Definition | Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_002678 |
Length | 7,036,071 |
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The map label for this gene is 13470955
Identifier: 13470955
GI number: 13470955
Start: 623492
End: 629866
Strand: Direct
Name: 13470955
Synonym: mlr0796
Alternate gene names: NA
Gene position: 623492-629866 (Clockwise)
Preceding gene: 13470954
Following gene: 13470960
Centisome position: 8.86
GC content: 65.63
Gene sequence:
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ATCCGCGACTCCATCCTCAATGCGTCGACCAAGCTGTCGATGACGATCACCAATTCCGGCGACACGCTTATCGACCGCAT CAATGAAAGCTCGATGTCGATCTTCGATTCGGTCGAAGGCCGGCTCGACACCATCACCGACAAGTTGTCGACCTCCGGCG AGGCCTTCGCCAGCCTGCTTGACACGCGCATCGCCAAGCTGACGGACACGACGGACGGCCTGACCCGGTCGCTGACCGAT CTGCTCGACGATCGCACCACCGGCATGGTTTCGCTTCTCGGCGGCGCCGCGCGCACCCTCAATTCGGAATTCGAAGCCAG CCTCAACGGCATCGAGCGCACGCTGGCCGAACGCGGCCAGGCGCTGATCAGCGAATTCCAGACCCGCGCCGAGGCGCTGG ACACCGGCACGCAGAAGCTCAACGCCGCGCTCGAGGCCCGCGCCCGCCAGATCAACGAGACGCTGGTCGAGCGCGCCCGC GAAATCGCCCACACCTTCGCCGAGAGCAAGGACACGCTGGCCGCGATGATCGATCAGGGCAAGACCCAGATCGGCGCCGA TATGGCAGACATCGTCACCTCGACATCGAGCATGCTGGAGGCCCGCGCCAGCGACTTTGCCGGTCGCATGGAAGCGGCGC GTCATGTAGTCTCGCGTTCCTTCGACAGCGACATCCAGCGGCTCGCCGACGCCCGTGTCGGCATTGAGGAAGCCGTCGAA AACCACAGCCGCAAGCTGTCCGAAAGCCGCGACCGCATGGCGGCCGCCATGCAGGCGGACCTGGAGAAATTCGCCGAAAG CCGCGACGGCATCGATGCCGCGGTGACCAACCAGGTGCAGAAGCTGGCCGAAGGCCGCAGCCTGATCGCGCGCGCCCTCG AAGAGGATTTGCGCAAGGTCAACGAATCGCGCGCCGCAATCGACGCGTCGCTCGGCAGCCACCTCGAAAGGCTGGAAGAA 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GGCCGCGCCGACGGAGAAAAGCAAAGGCGGGCCGGGGCCCGCCTTTTTCATTTTATCCAGACAACCAGACTGATGATGCA AGACGGATCAGATACCCCGT
Product: kinesin-like protein
Products: NA
Alternate protein names: Chemotaxis Sensory Transducer; Transmembrane Protein; Methyl-Accepting Chemotaxis Protein; Kinesin-Like Protein; ATPase
Number of amino acids: Translated: 2124; Mature: 2123
Protein sequence:
>2124_residues MAKKPTTTTRNLDSDVARELEKALDLDLSGDIGSGDLDIAASMEDLEAQISQAADELAREGRDQRPALAANQAAPIANQA ANPAPKAKPAELRPVETRNGNGTQPTGFAPANDDRQKDYKTLLHSLNRRASNTVYWIVAFVSLAWIAGAGGLANLLFGPS IWRIGTLDQFLARPELIGLAVAAIVPIILFWAFAAMIRRAQDMRIAAQSMTEVAFRLTEPENMAQDRVMMIGQAVRREVA AMGEGIERTLARAVELETLVHSEVNQIERSYSENETRIRSLVDGLGSEREAVVTHAERVRASIAGAHETLRDEIGAASDI IRDSILNASTKLSMTITNSGDTLIDRINESSMSIFDSVEGRLDTITDKLSTSGEAFASLLDTRIAKLTDTTDGLTRSLTD LLDDRTTGMVSLLGGAARTLNSEFEASLNGIERTLAERGQALISEFQTRAEALDTGTQKLNAALEARARQINETLVERAR EIAHTFAESKDTLAAMIDQGKTQIGADMADIVTSTSSMLEARASDFAGRMEAARHVVSRSFDSDIQRLADARVGIEEAVE NHSRKLSESRDRMAAAMQADLEKFAESRDGIDAAVTNQVQKLAEGRSLIARALEEDLRKVNESRAAIDASLGSHLERLEE GRNRLSLALNEDSGKLVQARTIIDEMVAGHVGKLAEGRNILSRALEADLGKLSDSRASIDGLVAGQVEKIAEGRAVLAKA LENDIAGIKSLIEVHSAKLVEDRSQLGRSLEDDLSGIRGLLDDHSVKLANDRSLLSQTLEADLAKLAESRSSIDGLVAGQ VEKLAEGRDILKRALESDLSTIKGVISSQSERLAEDRGQLSRVLEADLQNVNSVIADHMNRLVQDRSTLSKALEDDLAKL ADSRSSIDGLVAGQVEKLAEGRDILKRALEADLNTIKNTVADQSQKLVDDRAQFARALEADLESVNSLVNSHSERLVQDR STLSKALEVDLDNVNGLINSHAERLVQDRSTLSKALEADLESVSGLVNSHADRLVQERSTLSRALEDDLAKLAESRSSID GLVAGQVEKLAEGRDVLRRALEADLAKLAESRSSIDGLVAGQVEKLAEGRDILKRALEADLQKLSESRGDIDGVIAGHVG KLAEGRNMLSRALEDDLGKLAETRKDVDRSLSGHIDQIAARSTDISAAIAADVEKIEQAFSRQTGIIEERAGTMERALST GVDNVRSVLEKSAVFVAGALREKVLEVTSTLHEQAGAAFSDADRKIAERAEQTSAALLARAEDIARTFEEADRRLHARAE DTSNALLARADDTSSSLLARAHETADQLAARAGEIAGSFELADQKLAARAQDTADQLAARASEIAGTFDAADQKLVARAI ETAQSLAARAGDILRNFESADQRLGMRIGESAEALAARATDLGRIFDAADQQLVSRIAEGSDALSNRASEIGRIFDEADQ RLVSRIADSSSTIGEHAQSIVGAFASTEQKVADRARQTGQELAVHAREIEQALAGADERLASTAAAAAARVEEQIASVEN RLAHTTETMGQRLNEQVSSAEAQLVSRANVIAETFTAVGQHIGQSTNDAAKTIGANTRELNTMLAARSAEMSKILDETAR PLVERFAQGGSELQKSMEEVTERATEKLRSENAALVNALANRTAETLSAVEGARSSLSDSVADLIGRMTKSSSQLGQLIE QAAVNLGQVDERLTGSTQSFAATTEKAAQTFASSARLVDSNTTRLTELSSSTLREVASIATKFDEHSRLLASASDLLSSA QSNLEHTLERQSSLEDLAVGLVKKSEDLERVMRSFENLVGQTLQNAEGKTMESADKIRNAITDVVDSATKRFADATDEMR RTASSIKSELDLTRAELKKGVIEMPEEAKESTSAIRRAVSEQINALKELSDIVAKSGRGGGDTSEPRNLRPAPQAQAARP AEPPRRPPAPQPELRTPQPPLGGTALRGTLDLERPAEPRQRPEAGARTPQGGWVRDLLTAASNDADLRPATPPSPPAEAP RAAPAQRSPLHVVESLNSLSVDIARAIDHDASIELWNRYRRGERDVFTRRLYTLKGQQTFDEIRRKYQGEAEFRAAVDRY CDDFEKLLKDVSRNDRDNIMAQTYLTSDTGKVYTMLAHASGRLH
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
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Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
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EC number: NA
Molecular weight: Translated: 229258; Mature: 229127
Theoretical pI: Translated: 4.82; Mature: 4.82
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Signals:
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>Translated Secondary Structure MAKKPTTTTRNLDSDVARELEKALDLDLSGDIGSGDLDIAASMEDLEAQISQAADELARE CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GRDQRPALAANQAAPIANQAANPAPKAKPAELRPVETRNGNGTQPTGFAPANDDRQKDYK CCCCCCCHHCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH TLLHSLNRRASNTVYWIVAFVSLAWIAGAGGLANLLFGPSIWRIGTLDQFLARPELIGLA HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHCHHHHHHH VAAIVPIILFWAFAAMIRRAQDMRIAAQSMTEVAFRLTEPENMAQDRVMMIGQAVRREVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AMGEGIERTLARAVELETLVHSEVNQIERSYSENETRIRSLVDGLGSEREAVVTHAERVR HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH ASIAGAHETLRDEIGAASDIIRDSILNASTKLSMTITNSGDTLIDRINESSMSIFDSVEG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH RLDTITDKLSTSGEAFASLLDTRIAKLTDTTDGLTRSLTDLLDDRTTGMVSLLGGAARTL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NSEFEASLNGIERTLAERGQALISEFQTRAEALDTGTQKLNAALEARARQINETLVERAR 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