Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
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Accession | NC_005861 |
Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46446098
Identifier: 46446098
GI number: 46446098
Start: 596223
End: 598451
Strand: Direct
Name: 46446098
Synonym: pc0464
Alternate gene names: NA
Gene position: 596223-598451 (Clockwise)
Preceding gene: 46446097
Following gene: 46446099
Centisome position: 24.69
GC content: 29.88
Gene sequence:
>2229_bases ATGCTAGGTTTGAGTTTTATATTTTCAAAAACAGAGTCTGCTTATTTGGAAGGTTGCAAAGAGCTAGAATGGAAAGTTGT TCGTTATGAAGAGTTAATTAAACAACAGATAGAGATTCTTGGAAAACTTTTACTAAAAACAGACGGATTAATTGAATATG TAGTTAAACACATCTCCAATGAAAACGTAAAAAATACCTTGTTTCCTATCATTCAACACTTATTTTCTCAAACGTTTTCT CAAGAAACTTCCAGATTTAATGAAATTTATTTAGATCAAAAAAGGCAGTCATATAAAAAAATTATTTCTCTTCTTAGAAA AGCCCTCGATTATTTTGAAAAAAATCGACATGAACTCATTGCTAGGAATGTTTTAACTTTAGGCTATAAATTTTATTCCC AAATTCGCTTCAATAATTGCGGCACTGAAATTTTTAATAATTTAATGGAATTTGGGAAAAAAGCAACTCTTGAACAACCT AATATTTTTACAATAGTTCCTAATGATAGCCGTTATAAGCTAATCTTTGGATTAGAAATTATTCGTCAGCGAATGCTAGA ATTGGAAAAAAATTCTGTATTGACGGCAACCTCGTTTGGTCGTTATCAAGGTCAATATCAATCTTCTGGGAAACTATTTT ATGGTTTATTTGATCCCCACATACAAGGAAATTTTGTTTCTTTAAAAAGAAAGATTTGTGTTTATCAACCGGCAAACAAG TTTTGTGTTAAAAATCTGATGATGCCTTCCCCGACTATCGAAACAGGTGGCCCTGTCTCAATAAATTCAGAAATGCGTGC TTTTCTAACTCTGTGTCGAGAAAAGCAAAAAACGATACTTTATATTAACTGTCAAGACAAATGTCCAAGCGTAGGATTGA TAGCAGGAGATGACTCTTATCGTTGTCAAGCTATTGAAACATTAGCAGAAGAATTTGCAAATACTTTATTTTTAATTACT CTAACCCATGATCACCCTTTTTATGAGCAAATAGGACATCAGATAGACACATTAAATAGTCAGCTGGTCAAAAAGGCTAT ATTTGATCAAATTTTTAATCCTAATTTTCGTCAATTTGAGAATTATATACTGCCTACAGAGGAGATAAAAAAATGGATGG TAATTACTTTTGATGTGATTCATGCAAAAAAATTTAGCAATTGTGACCATTTTTCGGATGCACAAGAACGTGATTTTTTT ATTGAAGAATGTCATCTAGCATTAATACAAAATGAAGAAATGCTTCGATTAGGGTATTCAATTTATCATGATACAGAGCA TTTTAAAAAAGAATTATTGAGGCAAATCTTTATAGAGGATAAGCAAAAAAGTGGGAACTCCGTACCAGAAAAAATGGTTC TTATAAAAGAAGGTCAAAAATATAGATTTAATCTAAAACATTGGTGCTTGATATTAACGGATCAAATTCATGACATTTTA TTCAATAAACAAAAAGTTCTTTCTCCAAAAGAAAAACGGATTTTTATTCGCCTTTTTTATAACTATCTAACCATGCAATT ATTAATTTTTATTGAACCTAAATTTCTAAATATGAGTTCTACAAATTCAACCGATAGATCCATTAGCTTTGAAGAAATGT TTGCGCATGAGTTGATAGTGAAGGGATTGGAAGATAATCCTGAAATGATAGCTCATTTTGAAATGTCTATCCATTTGCGT GCTATGATGATTTGTAAAAGAGCCGTTGGCGAAAAGCAACTGAATCGACTTTTAGAAACAATTTTGTTTATGCTTGATCA CAAAGACCAAATAAAAACATTATTTGCAAAAGTATTTCCGAATGTAAATTTTGAAAATGATATATTAGAGAAAACGAAAA AATCTTCACTTCCAAGTTTATTTCAAAAGGAACAATTTAAAAATTTTCAAATGGAGCACGTTTTACCAGAATTGATGAAA TCTAAAGAATTTCAAAAATATTTAAAAGAAACTGTTTTTTCGGTTTTTTTAGGAAGTGAAAAGTTCCAAGAAATTTTTCA GTCCGAAACATTTAAATATTATTTGGGAAAAACTGTGAATTTGCCTGATTTGAATGATGAGCATGCAATTAATGAATTTT TACAAACTCAAACTCAAGCTATTGATTCAGCATTAGCAAGCCCTGATTGTCAAACACTTTTAATCCAAGCATTTTTGAAG GAAACCGCTACTTTAAAAGAATATTTAGAAACATTTATTTTGCAACAAATCAAAAATATTAAATATTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GAGTTAATCAAACGAGACATACTTGAATCAGCTATAGAGTAAAAGTTAGTTGAGTAAGAGGAAGGATAATTTTTGTAATA ATTAACATTCAGGATAACAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGTTTAAAAGCAATTTTTTTTGATTAGAATGAAATTTGAATGCCTTAACAAGTATTTAAATTGATTGTTAGATGAAAAT TTTCCAATTTTTAGTCCTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 742; Mature: 742
