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Definition Mesoplasma florum L1, complete genome.
Accession NC_006055
Length 793,224

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The map label for this gene is polC [H]

Identifier: 50365104

GI number: 50365104

Start: 330027

End: 334508

Strand: Direct

Name: polC [H]

Synonym: Mfl288

Alternate gene names: 50365104

Gene position: 330027-334508 (Clockwise)

Preceding gene: 50365103

Following gene: 50365105

Centisome position: 41.61

GC content: 27.29

Gene sequence:

>4482_bases
ATGTCAGACAATAAGGTATTAGAATTATTTCAAAAATTGAAGATCAATTTAAATGAAGGCGAACTTTCATATTTTGAACA
TTCTGAAATTGAAAAAGCTACAATAAGCTCTTTAAAATCAAAACTTAGATTGTCATTAAAAATTAAAAACTTTTTACCTA
TAAGAGTATTAAGTGAAATTCATGAAAAATGTGTCGGATCAGAAGAAATAAAAATAAAACTAATTTTAAATGTGCAAAAC
CAAAGAATAGATAAAGAATTAATTTGTGAGTATATTGAATTTATTAAAAATTTTAAATCTCAAAATAAAACAATTATCTG
AAACTTTATTGAAGCTGAAGGATTTGAATATGATGCAGATGAAAATTTAATTAAATTTGTTGTTGATTCTAATGAATTGA
AAAACCAATTAACAACTGAATTGGAATATTGTTTAGCTAAATTAAAACAATTTGGTTTTAAAGAACTTAGTTATGATATT
CAAGTTGAAGATAAAACAGAAGAATATATAAAACAATCTTTAATAATTGAACAACAAACTAAAGAACAATATAAACAATT
TGCCCCTGAATCAACAGAAAAATCTCAAAATATGATTATTTCAAAACAAAAGTCACAGAAGTGAAATCAATCTTTAGATA
ATCCAAGTTATGATTCATTTGAAGACATTGAAGAAGATGCACAAAATATTGTCTTACATGGTAAAATGATGAGCATTGAT
ATAAGAGATTCTAAAGCAAATAATCGTAAAATATATTCAATTGGTTTAACAGATAATAATTCATCAATCAAATGTATATA
TTTTGGTAAAGAAGATGAAAGAACTATTATGGACCCTTTAACCGAAGAAGAAATATCATCAGATAGAATTGAAGAAATTA
AAAATAAGAGAATTGCTAAAGGTGATTGAATAGCTGTTAAAGGTAAAACATCTTATTCACAATTTGATAAAGAACAAAAT
TTTATTATTGAAAAGATAGGAAAAATATCTCGATCAGAAGCTATGGTTAAAGACGATTCAGAACAAAAACGTGTTGAATT
GCATGTTCATACTAAAATGAGTGCTATGGATGGTGTTTCATCAATTCAAGAATATTTACAAATGGTTGATAAATGAAATT
GAAAAGCAATCGCAATTACTGATCATATAAATGTTCAAACTTTCCCTGATGCATATAATGAATTAAAAAAAATTAATAAA
AATAAAGCTGAAGAAGATAAACTAAAATTAATTTATGGTCTTGAAATGAATATGATTGAAAAAGAGGATTATTGAATTGT
TAAAAATCCTAAAGGTCAAAAAATAAGAGAATCAAAAATGGTTGTATTCGACTTAGAAACAACTGGTTTATCACCTGAGT
TTAATGAAATCATTGAATTTGGTGCTGTAGTTTTTGATCCTGTAACTGGGAAAACAACCAAATATGACTATTTATTTAAA
CCAAAACAACCTTTAAAACAATTTACAATAGATCTTACAAATATAACTCCTGAGATGTTAGAAGATAAGAAAAATATTGA
TGATGATTTTGATAAGATTTATGAATTAATTAAAGATAGTATTTTAGTTGCTCATAATGCAAACTTTGACTTTAACTTTT
TAAATAGCTTATCTAAAAGATTAGGATATGGTGATTTACAAAATACTGTTATTGATACATTAACACTTTCTAGATTAGTT
AGACCTGCTTTAAAATCTCATAGGTTAGGAGCAGTATGTAAAAAATTCGGTATTTTATACGATGAACATGTTGCTCACCG
TGGAGATTATGATGCAGATGTTTTAAACGATTTATTCTTTAAAATAATAGCTGAATTAAAATTAACAACACCAATCATTT
ATGATGCTGACTTAATTAAGTTAGAACCTGAAAATGATAAAGATAACATTAACTTATTAAGATCTCGTGGAGCTCATGTT
AATGTATTAGCTAAAAATCAACAAGGGTTAAAAGACATATTTAAATTGGTTTCAATTTCTCATACTGATAACTTTTTTAA
CTCTCCTAAAATATTTAAGGAAAAATTAAAAGAATTTAAAGAAAAAAATAATATTTTAATTGGAGCTGGTTGTGTAAACT
CAGAAGTTTTTGAAACAGCTAGAATTGGAACAGATGAAAAACTAGAAGAAATCATTCCTTTTTATGACTATATAGAAATT
CAACCATTAAGTGTTTATAAAAACTTAATTAATGATAATCAGTTAGAAGAACATGAACTAATAGATGTAATTAAAAAAAT
AATTAGGCTAGCTAAAAAATATAATGTAATGCTAGTAGCAACAAGTGATGCTCACTATACAAGACCTGAATTGAAAAAAA
TTCGTGATGTTTATATTAATGCAAAAGGACTTGGAGGAAGTAGACACCCATTATTTAGTTTTAGAAATAAAAACAAATTA
ATTGACTACCCTGATCAATATTTAAGAACAACTAATGAAATGCTTAAAGAATTTGCTTGATTAAGTGAACCTGCTTTAGT
GCAAGAAATGGTTATCACAAATACAAATAAAATAGCAGAAATGATTGATTCAAATATCATTGTTATCAAAGATGGTTTAT
TCACTCCAAACATTGAAAACGTAGATACTTTATTAAAAGATAAATGTTATGAAACAGCACATGCAATGTATGGTGATGTT
TTACCTGAAATAGTTGAGTCACGTTTAGAAAAAGAATTAACATCAATTATTAAACATGGTTTTGCTGTTGTTTATTGAAT
TTCACATTTACTAGTTGAAAGATCTAACAATGATGGATATCTTGTTGGTTCAAGAGGAAGTGTTGGTTCTTCATTTGTAG
CAACTGCTTCAAAGATTACTGAGGTTAATCCATTAAAAGCTCATTATAGATGTTTAAACTGTAAATATTCAGATTTTAAT
ACTCCAATTGAAATTAAATGTGGATATGATTTACCAGAACAAAATTGTCCAAAATGTAATGAAAAATTAATTGGTGATGG
GCATGATATTCCATTTGAAACATTCTTAGGATTTGATGGAGATAAAGTTCCAGATATTGATTTAAACTTTTCTGGAGAAT
ACCAACCAATTGCTCATAACTTTACAAAAGAGATGTTTGGTGAAAACAATGTATTTAGAGCCGGAACAATTTCAACAGTT
GCTGAAAAAACTGCTTTTGGATACGTAAAAGCATTTTATGAAGAAACTGGTGTATTAGAAGAAGATATGCCAAGAAAAAT
TGAAATTGAAAGACAAGCTAAGTTAGTTGAAGGAGTAAAAAGAACAACAGGACAACACCCTGGAGGAATTATTATCTTAC
CTAAAGAATTTGAAATTGAAGATTTCTCTCCTGTTAACTTCCCAGCTGATGATGCATCAAGTTCTTGAAAAACAACTCAC
TTTGATTTCCACTCAATTCATGATAACTTATTAAAAATGGATATTCTAGGACACGTTGACCCAACTGCTTTAAGAATGCT
TGGTGATCTAACTGGAGTTAATCCAATCAATATTCCAACAAATGATCCAAAAGTATATTCATTATTTAGTAATCTATCTG
CTTTAAATATAAAACCAGAACAAATTAATGGAGAAACAACTGGAGCTATTGGTTTACCTGAGTTTGGAACAGGATTTGTT
AGATCAATGTTAAGAGAAACAAAACCTAAAACATTTGCTGACTTAGTGCAAATTTCAGGACTATCACATGGTACTGATGT
TTGATTAGGAAATGCAAGAGATTTAATTAAAAACAATACAGCAAATATTTCAACTGTTATTGGTTGTCGTGATGATATTA
TGGTTTATTTAATGGGCCAAGGAATCGATGCTACTACTTCATTTAAAATAATGGAATCAGTACGTAAAGGACAAGGTTTA
AGAAAAGAATGAAAAGAAATTATGCTAGCACATAATGTTCCTGAATGATACATTGAATCTTGTTTAAAAATTAAGTATAT
GTTCCCTAAAGCTCATGCTACAGCGTATGTATTAATGGCTTATCGAATTGCTTGATATAAAATTTATTATCCTGCAGAAT
ACTATGCAACATTCTTAACTAATAGAGCCGATGCTTTTGATTTAAAAACATTCTTAGGTGGTTATAATGGAGTTAAAGAA
AAACTAGCAGAATTAGAATTAAGAAAAAATAAAAAAGATAAAATGACTACAAAAGAATTAGCTTTAATGCCAGTTCTAGA
AATAGGATTAGAAATGTTTAGTCGTGGAATTAAAATGGCTAACTTAAACTTTGAAAAATCTTTAGCTGATAAATATATTA
TTGAAAAAGATGAATCAACTGGTGAAGCTACACTATATCCTCCGTTCTTAGTAATTGATTCACTTGGAGATGCTGTGGCT
GATTCAATTATTAAAGCTAGAAGTGAAAGACCATTAACTAGTGTTAAAGATCTAACATCAAGAACAACAATTACTCAAAC
ACAAATGAAAATATTTGAACAATTAAATGTATTAGATACTTTAGCACAAGATGAACAATTAGAATTTGACTTTTTTAACT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATCAAAAACAATAATTTATGCAGCTGGAGCAATTTTATTAGTAACTTTCATAGTAATAGTAACAATTAAAGATTTTAT
AGTTTAAAAAAGGAGCTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGATAGACTGAGAGAAAGAATATGAAAAATTTAGCAGAATTAATGACACAAAGAAGAAGTGCTCGTGATTTTGATGTTA
ATTATGAAATACCTGAAGCT

Product: DNA polymerase III alpha subunit

Products: NA

Alternate protein names: PolIII [H]

Number of amino acids: Translated: 1493; Mature: 1492

Protein sequence:

>1493_residues
MSDNKVLELFQKLKINLNEGELSYFEHSEIEKATISSLKSKLRLSLKIKNFLPIRVLSEIHEKCVGSEEIKIKLILNVQN
QRIDKELICEYIEFIKNFKSQNKTIIWNFIEAEGFEYDADENLIKFVVDSNELKNQLTTELEYCLAKLKQFGFKELSYDI
QVEDKTEEYIKQSLIIEQQTKEQYKQFAPESTEKSQNMIISKQKSQKWNQSLDNPSYDSFEDIEEDAQNIVLHGKMMSID
IRDSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGKEDERTIMDPLTEEEISSDRIEEIKNKRIAKGDWIAVKGKTSYSQFDKEQN
FIIEKIGKISRSEAMVKDDSEQKRVELHVHTKMSAMDGVSSIQEYLQMVDKWNWKAIAITDHINVQTFPDAYNELKKINK
NKAEEDKLKLIYGLEMNMIEKEDYWIVKNPKGQKIRESKMVVFDLETTGLSPEFNEIIEFGAVVFDPVTGKTTKYDYLFK
PKQPLKQFTIDLTNITPEMLEDKKNIDDDFDKIYELIKDSILVAHNANFDFNFLNSLSKRLGYGDLQNTVIDTLTLSRLV
RPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFFKIIAELKLTTPIIYDADLIKLEPENDKDNINLLRSRGAHV
NVLAKNQQGLKDIFKLVSISHTDNFFNSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFETARIGTDEKLEEIIPFYDYIEI
QPLSVYKNLINDNQLEEHELIDVIKKIIRLAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYINAKGLGGSRHPLFSFRNKNKL
IDYPDQYLRTTNEMLKEFAWLSEPALVQEMVITNTNKIAEMIDSNIIVIKDGLFTPNIENVDTLLKDKCYETAHAMYGDV
LPEIVESRLEKELTSIIKHGFAVVYWISHLLVERSNNDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFN
TPIEIKCGYDLPEQNCPKCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHNFTKEMFGENNVFRAGTISTV
AEKTAFGYVKAFYEETGVLEEDMPRKIEIERQAKLVEGVKRTTGQHPGGIIILPKEFEIEDFSPVNFPADDASSSWKTTH
FDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRMLGDLTGVNPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFV
RSMLRETKPKTFADLVQISGLSHGTDVWLGNARDLIKNNTANISTVIGCRDDIMVYLMGQGIDATTSFKIMESVRKGQGL
RKEWKEIMLAHNVPEWYIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAWYKIYYPAEYYATFLTNRADAFDLKTFLGGYNGVKE
KLAELELRKNKKDKMTTKELALMPVLEIGLEMFSRGIKMANLNFEKSLADKYIIEKDESTGEATLYPPFLVIDSLGDAVA
DSIIKARSERPLTSVKDLTSRTTITQTQMKIFEQLNVLDTLAQDEQLEFDFFN

Sequences:

>Translated_1493_residues
MSDNKVLELFQKLKINLNEGELSYFEHSEIEKATISSLKSKLRLSLKIKNFLPIRVLSEIHEKCVGSEEIKIKLILNVQN
QRIDKELICEYIEFIKNFKSQNKTII*NFIEAEGFEYDADENLIKFVVDSNELKNQLTTELEYCLAKLKQFGFKELSYDI
QVEDKTEEYIKQSLIIEQQTKEQYKQFAPESTEKSQNMIISKQKSQK*NQSLDNPSYDSFEDIEEDAQNIVLHGKMMSID
IRDSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGKEDERTIMDPLTEEEISSDRIEEIKNKRIAKGD*IAVKGKTSYSQFDKEQN
FIIEKIGKISRSEAMVKDDSEQKRVELHVHTKMSAMDGVSSIQEYLQMVDK*N*KAIAITDHINVQTFPDAYNELKKINK
NKAEEDKLKLIYGLEMNMIEKEDY*IVKNPKGQKIRESKMVVFDLETTGLSPEFNEIIEFGAVVFDPVTGKTTKYDYLFK
PKQPLKQFTIDLTNITPEMLEDKKNIDDDFDKIYELIKDSILVAHNANFDFNFLNSLSKRLGYGDLQNTVIDTLTLSRLV
RPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFFKIIAELKLTTPIIYDADLIKLEPENDKDNINLLRSRGAHV
NVLAKNQQGLKDIFKLVSISHTDNFFNSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFETARIGTDEKLEEIIPFYDYIEI
QPLSVYKNLINDNQLEEHELIDVIKKIIRLAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYINAKGLGGSRHPLFSFRNKNKL
IDYPDQYLRTTNEMLKEFA*LSEPALVQEMVITNTNKIAEMIDSNIIVIKDGLFTPNIENVDTLLKDKCYETAHAMYGDV
LPEIVESRLEKELTSIIKHGFAVVY*ISHLLVERSNNDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFN
TPIEIKCGYDLPEQNCPKCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHNFTKEMFGENNVFRAGTISTV
AEKTAFGYVKAFYEETGVLEEDMPRKIEIERQAKLVEGVKRTTGQHPGGIIILPKEFEIEDFSPVNFPADDASSS*KTTH
FDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRMLGDLTGVNPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFV
RSMLRETKPKTFADLVQISGLSHGTDV*LGNARDLIKNNTANISTVIGCRDDIMVYLMGQGIDATTSFKIMESVRKGQGL
RKE*KEIMLAHNVPE*YIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIA*YKIYYPAEYYATFLTNRADAFDLKTFLGGYNGVKE
KLAELELRKNKKDKMTTKELALMPVLEIGLEMFSRGIKMANLNFEKSLADKYIIEKDESTGEATLYPPFLVIDSLGDAVA
DSIIKARSERPLTSVKDLTSRTTITQTQMKIFEQLNVLDTLAQDEQLEFDFFN
>Mature_1492_residues
SDNKVLELFQKLKINLNEGELSYFEHSEIEKATISSLKSKLRLSLKIKNFLPIRVLSEIHEKCVGSEEIKIKLILNVQNQ
RIDKELICEYIEFIKNFKSQNKTII*NFIEAEGFEYDADENLIKFVVDSNELKNQLTTELEYCLAKLKQFGFKELSYDIQ
VEDKTEEYIKQSLIIEQQTKEQYKQFAPESTEKSQNMIISKQKSQK*NQSLDNPSYDSFEDIEEDAQNIVLHGKMMSIDI
RDSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGKEDERTIMDPLTEEEISSDRIEEIKNKRIAKGD*IAVKGKTSYSQFDKEQNF
IIEKIGKISRSEAMVKDDSEQKRVELHVHTKMSAMDGVSSIQEYLQMVDK*N*KAIAITDHINVQTFPDAYNELKKINKN
KAEEDKLKLIYGLEMNMIEKEDY*IVKNPKGQKIRESKMVVFDLETTGLSPEFNEIIEFGAVVFDPVTGKTTKYDYLFKP
KQPLKQFTIDLTNITPEMLEDKKNIDDDFDKIYELIKDSILVAHNANFDFNFLNSLSKRLGYGDLQNTVIDTLTLSRLVR
PALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFFKIIAELKLTTPIIYDADLIKLEPENDKDNINLLRSRGAHVN
VLAKNQQGLKDIFKLVSISHTDNFFNSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFETARIGTDEKLEEIIPFYDYIEIQ
PLSVYKNLINDNQLEEHELIDVIKKIIRLAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYINAKGLGGSRHPLFSFRNKNKLI
DYPDQYLRTTNEMLKEFA*LSEPALVQEMVITNTNKIAEMIDSNIIVIKDGLFTPNIENVDTLLKDKCYETAHAMYGDVL
PEIVESRLEKELTSIIKHGFAVVY*ISHLLVERSNNDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFNT
PIEIKCGYDLPEQNCPKCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHNFTKEMFGENNVFRAGTISTVA
EKTAFGYVKAFYEETGVLEEDMPRKIEIERQAKLVEGVKRTTGQHPGGIIILPKEFEIEDFSPVNFPADDASSS*KTTHF
DFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRMLGDLTGVNPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFVR
SMLRETKPKTFADLVQISGLSHGTDV*LGNARDLIKNNTANISTVIGCRDDIMVYLMGQGIDATTSFKIMESVRKGQGLR
KE*KEIMLAHNVPE*YIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIA*YKIYYPAEYYATFLTNRADAFDLKTFLGGYNGVKEK
LAELELRKNKKDKMTTKELALMPVLEIGLEMFSRGIKMANLNFEKSLADKYIIEKDESTGEATLYPPFLVIDSLGDAVAD
SIIKARSERPLTSVKDLTSRTTITQTQMKIFEQLNVLDTLAQDEQLEFDFFN

Specific function: Required for replicative DNA synthesis. This DNA polymerase also exhibits 3' to 5' exonuclease activity [H]

COG id: COG2176

COG function: function code L; DNA polymerase III, alpha subunit (gram-positive type)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 exonuclease domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011708
- InterPro:   IPR006054
- InterPro:   IPR006055
- InterPro:   IPR013520
- InterPro:   IPR016027
- InterPro:   IPR004365
- InterPro:   IPR004013
- InterPro:   IPR003141
- InterPro:   IPR006308
- InterPro:   IPR012337 [H]

Pfam domain/function: PF07733 DNA_pol3_alpha; PF00929 Exonuc_X-T; PF02811 PHP; PF01336 tRNA_anti [H]

EC number: =2.7.7.7 [H]

Molecular weight: Translated: 168497; Mature: 168366

Theoretical pI: Translated: 5.30; Mature: 5.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSDNKVLELFQKLKINLNEGELSYFEHSEIEKATISSLKSKLRLSLKIKNFLPIRVLSEI
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHH
HEKCVGSEEIKIKLILNVQNQRIDKELICEYIEFIKNFKSQNKTIINFIEAEGFEYDADE
HHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCC
NLIKFVVDSNELKNQLTTELEYCLAKLKQFGFKELSYDIQVEDKTEEYIKQSLIIEQQTK
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
EQYKQFAPESTEKSQNMIISKQKSQKNQSLDNPSYDSFEDIEEDAQNIVLHGKMMSIDIR
HHHHHHCCCCCCCHHHHEEECHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECEEEEEEEE
DSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGKEDERTIMDPLTEEEISSDRIEEIKNKRIAKGD
CCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
IAVKGKTSYSQFDKEQNFIIEKIGKISRSEAMVKDDSEQKRVELHVHTKMSAMDGVSSIQ
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHH
EYLQMVDKNKAIAITDHINVQTFPDAYNELKKINKNKAEEDKLKLIYGLEMNMIEKEDYI
HHHHHHCCCCEEEEEECCCCEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCE
VKNPKGQKIRESKMVVFDLETTGLSPEFNEIIEFGAVVFDPVTGKTTKYDYLFKPKQPLK
EECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHH
QFTIDLTNITPEMLEDKKNIDDDFDKIYELIKDSILVAHNANFDFNFLNSLSKRLGYGDL
HHEEEHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHH
QNTVIDTLTLSRLVRPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFFKIIAEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KLTTPIIYDADLIKLEPENDKDNINLLRSRGAHVNVLAKNQQGLKDIFKLVSISHTDNFF
HHCCCEEECCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFETARIGTDEKLEEIIPFYDYIEIQPLSVY
CCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHEEEEHHHHH
KNLINDNQLEEHELIDVIKKIIRLAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYINAKGLGG
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCC
SRHPLFSFRNKNKLIDYPDQYLRTTNEMLKEFALSEPALVQEMVITNTNKIAEMIDSNII
CCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEE
VIKDGLFTPNIENVDTLLKDKCYETAHAMYGDVLPEIVESRLEKELTSIIKHGFAVVYIS
EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
HLLVERSNNDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFNTPIEIKCG
HHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEEECEECCCCCCEEEEEC
YDLPEQNCPKCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHNFTKEMFGE
CCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
NNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKAFYEETGVLEEDMPRKIEIERQAKLVEGVKRTTGQHPG
CCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GIIILPKEFEIEDFSPVNFPADDASSSKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRMLGD
CEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LTGVNPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFVRSMLRETKP
HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
KTFADLVQISGLSHGTDVLGNARDLIKNNTANISTVIGCRDDIMVYLMGQGIDATTSFKI
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHH
MESVRKGQGLRKEKEIMLAHNVPEYIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAYKIYYPAE
HHHHHHCCCCCCHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHH
YYATFLTNRADAFDLKTFLGGYNGVKEKLAELELRKNKKDKMTTKELALMPVLEIGLEMF
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRGIKMANLNFEKSLADKYIIEKDESTGEATLYPPFLVIDSLGDAVADSIIKARSERPLT
HCCCEEECCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
SVKDLTSRTTITQTQMKIFEQLNVLDTLAQDEQLEFDFFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCC
>Mature Secondary Structure 
SDNKVLELFQKLKINLNEGELSYFEHSEIEKATISSLKSKLRLSLKIKNFLPIRVLSEI
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCHHHHHHHH
HEKCVGSEEIKIKLILNVQNQRIDKELICEYIEFIKNFKSQNKTIINFIEAEGFEYDADE
HHHHCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCC
NLIKFVVDSNELKNQLTTELEYCLAKLKQFGFKELSYDIQVEDKTEEYIKQSLIIEQQTK
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
EQYKQFAPESTEKSQNMIISKQKSQKNQSLDNPSYDSFEDIEEDAQNIVLHGKMMSIDIR
HHHHHHCCCCCCCHHHHEEECHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEECEEEEEEEE
DSKANNRKIYSIGLTDNNSSIKCIYFGKEDERTIMDPLTEEEISSDRIEEIKNKRIAKGD
CCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
IAVKGKTSYSQFDKEQNFIIEKIGKISRSEAMVKDDSEQKRVELHVHTKMSAMDGVSSIQ
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHH
EYLQMVDKNKAIAITDHINVQTFPDAYNELKKINKNKAEEDKLKLIYGLEMNMIEKEDYI
HHHHHHCCCCEEEEEECCCCEECCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCE
VKNPKGQKIRESKMVVFDLETTGLSPEFNEIIEFGAVVFDPVTGKTTKYDYLFKPKQPLK
EECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHH
QFTIDLTNITPEMLEDKKNIDDDFDKIYELIKDSILVAHNANFDFNFLNSLSKRLGYGDL
HHEEEHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCHH
QNTVIDTLTLSRLVRPALKSHRLGAVCKKFGILYDEHVAHRGDYDADVLNDLFFKIIAEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KLTTPIIYDADLIKLEPENDKDNINLLRSRGAHVNVLAKNQQGLKDIFKLVSISHTDNFF
HHCCCEEECCCEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NSPKIFKEKLKEFKEKNNILIGAGCVNSEVFETARIGTDEKLEEIIPFYDYIEIQPLSVY
CCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCHHHHEEEEHHHHH
KNLINDNQLEEHELIDVIKKIIRLAKKYNVMLVATSDAHYTRPELKKIRDVYINAKGLGG
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHEEEEECCCC
SRHPLFSFRNKNKLIDYPDQYLRTTNEMLKEFALSEPALVQEMVITNTNKIAEMIDSNII
CCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEE
VIKDGLFTPNIENVDTLLKDKCYETAHAMYGDVLPEIVESRLEKELTSIIKHGFAVVYIS
EEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
HLLVERSNNDGYLVGSRGSVGSSFVATASKITEVNPLKAHYRCLNCKYSDFNTPIEIKCG
HHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHEEECEECCCCCCEEEEEC
YDLPEQNCPKCNEKLIGDGHDIPFETFLGFDGDKVPDIDLNFSGEYQPIAHNFTKEMFGE
CCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
NNVFRAGTISTVAEKTAFGYVKAFYEETGVLEEDMPRKIEIERQAKLVEGVKRTTGQHPG
CCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GIIILPKEFEIEDFSPVNFPADDASSSKTTHFDFHSIHDNLLKMDILGHVDPTALRMLGD
CEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LTGVNPINIPTNDPKVYSLFSNLSALNIKPEQINGETTGAIGLPEFGTGFVRSMLRETKP
HCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC
KTFADLVQISGLSHGTDVLGNARDLIKNNTANISTVIGCRDDIMVYLMGQGIDATTSFKI
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHH
MESVRKGQGLRKEKEIMLAHNVPEYIESCLKIKYMFPKAHATAYVLMAYRIAYKIYYPAE
HHHHHHCCCCCCHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECHH
YYATFLTNRADAFDLKTFLGGYNGVKEKLAELELRKNKKDKMTTKELALMPVLEIGLEMF
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRGIKMANLNFEKSLADKYIIEKDESTGEATLYPPFLVIDSLGDAVADSIIKARSERPLT
HCCCEEECCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
SVKDLTSRTTITQTQMKIFEQLNVLDTLAQDEQLEFDFFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11058132 [H]