| Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006055 |
| Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50364974
Identifier: 50364974
GI number: 50364974
Start: 175974
End: 181418
Strand: Direct
Name: 50364974
Synonym: Mfl159
Alternate gene names: NA
Gene position: 175974-181418 (Clockwise)
Preceding gene: 50364972
Following gene: 50364975
Centisome position: 22.18
GC content: 26.67
Gene sequence:
>5445_bases ATGAAAATAACATGACTTTTATTTAAGCAAGGAATAAGAAGTATGTTCAAATTTAAGATTCAATTCATTGTGGTTGTACT GCTTTCTTTTTTTGCGTCTTTTTATTTGGCTTCAACAACAAGCTTAAATTCTAGAATGAATAAGTCATATGATGACATTG TAAGAAATTATGAAAAATTTGATTATTCATATTCTACTAAAGCTAGTGAATCAAATTTATCAACATCAAATAAAACATTA TTACCAATCCTGGACTTGATGCCTACTTCAACAAATTATTTTGTTCAAGCTAATAAATCAATTCATGATTCTTTTAATGT TGTTTTAAATAACCACGGAATTAAAACAGAAGGTTATGAAGAAAATTTAATAACAAAAACATTTTTTGATCAAAACACTG GTAAACCAACACAAGCTATGCAAAATGTTTGAAACGGTATTCCATGATATAATTCTTGAAAATTTTTCTCTCTTCTAAAA TCTGATCCTAATAAAGGTGAGTTTTTATACTACCCACAAAGTTTTAAAACAAACTTTGGTTCTAATTTAGAAAATTTTGG TGGTGGTGACTACTTTAATGCATACGCTTCAATGACCTATTTAATAGTTAAAGAAATTTCAGATACTCTTTATAATGAAT TATTACTTGATGAACCTAATGAATCATTTGTTCAATCTTTAATTTATAAATATTGAAAAGCAAATGATTTAAAGGTAGAA AAAGATTTTAAAAAAATTGATGCTCCAATTGATCTTAATCAAACAAATAATTTTGATTGAATTTCAGAATATAAAAAACA AGTATCTAGTTTAGGAGAATTCCAACTTTATATTTATAATGCTCTAGAATCAATAGGTTATTTTATAACATATCAAATTA ACCAATTTTTAAGTAATTCTTATGCAAGAACTGCTAAATCAATTAATTTTGATTGAAATATTGCTGGAAGCGATGAAGAA 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Upstream 100 bases:
>100_bases TAAAATAATTTTACACTTTTTGAAGCTTTTTTACACTAAACATAGATGATTAATATAAAATATATAATATGTGAAAACAC TTATAGTTGGGGAAAAAGGT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATAAAAAATTTTAAAACAGACTTTGTTCTGTTTTTTTTGTTGTTTAACTCTTGAAACCATAAAACAAAAACATATAA AAAAGTTTATAATTATATAG
Product: substrate ABC transporter permease component
Products: NA
Alternate protein names: Permease
Number of amino acids: Translated: 1814; Mature: 1814
Protein sequence:
>1814_residues MKITWLLFKQGIRSMFKFKIQFIVVVLLSFFASFYLASTTSLNSRMNKSYDDIVRNYEKFDYSYSTKASESNLSTSNKTL LPILDLMPTSTNYFVQANKSIHDSFNVVLNNHGIKTEGYEENLITKTFFDQNTGKPTQAMQNVWNGIPWYNSWKFFSLLK SDPNKGEFLYYPQSFKTNFGSNLENFGGGDYFNAYASMTYLIVKEISDTLYNELLLDEPNESFVQSLIYKYWKANDLKVE KDFKKIDAPIDLNQTNNFDWISEYKKQVSSLGEFQLYIYNALESIGYFITYQINQFLSNSYARTAKSINFDWNIAGSDEE KSKLYVTKFNEMAEQTQEMKIFMELHTSSGTSEITGKDGETVESISNYNNELTFEYIFGTNLVDQTLNPKFTVKYGNAEN TYQIKGMDNQIIGSNLDAKKDGLRGLANPTTIKKDEEYNEYSISTMNLLNPWEKNDLSQKWENQNTGKKYDYEYDASKYA