Protein sequence:
>742_residues MLGLSFIFSKTESAYLEGCKELEWKVVRYEELIKQQIEILGKLLLKTDGLIEYVVKHISNENVKNTLFPIIQHLFSQTFS QETSRFNEIYLDQKRQSYKKIISLLRKALDYFEKNRHELIARNVLTLGYKFYSQIRFNNCGTEIFNNLMEFGKKATLEQP NIFTIVPNDSRYKLIFGLEIIRQRMLELEKNSVLTATSFGRYQGQYQSSGKLFYGLFDPHIQGNFVSLKRKICVYQPANK FCVKNLMMPSPTIETGGPVSINSEMRAFLTLCREKQKTILYINCQDKCPSVGLIAGDDSYRCQAIETLAEEFANTLFLIT LTHDHPFYEQIGHQIDTLNSQLVKKAIFDQIFNPNFRQFENYILPTEEIKKWMVITFDVIHAKKFSNCDHFSDAQERDFF IEECHLALIQNEEMLRLGYSIYHDTEHFKKELLRQIFIEDKQKSGNSVPEKMVLIKEGQKYRFNLKHWCLILTDQIHDIL FNKQKVLSPKEKRIFIRLFYNYLTMQLLIFIEPKFLNMSSTNSTDRSISFEEMFAHELIVKGLEDNPEMIAHFEMSIHLR AMMICKRAVGEKQLNRLLETILFMLDHKDQIKTLFAKVFPNVNFENDILEKTKKSSLPSLFQKEQFKNFQMEHVLPELMK SKEFQKYLKETVFSVFLGSEKFQEIFQSETFKYYLGKTVNLPDLNDEHAINEFLQTQTQAIDSALASPDCQTLLIQAFLK ETATLKEYLETFILQQIKNIKY
Sequences:
>Translated_742_residues MLGLSFIFSKTESAYLEGCKELEWKVVRYEELIKQQIEILGKLLLKTDGLIEYVVKHISNENVKNTLFPIIQHLFSQTFS QETSRFNEIYLDQKRQSYKKIISLLRKALDYFEKNRHELIARNVLTLGYKFYSQIRFNNCGTEIFNNLMEFGKKATLEQP NIFTIVPNDSRYKLIFGLEIIRQRMLELEKNSVLTATSFGRYQGQYQSSGKLFYGLFDPHIQGNFVSLKRKICVYQPANK FCVKNLMMPSPTIETGGPVSINSEMRAFLTLCREKQKTILYINCQDKCPSVGLIAGDDSYRCQAIETLAEEFANTLFLIT LTHDHPFYEQIGHQIDTLNSQLVKKAIFDQIFNPNFRQFENYILPTEEIKKWMVITFDVIHAKKFSNCDHFSDAQERDFF IEECHLALIQNEEMLRLGYSIYHDTEHFKKELLRQIFIEDKQKSGNSVPEKMVLIKEGQKYRFNLKHWCLILTDQIHDIL FNKQKVLSPKEKRIFIRLFYNYLTMQLLIFIEPKFLNMSSTNSTDRSISFEEMFAHELIVKGLEDNPEMIAHFEMSIHLR AMMICKRAVGEKQLNRLLETILFMLDHKDQIKTLFAKVFPNVNFENDILEKTKKSSLPSLFQKEQFKNFQMEHVLPELMK SKEFQKYLKETVFSVFLGSEKFQEIFQSETFKYYLGKTVNLPDLNDEHAINEFLQTQTQAIDSALASPDCQTLLIQAFLK ETATLKEYLETFILQQIKNIKY >Mature_742_residues MLGLSFIFSKTESAYLEGCKELEWKVVRYEELIKQQIEILGKLLLKTDGLIEYVVKHISNENVKNTLFPIIQHLFSQTFS QETSRFNEIYLDQKRQSYKKIISLLRKALDYFEKNRHELIARNVLTLGYKFYSQIRFNNCGTEIFNNLMEFGKKATLEQP NIFTIVPNDSRYKLIFGLEIIRQRMLELEKNSVLTATSFGRYQGQYQSSGKLFYGLFDPHIQGNFVSLKRKICVYQPANK FCVKNLMMPSPTIETGGPVSINSEMRAFLTLCREKQKTILYINCQDKCPSVGLIAGDDSYRCQAIETLAEEFANTLFLIT LTHDHPFYEQIGHQIDTLNSQLVKKAIFDQIFNPNFRQFENYILPTEEIKKWMVITFDVIHAKKFSNCDHFSDAQERDFF IEECHLALIQNEEMLRLGYSIYHDTEHFKKELLRQIFIEDKQKSGNSVPEKMVLIKEGQKYRFNLKHWCLILTDQIHDIL FNKQKVLSPKEKRIFIRLFYNYLTMQLLIFIEPKFLNMSSTNSTDRSISFEEMFAHELIVKGLEDNPEMIAHFEMSIHLR AMMICKRAVGEKQLNRLLETILFMLDHKDQIKTLFAKVFPNVNFENDILEKTKKSSLPSLFQKEQFKNFQMEHVLPELMK SKEFQKYLKETVFSVFLGSEKFQEIFQSETFKYYLGKTVNLPDLNDEHAINEFLQTQTQAIDSALASPDCQTLLIQAFLK ETATLKEYLETFILQQIKNIKY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 87341; Mature: 87341
Theoretical pI: Translated: 7.72; Mature: 7.72
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.8 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.8 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLGLSFIFSKTESAYLEGCKELEWKVVRYEELIKQQIEILGKLLLKTDGLIEYVVKHISN CCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC ENVKNTLFPIIQHLFSQTFSQETSRFNEIYLDQKRQSYKKIISLLRKALDYFEKNRHELI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ARNVLTLGYKFYSQIRFNNCGTEIFNNLMEFGKKATLEQPNIFTIVPNDSRYKLIFGLEI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECHHH IRQRMLELEKNSVLTATSFGRYQGQYQSSGKLFYGLFDPHIQGNFVSLKRKICVYQPANK HHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHEEEECCCHH FCVKNLMMPSPTIETGGPVSINSEMRAFLTLCREKQKTILYINCQDKCPSVGLIAGDDSY HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCH RCQAIETLAEEFANTLFLITLTHDHPFYEQIGHQIDTLNSQLVKKAIFDQIFNPNFRQFE HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH NYILPTEEIKKWMVITFDVIHAKKFSNCDHFSDAQERDFFIEECHLALIQNEEMLRLGYS HCCCCHHHHHHHHEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH IYHDTEHFKKELLRQIFIEDKQKSGNSVPEKMVLIKEGQKYRFNLKHWCLILTDQIHDIL HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCEEECHHHEEEEHHHHHHHHH FNKQKVLSPKEKRIFIRLFYNYLTMQLLIFIEPKFLNMSSTNSTDRSISFEEMFAHELIV HCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KGLEDNPEMIAHFEMSIHLRAMMICKRAVGEKQLNRLLETILFMLDHKDQIKTLFAKVFP HCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC NVNFENDILEKTKKSSLPSLFQKEQFKNFQMEHVLPELMKSKEFQKYLKETVFSVFLGSE CCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH KFQEIFQSETFKYYLGKTVNLPDLNDEHAINEFLQTQTQAIDSALASPDCQTLLIQAFLK HHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH ETATLKEYLETFILQQIKNIKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLGLSFIFSKTESAYLEGCKELEWKVVRYEELIKQQIEILGKLLLKTDGLIEYVVKHISN CCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCC ENVKNTLFPIIQHLFSQTFSQETSRFNEIYLDQKRQSYKKIISLLRKALDYFEKNRHELI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ARNVLTLGYKFYSQIRFNNCGTEIFNNLMEFGKKATLEQPNIFTIVPNDSRYKLIFGLEI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECHHH IRQRMLELEKNSVLTATSFGRYQGQYQSSGKLFYGLFDPHIQGNFVSLKRKICVYQPANK HHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHEEEECCCHH FCVKNLMMPSPTIETGGPVSINSEMRAFLTLCREKQKTILYINCQDKCPSVGLIAGDDSY HHHHHCCCCCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEECCCCH RCQAIETLAEEFANTLFLITLTHDHPFYEQIGHQIDTLNSQLVKKAIFDQIFNPNFRQFE HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH NYILPTEEIKKWMVITFDVIHAKKFSNCDHFSDAQERDFFIEECHLALIQNEEMLRLGYS HCCCCHHHHHHHHEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH IYHDTEHFKKELLRQIFIEDKQKSGNSVPEKMVLIKEGQKYRFNLKHWCLILTDQIHDIL HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCEEECHHHEEEEHHHHHHHHH FNKQKVLSPKEKRIFIRLFYNYLTMQLLIFIEPKFLNMSSTNSTDRSISFEEMFAHELIV HCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KGLEDNPEMIAHFEMSIHLRAMMICKRAVGEKQLNRLLETILFMLDHKDQIKTLFAKVFP HCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC NVNFENDILEKTKKSSLPSLFQKEQFKNFQMEHVLPELMKSKEFQKYLKETVFSVFLGSE CCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH KFQEIFQSETFKYYLGKTVNLPDLNDEHAINEFLQTQTQAIDSALASPDCQTLLIQAFLK HHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH ETATLKEYLETFILQQIKNIKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA