| Definition | Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002662 |
| Length | 2,365,589 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is kupA
Identifier: 15672605
GI number: 15672605
Start: 609512
End: 611524
Strand: Direct
Name: kupA
Synonym: L9458
Alternate gene names: 15672605
Gene position: 609512-611524 (Clockwise)
Preceding gene: 15672604
Following gene: 15672606
Centisome position: 25.77
GC content: 36.76
Gene sequence:
>2013_bases ATGGGTTATGAATCTAATCGCTCATTTAATAAAGCAACAGGTGCCGGTTTCATCATCGCAATGGGAATTGTTTATGGCGA CATCGGAACGAGCCCTCTTTACACAATGGAATCAATTGTCCAAGGCCAAGGGGGGCTTGAGCGAATCTCAGAAACGTCAA TTATTGGGGCACTTTCGCTCATTATCTGGACGCTGACATTAATTACAACAGTCAAATATGTGTGGATTGCTTTAAAAGCG GATAATAATCATGAAGGCGGAATTTTTTCATTATTTACTCTCGTTCGCAAATATGCAAAATGGTTAATTATTCCGGCAAT GATTGGTGGTGCTGCTTTGCTTTCTGACGGAGCCTTAACACCTGCCGTAACGGTTACGTCAGCAATAGAAGGCTTGAGGT CAATTCCAGCTTTTCATGAAGCTTTTGGTCAGCAGCAATTACCGATTGTTATTATTACTTTAGCGATTTTAGCGGTCTTA TTTTTAATTCAACGATTTGGAACTTCAATCGTTGGTAAAGTGTTTGGACCAGTCATGTTTATTTGGTTTAGTTTTCTTGG AATTACGGGTTTGATTAATCTCTTTGGTGATTTTTCTGTTCTTCAAGCAATTAATCCTTATTGGGCAATTCATTTACTTT TAAGCCCAGAAAATAAAGCTGGAATTTTTGTTTTAGGTTCAGTCTTTCTGGCAACGACGGGCGCAGAAGCTCTTTATTCC GATTTAGGACATGTTGGTCGGGGAAATATTCATGTCAGTTGGCCTTTTGTTAAAGTTTGTATCATCCTATCCTATTGCGG GCAAGGGGCTTGGCTTTTACAAAATCGCGGAAAATCATTAGGAGATATCAATCCATTTTTTGCTGTCCTTCCTCAAAATT TAATCATTTTTTCAGTAATTTTAGCAACTTTGGCGGCAATTATTGCCTCACAGGCATTGATTTCTGGTTCATTTACTCTT GTGTCAGAAGCTATTCGTCTTAAACTCCTTCCTCGATTAAGAATTTTTTATCCAGGAGAAACTTTCGGACAATTATATAT TCCAGCCGTAAATTTGGGACTCTGGTTGGCAGCGAGTTTTATTGTTGTCTATTTCCAAAGTTCTGCTCACATGGAAGCGG CTTATGGTTTAGCAATCACAGTAACCATGCTTATGACAACAACATTGTTAACTGTCTATTTAAGTCACTATCAAAAAGTT AAAAAAGTATTGGTTGGCCTATTTTTCACCGTTTTTATCTTTATTGAAGGCTTGTTTTTTGCAGCTTCCGCTGTAAAATT TATGCATGGCGGGTATGTCGTTGTGATTATTGCTGCCATGATTCTATTTGTTATGGCAATCTGGCATAAATCTGATCAGC TTTTTTATAAATATCTTAATTCTTCAAATCTTAATGATTATAAAGAACAAATGGACAAACTCCGCAAAGATGAAACTTAC GACCTTTATCATACGAATGTCGTTTATTTAACGGCTAAAATGGATAAAGAATGGATTGACCGTTCAATCTTGTATTCTAT TTTGGATAAGCGTCCTAAAAAAGCTAAAGTTTACTGGTTTGTGAAGGTTAATGTTACAGATGAGCCTTATACTTCTGAAT ACGAAGTGGATATGCTAGGAACTGATTTTATTGTCTGTGTTAATCTATATCTCGGTTTTCATATGCGTCAAGAAATCCCT CGGTATTTACGGACGATTGTGACCAACTTGATGGAGTCAGGACGATTACCACAACAAAATCAAACTTATAGTATTACACC AGGACGAAAAGTTGGAGATTTCCGTTTTATTATTTTAGAAGAAAAACTAATTAATGCAAGACAAATGCCTGGCTTTGAAC GATTTGTTCTTCAAACAAAAGAGCAAATTAAAAAAATTACAGCTTCGCCAGCACGTTGGTTTGGTCTTCACTTTTCAGAA GTGACGGTTGAAACTGTTCCTTTGGTTCTCTCGGATGTTAAAAATTTGGAAATTCACGAACGAATTTCAGAAGAAAATCA AGGAGAATCATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAACAAAAAATCAAGAAATTGTTATATGATTTAGGTAATCAAATGTGAATTATTTACTTTGATAAATTTTATGGAACTAG AGAAAGTTGAGGAAATTAGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAAATAAAAGCAATCAAAAGATAGCTTACGGTTGCTATCATCGCTTTTGTTATGATTACTGTATTATATATAAAACTGT GAGAAATAAATAAATATAAT
Product: potassium uptake protein
Products: K (I) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 670; Mature: 669
Protein sequence:
>670_residues MGYESNRSFNKATGAGFIIAMGIVYGDIGTSPLYTMESIVQGQGGLERISETSIIGALSLIIWTLTLITTVKYVWIALKA DNNHEGGIFSLFTLVRKYAKWLIIPAMIGGAALLSDGALTPAVTVTSAIEGLRSIPAFHEAFGQQQLPIVIITLAILAVL FLIQRFGTSIVGKVFGPVMFIWFSFLGITGLINLFGDFSVLQAINPYWAIHLLLSPENKAGIFVLGSVFLATTGAEALYS DLGHVGRGNIHVSWPFVKVCIILSYCGQGAWLLQNRGKSLGDINPFFAVLPQNLIIFSVILATLAAIIASQALISGSFTL VSEAIRLKLLPRLRIFYPGETFGQLYIPAVNLGLWLAASFIVVYFQSSAHMEAAYGLAITVTMLMTTTLLTVYLSHYQKV KKVLVGLFFTVFIFIEGLFFAASAVKFMHGGYVVVIIAAMILFVMAIWHKSDQLFYKYLNSSNLNDYKEQMDKLRKDETY DLYHTNVVYLTAKMDKEWIDRSILYSILDKRPKKAKVYWFVKVNVTDEPYTSEYEVDMLGTDFIVCVNLYLGFHMRQEIP RYLRTIVTNLMESGRLPQQNQTYSITPGRKVGDFRFIILEEKLINARQMPGFERFVLQTKEQIKKITASPARWFGLHFSE VTVETVPLVLSDVKNLEIHERISEENQGES
Sequences:
>Translated_670_residues MGYESNRSFNKATGAGFIIAMGIVYGDIGTSPLYTMESIVQGQGGLERISETSIIGALSLIIWTLTLITTVKYVWIALKA DNNHEGGIFSLFTLVRKYAKWLIIPAMIGGAALLSDGALTPAVTVTSAIEGLRSIPAFHEAFGQQQLPIVIITLAILAVL FLIQRFGTSIVGKVFGPVMFIWFSFLGITGLINLFGDFSVLQAINPYWAIHLLLSPENKAGIFVLGSVFLATTGAEALYS DLGHVGRGNIHVSWPFVKVCIILSYCGQGAWLLQNRGKSLGDINPFFAVLPQNLIIFSVILATLAAIIASQALISGSFTL VSEAIRLKLLPRLRIFYPGETFGQLYIPAVNLGLWLAASFIVVYFQSSAHMEAAYGLAITVTMLMTTTLLTVYLSHYQKV KKVLVGLFFTVFIFIEGLFFAASAVKFMHGGYVVVIIAAMILFVMAIWHKSDQLFYKYLNSSNLNDYKEQMDKLRKDETY DLYHTNVVYLTAKMDKEWIDRSILYSILDKRPKKAKVYWFVKVNVTDEPYTSEYEVDMLGTDFIVCVNLYLGFHMRQEIP RYLRTIVTNLMESGRLPQQNQTYSITPGRKVGDFRFIILEEKLINARQMPGFERFVLQTKEQIKKITASPARWFGLHFSE VTVETVPLVLSDVKNLEIHERISEENQGES >Mature_669_residues GYESNRSFNKATGAGFIIAMGIVYGDIGTSPLYTMESIVQGQGGLERISETSIIGALSLIIWTLTLITTVKYVWIALKAD NNHEGGIFSLFTLVRKYAKWLIIPAMIGGAALLSDGALTPAVTVTSAIEGLRSIPAFHEAFGQQQLPIVIITLAILAVLF LIQRFGTSIVGKVFGPVMFIWFSFLGITGLINLFGDFSVLQAINPYWAIHLLLSPENKAGIFVLGSVFLATTGAEALYSD LGHVGRGNIHVSWPFVKVCIILSYCGQGAWLLQNRGKSLGDINPFFAVLPQNLIIFSVILATLAAIIASQALISGSFTLV SEAIRLKLLPRLRIFYPGETFGQLYIPAVNLGLWLAASFIVVYFQSSAHMEAAYGLAITVTMLMTTTLLTVYLSHYQKVK KVLVGLFFTVFIFIEGLFFAASAVKFMHGGYVVVIIAAMILFVMAIWHKSDQLFYKYLNSSNLNDYKEQMDKLRKDETYD LYHTNVVYLTAKMDKEWIDRSILYSILDKRPKKAKVYWFVKVNVTDEPYTSEYEVDMLGTDFIVCVNLYLGFHMRQEIPR YLRTIVTNLMESGRLPQQNQTYSITPGRKVGDFRFIILEEKLINARQMPGFERFVLQTKEQIKKITASPARWFGLHFSEV TVETVPLVLSDVKNLEIHERISEENQGES
Specific function: Transport of potassium into the cell [H]
COG id: COG3158
COG function: function code P; K+ transporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the HAK/KUP transporter (TC 2.A.72) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI48994960, Length=519, Percent_Identity=35.4527938342967, Blast_Score=284, Evalue=1e-77,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003855 - InterPro: IPR023051 [H]
Pfam domain/function: PF02705 K_trans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 74983; Mature: 74852
Theoretical pI: Translated: 8.76; Mature: 8.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGYESNRSFNKATGAGFIIAMGIVYGDIGTSPLYTMESIVQGQGGLERISETSIIGALSL CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IIWTLTLITTVKYVWIALKADNNHEGGIFSLFTLVRKYAKWLIIPAMIGGAALLSDGALT HHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCC PAVTVTSAIEGLRSIPAFHEAFGQQQLPIVIITLAILAVLFLIQRFGTSIVGKVFGPVMF HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWFSFLGITGLINLFGDFSVLQAINPYWAIHLLLSPENKAGIFVLGSVFLATTGAEALYS HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHH DLGHVGRGNIHVSWPFVKVCIILSYCGQGAWLLQNRGKSLGDINPFFAVLPQNLIIFSVI HHCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LATLAAIIASQALISGSFTLVSEAIRLKLLPRLRIFYPGETFGQLYIPAVNLGLWLAASF HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH IVVYFQSSAHMEAAYGLAITVTMLMTTTLLTVYLSHYQKVKKVLVGLFFTVFIFIEGLFF HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AASAVKFMHGGYVVVIIAAMILFVMAIWHKSDQLFYKYLNSSNLNDYKEQMDKLRKDETY HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC DLYHTNVVYLTAKMDKEWIDRSILYSILDKRPKKAKVYWFVKVNVTDEPYTSEYEVDMLG EEEECEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECC TDFIVCVNLYLGFHMRQEIPRYLRTIVTNLMESGRLPQQNQTYSITPGRKVGDFRFIILE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEE EKLINARQMPGFERFVLQTKEQIKKITASPARWFGLHFSEVTVETVPLVLSDVKNLEIHE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH RISEENQGES HHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure GYESNRSFNKATGAGFIIAMGIVYGDIGTSPLYTMESIVQGQGGLERISETSIIGALSL CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IIWTLTLITTVKYVWIALKADNNHEGGIFSLFTLVRKYAKWLIIPAMIGGAALLSDGALT HHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCC PAVTVTSAIEGLRSIPAFHEAFGQQQLPIVIITLAILAVLFLIQRFGTSIVGKVFGPVMF HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWFSFLGITGLINLFGDFSVLQAINPYWAIHLLLSPENKAGIFVLGSVFLATTGAEALYS HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHHHHHCCHHHHHH DLGHVGRGNIHVSWPFVKVCIILSYCGQGAWLLQNRGKSLGDINPFFAVLPQNLIIFSVI HHCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LATLAAIIASQALISGSFTLVSEAIRLKLLPRLRIFYPGETFGQLYIPAVNLGLWLAASF HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHH IVVYFQSSAHMEAAYGLAITVTMLMTTTLLTVYLSHYQKVKKVLVGLFFTVFIFIEGLFF HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AASAVKFMHGGYVVVIIAAMILFVMAIWHKSDQLFYKYLNSSNLNDYKEQMDKLRKDETY HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCC DLYHTNVVYLTAKMDKEWIDRSILYSILDKRPKKAKVYWFVKVNVTDEPYTSEYEVDMLG EEEECEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECC TDFIVCVNLYLGFHMRQEIPRYLRTIVTNLMESGRLPQQNQTYSITPGRKVGDFRFIILE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEE EKLINARQMPGFERFVLQTKEQIKKITASPARWFGLHFSEVTVETVPLVLSDVKNLEIHE HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH RISEENQGES HHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: K (I) [Periplasm] [C]
Specific reaction: K (I) [Periplasm] = K (I) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9931298 [H]