Definition | Bacillus anthracis str. Sterne chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_005945 |
Length | 5,228,663 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 49188054
GI number: 49188054
Start: 4942080
End: 4944080
Strand: Reverse
Name: yhgE [H]
Synonym: BAS5068
Alternate gene names: 49188054
Gene position: 4944080-4942080 (Counterclockwise)
Preceding gene: 49188056
Following gene: 49188050
Centisome position: 94.56
GC content: 38.58
Gene sequence:
>2001_bases ATGAAAGGAATTCAACTTATATTTAAAGATTGGAAAGCGATGTGGCACCATAAACATGGACGTATCGCTTTAATTTTTTT ATTAATCGTTCCTTTAATTTATTCAGGATTCTTTTTAGCTGGATATTGGGATCCGTACGGACGATTAGATAAATTACCTG TTGCGATTATAAATTTAGATAAGGGTGCTGCGATGGATGAGAAAACAATTCGTGCAGGAGACGATTTTGTAAAAAATTTA AAAGAGAATAAGGAACTAGCTTTTCATTTCGTATCAGAAAAAAATGCTGATGAAGGGCTAAAAGAAGATAAGTACTATAT GGTTGTTACGATTCCAGAGGATTTCTCTAAAAAGGTAAGTACACTTATGGATGAGAAACCAGAGCCAGCGCAGCTTCAGT ACAAAGTAAATCCGGGTAAAAACTTTGTAGCAGCGCAAATTGGAACGACAGCTGTTGAAAATATGAAAACAAAAATTTCA AATAGTATTACAAAATCTTATACAGAAGGTGTCTTTTCAAAGTTTCAAGACTTAGCACAAGGGTTGAATGATGCAAGTCA TGGTGCTGGGAAGTTACATGAAGGAACGACAGAAGCAAGAAATGGAGCAAATCAGCTCGCAGATGGTATTCATCGTTTAA GTGACGGGACATCAAAAGTGAAAGAGGAAAGTGACAAACTTGCTTCTAGCCAATCTGCCTTAACTGACGGAGCAAATGGG CTAAGTCAAGGAGCAACCTCACTTCATAGCGGGATGGAGTTATTGACACAAGGTGAAAAAACTTTACAATCAGGGGTTAG TGAATTAAGTGCTGGTACAAATGAATGGGTGAACGGAAGCGAGAAACTTGCTGAAGGGCAAGTGAAAGCGGACAATGCAG CAAATAGTGTAAAACAACAATTAGAAGAGTACGTGAAAAGTCATCCAGAAGTGCAGCAAGATCCTGCTTTTCAAAAGATT ATTGCTACGTCTAATGGATTAGCTCAAGCAACAAACACCTTAAATAATAGCCAGCAACAATTGACGCAAGGTGCAAAGAA GCTTGCGGATGGTCAACATAAGATTGAAGAAGGTATAAATACATTCGGAGTTAAGTTAAATGAGGCTACTGCTGGAACGA AAAAGATAGCAGATGGTGCGGCGAATTTAGCTAGTGGATTTACGAAATGGGGGACTGGATTTACATCATTACAAGAAGGT GTCAATCAACTTGCGAGTGGCGGAACAGAGCTGAATCATGGTGTTGATCAGTTAACGAACGGACTTGTTAAACTTGACGA TGGTGCGAAAGAACTTTCTACGAAATTAGGAGAGGGCGCAGCGAAGATAGCAGATGTTCGCAATGATGATGCACGCAATA CGATGTTCTCAGAGCCGGTTCAATTAGTGAAATCAACAGTTTCTGACGCACCTAATTACGGTTCAGGTATTGCACCATAT TTCTTATCGCTTGCGTTTTATGTTGGCGGAATTATGGCGTCGAATATTTTACCGCTTGGCCGTAGACAAAATATGAAAGT AAGTGGAACAGTACATTTTATTAATAAATTAGGATTGGTATATGTAATTGGACTTATTCAAGCATTGCTTGTAGATGTAG TTGTGCTAGGAGTTATGAAATTAGAAGTTGCAAGTGTGCCACTCTTTGTTTTATCAAGTATCGTTATTTCCTTTACGTTT ATGACGTTTATTCTTATGTTAGTAACAGTATTTGGTCTTGTTGGAAAGTTCTTAGCGGTAACGCTCCTTGTCCTGCAGTT AGCGACGAGCGGGGGGACTTTCCCAGGAGAATTAAATATAGCTGTTCTTAGCAAAATTGGACAATTTCTCCCAATGTCTC ATTCTCTTAGAGGACTACAAGATGTGATTTCTTTAGGAGATTGGTCGCAATTACAAATGCAAATTTTAATATTGTTATGC TATCTCGTTGTTGCTGGTGGAATTGCTTGGATCACGAGCCATATACAACATAGGGAAACGAATGTAGAACAAGTTTCCTA A
Upstream 100 bases:
>100_bases TTGATAATTAAAGATGTATTATACAGTATGAAAATGGACGTGTATAGTAAATCTGTTAAACCATTCTAATGGTGTTAAAT TTGGAGAAGGAGTATGTTTC
Downstream 100 bases:
>100_bases AATGAAAGAAGCTATCCGGTTTTTTCGGATAGCTTCTTTTTTATTTGCGTTCCATTACTGCAAAGTAATTGTTTTCATTA TCAGCAAAGTTAAATGCTCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 666; Mature: 666
Protein sequence:
>666_residues MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIINLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNL KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLNDASHGAGKLHEGTTEARNGANQLADGIHRLSDGTSKVKEESDKLASSQSALTDGANG LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAANSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI IATSNGLAQATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEG VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDAPNYGSGIAPY FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC YLVVAGGIAWITSHIQHRETNVEQVS
Sequences:
>Translated_666_residues MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIINLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNL KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLNDASHGAGKLHEGTTEARNGANQLADGIHRLSDGTSKVKEESDKLASSQSALTDGANG LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAANSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI IATSNGLAQATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEG VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDAPNYGSGIAPY FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC YLVVAGGIAWITSHIQHRETNVEQVS >Mature_666_residues MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIINLDKGAAMDEKTIRAGDDFVKNL KENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVSTLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKIS NSITKSYTEGVFSKFQDLAQGLNDASHGAGKLHEGTTEARNGANQLADGIHRLSDGTSKVKEESDKLASSQSALTDGANG LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAANSVKQQLEEYVKSHPEVQQDPAFQKI IATSNGLAQATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGINTFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEG VNQLASGGTELNHGVDQLTNGLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDAPNYGSGIAPY FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMKLEVASVPLFVLSSIVISFTF MTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNIAVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLC YLVVAGGIAWITSHIQHRETNVEQVS
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71791; Mature: 71791
Theoretical pI: Translated: 6.58; Mature: 6.58
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIINLD CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECC KGAAMDEKTIRAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVS CCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHH TLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGVFSKFQDLAQ HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLNDASHGAGKLHEGTTEARNGANQLADGIHRLSDGTSKVKEESDKLASSQSALTDGANG CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAANSVKQQ HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH LEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAQATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGIN HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCHH TFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEGVNQLASGGTELNHGVDQLTN HHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHC GLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDAPNYGSGIAPY CCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH AVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRET HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NVEQVS CHHHCC >Mature Secondary Structure MKGIQLIFKDWKAMWHHKHGRIALIFLLIVPLIYSGFFLAGYWDPYGRLDKLPVAIINLD CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECC KGAAMDEKTIRAGDDFVKNLKENKELAFHFVSEKNADEGLKEDKYYMVVTIPEDFSKKVS CCCCCCHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHH TLMDEKPEPAQLQYKVNPGKNFVAAQIGTTAVENMKTKISNSITKSYTEGVFSKFQDLAQ HHHCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLNDASHGAGKLHEGTTEARNGANQLADGIHRLSDGTSKVKEESDKLASSQSALTDGANG CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH LSQGATSLHSGMELLTQGEKTLQSGVSELSAGTNEWVNGSEKLAEGQVKADNAANSVKQQ HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH LEEYVKSHPEVQQDPAFQKIIATSNGLAQATNTLNNSQQQLTQGAKKLADGQHKIEEGIN HHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCHH TFGVKLNEATAGTKKIADGAANLASGFTKWGTGFTSLQEGVNQLASGGTELNHGVDQLTN HHCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHC GLVKLDDGAKELSTKLGEGAAKIADVRNDDARNTMFSEPVQLVKSTVSDAPNYGSGIAPY CCEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH FLSLAFYVGGIMASNILPLGRRQNMKVSGTVHFINKLGLVYVIGLIQALLVDVVVLGVMK HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEVASVPLFVLSSIVISFTFMTFILMLVTVFGLVGKFLAVTLLVLQLATSGGTFPGELNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH AVLSKIGQFLPMSHSLRGLQDVISLGDWSQLQMQILILLCYLVVAGGIAWITSHIQHRET HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC NVEQVS CHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]