLVLLIVLSIIGLDIRLVFRSFLNNSQKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MERETNIVPNFWGLTPFFLFIGIYIGTGLVLYFNGVERAFYQMPPIFAMFIAIVLTFIVF
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
RGSFLAKMNKFIEGCAQQDVIFISLIFMLSGAFSAVCKEIGSVEAVVNIGLKYVPFNLLV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHH
CGIFLITLFLSFSTGSFMGTIVAVAPIALELADKVNISLPLVAGAILSAGAFGDNMSLIS
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
DTPIISSHTQKVNIVDVFKNGAFYTFPAAILASIVFAFLGSYYSKTANFIIEPSDINFFK
CCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHH
IVPYVFVMAFAISGFNVFLALFLGIFVAGIIGIYYSDITFLLLAKKINEGFLGLGEMFIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VVFTGGISYMAIKYGGFDWLLLKLQKMSKSKRTSEFVIVFLVGILTVFLANNGLAILMSG
HHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECC
SVVRSITQENNLNSKRIAALLCMSSCFFLSILPHSMHVIALVDFTKGKLSPFDIFPFLIY
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHH
QGFLVLLIVLSIIGLDIRLVFRSFLNNSQKS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377; 10903309 [H]