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The map label for this gene is secA

Identifier: 21672481

GI number: 21672481

Start: 219583

End: 222207

Strand: Direct

Name: secA

Synonym: BUsg195

Alternate gene names: 21672481

Gene position: 219583-222207 (Clockwise)

Preceding gene: 21672480

Following gene: 21672482

Centisome position: 34.23

GC content: 26.78

Gene sequence:

>2625_bases
ATGTTTATTAAATTTTTACATAAAATATTTAGTAATCGTAATGATCGTATTTTAAAAAAGTTCAAAAAGATAGTATCTTC
AATTAATCAATTAGAAGAAAAATTTAAAAAATTATCAGATAAAAAGTTACAAGAAAATACAGGAATATTTCGTTTAAGAT
TAAAAAAAGGTGAATGTTTAGACGATTTATTACCAGAATCTTTTGCAACAGTTAGAGAAGCAAGTCGTCGTGTTTTCAAT
ATGCGTCATTTTGATGTTCAAATTCTTGGTGGAATAGTTTTAAATAAACAATGTATTGCAGAAATGCGTACAGGAGAGGG
AAAAACATTAACCTCTACCTTACCTGCTTATTTAAATGCATTAACAGGTCGAGGCGTTCATATAGTTACTATGAATGATT
ATTTAGCAGAGAGAGATGCTAAAAATAATACTCCTCTATTTGAATTTCTTGGTTTAACAGTTGGTTTAAATTTACCTGAA
ATGTCTTTTATTGATAAAAAAAAGGCTTATTTATGTGATATTACCTATGGTACTAATAATGAATACGGATTTGATTATCT
TCGAGATAATATGATTTTTTCTGCTGAAGAAAGAGTTCAACGTGAACTAAATTATGCTTTAATAGATGAAGTAGATTCGA
TCTTAATAGATGAAGCCAGAACACCTTTAATTATTTCTGGACCTTCAGAAGATAGCTCTTTTTTATATAAAGAAATTAAT
AAATTGGTACCATCTTTAATTTGTCAAAAAAAAGAAGATTCAGATAAATTTCATGGTAACGGTCACTTTTCTATCGATGA
AAAGTCAAAACAAATATATTTAACCGAAAGAGGTTTAGTTGAAGTTGAAAAAATATTACTTGATCGAAAATTAATGAAAA
AAGAAGAATCTTTATATTCTTCAAATAATATTATATTAATGCATCATGTTATATCTGCCTTACGTGCTCATAATTTATTT
ACACGAAACATAGATTATCTTGTAAAAGATAACAATATTATTATTGTTGACGAACATACAGGTCGAACTATGCCTGGTAG
AAGATGGTCTGATGGATTGCATCAAGCAATAGAAGCAAAAGAAAATGTTACTGTAAGAAATGAAAATCAAACTTTAGCGT
CAATTACATTTCAAAATTATTTTCGTTTATATAAAAAAATAGCAGGTATGACGGGTACTGCTGCAACTGAATCTTTTGAA
TTTAGTTCAATTTATAATCTTGATACTGTGATAATCCCCCCTAATAAACCAATGATAAGAAAAGATCTCTCTGATTTAGT
TTACATGACGGAAGAAGAAAAAATCAATGCTATCTTAAAAGATATTAAAAATTGTATAAAAAAAAATCAACCTGTACTAG
TTGGTACTATTTCAATTGAGAAATCAGAAATGATTTCAAAAAAATTGAAAATTTTAAATATTAAACATAATGTTTTAAAT
GCTAAATTTCATGCAAGGGAAGCTGAAATTATAGCTCAAGCAGGAAAACCAAAATCAGTGACAATTGCTACTAATATGGC
TGGTCGGGGTACAGATATTGTACTAGGAGGTAGTTTAGAATCACAATTAGAAAAAAATATGTATTTAGATAAAATTGAAA
CAATTAAAAGAAATTGGAAAAAACAACATGATTTAGTTGTTTTATCTGGAGGATTACATATTATTGGCACTGAACGTCAC
GAATCACGTCGTATTGATAATCAATTGAGAGGTCGATCTGGTCGACAAGGAGACAGTGGTTCTTCACGTTTTTATCTTTC
TATGGAAGATTCTCTGATGAGGATTTTTGCATCTGATAAAATTATTAGTATGATGCGAAAGTTAGGACTTTCTTTAAACG
AAGCAATCGAGCATCCTTGGGTGACGAAAGCTATAGAAAATGCTCAAAAAAAAGTAGAAAATCGTAATTTTGATATTAGA
AAACAATTATTAGAATATGATGATGTATGTAATGAACAACGTCGTGTAATTTACGCACAGCGTAATAAATTAATTGATTC
AGAAAACATTCAACAAAATATTTATGATATTTTAAAAGATGTATTACATAGTATAATCAAAACACACTTAAATTTCGATT
TTCCAAAAAATACACGAAATATTCTAGATTTAGAAAATAAATTAAGCATTGAATTTAATTTAAATATTTCAATTAAAGAT
TGGTTGAAAAAAGATCATGATATAAAAAAAGAAAACATTATAAAAAAAATTATTGATATTGCAAAAAAAAATTATCTGAA
TAAAGAAATTCAAATAGGTTTTCATAACATTAGAATGATAGAAAAGTCTATTATGCTAAAAACATTAGATTCTCTTTGGA
AAGAGCATTTATCCGCAATGGATTATTTAAGACAAGGTATTCATTTACGTGGTTATGCTCAAAAAGACCCTAAACAAGAA
TATAAACGTGAATCTTTTAACATGTTTTCTAACATGTTAGAATTATTAAAATATGAAGTTATATCTTTTCTTAGTAAATT
AGATATATCTTATATAAAAAGCAATTTGCATTTAAACATGAATAATAATTCTTCTATTGTAAATAATGATATTAAAATGG
GAAGAAATACGCCCTGTTTTTGCAAATCTGGAAAAAAATATAAGTATTGTCATGGAAGTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAACTTTTTTTATATTCAATTAATAAAAATAGTATTTTTATTGAATAAATTTTTATTTTTTTGACTAGTAAAATAAG
TATAACCTGAGAATTATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTTTTTAAAAATTTGGATTCTATTTAATGAAGTATACAAATATAGTAATTGGAATAATTATAAAAAAAAATAAAATT
TATATTACTAAAGCAAGAAA

Product: preprotein translocase subunit SecA

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 874; Mature: 874

Protein sequence:

>874_residues
MFIKFLHKIFSNRNDRILKKFKKIVSSINQLEEKFKKLSDKKLQENTGIFRLRLKKGECLDDLLPESFATVREASRRVFN
MRHFDVQILGGIVLNKQCIAEMRTGEGKTLTSTLPAYLNALTGRGVHIVTMNDYLAERDAKNNTPLFEFLGLTVGLNLPE
MSFIDKKKAYLCDITYGTNNEYGFDYLRDNMIFSAEERVQRELNYALIDEVDSILIDEARTPLIISGPSEDSSFLYKEIN
KLVPSLICQKKEDSDKFHGNGHFSIDEKSKQIYLTERGLVEVEKILLDRKLMKKEESLYSSNNIILMHHVISALRAHNLF
TRNIDYLVKDNNIIIVDEHTGRTMPGRRWSDGLHQAIEAKENVTVRNENQTLASITFQNYFRLYKKIAGMTGTAATESFE
FSSIYNLDTVIIPPNKPMIRKDLSDLVYMTEEEKINAILKDIKNCIKKNQPVLVGTISIEKSEMISKKLKILNIKHNVLN
AKFHAREAEIIAQAGKPKSVTIATNMAGRGTDIVLGGSLESQLEKNMYLDKIETIKRNWKKQHDLVVLSGGLHIIGTERH
ESRRIDNQLRGRSGRQGDSGSSRFYLSMEDSLMRIFASDKIISMMRKLGLSLNEAIEHPWVTKAIENAQKKVENRNFDIR
KQLLEYDDVCNEQRRVIYAQRNKLIDSENIQQNIYDILKDVLHSIIKTHLNFDFPKNTRNILDLENKLSIEFNLNISIKD
WLKKDHDIKKENIIKKIIDIAKKNYLNKEIQIGFHNIRMIEKSIMLKTLDSLWKEHLSAMDYLRQGIHLRGYAQKDPKQE
YKRESFNMFSNMLELLKYEVISFLSKLDISYIKSNLHLNMNNNSSIVNNDIKMGRNTPCFCKSGKKYKYCHGSL

