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Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is pglB

Identifier: 57238007

GI number: 57238007

Start: 1183722

End: 1185863

Strand: Reverse

Name: pglB

Synonym: CJE1268

Alternate gene names: NA

Gene position: 1185863-1183722 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57238008

Following gene: 57238006

Centisome position: 66.7

GC content: 29.23

Gene sequence:

>2142_bases
ATGTTGAAAAAAGAGTATTTAAAAAACCCTTATTTAGTTTTGTTTGCGATGATTATATTAGCTTATGTTTTTAGTGTATT
GTGTAGATTTTACTGGATTTGGTGGGCAAGTGAGTTTAATGAGTATTTTTTCAATAATCAATTAATGATCATTTCAAACG
ATGGCTATGCCTTTGCTGAGGGCGCAAGAGATATGATAGCAGGTTTTCATCAGCCTAATGATTTGAGTTATTATGGATCT
TCTTTATCTACGCTTACTTATTGGCTTTATAAAATCACACCTTTTTCTTTTGAAAGTATCATTTTATATATGAGTACTTT
TTTATCTTCTTTGGTGGTGATTCCTATTATTTTACTAGCTAATGAATACAAACGTCCTTTAATGGGCTTTGTAGCTGCTC
TTTTAGCAAGTGTAGCAAACAGTTATTATAATCGCACTATGAGTGGGTATTATGATACGGATATGCTGGTAATTGTTTTA
CCTATGTTTATTTTATTTTTTATGGTAAGAATGATTTTAAAAAAAGACTTTTTTTCATTGATTGCCTTGCCATTATTTAT
AGGGATTTATCTTTGGTGGTATCCTTCAAGTTATACTTTAAATGTAGCTTTAATTGGACTTTTTTTAATTTATACACTTA
TTTTTCATAGAAAAGAAAAGATTTTTTATATAGCTGTGATTTTGTCTTCTCTTACTCTTTCAAATATAGCATGGTTTTAT
CAAAGTGCCATTATAGTAATACTTTTTGCTTTATTTGCTTTAGAGCAAAAACGCTTAAATTTTATGATTATAGGAATTTT
AGGTAGTGCAACTTTGATATTTTTGATTTTAAGCGGTGGGGTTGATCCCATACTTTATCAGCTTAAATTTTATATTTTTA
GAAATGATGAAAGTGCGAATTTAACACAGGGCTTTATGTATTTTAATGTTAATCAAACCATACAAGAAGTTGAAAATGTA
GATTTTAGCGAATTTATGCGAAGAATTAGTGGTAGTGAAATTGTTTTCTTGTTTTCTTTGTTTGGTTTTGTATGGCTTTT
GAGAAAACATAAAAGTATGATTATGGCTTTACCTATATTGGTGCTTGGGTTTTTAGCCTTAAAAGGGGGGCTTAGATTTA
CCATTTATTCTGTACCTGTAATGGCTTTAGGATTTGGTTTTTTATTGAGCGAGTTTAAGGCTATATTGGTTAAAAAATAT
AGCCAATTAACTTCAAATGTTTGTATTGTTTTTGCAACTATTTTGACTTTAGCTCCAGTATTTATCCATATTTACAACTA
TAAAGCGCCAACAGTTTTTTCTCAAAATGAAGCATCATTATTAAATCAATTAAAAAATATAGCCAATAGAGAAGATTATG
TGGTAACTTGGTGGGATTATGGTTATCCTGTGCGTTATTATAGCGATGTGAAAACTTTAGTAGATGGTGGAAAGCATTTA
GGTAAGGATAATTTTTTCCCTTCTTTTGCTTTAAGCAAAGATGAACAAGCTGCGGCTAATATGGCAAGACTTAGTGTAGA
ATATACAGAAAAAAGCTTTTATGCTCCGCAAAATGATATTTTAAAATCAGACATTTTACAAGCCATGATGAAAGATTATA
ATCAAAGCAATGTGGATTTATTTCTAGCTTCATTATCAAAACCTGATTTTAAAATCGATACACCAAAAACTCGTGATATT
TATCTTTATATGCCCGCTAGAATGTCTTTGATTTTTTCTACGGTGGCTAGTTTTTCTTTTATTAATTTAGATACAGGAGT
TTTGGATAAACCTTTTACCTTTAGCACAGCTTATCCACTTGATGTTAAAAATGGAGAAATTTATCTTAGCAACGGAGTGG
TTTTAAGCGATGATTTTAGAAGTTTTAAAATAGGTGATAATGTGGTTTCTGTAAATAGTATCGTAGAGATTAATTCTATT
AAACAAGGTGAATACAAAATCACTCCAATTGACGATAAGGCTCAGTTTTATATTTTTTATTTAAAGGATAGTGCTATTCC
TTACGCACAATTTATTTTAATGGATAAAACCATGTTTAATAGTGCTTATGTGCAAATGTTTTTTTTAGGAAATTATGATA
AGAATTTATTTGACTTGGTGATTAATTCTAGAGATGCTAAGGTTTTTAAACTTAAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAAGAAAAGCGTATAAAAACAAAGCTAAAACTAGGGCTAAAGCCTTTGATAAAGTAAAAATTGCACGCGATGCTTTGA
AATATTTATTAGGATAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGTTGAAAATGAGAATAGGATTTTTATCACATGCAGGAGCAAGTATTTATCATTTTAGAATGCCTATTATAAAAGCATT
AAAAGATAGAAAAGATGAAG

Product: general glycosylation pathway protein

Products: NA

Alternate protein names: General Glycosylation Pathway Protein; Oligosaccharide Transferase; Oligosaccharyl Transferase Stt3 Subunit; Oligosaccharyl Transferase PglB; Acetyltransferase; Oligosaccharide Transferase N-Glycosylate Proteins; Iron Chelatin ABC Transporter Permease Protein; Oligosaccharyltransferase; Hydroxylamine Reductase (Hybrid-Cluster Protein

Number of amino acids: Translated: 713; Mature: 713

Protein sequence:

>713_residues
MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGARDMIAGFHQPNDLSYYGS
SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLANEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL
PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY
QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV
DFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKY
SQLTSNVCIVFATILTLAPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL
GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDLFLASLSKPDFKIDTPKTRDI
YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI
KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI

Sequences:

>Translated_713_residues
MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGARDMIAGFHQPNDLSYYGS
SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLANEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL
PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY
QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV
DFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKY
SQLTSNVCIVFATILTLAPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL
GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDLFLASLSKPDFKIDTPKTRDI
YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI
KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI
>Mature_713_residues
MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGARDMIAGFHQPNDLSYYGS
SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLANEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL
PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY
QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV
DFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKY
SQLTSNVCIVFATILTLAPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL
GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDLFLASLSKPDFKIDTPKTRDI
YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI
KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI

Specific function: Unknown

COG id: COG1287

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 82207; Mature: 82207

Theoretical pI: Translated: 8.55; Mature: 8.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.5 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
3.5 %Met     (Mature Protein)
3.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAE
CCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCEECC
GARDMIAGFHQPNDLSYYGSSLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLA
CCHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVLPMFILFFMVRMILKKDFFSL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESAN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEEEECCCCCC
LTQGFMYFNVNQTIQEVENVDFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPIL
CEECEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKYSQLTSNVCIVFATILTLAPV
HHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL
HHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHC
GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
FLASLSKPDFKIDTPKTRDIYLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPL
EEEECCCCCEEECCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEECCCCCE
DVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSIKQGEYKITPIDDKAQFYIFY
EECCCEEEEECCEEEECCCCCEECCCCEEEECCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEE
LKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI
EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHHHEECCCCCEEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAE
CCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCEECC
GARDMIAGFHQPNDLSYYGSSLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLA
CCHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVLPMFILFFMVRMILKKDFFSL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESAN
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEEEECCCCCC
LTQGFMYFNVNQTIQEVENVDFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPIL
CEECEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKYSQLTSNVCIVFATILTLAPV
HHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL
HHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHC
GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDL
CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
FLASLSKPDFKIDTPKTRDIYLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPL
EEEECCCCCEEECCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEECCCCCE
DVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSIKQGEYKITPIDDKAQFYIFY
EECCCEEEEECCEEEECCCCCEECCCCEEEECCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEE
LKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI
EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHHHEECCCCCEEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA