| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is mviN [H]
Identifier: 57237646
GI number: 57237646
Start: 830261
End: 831712
Strand: Direct
Name: mviN [H]
Synonym: CJE0892
Alternate gene names: 57237646
Gene position: 830261-831712 (Clockwise)
Preceding gene: 57237639
Following gene: 57237647
Centisome position: 46.7
GC content: 29.06
Gene sequence:
>1452_bases ATGAAGAGTTTAGTATTTAAAAATTTTATTATCAATGCTTTAGGAATTTTATTTTCAAGAATTTTAGGGCTTGCTAGAGA TGTTTTAATAGCGCTTTTTTTAGGAGCAGGGCTTTATAGTGATATTTTTTTTGTGGCTTTAAAAATGCCTGCTTTTTTTA GAAGAATTTTTGCAGAAGGGGCTTTTGGACAAAGTTTTTTGCCTAATTTTGTAAAAGCGAAAAAAAAAGGAGCTTTTTGC GTTAGTGTAATGATGCAATTTAGCCTTATAGTTTTTTTATTTTGTCTTTTGGTAAGTTTTTTCTCCTCTTTTTTTACCAA GCTTTTTGCTTTTGGGTTTAACGCAGATACTATAGCTTTAGCGGCTCCTTTGGTGGCGATTAATTTTTGGTATTTGTTTT TTATTTTTTTAGTTACTTTTTTAGGAGCTATTTTAAATTATAGACAAAAATTTTTCATTACCTCTTTTTCTGCGGCATTA TTTAACTTAAGTATTGTTATAGCTGCCTTTTTTGTGGATAAAAATGCACCGCAAAATACACTTTATTATTTTTCTTATGC AACGGTTTTAAGTGGGGTGGCACAGCTTATTTTACATTTGCTTGTTTTAAAAAACAATCCTGTAATACGTGCTATGACTT TAAGTATAAAATTTAAAAAAGCCAAGGCGAAATTACAAGGTTTTTATGGCAATTTTTTTCATGGAGTTTTAGGTTCTTCT GCGACTCAATTTAGCTCATTGCTTGATACAACTATAGCTAGTTTTTTAATGAGCGGGAGTATTTCTTATCTTTATTATGC AAATCGTGTCTTCCAACTCCCCCTGGCACTTTTTGCTATTGCTTTAACTCAAGTTTCTTTTCCAAAAATTTTAAAACATT TAAAAAGTGATCAAGAAAATTTAGCCTTAAAATTTATGCAAAGAGCATTAGCACTTTTAAGCATTTTGCTTATTGCTTCT AGTATTGTAGGTTCTGTGTTTGCTTTGGAAATTTCAAAGCTTTTATTTGAAAGAGGAAATTTCACTCACGAAGATAGTGT GATTACGGCTTATGTTTTGATTGCTTATCTTATAGGGCTTTTACCTTTTGGTTTGCAAAAGCTTTTTTCTTTGTGGCTTT ATGCAAAATTTAAACAAAAAACAGCAGCTTGGATCGCGGTAAAATCTTTAATTATTAGTGCTTTATGTTCTATGGCTTTT ATATTTTTGATTAAAGATGAAAGTTTAAAGGTTATTGCAGTGGCACTTTCAAGCTCTATTAGTGCTTTTTATTTGCTTGG AGCTAATATCAAAGAATTTGGTTTTAAGAAATTTTTTGCTTTAATATCTATTAAAATTTGCTTATTGGTTATAGTTGCTT TGATTGTTTTTACGATCTTACTTATTTTGATTAAACCTTATATTTTAAGTTTTTTTATAGGAATTTTTACAAGTTTTAAA GGAGTTTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTCCCCTTGTAAAAAATTAAGAATGTAATTATAGTCAATTTTTAATCAATTTTAGTTAAAATAGTTCTCTTTATATTTT GAAATTTATGAAAAAATTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAGATTATTAGATAGTGTAACAAAAGAGAAAATAAAACTTGATAAAAAAGATATTAGTATTTACTTATGCGGGCCTACG GTTTATGATGATGCACATTT
Product: integral membrane protein MviN
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 483; Mature: 483
Protein sequence:
>483_residues MKSLVFKNFIINALGILFSRILGLARDVLIALFLGAGLYSDIFFVALKMPAFFRRIFAEGAFGQSFLPNFVKAKKKGAFC VSVMMQFSLIVFLFCLLVSFFSSFFTKLFAFGFNADTIALAAPLVAINFWYLFFIFLVTFLGAILNYRQKFFITSFSAAL FNLSIVIAAFFVDKNAPQNTLYYFSYATVLSGVAQLILHLLVLKNNPVIRAMTLSIKFKKAKAKLQGFYGNFFHGVLGSS ATQFSSLLDTTIASFLMSGSISYLYYANRVFQLPLALFAIALTQVSFPKILKHLKSDQENLALKFMQRALALLSILLIAS SIVGSVFALEISKLLFERGNFTHEDSVITAYVLIAYLIGLLPFGLQKLFSLWLYAKFKQKTAAWIAVKSLIISALCSMAF IFLIKDESLKVIAVALSSSISAFYLLGANIKEFGFKKFFALISIKICLLVIVALIVFTILLILIKPYILSFFIGIFTSFK GVF
Sequences:
>Translated_483_residues MKSLVFKNFIINALGILFSRILGLARDVLIALFLGAGLYSDIFFVALKMPAFFRRIFAEGAFGQSFLPNFVKAKKKGAFC VSVMMQFSLIVFLFCLLVSFFSSFFTKLFAFGFNADTIALAAPLVAINFWYLFFIFLVTFLGAILNYRQKFFITSFSAAL FNLSIVIAAFFVDKNAPQNTLYYFSYATVLSGVAQLILHLLVLKNNPVIRAMTLSIKFKKAKAKLQGFYGNFFHGVLGSS ATQFSSLLDTTIASFLMSGSISYLYYANRVFQLPLALFAIALTQVSFPKILKHLKSDQENLALKFMQRALALLSILLIAS SIVGSVFALEISKLLFERGNFTHEDSVITAYVLIAYLIGLLPFGLQKLFSLWLYAKFKQKTAAWIAVKSLIISALCSMAF IFLIKDESLKVIAVALSSSISAFYLLGANIKEFGFKKFFALISIKICLLVIVALIVFTILLILIKPYILSFFIGIFTSFK GVF >Mature_483_residues MKSLVFKNFIINALGILFSRILGLARDVLIALFLGAGLYSDIFFVALKMPAFFRRIFAEGAFGQSFLPNFVKAKKKGAFC VSVMMQFSLIVFLFCLLVSFFSSFFTKLFAFGFNADTIALAAPLVAINFWYLFFIFLVTFLGAILNYRQKFFITSFSAAL FNLSIVIAAFFVDKNAPQNTLYYFSYATVLSGVAQLILHLLVLKNNPVIRAMTLSIKFKKAKAKLQGFYGNFFHGVLGSS ATQFSSLLDTTIASFLMSGSISYLYYANRVFQLPLALFAIALTQVSFPKILKHLKSDQENLALKFMQRALALLSILLIAS SIVGSVFALEISKLLFERGNFTHEDSVITAYVLIAYLIGLLPFGLQKLFSLWLYAKFKQKTAAWIAVKSLIISALCSMAF IFLIKDESLKVIAVALSSSISAFYLLGANIKEFGFKKFFALISIKICLLVIVALIVFTILLILIKPYILSFFIGIFTSFK GVF
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=417, Percent_Identity=32.3741007194245, Blast_Score=188, Evalue=6e-49,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004268 [H]
Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53898; Mature: 53898
Theoretical pI: Translated: 10.54; Mature: 10.54
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKSLVFKNFIINALGILFSRILGLARDVLIALFLGAGLYSDIFFVALKMPAFFRRIFAEG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC AFGQSFLPNFVKAKKKGAFCVSVMMQFSLIVFLFCLLVSFFSSFFTKLFAFGFNADTIAL CCCHHHCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH AAPLVAINFWYLFFIFLVTFLGAILNYRQKFFITSFSAALFNLSIVIAAFFVDKNAPQNT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH LYYFSYATVLSGVAQLILHLLVLKNNPVIRAMTLSIKFKKAKAKLQGFYGNFFHGVLGSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ATQFSSLLDTTIASFLMSGSISYLYYANRVFQLPLALFAIALTQVSFPKILKHLKSDQEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH LALKFMQRALALLSILLIASSIVGSVFALEISKLLFERGNFTHEDSVITAYVLIAYLIGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LPFGLQKLFSLWLYAKFKQKTAAWIAVKSLIISALCSMAFIFLIKDESLKVIAVALSSSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHCCC SAFYLLGANIKEFGFKKFFALISIKICLLVIVALIVFTILLILIKPYILSFFIGIFTSFK HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GVF CCC >Mature Secondary Structure MKSLVFKNFIINALGILFSRILGLARDVLIALFLGAGLYSDIFFVALKMPAFFRRIFAEG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC AFGQSFLPNFVKAKKKGAFCVSVMMQFSLIVFLFCLLVSFFSSFFTKLFAFGFNADTIAL CCCHHHCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH AAPLVAINFWYLFFIFLVTFLGAILNYRQKFFITSFSAALFNLSIVIAAFFVDKNAPQNT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH LYYFSYATVLSGVAQLILHLLVLKNNPVIRAMTLSIKFKKAKAKLQGFYGNFFHGVLGSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC ATQFSSLLDTTIASFLMSGSISYLYYANRVFQLPLALFAIALTQVSFPKILKHLKSDQEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHH LALKFMQRALALLSILLIASSIVGSVFALEISKLLFERGNFTHEDSVITAYVLIAYLIGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LPFGLQKLFSLWLYAKFKQKTAAWIAVKSLIISALCSMAFIFLIKDESLKVIAVALSSSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHCCC SAFYLLGANIKEFGFKKFFALISIKICLLVIVALIVFTILLILIKPYILSFFIGIFTSFK HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GVF CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9252185 [H]