TMYDWSNIYSNNIFHQKMAAEINDLDLYLREEAFMYDRNTKTNFRFVVTDNNYDYNFKVTAGLPVMHSSEIVISQQYAFK NGYSVGDKIKIGNSNFIISGFGSDALTYYPLVDPEVPLSDVANSVIVYAPKYVINEIMKNGNEKDVTFTTYYFIRDNLKD KETIGKRMSNFDSSLLSNKSKLSESFIDSKNENLSFGDKKSANEIKLFEKTYFNLNWTLQPKMLEIVTIISIVTSVLVLI MSFVSIVFGIKKTIDHNSSQIGFLKAKGVDSYRLSLSYIGYSIILLFIIVPLAWLAAGFFQEIITKLFATYFSTTLYEFV FDYKILLILLVVFGIGSLILSYFIAFLLVSKDVMQIINKESQQRKVRNWLPRKLNVINIIDFKFRFPLKISLRGSKQIAM ISFTALITTFVITFSVLTPSMLNVYIRDAGKYYQYNNQYVMQDQLTGLPTAKASLTASRGLPTTEELYQEPKTLLGTSTR DQISDIYFDNNKYYTDSSWDSSIFPPILLGEGWTNGQWTKDELNWTEKWIFDENSSTRDDTSKLLKMAMPVIGQLGNLNG ITISAGEFEKISSYIWNAEINPNTGKSYFDGQQINPNTLQNIWEMKKNSAKGSIEFIQMALQVAMQSLANSEDNGLPTIE RPTDTTWKEDLILLALAFLPNVGQQYLKDSPNRASQFGISINAENYTPGIETLSTDVYTQMNNNFVNVNGLKDNQTVYNL DSIDDDKVFIKDQETIDKLNVLFNDKENYTGGDIYLNDDFKIYDSNTKVLNIPVVTNLKSYKQQNLNKSVPIQGMSYKTL SIGGKEVPKNAWIYDNREITNNKNLFSSDLNMKNEEDWINPSKIDPNKLTYTKQFRYDDNGNITSLNDQSKWFINSIVND QYNIDGLDFEIRPYYHYNNLKLFVPRNLTDIDSLLNGKNANTSKTSKNSSSDWRSNIDIWHGSVLSVDVPEEVKKAWGSE YANQTEWEWISPFSLNYSRKITDPNRKGWIQNIDTDLQQIYTWASDKIVASGSSSDAVVTVSNKLPSFLSDVRMQSVDTI QTYNGNIVIADQDILNLLTNKSTEKYLPVDYDFYGAPIKQIPNGQITSGDHTITVNSMRNPIEQLNMMRENKTFFMKDDL MNKYEITDQEAYRKVLQNRDFNSKFSSFDEAYGITGGVKGIMVDSPGVFALQGSTDRIEETLGMTYNKIDLVSTQLGMII SISESILLVALFLITGIIIISVLIITIISDVYIMKYHRFMVTMKALGYSNKETIINTILIPAVISTIFVLIGYLVGKWLL GSMMIQAQKFGIFIPLITNWWATPLILLGIIIMFVLAFTFSLRKPIKDELKTLT
Sequences:
>Translated_1814_residues MKIT*LLFKQGIRSMFKFKIQFIVVVLLSFFASFYLASTTSLNSRMNKSYDDIVRNYEKFDYSYSTKASESNLSTSNKTL LPILDLMPTSTNYFVQANKSIHDSFNVVLNNHGIKTEGYEENLITKTFFDQNTGKPTQAMQNV*NGIP*YNS*KFFSLLK SDPNKGEFLYYPQSFKTNFGSNLENFGGGDYFNAYASMTYLIVKEISDTLYNELLLDEPNESFVQSLIYKY*KANDLKVE KDFKKIDAPIDLNQTNNFD*ISEYKKQVSSLGEFQLYIYNALESIGYFITYQINQFLSNSYARTAKSINFD*NIAGSDEE KSKLYVTKFNEMAEQTQEMKIFMELHTSSGTSEITGKDGETVESISNYNNELTFEYIFGTNLVDQTLNPKFTVKYGNAEN TYQIKGMDNQIIGSNLDAKKDGLRGLANPTTIKKDEEYNEYSISTMNLLNP*EKNDLSQK*ENQNTGKKYDYEYDASKYA TMYD*SNIYSNNIFHQKMAAEINDLDLYLREEAFMYDRNTKTNFRFVVTDNNYDYNFKVTAGLPVMHSSEIVISQQYAFK NGYSVGDKIKIGNSNFIISGFGSDALTYYPLVDPEVPLSDVANSVIVYAPKYVINEIMKNGNEKDVTFTTYYFIRDNLKD KETIGKRMSNFDSSLLSNKSKLSESFIDSKNENLSFGDKKSANEIKLFEKTYFNLN*TLQPKMLEIVTIISIVTSVLVLI MSFVSIVFGIKKTIDHNSSQIGFLKAKGVDSYRLSLSYIGYSIILLFIIVPLA*LAAGFFQEIITKLFATYFSTTLYEFV FDYKILLILLVVFGIGSLILSYFIAFLLVSKDVMQIINKESQQRKVRN*LPRKLNVINIIDFKFRFPLKISLRGSKQIAM ISFTALITTFVITFSVLTPSMLNVYIRDAGKYYQYNNQYVMQDQLTGLPTAKASLTASRGLPTTEELYQEPKTLLGTSTR DQISDIYFDNNKYYTDSS*DSSIFPPILLGEG*TNGQ*TKDELN*TEK*IFDENSSTRDDTSKLLKMAMPVIGQLGNLNG ITISAGEFEKISSYI*NAEINPNTGKSYFDGQQINPNTLQNI*EMKKNSAKGSIEFIQMALQVAMQSLANSEDNGLPTIE RPTDTT*KEDLILLALAFLPNVGQQYLKDSPNRASQFGISINAENYTPGIETLSTDVYTQMNNNFVNVNGLKDNQTVYNL DSIDDDKVFIKDQETIDKLNVLFNDKENYTGGDIYLNDDFKIYDSNTKVLNIPVVTNLKSYKQQNLNKSVPIQGMSYKTL SIGGKEVPKNA*IYDNREITNNKNLFSSDLNMKNEED*INPSKIDPNKLTYTKQFRYDDNGNITSLNDQSK*FINSIVND QYNIDGLDFEIRPYYHYNNLKLFVPRNLTDIDSLLNGKNANTSKTSKNSSSD*RSNIDI*HGSVLSVDVPEEVKKA*GSE YANQTE*E*ISPFSLNYSRKITDPNRKG*IQNIDTDLQQIYT*ASDKIVASGSSSDAVVTVSNKLPSFLSDVRMQSVDTI QTYNGNIVIADQDILNLLTNKSTEKYLPVDYDFYGAPIKQIPNGQITSGDHTITVNSMRNPIEQLNMMRENKTFFMKDDL MNKYEITDQEAYRKVLQNRDFNSKFSSFDEAYGITGGVKGIMVDSPGVFALQGSTDRIEETLGMTYNKIDLVSTQLGMII SISESILLVALFLITGIIIISVLIITIISDVYIMKYHRFMVTMKALGYSNKETIINTILIPAVISTIFVLIGYLVGK*LL GSMMIQAQKFGIFIPLITN**ATPLILLGIIIMFVLAFTFSLRKPIKDELKTLT >Mature_1814_residues MKIT*LLFKQGIRSMFKFKIQFIVVVLLSFFASFYLASTTSLNSRMNKSYDDIVRNYEKFDYSYSTKASESNLSTSNKTL LPILDLMPTSTNYFVQANKSIHDSFNVVLNNHGIKTEGYEENLITKTFFDQNTGKPTQAMQNV*NGIP*YNS*KFFSLLK SDPNKGEFLYYPQSFKTNFGSNLENFGGGDYFNAYASMTYLIVKEISDTLYNELLLDEPNESFVQSLIYKY*KANDLKVE KDFKKIDAPIDLNQTNNFD*ISEYKKQVSSLGEFQLYIYNALESIGYFITYQINQFLSNSYARTAKSINFD*NIAGSDEE KSKLYVTKFNEMAEQTQEMKIFMELHTSSGTSEITGKDGETVESISNYNNELTFEYIFGTNLVDQTLNPKFTVKYGNAEN TYQIKGMDNQIIGSNLDAKKDGLRGLANPTTIKKDEEYNEYSISTMNLLNP*EKNDLSQK*ENQNTGKKYDYEYDASKYA TMYD*SNIYSNNIFHQKMAAEINDLDLYLREEAFMYDRNTKTNFRFVVTDNNYDYNFKVTAGLPVMHSSEIVISQQYAFK NGYSVGDKIKIGNSNFIISGFGSDALTYYPLVDPEVPLSDVANSVIVYAPKYVINEIMKNGNEKDVTFTTYYFIRDNLKD KETIGKRMSNFDSSLLSNKSKLSESFIDSKNENLSFGDKKSANEIKLFEKTYFNLN*TLQPKMLEIVTIISIVTSVLVLI MSFVSIVFGIKKTIDHNSSQIGFLKAKGVDSYRLSLSYIGYSIILLFIIVPLA*LAAGFFQEIITKLFATYFSTTLYEFV FDYKILLILLVVFGIGSLILSYFIAFLLVSKDVMQIINKESQQRKVRN*LPRKLNVINIIDFKFRFPLKISLRGSKQIAM ISFTALITTFVITFSVLTPSMLNVYIRDAGKYYQYNNQYVMQDQLTGLPTAKASLTASRGLPTTEELYQEPKTLLGTSTR DQISDIYFDNNKYYTDSS*DSSIFPPILLGEG*TNGQ*TKDELN*TEK*IFDENSSTRDDTSKLLKMAMPVIGQLGNLNG ITISAGEFEKISSYI*NAEINPNTGKSYFDGQQINPNTLQNI*EMKKNSAKGSIEFIQMALQVAMQSLANSEDNGLPTIE RPTDTT*KEDLILLALAFLPNVGQQYLKDSPNRASQFGISINAENYTPGIETLSTDVYTQMNNNFVNVNGLKDNQTVYNL DSIDDDKVFIKDQETIDKLNVLFNDKENYTGGDIYLNDDFKIYDSNTKVLNIPVVTNLKSYKQQNLNKSVPIQGMSYKTL SIGGKEVPKNA*IYDNREITNNKNLFSSDLNMKNEED*INPSKIDPNKLTYTKQFRYDDNGNITSLNDQSK*FINSIVND QYNIDGLDFEIRPYYHYNNLKLFVPRNLTDIDSLLNGKNANTSKTSKNSSSD*RSNIDI*HGSVLSVDVPEEVKKA*GSE YANQTE*E*ISPFSLNYSRKITDPNRKG*IQNIDTDLQQIYT*ASDKIVASGSSSDAVVTVSNKLPSFLSDVRMQSVDTI QTYNGNIVIADQDILNLLTNKSTEKYLPVDYDFYGAPIKQIPNGQITSGDHTITVNSMRNPIEQLNMMRENKTFFMKDDL MNKYEITDQEAYRKVLQNRDFNSKFSSFDEAYGITGGVKGIMVDSPGVFALQGSTDRIEETLGMTYNKIDLVSTQLGMII SISESILLVALFLITGIIIISVLIITIISDVYIMKYHRFMVTMKALGYSNKETIINTILIPAVISTIFVLIGYLVGK*LL GSMMIQAQKFGIFIPLITN**ATPLILLGIIIMFVLAFTFSLRKPIKDELKTLT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 200878; Mature: 200878
Theoretical pI: Translated: 5.03; Mature: 5.03
Prosite motif: PS50928 ABC_TM1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKITLLFKQGIRSMFKFKIQFIVVVLLSFFASFYLASTTSLNSRMNKSYDDIVRNYEKFD CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHC YSYSTKASESNLSTSNKTLLPILDLMPTSTNYFVQANKSIHDSFNVVLNNHGIKTEGYEE CCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCC NLITKTFFDQNTGKPTQAMQNVNGIPYNSKFFSLLKSDPNKGEFLYYPQSFKTNFGSNLE CCEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHCCCCCCCCC NFGGGDYFNAYASMTYLIVKEISDTLYNELLLDEPNESFVQSLIYKYKANDLKVEKDFKK CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECHHHH IDAPIDLNQTNNFDISEYKKQVSSLGEFQLYIYNALESIGYFITYQINQFLSNSYARTAK CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH SINFDNIAGSDEEKSKLYVTKFNEMAEQTQEMKIFMELHTSSGTSEITGKDGETVESISN CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHC YNNELTFEYIFGTNLVDQTLNPKFTVKYGNAENTYQIKGMDNQIIGSNLDAKKDGLRGLA CCCCEEEEEEECCCHHHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCC NPTTIKKDEEYNEYSISTMNLLNPEKNDLSQKENQNTGKKYDYEYDASKYATMYDSNIYS 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CCCCCCCCCCCEEEECEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCCH QNIDTDLQQIYTASDKIVASGSSSDAVVTVSNKLPSFLSDVRMQSVDTIQTYNGNIVIAD HHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEC QDILNLLTNKSTEKYLPVDYDFYGAPIKQIPNGQITSGDHTITVNSMRNPIEQLNMMREN HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCEECCCCEEEECHHHCHHHHHHHHHCC KTFFMKDDLMNKYEITDQEAYRKVLQNRDFNSKFSSFDEAYGITGGVKGIMVDSPGVFAL CCEEEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCEEEE QGSTDRIEETLGMTYNKIDLVSTQLGMIISISESILLVALFLITGIIIISVLIITIISDV CCCHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YIMKYHRFMVTMKALGYSNKETIINTILIPAVISTIFVLIGYLVGKLLGSMMIQAQKFGI HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCE FIPLITNATPLILLGIIIMFVLAFTFSLRKPIKDELKTLT EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKITLLFKQGIRSMFKFKIQFIVVVLLSFFASFYLASTTSLNSRMNKSYDDIVRNYEKFD CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHC YSYSTKASESNLSTSNKTLLPILDLMPTSTNYFVQANKSIHDSFNVVLNNHGIKTEGYEE 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