| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is pglB
Identifier: 57238007
GI number: 57238007
Start: 1183722
End: 1185863
Strand: Reverse
Name: pglB
Synonym: CJE1268
Alternate gene names: NA
Gene position: 1185863-1183722 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57238008
Following gene: 57238006
Centisome position: 66.7
GC content: 29.23
Gene sequence:
>2142_bases ATGTTGAAAAAAGAGTATTTAAAAAACCCTTATTTAGTTTTGTTTGCGATGATTATATTAGCTTATGTTTTTAGTGTATT GTGTAGATTTTACTGGATTTGGTGGGCAAGTGAGTTTAATGAGTATTTTTTCAATAATCAATTAATGATCATTTCAAACG ATGGCTATGCCTTTGCTGAGGGCGCAAGAGATATGATAGCAGGTTTTCATCAGCCTAATGATTTGAGTTATTATGGATCT TCTTTATCTACGCTTACTTATTGGCTTTATAAAATCACACCTTTTTCTTTTGAAAGTATCATTTTATATATGAGTACTTT TTTATCTTCTTTGGTGGTGATTCCTATTATTTTACTAGCTAATGAATACAAACGTCCTTTAATGGGCTTTGTAGCTGCTC TTTTAGCAAGTGTAGCAAACAGTTATTATAATCGCACTATGAGTGGGTATTATGATACGGATATGCTGGTAATTGTTTTA CCTATGTTTATTTTATTTTTTATGGTAAGAATGATTTTAAAAAAAGACTTTTTTTCATTGATTGCCTTGCCATTATTTAT AGGGATTTATCTTTGGTGGTATCCTTCAAGTTATACTTTAAATGTAGCTTTAATTGGACTTTTTTTAATTTATACACTTA TTTTTCATAGAAAAGAAAAGATTTTTTATATAGCTGTGATTTTGTCTTCTCTTACTCTTTCAAATATAGCATGGTTTTAT CAAAGTGCCATTATAGTAATACTTTTTGCTTTATTTGCTTTAGAGCAAAAACGCTTAAATTTTATGATTATAGGAATTTT AGGTAGTGCAACTTTGATATTTTTGATTTTAAGCGGTGGGGTTGATCCCATACTTTATCAGCTTAAATTTTATATTTTTA GAAATGATGAAAGTGCGAATTTAACACAGGGCTTTATGTATTTTAATGTTAATCAAACCATACAAGAAGTTGAAAATGTA GATTTTAGCGAATTTATGCGAAGAATTAGTGGTAGTGAAATTGTTTTCTTGTTTTCTTTGTTTGGTTTTGTATGGCTTTT GAGAAAACATAAAAGTATGATTATGGCTTTACCTATATTGGTGCTTGGGTTTTTAGCCTTAAAAGGGGGGCTTAGATTTA CCATTTATTCTGTACCTGTAATGGCTTTAGGATTTGGTTTTTTATTGAGCGAGTTTAAGGCTATATTGGTTAAAAAATAT AGCCAATTAACTTCAAATGTTTGTATTGTTTTTGCAACTATTTTGACTTTAGCTCCAGTATTTATCCATATTTACAACTA TAAAGCGCCAACAGTTTTTTCTCAAAATGAAGCATCATTATTAAATCAATTAAAAAATATAGCCAATAGAGAAGATTATG TGGTAACTTGGTGGGATTATGGTTATCCTGTGCGTTATTATAGCGATGTGAAAACTTTAGTAGATGGTGGAAAGCATTTA GGTAAGGATAATTTTTTCCCTTCTTTTGCTTTAAGCAAAGATGAACAAGCTGCGGCTAATATGGCAAGACTTAGTGTAGA ATATACAGAAAAAAGCTTTTATGCTCCGCAAAATGATATTTTAAAATCAGACATTTTACAAGCCATGATGAAAGATTATA ATCAAAGCAATGTGGATTTATTTCTAGCTTCATTATCAAAACCTGATTTTAAAATCGATACACCAAAAACTCGTGATATT TATCTTTATATGCCCGCTAGAATGTCTTTGATTTTTTCTACGGTGGCTAGTTTTTCTTTTATTAATTTAGATACAGGAGT TTTGGATAAACCTTTTACCTTTAGCACAGCTTATCCACTTGATGTTAAAAATGGAGAAATTTATCTTAGCAACGGAGTGG TTTTAAGCGATGATTTTAGAAGTTTTAAAATAGGTGATAATGTGGTTTCTGTAAATAGTATCGTAGAGATTAATTCTATT AAACAAGGTGAATACAAAATCACTCCAATTGACGATAAGGCTCAGTTTTATATTTTTTATTTAAAGGATAGTGCTATTCC TTACGCACAATTTATTTTAATGGATAAAACCATGTTTAATAGTGCTTATGTGCAAATGTTTTTTTTAGGAAATTATGATA AGAATTTATTTGACTTGGTGATTAATTCTAGAGATGCTAAGGTTTTTAAACTTAAAATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTAAGAAAAGCGTATAAAAACAAAGCTAAAACTAGGGCTAAAGCCTTTGATAAAGTAAAAATTGCACGCGATGCTTTGA AATATTTATTAGGATAAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases GGGTTGAAAATGAGAATAGGATTTTTATCACATGCAGGAGCAAGTATTTATCATTTTAGAATGCCTATTATAAAAGCATT AAAAGATAGAAAAGATGAAG
Product: general glycosylation pathway protein
Products: NA
Alternate protein names: General Glycosylation Pathway Protein; Oligosaccharide Transferase; Oligosaccharyl Transferase Stt3 Subunit; Oligosaccharyl Transferase PglB; Acetyltransferase; Oligosaccharide Transferase N-Glycosylate Proteins; Iron Chelatin ABC Transporter Permease Protein; Oligosaccharyltransferase; Hydroxylamine Reductase (Hybrid-Cluster Protein
Number of amino acids: Translated: 713; Mature: 713
Protein sequence:
>713_residues MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGARDMIAGFHQPNDLSYYGS SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLANEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV DFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKY SQLTSNVCIVFATILTLAPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDLFLASLSKPDFKIDTPKTRDI YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI
Sequences:
>Translated_713_residues MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGARDMIAGFHQPNDLSYYGS SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLANEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV DFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKY SQLTSNVCIVFATILTLAPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDLFLASLSKPDFKIDTPKTRDI YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI >Mature_713_residues MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAEGARDMIAGFHQPNDLSYYGS SLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLANEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVL PMFILFFMVRMILKKDFFSLIALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESANLTQGFMYFNVNQTIQEVENV DFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPILVLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKY SQLTSNVCIVFATILTLAPVFIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDLFLASLSKPDFKIDTPKTRDI YLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPLDVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSI KQGEYKITPIDDKAQFYIFYLKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI
Specific function: Unknown
COG id: COG1287
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82207; Mature: 82207
Theoretical pI: Translated: 8.55; Mature: 8.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAE CCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCEECC GARDMIAGFHQPNDLSYYGSSLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLA CCHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVLPMFILFFMVRMILKKDFFSL HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESAN HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEEEECCCCCC LTQGFMYFNVNQTIQEVENVDFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPIL CEECEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKYSQLTSNVCIVFATILTLAPV HHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL HHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHC GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDL CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE FLASLSKPDFKIDTPKTRDIYLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPL EEEECCCCCEEECCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEECCCCCE DVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSIKQGEYKITPIDDKAQFYIFY EECCCEEEEECCEEEECCCCCEECCCCEEEECCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEE LKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHHHEECCCCCEEEEEEC >Mature Secondary Structure MLKKEYLKNPYLVLFAMIILAYVFSVLCRFYWIWWASEFNEYFFNNQLMIISNDGYAFAE CCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCEECC GARDMIAGFHQPNDLSYYGSSLSTLTYWLYKITPFSFESIILYMSTFLSSLVVIPIILLA CCHHHHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NEYKRPLMGFVAALLASVANSYYNRTMSGYYDTDMLVIVLPMFILFFMVRMILKKDFFSL HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IALPLFIGIYLWWYPSSYTLNVALIGLFLIYTLIFHRKEKIFYIAVILSSLTLSNIAWFY HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSAIIVILFALFALEQKRLNFMIIGILGSATLIFLILSGGVDPILYQLKFYIFRNDESAN HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEEEECCCCCC LTQGFMYFNVNQTIQEVENVDFSEFMRRISGSEIVFLFSLFGFVWLLRKHKSMIMALPIL CEECEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLGFLALKGGLRFTIYSVPVMALGFGFLLSEFKAILVKKYSQLTSNVCIVFATILTLAPV HHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIHIYNYKAPTVFSQNEASLLNQLKNIANREDYVVTWWDYGYPVRYYSDVKTLVDGGKHL HHHHCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCCHHC GKDNFFPSFALSKDEQAAANMARLSVEYTEKSFYAPQNDILKSDILQAMMKDYNQSNVDL CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE FLASLSKPDFKIDTPKTRDIYLYMPARMSLIFSTVASFSFINLDTGVLDKPFTFSTAYPL EEEECCCCCEEECCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEECCCCCE DVKNGEIYLSNGVVLSDDFRSFKIGDNVVSVNSIVEINSIKQGEYKITPIDDKAQFYIFY EECCCEEEEECCEEEECCCCCEECCCCEEEECCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEE LKDSAIPYAQFILMDKTMFNSAYVQMFFLGNYDKNLFDLVINSRDAKVFKLKI EECCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCHHHHEECCCCCEEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA