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The map label for this gene is pepF [H]

Identifier: 57237981

GI number: 57237981

Start: 1159425

End: 1161146

Strand: Direct

Name: pepF [H]

Synonym: CJE1242

Alternate gene names: 57237981

Gene position: 1159425-1161146 (Clockwise)

Preceding gene: 57237980

Following gene: 57237982

Centisome position: 65.22

GC content: 29.09

Gene sequence:

>1722_bases
ATGTTAGAATGGGATTTAAGTGCTTTATTTCACGATAAAGAAGCGTTGCAAAATTTTACACAAGATCAAATCCAACAAAG
TTTAAATTTCAAAAAAAACTATGAAAATAAACTTTATACATTAAATGCTAATGAGTTTTTACAAGCTTTAAAAGATTATG
AAATTTTAAATCAAGCTCTTGGCAAAATCATGACTTATACTTATTTGCTTTTTGCTAAAAACACTCAAAATGGTTCTTTT
TACGCACAATACGAAGAAGAATGCAAAAAAATAGAAGAAAATTTACTCTTTTTCGAGCTTGAATTTTGCGAGTTAGCTCC
TGAGAAAAGTCAAAAATTTACAACTTTTTGCAAAGATTATGATTTTTATCTTTCTAATTTATTGCAAAACAAACGCTATA
ATCTTAGCAAAAACGAAGAACGCATTATGCTCTATCTTTCCAATACAGGTGCAAATGCTTTTAGTAGACTTTTTGATGAA
AGTATGAGCGCTTTAAAAATCCCTTTTGAAGGTAAAAAACTTAGCGAAGAAGAAGTTCTAAGCAAAATGTATGATGAAGA
TAGAAAAATACGCAAAAAAGCTGCTAAAAAATTCAGTAAAGTTTTGCAAAAAAATAGCAGACTTTTAAGTTTTATTATCA
ATATGATAAAAACAGAAAGAAAAAACATAAGCTTATTAAGAGGTTATGAAAATACTGAAATTTCAAGACATATCAGCAAT
CAAATTTCACAAAAAAGCGTTGATTCTTTGATAGCAAGTGCGCAAAAACATTTTAACTTAGTATCGCAATTTTACAAAAG
AAAAAAACAAATTTTAGGCTATGATGAGCTTAAAGACTATGACAGATATGCACCCATAGGAAAAGAAGCAAGTTTTGATT
TTAAAACAAGTAAAAATATTGTTTTAGAGGCATTTCAAGCTTTTTCTCCTCAATTTTATGATATAGCAAAAAATGCTTTT
GATCAAGGTTGGATTGATGTTTATCCGCAAGAAAATAAACAAGGGGGTGCTTTTTCGCATTCTGCAACTTCTGATGCACA
TCCTTTTGTTTTATTAAACTACACCAATAAAAGACGCGATCTTTTTACACTTGCACATGAATTAGGACACACTATCCATC
AAAAACTTTCTTATAATGTAAGCTATTTAAATCAAAACACGCCTTTAACCACCGCAGAAACAGCTTCAGTTTTTGCCGAA
ATGCTCGTATTTGATTTTATTAAAGATAAGTTAAAAAAAGAAGAACTCTTATCTTTATATGCAAATAAAATCGAAGATAT
TTTTGCAACTTTTTATAGACAGATTAATTTTACTTGTTTTGAAAGACGCTTACATGCTCAAGAAAATGAACTTAGCACCG
AAGAAATCAATAAAATTTGGATGGAAGAATCTCAAAAGATGTTTCAAGACAGCGTAAAACTTACAAAAAATTATGCTTCT
TGGTGGAGTTATATTCCTCATTTTATCCATTCTCCTTTCTACTGCTATGCTTATGCTTATGCACAACTTTTAGTTTTAGC
TCTTTATGGACTTTACAAAAGTAAAAAATGTGAAAATTTTAAAGAACTTTATATCAAAATGCTTTCTTTAGGCGGAAGTG
TGAGTCCAAAAGAACTAGTAGGAATGTTTGGCTTTGATATAGAAGATGAAAATTTTTGGGAAATAGGCATAAAAGAAATT
CAAAAACTCATCAATGAATTTATGGAGTTACAATCATGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAGCGATGAAAGGACTTTAGTTTTAAAACAAGTTAAAAATGGAGTGGCCATTAGAATGGCTGTTCTTAAAAAACTCATAT
TAGAAAATGAAGGATAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAATTTTAAAAAATGAAAATTTTATCCATACCATGCAAAAGCATTGCCATGAGATTATTTCACATCTTATAGAAGAA
AATATAGAATTTTCAATAGT

Product: oligoendopeptidase F

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 573; Mature: 573

Protein sequence:

>573_residues
MLEWDLSALFHDKEALQNFTQDQIQQSLNFKKNYENKLYTLNANEFLQALKDYEILNQALGKIMTYTYLLFAKNTQNGSF
YAQYEEECKKIEENLLFFELEFCELAPEKSQKFTTFCKDYDFYLSNLLQNKRYNLSKNEERIMLYLSNTGANAFSRLFDE
SMSALKIPFEGKKLSEEEVLSKMYDEDRKIRKKAAKKFSKVLQKNSRLLSFIINMIKTERKNISLLRGYENTEISRHISN
QISQKSVDSLIASAQKHFNLVSQFYKRKKQILGYDELKDYDRYAPIGKEASFDFKTSKNIVLEAFQAFSPQFYDIAKNAF
DQGWIDVYPQENKQGGAFSHSATSDAHPFVLLNYTNKRRDLFTLAHELGHTIHQKLSYNVSYLNQNTPLTTAETASVFAE
MLVFDFIKDKLKKEELLSLYANKIEDIFATFYRQINFTCFERRLHAQENELSTEEINKIWMEESQKMFQDSVKLTKNYAS
WWSYIPHFIHSPFYCYAYAYAQLLVLALYGLYKSKKCENFKELYIKMLSLGGSVSPKELVGMFGFDIEDENFWEIGIKEI
QKLINEFMELQSC

Sequences:

>Translated_573_residues
MLEWDLSALFHDKEALQNFTQDQIQQSLNFKKNYENKLYTLNANEFLQALKDYEILNQALGKIMTYTYLLFAKNTQNGSF
YAQYEEECKKIEENLLFFELEFCELAPEKSQKFTTFCKDYDFYLSNLLQNKRYNLSKNEERIMLYLSNTGANAFSRLFDE
SMSALKIPFEGKKLSEEEVLSKMYDEDRKIRKKAAKKFSKVLQKNSRLLSFIINMIKTERKNISLLRGYENTEISRHISN
QISQKSVDSLIASAQKHFNLVSQFYKRKKQILGYDELKDYDRYAPIGKEASFDFKTSKNIVLEAFQAFSPQFYDIAKNAF
DQGWIDVYPQENKQGGAFSHSATSDAHPFVLLNYTNKRRDLFTLAHELGHTIHQKLSYNVSYLNQNTPLTTAETASVFAE
MLVFDFIKDKLKKEELLSLYANKIEDIFATFYRQINFTCFERRLHAQENELSTEEINKIWMEESQKMFQDSVKLTKNYAS
WWSYIPHFIHSPFYCYAYAYAQLLVLALYGLYKSKKCENFKELYIKMLSLGGSVSPKELVGMFGFDIEDENFWEIGIKEI
QKLINEFMELQSC
>Mature_573_residues
MLEWDLSALFHDKEALQNFTQDQIQQSLNFKKNYENKLYTLNANEFLQALKDYEILNQALGKIMTYTYLLFAKNTQNGSF
YAQYEEECKKIEENLLFFELEFCELAPEKSQKFTTFCKDYDFYLSNLLQNKRYNLSKNEERIMLYLSNTGANAFSRLFDE
SMSALKIPFEGKKLSEEEVLSKMYDEDRKIRKKAAKKFSKVLQKNSRLLSFIINMIKTERKNISLLRGYENTEISRHISN
QISQKSVDSLIASAQKHFNLVSQFYKRKKQILGYDELKDYDRYAPIGKEASFDFKTSKNIVLEAFQAFSPQFYDIAKNAF
DQGWIDVYPQENKQGGAFSHSATSDAHPFVLLNYTNKRRDLFTLAHELGHTIHQKLSYNVSYLNQNTPLTTAETASVFAE
MLVFDFIKDKLKKEELLSLYANKIEDIFATFYRQINFTCFERRLHAQENELSTEEINKIWMEESQKMFQDSVKLTKNYAS
WWSYIPHFIHSPFYCYAYAYAQLLVLALYGLYKSKKCENFKELYIKMLSLGGSVSPKELVGMFGFDIEDENFWEIGIKEI
QKLINEFMELQSC

Specific function: Unknown

COG id: COG1164

COG function: function code E; Oligoendopeptidase F

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M3B family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001567
- InterPro:   IPR004438
- InterPro:   IPR013647 [H]

Pfam domain/function: PF01432 Peptidase_M3; PF08439 Peptidase_M3_N [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67477; Mature: 67477

Theoretical pI: Translated: 6.90; Mature: 6.90

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLEWDLSALFHDKEALQNFTQDQIQQSLNFKKNYENKLYTLNANEFLQALKDYEILNQAL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKIMTYTYLLFAKNTQNGSFYAQYEEECKKIEENLLFFELEFCELAPEKSQKFTTFCKDY
HHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
DFYLSNLLQNKRYNLSKNEERIMLYLSNTGANAFSRLFDESMSALKIPFEGKKLSEEEVL
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHH
SKMYDEDRKIRKKAAKKFSKVLQKNSRLLSFIINMIKTERKNISLLRGYENTEISRHISN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHH
QISQKSVDSLIASAQKHFNLVSQFYKRKKQILGYDELKDYDRYAPIGKEASFDFKTSKNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHH
VLEAFQAFSPQFYDIAKNAFDQGWIDVYPQENKQGGAFSHSATSDAHPFVLLNYTNKRRD
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHH
LFTLAHELGHTIHQKLSYNVSYLNQNTPLTTAETASVFAEMLVFDFIKDKLKKEELLSLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANKIEDIFATFYRQINFTCFERRLHAQENELSTEEINKIWMEESQKMFQDSVKLTKNYAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WWSYIPHFIHSPFYCYAYAYAQLLVLALYGLYKSKKCENFKELYIKMLSLGGSVSPKELV
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
GMFGFDIEDENFWEIGIKEIQKLINEFMELQSC
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLEWDLSALFHDKEALQNFTQDQIQQSLNFKKNYENKLYTLNANEFLQALKDYEILNQAL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GKIMTYTYLLFAKNTQNGSFYAQYEEECKKIEENLLFFELEFCELAPEKSQKFTTFCKDY
HHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
DFYLSNLLQNKRYNLSKNEERIMLYLSNTGANAFSRLFDESMSALKIPFEGKKLSEEEVL
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHHHH
SKMYDEDRKIRKKAAKKFSKVLQKNSRLLSFIINMIKTERKNISLLRGYENTEISRHISN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHH
QISQKSVDSLIASAQKHFNLVSQFYKRKKQILGYDELKDYDRYAPIGKEASFDFKTSKNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHH
VLEAFQAFSPQFYDIAKNAFDQGWIDVYPQENKQGGAFSHSATSDAHPFVLLNYTNKRRD
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHH
LFTLAHELGHTIHQKLSYNVSYLNQNTPLTTAETASVFAEMLVFDFIKDKLKKEELLSLY
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANKIEDIFATFYRQINFTCFERRLHAQENELSTEEINKIWMEESQKMFQDSVKLTKNYAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WWSYIPHFIHSPFYCYAYAYAQLLVLALYGLYKSKKCENFKELYIKMLSLGGSVSPKELV
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
GMFGFDIEDENFWEIGIKEIQKLINEFMELQSC
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9403685 [H]