Definition | Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403, complete genome. |
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Accession | NC_002662 |
Length | 2,365,589 |
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The map label for this gene is cstA
Identifier: 15672391
GI number: 15672391
Start: 413148
End: 415502
Strand: Direct
Name: cstA
Synonym: L13150
Alternate gene names: 15672391
Gene position: 413148-415502 (Clockwise)
Preceding gene: 15672390
Following gene: 15672392
Centisome position: 17.46
GC content: 38.98
Gene sequence:
>2355_bases ATGAAAGATATTGGAAACTCTTCAAACTTTACCGAAGAAGAAGAGCTATTTTTGTTGCGAAATAAACAAGGAAAAATTGT CGGAATTAAAGATTTAAAGCAGGCAAATTTTCAAGAAACAATGAAAGACTGGAAAAAACATTTACCAAAACCTAGTCTTC TATCAATTATCATTTGGGTGGCGGTCGCTTTACTAGGTGGTCTTGCTTGGTCGTTGATTGCTCTGGCTCAAGGAGAGACG ATTAATGCGATTTGGTTTGTTATTGCAGCAGTTTGTTCTTATTTGATTGGCTATCGTTTTTATGCTTTATATATTCAACG TAAGATTATGCGTCCAAATGATTTACGGGCAACTCCTTCGGAAAGCCATAATGACGGAAAAGAATTCGACCCAACCAATC GAGTTGTTTTATTCGGTCACCATTTTGCTTCAATTGCTGGAGCTGGGCCTTTGGTTGGACCAGTTTTAGCGGCACAAATG GGTTACTTACCAGGGACAATTTGGATTATTTTCGGAGTTATTTTTGCCGGAGGGGTACAAGATATGCTTGTTCTCTGGTA TTCTCATCGTCGTCGAGCAAAATCTATTGGGGCAATGGCTCATGATGAAGTTGGCAGATTTGCTGGTGGCTTGACTTCAT TTATTGTATTTATCATGACAATGATTGTTCTTGCTGTTTTAGCTTTGATTTGTGTGACGGCGATGGCAAATTCTGCTTGG GCAGTCTTTTCGATTGGGATGACCATCCCAATTGCCTTGTTAATGGGAATTTATTTGAAATATATTCGCCCAGGGCATGT GAATGAAATTTCAGCGATTGGTTTTATTCTCCTTTTAGTTGCTATTTTTGGTGGCCGTTGGGTTTCGGAATCTTCATTTG CGCATATTTTCATGCTTTCGCCAACTGCTTTAGTTTGGTGGGTCATGGGCTATACTTTTATTGCAGCCATTATCCCCGCT TGGATTTTACTTACGCCTCGTGATTACTTATCCATGTTTATGAAAATAGGTACAATTGCTGTTTTAGCAATAGCTGTAGT TGGTGTGCGTCCAGATGTTACGATTCCAGCTCTGACTAATTTTGCACATAATACAGATGGTCCTGCTTTTGCTGGTTCCC TCTTTCCCTTCTTATTTGTTACGATTGCCTGTGGAGCCTTGTCTGGTTTCCATGTAATGATGTCTTCTGGAACAACGCCT CATTTGATTGCTAAAGAGTCACAAACGCGAATGATTGGTTATGGTGGGATGCTCTTTGAATCATTTGTTGCTATTATGGC TTTAGTCGCTGCGATTTCTCTTAATCCTGGAATTTATTATTCTATGAATACCCCTCAAGCTAGTATTCAAAAACTCGCAG CTTCAAGTTATCAAGCAGATAAAAGTGCCGAATATAATGCTGCCAAAGCAATTCCAAATGTAGCCATGATGCCTGATGGT TCAAAACTCAGTATTGACTGGGAAGGAACGACTGGTGAAAAAGCACTTGAGCAAGTGGCAAAAGATGTAGGTGAACAATC AATCGTTTCACGGACTGGTGGTGCACCAACTTTAGCCGTTTCAATGTCAAATATTCTACATAAGGTTCCACTTATTGGTG GGACAAATATGATGGGATTCTGGTATCATTTTGCGATTATGTTTGAGGTGCTCTTTATCCTGTCAGCTGTTTCAGCGGCA ACAAAATCGACTCGTTATTTACTTAATGATGCCCTGCGTGGCTTCAAAAAATTAGGTCGCTTAGGTGATGATGATTGGTT ACCTAGTAAAATTATAACGACAGCAGTGATTGTTGGAGTTTGGGGTGCTTTGCTTTTGATGGGCGTTTCTGATCCGAATG GTGGAATAAAAATCATGTATCCGCTCTTTGGGATTTCTAATCAATTAATTGCGGCGGTAGCTCTGGCTATTGTTTGTGTC ATGGTTATCCGTAAAGGTTATCTTAAATGGGTTTGGATTCCAGCACTTCCTTTAGTTTGGGATGTTTGTGTAACTTTTGC GGCCAGTTGGCAAAAAATCTTTTCAAATGATGTCAATATTGGTTACTTTGCTTCTTATTCAGCAGCAAAAGCCCAAGTGG CTTCTGGTAAATTATCTGGTCTAGCATTAACGAATGCGCAAGCAACCATGCGTAATACAATGATTCAAGGAAGTCTGTCA GTCATTTTCTTACTTTGTGTGGCTATATTATTAGTCATCTGTGCCTTTAAAGTTGCTAAAATTTTAAGAACAAATGAAGT TGGTGATAAATTTAGCTCAGAAGAAGTTTTTGAAGAATCAAATCTTTTTGAAACTTCAAGTTTCTGGCCTAGTAAGCTTG AACATAAGGTTTTAAAAAGTAAAGTTAATGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGATTAAATAGTGCTAAAATATTATTGTAATCGGTTACATTTTTGTTTTAAAAAATATGGAAGGTCAAATGCATTAATAA TTGCATAGGAATAGAGGATT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGGAAAATAAAAGTTACTGACAGGATTTCTGTCAGTAACTTTTTATTTATAATATAATCACTGACTTCAACGTTGAACAG CTGTCAGTAATTTTTTCTAA
Product: carbon starvation protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 784; Mature: 784
Protein sequence:
>784_residues MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA WILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGFWYHFAIMFEVLFILSAVSAA TKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGVWGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCV MVIRKGYLKWVWIPALPLVWDVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKSKVNE
Sequences:
>Translated_784_residues MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA WILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGFWYHFAIMFEVLFILSAVSAA TKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGVWGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCV MVIRKGYLKWVWIPALPLVWDVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKSKVNE >Mature_784_residues MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWVAVALLGGLAWSLIALAQGET INAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPSESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQM GYLPGTIWIIFGVIFAGGVQDMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLSPTALVWWVMGYTFIAAIIPA WILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTNFAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTP HLIAKESQTRMIGYGGMLFESFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGFWYHFAIMFEVLFILSAVSAA TKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGVWGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCV MVIRKGYLKWVWIPALPLVWDVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKSKVNE
Specific function: Peptide Utilization During Carbon Starvation. [C]
COG id: COG1966
COG function: function code T; Carbon starvation protein, predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the CstA family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786814, Length=676, Percent_Identity=46.7455621301775, Blast_Score=614, Evalue=1e-177, Organism=Escherichia coli, GI87082431, Length=714, Percent_Identity=44.3977591036415, Blast_Score=589, Evalue=1e-169,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003706 [H]
Pfam domain/function: PF02554 CstA [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 85325; Mature: 85325
Theoretical pI: Translated: 9.31; Mature: 9.31
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 4.1 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 4.1 %Met (Mature Protein) 5.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWV CCCCCCCCCCCCHHHEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH AVALLGGLAWSLIALAQGETINAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC ESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQMGYLPGTIWIIFGVIFAGGVQ CCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH DMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLS HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEC PTALVWWVMGYTFIAAIIPAWILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH FAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTPHLIAKESQTRMIGYGGMLFE HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEECCCCCEEEECCHHHHH SFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEECCCC SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGF CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH WYHFAIMFEVLFILSAVSAATKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH WGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCVMVIRKGYLKWVWIPALPLVW HHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHH DVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHH VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KVNE HCCC >Mature Secondary Structure MKDIGNSSNFTEEEELFLLRNKQGKIVGIKDLKQANFQETMKDWKKHLPKPSLLSIIIWV CCCCCCCCCCCCHHHEEEEECCCCCEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH AVALLGGLAWSLIALAQGETINAIWFVIAAVCSYLIGYRFYALYIQRKIMRPNDLRATPS HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC ESHNDGKEFDPTNRVVLFGHHFASIAGAGPLVGPVLAAQMGYLPGTIWIIFGVIFAGGVQ CCCCCCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCHH DMLVLWYSHRRRAKSIGAMAHDEVGRFAGGLTSFIVFIMTMIVLAVLALICVTAMANSAW HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH AVFSIGMTIPIALLMGIYLKYIRPGHVNEISAIGFILLLVAIFGGRWVSESSFAHIFMLS HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEC PTALVWWVMGYTFIAAIIPAWILLTPRDYLSMFMKIGTIAVLAIAVVGVRPDVTIPALTN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH FAHNTDGPAFAGSLFPFLFVTIACGALSGFHVMMSSGTTPHLIAKESQTRMIGYGGMLFE HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEECCCCCEEEECCHHHHH SFVAIMALVAAISLNPGIYYSMNTPQASIQKLAASSYQADKSAEYNAAKAIPNVAMMPDG HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCEECCCC SKLSIDWEGTTGEKALEQVAKDVGEQSIVSRTGGAPTLAVSMSNILHKVPLIGGTNMMGF CEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH WYHFAIMFEVLFILSAVSAATKSTRYLLNDALRGFKKLGRLGDDDWLPSKIITTAVIVGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH WGALLLMGVSDPNGGIKIMYPLFGISNQLIAAVALAIVCVMVIRKGYLKWVWIPALPLVW HHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHH DVCVTFAASWQKIFSNDVNIGYFASYSAAKAQVASGKLSGLALTNAQATMRNTMIQGSLS HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHH VIFLLCVAILLVICAFKVAKILRTNEVGDKFSSEEVFEESNLFETSSFWPSKLEHKVLKS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH KVNE HCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9634230; 12218036 [H]