Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
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Accession | NC_005861 |
Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446097
Identifier: 46446097
GI number: 46446097
Start: 594026
End: 596164
Strand: Direct
Name: 46446097
Synonym: pc0463
Alternate gene names: NA
Gene position: 594026-596164 (Clockwise)
Preceding gene: 46446080
Following gene: 46446098
Centisome position: 24.6
GC content: 31.65
Gene sequence:
>2139_bases ATGGAACCTCTTGGTCATTCGCAAACAGTTTCTACAAAAATGCCTCAAATAATTTGGAAAGTAAAACGTTATGATGCGTT ACTAGAACAAATCTTGGAAAATTTTAAAAATTATTTAATATCTCAAGAATCTTTACTTAATTGGATTGTTCATGATTTTA ATAATATCAATTTACAAAATACAATAATCCCTATTATCAAACACTTGTTTGTTAATAGACTAAAAAAACCTGATCGATCT AGTTCTGAATATTTAAATTTTCAACGAGAACACTACAAAAAATTTTTAAAAATTCTAAGAACAGCTGTTGAATGGTCCGA ATTGAATCGCAATGAAGCTGTAGCTGAACATGTGTTTGCATTTTGTCATATTCTTTATACAGAAACACATTTTAACTATT GTACCCAAATTATTTTTAGGACATTTATTCAATTAGGTACTGCGAAGCTTAGCAAAGAAAAGGTAAAATACCCCCTTCCA TATGTAAAAGGATTTGACAAACATCGGATGGTAAGAGGATTGGAGGTTCAATATCAAAGAATTGCCTCAGTTGACGACTC TGAACAGACAACGAGTGTTCTTACTCGCACAACAAATAGTTTGATTGGTTACATGAATGGGATTAGCCTTTATGATTTTG ATCCCAATATGCAATCTAATCCTATGCATCTCCTCATGAATTTAACAATTAATATTCAAGGTCAAACTTTTTGTACTAAA AATTTAGCATTAGGTTCTCCGACGATCGAAAATGGATCGGGTGTAGCGACCATTAATCCTGAAATGAGGGGTTTACTTTC CTATTATCGGCAAAAAGAAGTTGAGTGTGGGCTTTTGTATCTGAATTACCAAAATTGTCGCAATCAAATTAGTCGATTAG CTGCAGATGAAAAGCCTCGATGCCTTGCTATTCATGATTTAGGCGATCAGTTTAAAGAATTTTATGTTCTCACATTATCT CACAATAGCCCTTTTTATGAGCAAATTGGCCATGATATTGAAGATTTAACTGCAAGCTCAGTAAAAAGTAAAATTTGGGC AGATTTATGTACAACAGGTTCTGAAGTATTTAAGTATTATTTACCATTGGATCATGGGTTATCAGAGTGGGTGAAAGCCA CTTTAAATCTTGTTCATGCCACGCAATTTGATAAATGCAAAATTTTTACAGAAGACACTTTGAAGTTATTTATTGAAAAG TTTCATCATACGTTAATTATTAATGCAAAAACTTGTTTTGGTCTTGCTTTGGGGTACTCTATCTACCAACCTGGGTCTTT TTTTAAAAAACATTTGATCACCGAAATATTTGATGGAAATCCTGAAGAAACAGGATATTGGATTCCTCAAAAATTAGTAG AGGCAACAGATTTAAGAAATTTTGGGATTGAATTGGCAGATCATATTCATTCAATTATTTTTCATAATAGAGATGATTTA AGCCCCAGTGAAAGGCGTATATTTCTTAGTTTCTTCTATAATTATTTGACAAATTATTGTTTAATTCGTTTACAGCCAAA GGCGATGGCTGGTGTTTGTAAAGGTAGAATTGATCGAGGTGTCGCGCGCATAGGCGCATCAATTGCTGAAATGATTATTC TAAAAGATCAAGAAAATGACCCACAAATAATTGAATTTTTTGAAATGCTTCTTTTGGTTCGATCCCTTATTGTACGTAAA AGAGTTATCAAACGTGAGAGGTTATTGGAGCTAATTGAGTTTCTTCAATTTCTGCATGATCATAAATCACAAGTTAAAAA ACTTTTTAAAGCTGTTTTTCCAGACGTATCCATCAACTATGATTTACTTTTATCTAAGCCAGAAACTGACTTAAAAAATG TTTTTGAAGATCACTATTTTTTAACCACATTGATTGAAATTATTTTGCCAGATTTATTAGAAGAGGAAAAATTCTTAAAA TTTCTCATAGAATTTGCAAAGGAGTCAACTGAAGAATTAGGTTCTGACAGGAGATTTCCAAAGGTTTTAAAAGATTTTAT CTTAGATAAAAAATTCTTAAATAACCCAAAAAAATCTACGTATACACTTCTAAATAAGCTACAGCGTTATCCAATCTTTG TCAAAGAGTTATTTAAAGAGTTAATCAAACGAGACATACTTGAATCAGCTATAGAGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATAAAAAACCAAATTTTTTTCTAAAATAGCTAATTTTATAAAAAATAATTGGACAAATATTTCTTAATGTTTTTTCGA TTTAATTAAGGATAGAAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGTTAGTTGAGTAAGAGGAAGGATAATTTTTGTAATAATTAACATTCAGGATAACATATGCTAGGTTTGAGTTTTATAT TTTCAAAAACAGAGTCTGCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 712; Mature: 712
Protein sequence:
>712_residues MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQNTIIPIIKHLFVNRLKKPDRS SSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFAFCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLP YVKGFDKHRMVRGLEVQYQRIASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPRCLAIHDLGDQFKEFYVLTLS HNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYYLPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEK FHHTLIINAKTCFGLALGYSIYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQENDPQIIEFFEMLLLVRSLIVRK RVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINYDLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLK FLIEFAKESTEELGSDRRFPKVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE
Sequences:
