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Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46446097

Identifier: 46446097

GI number: 46446097

Start: 594026

End: 596164

Strand: Direct

Name: 46446097

Synonym: pc0463

Alternate gene names: NA

Gene position: 594026-596164 (Clockwise)

Preceding gene: 46446080

Following gene: 46446098

Centisome position: 24.6

GC content: 31.65

Gene sequence:

>2139_bases
ATGGAACCTCTTGGTCATTCGCAAACAGTTTCTACAAAAATGCCTCAAATAATTTGGAAAGTAAAACGTTATGATGCGTT
ACTAGAACAAATCTTGGAAAATTTTAAAAATTATTTAATATCTCAAGAATCTTTACTTAATTGGATTGTTCATGATTTTA
ATAATATCAATTTACAAAATACAATAATCCCTATTATCAAACACTTGTTTGTTAATAGACTAAAAAAACCTGATCGATCT
AGTTCTGAATATTTAAATTTTCAACGAGAACACTACAAAAAATTTTTAAAAATTCTAAGAACAGCTGTTGAATGGTCCGA
ATTGAATCGCAATGAAGCTGTAGCTGAACATGTGTTTGCATTTTGTCATATTCTTTATACAGAAACACATTTTAACTATT
GTACCCAAATTATTTTTAGGACATTTATTCAATTAGGTACTGCGAAGCTTAGCAAAGAAAAGGTAAAATACCCCCTTCCA
TATGTAAAAGGATTTGACAAACATCGGATGGTAAGAGGATTGGAGGTTCAATATCAAAGAATTGCCTCAGTTGACGACTC
TGAACAGACAACGAGTGTTCTTACTCGCACAACAAATAGTTTGATTGGTTACATGAATGGGATTAGCCTTTATGATTTTG
ATCCCAATATGCAATCTAATCCTATGCATCTCCTCATGAATTTAACAATTAATATTCAAGGTCAAACTTTTTGTACTAAA
AATTTAGCATTAGGTTCTCCGACGATCGAAAATGGATCGGGTGTAGCGACCATTAATCCTGAAATGAGGGGTTTACTTTC
CTATTATCGGCAAAAAGAAGTTGAGTGTGGGCTTTTGTATCTGAATTACCAAAATTGTCGCAATCAAATTAGTCGATTAG
CTGCAGATGAAAAGCCTCGATGCCTTGCTATTCATGATTTAGGCGATCAGTTTAAAGAATTTTATGTTCTCACATTATCT
CACAATAGCCCTTTTTATGAGCAAATTGGCCATGATATTGAAGATTTAACTGCAAGCTCAGTAAAAAGTAAAATTTGGGC
AGATTTATGTACAACAGGTTCTGAAGTATTTAAGTATTATTTACCATTGGATCATGGGTTATCAGAGTGGGTGAAAGCCA
CTTTAAATCTTGTTCATGCCACGCAATTTGATAAATGCAAAATTTTTACAGAAGACACTTTGAAGTTATTTATTGAAAAG
TTTCATCATACGTTAATTATTAATGCAAAAACTTGTTTTGGTCTTGCTTTGGGGTACTCTATCTACCAACCTGGGTCTTT
TTTTAAAAAACATTTGATCACCGAAATATTTGATGGAAATCCTGAAGAAACAGGATATTGGATTCCTCAAAAATTAGTAG
AGGCAACAGATTTAAGAAATTTTGGGATTGAATTGGCAGATCATATTCATTCAATTATTTTTCATAATAGAGATGATTTA
AGCCCCAGTGAAAGGCGTATATTTCTTAGTTTCTTCTATAATTATTTGACAAATTATTGTTTAATTCGTTTACAGCCAAA
GGCGATGGCTGGTGTTTGTAAAGGTAGAATTGATCGAGGTGTCGCGCGCATAGGCGCATCAATTGCTGAAATGATTATTC
TAAAAGATCAAGAAAATGACCCACAAATAATTGAATTTTTTGAAATGCTTCTTTTGGTTCGATCCCTTATTGTACGTAAA
AGAGTTATCAAACGTGAGAGGTTATTGGAGCTAATTGAGTTTCTTCAATTTCTGCATGATCATAAATCACAAGTTAAAAA
ACTTTTTAAAGCTGTTTTTCCAGACGTATCCATCAACTATGATTTACTTTTATCTAAGCCAGAAACTGACTTAAAAAATG
TTTTTGAAGATCACTATTTTTTAACCACATTGATTGAAATTATTTTGCCAGATTTATTAGAAGAGGAAAAATTCTTAAAA
TTTCTCATAGAATTTGCAAAGGAGTCAACTGAAGAATTAGGTTCTGACAGGAGATTTCCAAAGGTTTTAAAAGATTTTAT
CTTAGATAAAAAATTCTTAAATAACCCAAAAAAATCTACGTATACACTTCTAAATAAGCTACAGCGTTATCCAATCTTTG
TCAAAGAGTTATTTAAAGAGTTAATCAAACGAGACATACTTGAATCAGCTATAGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATAAAAAACCAAATTTTTTTCTAAAATAGCTAATTTTATAAAAAATAATTGGACAAATATTTCTTAATGTTTTTTCGA
TTTAATTAAGGATAGAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGTTAGTTGAGTAAGAGGAAGGATAATTTTTGTAATAATTAACATTCAGGATAACATATGCTAGGTTTGAGTTTTATAT
TTTCAAAAACAGAGTCTGCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 712; Mature: 712