Sequences:

>Translated_874_residues
MFIKFLHKIFSNRNDRILKKFKKIVSSINQLEEKFKKLSDKKLQENTGIFRLRLKKGECLDDLLPESFATVREASRRVFN
MRHFDVQILGGIVLNKQCIAEMRTGEGKTLTSTLPAYLNALTGRGVHIVTMNDYLAERDAKNNTPLFEFLGLTVGLNLPE
MSFIDKKKAYLCDITYGTNNEYGFDYLRDNMIFSAEERVQRELNYALIDEVDSILIDEARTPLIISGPSEDSSFLYKEIN
KLVPSLICQKKEDSDKFHGNGHFSIDEKSKQIYLTERGLVEVEKILLDRKLMKKEESLYSSNNIILMHHVISALRAHNLF
TRNIDYLVKDNNIIIVDEHTGRTMPGRRWSDGLHQAIEAKENVTVRNENQTLASITFQNYFRLYKKIAGMTGTAATESFE
FSSIYNLDTVIIPPNKPMIRKDLSDLVYMTEEEKINAILKDIKNCIKKNQPVLVGTISIEKSEMISKKLKILNIKHNVLN
AKFHAREAEIIAQAGKPKSVTIATNMAGRGTDIVLGGSLESQLEKNMYLDKIETIKRNWKKQHDLVVLSGGLHIIGTERH
ESRRIDNQLRGRSGRQGDSGSSRFYLSMEDSLMRIFASDKIISMMRKLGLSLNEAIEHPWVTKAIENAQKKVENRNFDIR
KQLLEYDDVCNEQRRVIYAQRNKLIDSENIQQNIYDILKDVLHSIIKTHLNFDFPKNTRNILDLENKLSIEFNLNISIKD
WLKKDHDIKKENIIKKIIDIAKKNYLNKEIQIGFHNIRMIEKSIMLKTLDSLWKEHLSAMDYLRQGIHLRGYAQKDPKQE
YKRESFNMFSNMLELLKYEVISFLSKLDISYIKSNLHLNMNNNSSIVNNDIKMGRNTPCFCKSGKKYKYCHGSL
>Mature_874_residues
MFIKFLHKIFSNRNDRILKKFKKIVSSINQLEEKFKKLSDKKLQENTGIFRLRLKKGECLDDLLPESFATVREASRRVFN
MRHFDVQILGGIVLNKQCIAEMRTGEGKTLTSTLPAYLNALTGRGVHIVTMNDYLAERDAKNNTPLFEFLGLTVGLNLPE
MSFIDKKKAYLCDITYGTNNEYGFDYLRDNMIFSAEERVQRELNYALIDEVDSILIDEARTPLIISGPSEDSSFLYKEIN
KLVPSLICQKKEDSDKFHGNGHFSIDEKSKQIYLTERGLVEVEKILLDRKLMKKEESLYSSNNIILMHHVISALRAHNLF
TRNIDYLVKDNNIIIVDEHTGRTMPGRRWSDGLHQAIEAKENVTVRNENQTLASITFQNYFRLYKKIAGMTGTAATESFE
FSSIYNLDTVIIPPNKPMIRKDLSDLVYMTEEEKINAILKDIKNCIKKNQPVLVGTISIEKSEMISKKLKILNIKHNVLN
AKFHAREAEIIAQAGKPKSVTIATNMAGRGTDIVLGGSLESQLEKNMYLDKIETIKRNWKKQHDLVVLSGGLHIIGTERH
ESRRIDNQLRGRSGRQGDSGSSRFYLSMEDSLMRIFASDKIISMMRKLGLSLNEAIEHPWVTKAIENAQKKVENRNFDIR
KQLLEYDDVCNEQRRVIYAQRNKLIDSENIQQNIYDILKDVLHSIIKTHLNFDFPKNTRNILDLENKLSIEFNLNISIKD
WLKKDHDIKKENIIKKIIDIAKKNYLNKEIQIGFHNIRMIEKSIMLKTLDSLWKEHLSAMDYLRQGIHLRGYAQKDPKQE
YKRESFNMFSNMLELLKYEVISFLSKLDISYIKSNLHLNMNNNSSIVNNDIKMGRNTPCFCKSGKKYKYCHGSL

Specific function: Part of the Sec protein translocase complex. Interacts with the secYEG preprotein conducting channel. Has a central role in coupling the hydrolysis of ATP to the transfer of proteins into and across the cell membrane, serving both as a receptor for the pr

COG id: COG0653

COG function: function code U; Preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side. Cytoplasm (By similarity). Note=Distribution is 50-50 (By similarity)

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the secA family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786287, Length=900, Percent_Identity=64.2222222222222, Blast_Score=1217, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): SECA_BUCAP (Q8K9U3)

Other databases:

- EMBL:   AE013218
- RefSeq:   NP_660548.1
- ProteinModelPortal:   Q8K9U3
- SMR:   Q8K9U3
- EnsemblBacteria:   EBBUCT00000000368
- GeneID:   1005392
- GenomeReviews:   AE013218_GR
- KEGG:   bas:BUsg195
- GeneTree:   EBGT00050000007857
- HOGENOM:   HBG284200
- OMA:   GGMVLHD
- ProtClustDB:   PRK12904
- BioCyc:   BAPH198804:BUSG195-MONOMER
- GO:   GO:0005737
- HAMAP:   MF_01382
- InterPro:   IPR004027
- InterPro:   IPR000185
- InterPro:   IPR020937
- InterPro:   IPR011115
- InterPro:   IPR014018
- InterPro:   IPR011130
- InterPro:   IPR011116
- Gene3D:   G3DSA:1.10.3060.10
- PRINTS:   PR00906
- SMART:   SM00957
- SMART:   SM00958
- TIGRFAMs:   TIGR00963

Pfam domain/function: PF02810 SEC-C; PF07517 SecA_DEAD; PF01043 SecA_PP_bind; PF07516 SecA_SW; SSF81767 SecA_PP_bd; SSF81886 SecA_SW

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101165; Mature: 101165

Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70

Prosite motif: PS01312 SECA; PS51196 SECA_MOTOR_DEAD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFIKFLHKIFSNRNDRILKKFKKIVSSINQLEEKFKKLSDKKLQENTGIFRLRLKKGECL
CHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCH
DDLLPESFATVREASRRVFNMRHFDVQILGGIVLNKQCIAEMRTGEGKTLTSTLPAYLNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LTGRGVHIVTMNDYLAERDAKNNTPLFEFLGLTVGLNLPEMSFIDKKKAYLCDITYGTNN
HCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEEECCCC
EYGFDYLRDNMIFSAEERVQRELNYALIDEVDSILIDEARTPLIISGPSEDSSFLYKEIN
CCCHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHH
KLVPSLICQKKEDSDKFHGNGHFSIDEKSKQIYLTERGLVEVEKILLDRKLMKKEESLYS
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SNNIILMHHVISALRAHNLFTRNIDYLVKDNNIIIVDEHTGRTMPGRRWSDGLHQAIEAK
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
ENVTVRNENQTLASITFQNYFRLYKKIAGMTGTAATESFEFSSIYNLDTVIIPPNKPMIR
CCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCCHHH
KDLSDLVYMTEEEKINAILKDIKNCIKKNQPVLVGTISIEKSEMISKKLKILNIKHNVLN
HHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHEEEHHHHHC
AKFHAREAEIIAQAGKPKSVTIATNMAGRGTDIVLGGSLESQLEKNMYLDKIETIKRNWK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQHDLVVLSGGLHIIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDSGSSRFYLSMEDSLMRIFASDK
HHCCEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
IISMMRKLGLSLNEAIEHPWVTKAIENAQKKVENRNFDIRKQLLEYDDVCNEQRRVIYAQ
HHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEHHH
RNKLIDSENIQQNIYDILKDVLHSIIKTHLNFDFPKNTRNILDLENKLSIEFNLNISIKD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEEEEEEHHH
WLKKDHDIKKENIIKKIIDIAKKNYLNKEIQIGFHNIRMIEKSIMLKTLDSLWKEHLSAM
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DYLRQGIHLRGYAQKDPKQEYKRESFNMFSNMLELLKYEVISFLSKLDISYIKSNLHLNM
HHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
NNNSSIVNNDIKMGRNTPCFCKSGKKYKYCHGSL
CCCCCEECCCHHCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFIKFLHKIFSNRNDRILKKFKKIVSSINQLEEKFKKLSDKKLQENTGIFRLRLKKGECL
CHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCH
DDLLPESFATVREASRRVFNMRHFDVQILGGIVLNKQCIAEMRTGEGKTLTSTLPAYLNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LTGRGVHIVTMNDYLAERDAKNNTPLFEFLGLTVGLNLPEMSFIDKKKAYLCDITYGTNN
HCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEEECCCC
EYGFDYLRDNMIFSAEERVQRELNYALIDEVDSILIDEARTPLIISGPSEDSSFLYKEIN
CCCHHHHHCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHH
KLVPSLICQKKEDSDKFHGNGHFSIDEKSKQIYLTERGLVEVEKILLDRKLMKKEESLYS
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SNNIILMHHVISALRAHNLFTRNIDYLVKDNNIIIVDEHTGRTMPGRRWSDGLHQAIEAK
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
ENVTVRNENQTLASITFQNYFRLYKKIAGMTGTAATESFEFSSIYNLDTVIIPPNKPMIR
CCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEECCCCCHHH
KDLSDLVYMTEEEKINAILKDIKNCIKKNQPVLVGTISIEKSEMISKKLKILNIKHNVLN
HHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHEEEHHHHHC
AKFHAREAEIIAQAGKPKSVTIATNMAGRGTDIVLGGSLESQLEKNMYLDKIETIKRNWK
CHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KQHDLVVLSGGLHIIGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDSGSSRFYLSMEDSLMRIFASDK
HHCCEEEEECCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHH
IISMMRKLGLSLNEAIEHPWVTKAIENAQKKVENRNFDIRKQLLEYDDVCNEQRRVIYAQ
HHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEHHH
RNKLIDSENIQQNIYDILKDVLHSIIKTHLNFDFPKNTRNILDLENKLSIEFNLNISIKD
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHCCCCEEEEEEEEEEEHHH
WLKKDHDIKKENIIKKIIDIAKKNYLNKEIQIGFHNIRMIEKSIMLKTLDSLWKEHLSAM
HHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DYLRQGIHLRGYAQKDPKQEYKRESFNMFSNMLELLKYEVISFLSKLDISYIKSNLHLNM
HHHHCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEE
NNNSSIVNNDIKMGRNTPCFCKSGKKYKYCHGSL
CCCCCEECCCHHCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12089438