>Translated_712_residues MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQNTIIPIIKHLFVNRLKKPDRS SSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFAFCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLP YVKGFDKHRMVRGLEVQYQRIASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPRCLAIHDLGDQFKEFYVLTLS HNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYYLPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEK FHHTLIINAKTCFGLALGYSIYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQENDPQIIEFFEMLLLVRSLIVRK RVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINYDLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLK FLIEFAKESTEELGSDRRFPKVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE >Mature_712_residues MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQNTIIPIIKHLFVNRLKKPDRS SSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFAFCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLP YVKGFDKHRMVRGLEVQYQRIASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPRCLAIHDLGDQFKEFYVLTLS HNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYYLPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEK FHHTLIINAKTCFGLALGYSIYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQENDPQIIEFFEMLLLVRSLIVRK RVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINYDLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLK FLIEFAKESTEELGSDRRFPKVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 83228; Mature: 83228
Theoretical pI: Translated: 7.79; Mature: 7.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH TIIPIIKHLFVNRLKKPDRSSSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH FCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLPYVKGFDKHRMVRGLEVQYQR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH IASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEC NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPR CCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCC CLAIHDLGDQFKEFYVLTLSHNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYY EEEEHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH LPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEKFHHTLIINAKTCFGLALGYS CCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHCCH IYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL HCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCC SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQEND CHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC PQIIEFFEMLLLVRSLIVRKRVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE DLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLKFLIEFAKESTEELGSDRRFP EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH KVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MEPLGHSQTVSTKMPQIIWKVKRYDALLEQILENFKNYLISQESLLNWIVHDFNNINLQN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHH TIIPIIKHLFVNRLKKPDRSSSEYLNFQREHYKKFLKILRTAVEWSELNRNEAVAEHVFA HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH FCHILYTETHFNYCTQIIFRTFIQLGTAKLSKEKVKYPLPYVKGFDKHRMVRGLEVQYQR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH IASVDDSEQTTSVLTRTTNSLIGYMNGISLYDFDPNMQSNPMHLLMNLTINIQGQTFCTK HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEEEC NLALGSPTIENGSGVATINPEMRGLLSYYRQKEVECGLLYLNYQNCRNQISRLAADEKPR CCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCC CLAIHDLGDQFKEFYVLTLSHNSPFYEQIGHDIEDLTASSVKSKIWADLCTTGSEVFKYY EEEEHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH LPLDHGLSEWVKATLNLVHATQFDKCKIFTEDTLKLFIEKFHHTLIINAKTCFGLALGYS CCHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHCCH IYQPGSFFKKHLITEIFDGNPEETGYWIPQKLVEATDLRNFGIELADHIHSIIFHNRDDL HCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCC SPSERRIFLSFFYNYLTNYCLIRLQPKAMAGVCKGRIDRGVARIGASIAEMIILKDQEND CHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCC PQIIEFFEMLLLVRSLIVRKRVIKRERLLELIEFLQFLHDHKSQVKKLFKAVFPDVSINY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCE DLLLSKPETDLKNVFEDHYFLTTLIEIILPDLLEEEKFLKFLIEFAKESTEELGSDRRFP EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCH KVLKDFILDKKFLNNPKKSTYTLLNKLQRYPIFVKELFKELIKRDILESAIE HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA