| Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006055 |
| Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50364981
Identifier: 50364981
GI number: 50364981
Start: 188260
End: 189954
Strand: Direct
Name: 50364981
Synonym: Mfl166
Alternate gene names: NA
Gene position: 188260-189954 (Clockwise)
Preceding gene: 50364978
Following gene: 50364982
Centisome position: 23.73
GC content: 27.26
Gene sequence:
>1695_bases ATGAATGGGGGTAATCAAATGTCTACCAACACAAATAAGTCTAATAAATCTAAATGACTACACTTTAAAAAAAATAAAGA ACAAAAAAATAAATTTGATCCCCATAAAGCTTTTTTAAAATTAAAAACTTGATGGCCATTGTCTAAAGTATCAGGAAGAA TATTCTTAATTTATTTATTTATAGTTTTATTTGGTGGTTTCTTATTATGCATACCAGGAATTGTTGTCAATAATGATTTA AATGGCTATGATTTCAGATGAGATTATTTAACAGGTATTTTCACAGCATCAAGTGCTTTTAGTGATACTGGTATTAATAT TATTGACCCATCACATGACTATACTTTTTGAGGACAATTAATTTTACTTATTCTAATTGAAATGGGTGGGATTGGTGTTT TAACTTTAAAAATTATTTTATTTATTTCTATTAATAAAAAAATATCACTTAGTGATACTGTTGTTGCTCAATCTGAGCGT GGAAATGATGTTAAATCTTCAACAATTGAATTAATCAAAGATGGATTTATATTTTTAACTTTTATTCAATTGATTGCAGC AGGAGTTTTATTCTTTTTATTTTTCTTTTCTGAACCAGCAACTCAATCATTAAATGGAACTGAATTAAATGTTGTATCAC CATATCATAACTTTATAAAATCAATCTGATTTGCTATTTTTCACTCAACAAGTGCTATTAATAATGCTGGTTATGATTTA CTTTCTACAAATTCATTGCAACCATATAATATTGAAGGGCATCAAGCTTATGCTATTCAAATAGTATTTTTACTTGAATG AGTTATTGGGGGATTAGGATATCCAACATTCCATGATATTAAGAGAAAAATGAGAGCGAGAAGAGTTGGACAAAAAGTAA AATTTAGTTTATTTACAAAATTAAATTTCTGAGTTTACTCAACACTATTTGTTGTTGGACCTTTATTAATTTTTCTTAGT GAATATTCAAATCAAACAAACTCATTAATTTTTAATTACTATACATATGATGTTGATCCGTTAACTCAAATGCCAATTAA TGTAATTGTAACTGAAGCAAAACCAACCTTTGTTGTCGCTATGGATATAATATTTAATACAACAGCTTGTAGAAACGCAG GTTTCTCAACAGTACCAATAAATGATTTTAATGCATCATCTAAAACAATACTATCTTCATTAATGTTTATTGGTTCTGCC CCTTCTTCAACCGCAGGGGGTATTAGAACAACAACATTTGCTATCATTTTACTTTCAACATGAGCAATCATTAGAAATAA AAGTTATACAAGTGCTTTTAAAAAAGTAATTCCTGCAGAAACTGTAAGAAGAAGCTTTTCAGTATTCTTTATTTCAGTAT TTATTTTAACTATTGTTATTATTTTAATTTATTTTGATTCAAATGGATTCTTAACACCAGGAATTGAAAATGGAGTTGCT GGAGAACTTGTGCAAAATCAAGGCGATGCAAGTATTGTTCAAATTTTAACTTTAATAACTAGTGCATATGGAACGGTAGG AATGAATCCATTTACACAACATCAGATGTATAATTTTGGTGTATTAACTAAATTGTTAATTATTTTATGTATGTTCTTAG GACAATTAGGAATATCAAATACATTATTAGCATTTATTAAACCATCAAGAAAAACAAACTTTAAATATTTAGAAGAAGAC GTAACTATAGGGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATAATTGCAATACTTTTTTTCTTTGCCATTTAATATACACCTTCTTTGATACTTTAATAATTATACATTTGTAATAAT TAAATTGTATAATAATTACT
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGATATTATGATTATTTTAGACGGAAAAAAAGTAGCATCAAGAAGAAAAGAAGAGTTAACTGCTAAAATTTCAAAATAT CACAATAAAGGGTTAAGAAA
Product: K+, Na+ uptake protein bound cytoplasmic subunit
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 564; Mature: 564
Protein sequence:
>564_residues MNGGNQMSTNTNKSNKSKWLHFKKNKEQKNKFDPHKAFLKLKTWWPLSKVSGRIFLIYLFIVLFGGFLLCIPGIVVNNDL NGYDFRWDYLTGIFTASSAFSDTGINIIDPSHDYTFWGQLILLILIEMGGIGVLTLKIILFISINKKISLSDTVVAQSER GNDVKSSTIELIKDGFIFLTFIQLIAAGVLFFLFFFSEPATQSLNGTELNVVSPYHNFIKSIWFAIFHSTSAINNAGYDL LSTNSLQPYNIEGHQAYAIQIVFLLEWVIGGLGYPTFHDIKRKMRARRVGQKVKFSLFTKLNFWVYSTLFVVGPLLIFLS EYSNQTNSLIFNYYTYDVDPLTQMPINVIVTEAKPTFVVAMDIIFNTTACRNAGFSTVPINDFNASSKTILSSLMFIGSA PSSTAGGIRTTTFAIILLSTWAIIRNKSYTSAFKKVIPAETVRRSFSVFFISVFILTIVIILIYFDSNGFLTPGIENGVA GELVQNQGDASIVQILTLITSAYGTVGMNPFTQHQMYNFGVLTKLLIILCMFLGQLGISNTLLAFIKPSRKTNFKYLEED VTIG
Sequences:
>Translated_564_residues MNGGNQMSTNTNKSNKSK*LHFKKNKEQKNKFDPHKAFLKLKT*WPLSKVSGRIFLIYLFIVLFGGFLLCIPGIVVNNDL NGYDFR*DYLTGIFTASSAFSDTGINIIDPSHDYTF*GQLILLILIEMGGIGVLTLKIILFISINKKISLSDTVVAQSER GNDVKSSTIELIKDGFIFLTFIQLIAAGVLFFLFFFSEPATQSLNGTELNVVSPYHNFIKSI*FAIFHSTSAINNAGYDL LSTNSLQPYNIEGHQAYAIQIVFLLE*VIGGLGYPTFHDIKRKMRARRVGQKVKFSLFTKLNF*VYSTLFVVGPLLIFLS EYSNQTNSLIFNYYTYDVDPLTQMPINVIVTEAKPTFVVAMDIIFNTTACRNAGFSTVPINDFNASSKTILSSLMFIGSA PSSTAGGIRTTTFAIILLST*AIIRNKSYTSAFKKVIPAETVRRSFSVFFISVFILTIVIILIYFDSNGFLTPGIENGVA GELVQNQGDASIVQILTLITSAYGTVGMNPFTQHQMYNFGVLTKLLIILCMFLGQLGISNTLLAFIKPSRKTNFKYLEED VTIG >Mature_564_residues MNGGNQMSTNTNKSNKSK*LHFKKNKEQKNKFDPHKAFLKLKT*WPLSKVSGRIFLIYLFIVLFGGFLLCIPGIVVNNDL NGYDFR*DYLTGIFTASSAFSDTGINIIDPSHDYTF*GQLILLILIEMGGIGVLTLKIILFISINKKISLSDTVVAQSER GNDVKSSTIELIKDGFIFLTFIQLIAAGVLFFLFFFSEPATQSLNGTELNVVSPYHNFIKSI*FAIFHSTSAINNAGYDL LSTNSLQPYNIEGHQAYAIQIVFLLE*VIGGLGYPTFHDIKRKMRARRVGQKVKFSLFTKLNF*VYSTLFVVGPLLIFLS EYSNQTNSLIFNYYTYDVDPLTQMPINVIVTEAKPTFVVAMDIIFNTTACRNAGFSTVPINDFNASSKTILSSLMFIGSA PSSTAGGIRTTTFAIILLST*AIIRNKSYTSAFKKVIPAETVRRSFSVFFISVFILTIVIILIYFDSNGFLTPGIENGVA GELVQNQGDASIVQILTLITSAYGTVGMNPFTQHQMYNFGVLTKLLIILCMFLGQLGISNTLLAFIKPSRKTNFKYLEED VTIG
Specific function: Unknown
COG id: COG0168
COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003445 [H]
Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61542; Mature: 61542
Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNGGNQMSTNTNKSNKSKLHFKKNKEQKNKFDPHKAFLKLKTWPLSKVSGRIFLIYLFIV CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCHHCCCCCHHHHHEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHH LFGGFLLCIPGIVVNNDLNGYDFRDYLTGIFTASSAFSDTGINIIDPSHDYTFGQLILLI HHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHH LIEMGGIGVLTLKIILFISINKKISLSDTVVAQSERGNDVKSSTIELIKDGFIFLTFIQL HHHCCCCHHHHHHHHHHEECCCEEECCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IAAGVLFFLFFFSEPATQSLNGTELNVVSPYHNFIKSIFAIFHSTSAINNAGYDLLSTNS HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCC LQPYNIEGHQAYAIQIVFLLEVIGGLGYPTFHDIKRKMRARRVGQKVKFSLFTKLNFVYS CCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH TLFVVGPLLIFLSEYSNQTNSLIFNYYTYDVDPLTQMPINVIVTEAKPTFVVAMDIIFNT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHCC TACRNAGFSTVPINDFNASSKTILSSLMFIGSAPSSTAGGIRTTTFAIILLSTAIIRNKS HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH YTSAFKKVIPAETVRRSFSVFFISVFILTIVIILIYFDSNGFLTPGIENGVAGELVQNQG HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCC DASIVQILTLITSAYGTVGMNPFTQHQMYNFGVLTKLLIILCMFLGQLGISNTLLAFIKP CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEECC SRKTNFKYLEEDVTIG CCCCCCHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNGGNQMSTNTNKSNKSKLHFKKNKEQKNKFDPHKAFLKLKTWPLSKVSGRIFLIYLFIV CCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCHHCCCCCHHHHHEEEECCCCHHHCCHHHHHHHHHH LFGGFLLCIPGIVVNNDLNGYDFRDYLTGIFTASSAFSDTGINIIDPSHDYTFGQLILLI HHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHH LIEMGGIGVLTLKIILFISINKKISLSDTVVAQSERGNDVKSSTIELIKDGFIFLTFIQL HHHCCCCHHHHHHHHHHEECCCEEECCHHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH IAAGVLFFLFFFSEPATQSLNGTELNVVSPYHNFIKSIFAIFHSTSAINNAGYDLLSTNS HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCC LQPYNIEGHQAYAIQIVFLLEVIGGLGYPTFHDIKRKMRARRVGQKVKFSLFTKLNFVYS CCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH TLFVVGPLLIFLSEYSNQTNSLIFNYYTYDVDPLTQMPINVIVTEAKPTFVVAMDIIFNT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHCC TACRNAGFSTVPINDFNASSKTILSSLMFIGSAPSSTAGGIRTTTFAIILLSTAIIRNKS HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH YTSAFKKVIPAETVRRSFSVFFISVFILTIVIILIYFDSNGFLTPGIENGVAGELVQNQG HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCC DASIVQILTLITSAYGTVGMNPFTQHQMYNFGVLTKLLIILCMFLGQLGISNTLLAFIKP CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEEECC SRKTNFKYLEEDVTIG CCCCCCHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7569993 [H]