Protein sequence:

>712_residues
MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQNTIIPIIKHLFVNRLKKPDRS
SSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFAFCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLP
YVKGFDKHRMVRGLEVQYQRIASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK
NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPRCLAIHDLGDQFKEFYVLTLS
HNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYYLPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEK
FHHTLIINAKTCFGLALGYSIYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL
SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQENDPQIIEFFEMLLLVRSLIVRK
RVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINYDLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLK
FLIEFAKESTEELGSDRRFPKVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE

Sequences:

>Translated_712_residues
MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQNTIIPIIKHLFVNRLKKPDRS
SSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFAFCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLP
YVKGFDKHRMVRGLEVQYQRIASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK
NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPRCLAIHDLGDQFKEFYVLTLS
HNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYYLPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEK
FHHTLIINAKTCFGLALGYSIYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL
SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQENDPQIIEFFEMLLLVRSLIVRK
RVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINYDLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLK
FLIEFAKESTEELGSDRRFPKVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE
>Mature_712_residues
MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQNTIIPIIKHLFVNRLKKPDRS
SSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFAFCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLP
YVKGFDKHRMVRGLEVQYQRIASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK
NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPRCLAIHDLGDQFKEFYVLTLS
HNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYYLPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEK
FHHTLIINAKTCFGLALGYSIYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL
SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQENDPQIIEFFEMLLLVRSLIVRK
RVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINYDLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLK
FLIEFAKESTEELGSDRRFPKVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 83228; Mature: 83228

Theoretical pI: Translated: 7.79; Mature: 7.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
TIIPIIKHLFVNRLKKPDRSSSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
FCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLPYVKGFDKHRMVRGLEVQYQR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
IASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEC
NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPR
CCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCC
CLAIHDLGDQFKEFYVLTLSHNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYY
EEEEHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
LPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEKFHHTLIINAKTCFGLALGYS
CCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHCCH
IYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL
HCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQEND
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC
PQIIEFFEMLLLVRSLIVRKRVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
DLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLKFLIEFAKESTEELGSDRRFP
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
KVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
TIIPIIKHLFVNRLKKPDRSSSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
IASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK
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NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPR
CCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCC
CLAIHDLGDQFKEFYVLTLSHNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYY
EEEEHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH
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CCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHCCH
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HCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQEND
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC
PQIIEFFEMLLLVRSLIVRKRVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE
DLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLKFLIEFAKESTEELGSDRRFP
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
KVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA