| Definition | Yersinia pestis KIM 10 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004088 |
| Length | 4,600,755 |
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The map label for this gene is yapH [H]
Identifier: 22127272
GI number: 22127272
Start: 3747888
End: 3759020
Strand: Direct
Name: yapH [H]
Synonym: y3396
Alternate gene names: 22127272
Gene position: 3747888-3759020 (Clockwise)
Preceding gene: 22127271
Following gene: 22127277
Centisome position: 81.46
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Gene sequence:
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Product: autotransporter adhesin
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Protein sequence:
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Sequences:
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VTLSGNNSFSGAHQIGTDGELTVGQASNLGASSATVNLGTLTSHLILNGVSESIANVLSGVAGSTVDIIGGADTALTANN SGFLGQYALAGNSKLTVASTNNLGASSSVALAGAGDTLSLSGFNGTFGNSVTGSGVLQVTDDAEVTLTSSNGVGNTVKVD IADATLNLNDIALFDHVLTGNGTLNVAKNLATTAFDFGSTVGGAFSGIVNLTNTTFALSADNAAALARATLKLSDDSVTT VGTTDRILHGLDLNGGTLIFDGSPPQSQANGVVTVTDLALNSGTISITGAGNWENEHPVTPPNVSLLEQDRGDILLQLID ADNVTGNANDLELMINGTTISAGQGVQSTVQQGGYTVANATHNYGMTSNGGSGLYVNYTLSALELLADGANALLLATESG LTANRELNAELSGVGGLVVDAQNGALTLANGNNRYEGTTTVTAGELILGANGAFGQTSLLNIASGASANINGYRQTVGAV TNTGTVTLGNGGELTSTDTLINTGMINVTDGILNLENGGASSISGGLTGNGILNIKGGDFTISIDNNGLAGQTNISDGAS VTLGNGGTIIGTGNLGSSVIDVLGDLNLVADNSLANVISGDGTINTTATVTLSGNSSFSGAHQIGTNGELTVGQASNLGA SSATVNLGTLTSHLILNGVSESIANVLSGVAGSTVDIIGGADTALTANNSGFLGQYALAGNSKLTVASTNNLGASSSVAL AGTGDTLSLSGFNGTFGNSVTGSGVLQVTDDAEVTLTSSNGVSNAVTIDIADATLNLDDIALFNHALTGNGLLNVAKNDA STAFDFGATVGGAFTGTVNLNNSTFDLSGNNTTVLAQATLKLSSGNLTSVGNGVQNIGTLAMNGGTLLFDNIVDNAGIIT SDGTIAANSINTTGGGEVRVNLPSNLAPSLDGLSVMELDEGEIIVTLATGAATGTGHELTLTDENGDPISAVTYQGVHNA 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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cell outer membrane; Peripheral membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 autotransporter (TC 1.B.12) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788565, Length=474, Percent_Identity=29.3248945147679, Blast_Score=193, Evalue=2e-49,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005546 - InterPro: IPR013425 - InterPro: IPR006315 - InterPro: IPR012332 - InterPro: IPR011050 - InterPro: IPR004899 [H]
Pfam domain/function: PF03797 Autotransporter; PF03212 Pertactin [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 371162; Mature: 371162
Theoretical pI: Translated: 3.91; Mature: 3.91
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 0.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 0.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLRLYMNTIFKVIWNASLNVWVVVSELAKGRIKTKSSRNLISEGVLPKFEQSMVSKLFRK CEEEHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHCCCEECCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH NLLALSLGSIVFLSTGPVFAADITVSTQAELSAALSNGTYDKIILGADITLIGSLTVNMT CEEEEEECCEEEEECCCEEEEEEEEECHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEEEEEEEEEEEC SNQVVIDGQGKFGLTVNNTTNYGLVVSSGSGTLTLQNMSKIDSANYYSMVVLNGANTAVN CCEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEECCHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEE VIYNNIDFLGSSQLIYMGAYGAATNSIMTFGDILNDVVVNDRAQEIGEVNKLAFTGRFHV EEEECEEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCEEEEEEEEEE THTGSSVTSFVSTGGANNTSTMDFASGADVKIDRTGSTGDLTSTGVNAFAYTFADGASFE EECCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCEEE LIANQNVFSGTTTNRGLEIGSYNSIDGFGSGVKIVLQSRSDGSIISGNGIDNATTNAAGI EEECCCEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCCC NNNASGDANVIYNLGTGSILKATNTGILATKNANNASDIYIRSAGDITAATGISATHNGT CCCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCCEEEECCCCCCCEEEEEECCCEEEECCCCEECCCE GTVKIKNDGTITSTTAGIAISSASIKEISVDNTDGTITATAGTGVNVLASAILNLFGGTI 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HECCCCCCCHHHHHHEEEEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCCEEEECCCCCEEEEEEC SGGTLIFDGAVPQSQTSGVVTVTDLALNSGTVNITGSGSWDNTDPLATNVSILEQDRAGS CCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCC TLELINATNVTGDIDALDLLVNGTAITSGTQGVQSAIQQGGSTVANAIHNYGLASSNSNG EEEEEEECCCCCCCCEEEEEEECEEEECCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC DSGLYVNYTLSALELLADGADALLLATESGLTANRVLNAELFGVGGLVVDAQNGALTLAN CCEEEEEEEHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECEEEEECCCCEEEEEC GSNRYEGTTTVTAGELILGANGAFGQTSLLDIASGASANINGYSQTVGAVTNVGTVTLGS CCCCCCCEEEEEECEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECC GGVLTSGLLTNGGILDLTGGALNLTAGGASTVAGGLTGAGTLNINGGNLSVSAANSGLSG CCCEECCEECCCCEEEECCCEEEEECCCCHHHCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCC QTHIADVASVTLTDTGTLGTSAVEVLGTLNLNGANAAMTNVLSGDGTINTNAAVTLSGNN CEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHEEECCCCEECCCEEEEECCCC SFSGAHQIGTDGELTVGQASNLGASSATVNLGTLTSHLILNGVSESIANVLSGVAGSTVD CCCCCEECCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE IIGGADTALTANNSGFLGQYALAGNSKLTVASTNNLGASSSVALAGAGDTLSLSGFNGTF 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CCCCEEEEECCCCEECCEEEEEECEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHCCE TNTGTVTLGNGGELTSTDTLINTGMINVTDGILNLENGGASSISGGLTGNGILNIKGGDF ECCCEEEECCCCCCCCCCEEEECCEEEEECCEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCEE TISIDNNGLAGQTNISDGASVTLGNGGTIIGTGNLGSSVIDVLGDLNLVADNSLANVISG EEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCCHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHCCC DGTINTTATVTLSGNSSFSGAHQIGTNGELTVGQASNLGASSATVNLGTLTSHLILNGVS CCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHH ESIANVLSGVAGSTVDIIGGADTALTANNSGFLGQYALAGNSKLTVASTNNLGASSSVAL HHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCEEE AGTGDTLSLSGFNGTFGNSVTGSGVLQVTDDAEVTLTSSNGVSNAVTIDIADATLNLDDI EECCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEEEEECCEECCCCE ALFNHALTGNGLLNVAKNDASTAFDFGATVGGAFTGTVNLNNSTFDLSGNNTTVLAQATL EEEEEEECCCCEEEEECCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEEECCCEEEECCCCEEEEEEEEE KLSSGNLTSVGNGVQNIGTLAMNGGTLLFDNIVDNAGIITSDGTIAANSINTTGGGEVRV EECCCCCCCCCCCHHHCEEEEECCCEEEEECCCCCCCEEECCCEEEECCCCCCCCCEEEE NLPSNLAPSLDGLSVMELDEGEIIVTLATGAATGTGHELTLTDENGDPISAVTYQGVHNA 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