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Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome.
Accession NC_002162
Length 751,719

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Identifier: 13358084

GI number: 13358084

Start: 643446

End: 645281

Strand: Reverse

Name: Not Available

Synonym: UU520

Alternate gene names: NA

Gene position: 645281-643446 (Counterclockwise)

Preceding gene: 13358085

Following gene: 13358083

Centisome position: 85.84

GC content: 25.98

Gene sequence:

>1836_bases
ATGGTGTTTTTATATAAAAGGGGGAGATTTAATTTGGAAGAACAGAAACAAATGAAAGTTATTAAAAAATCCGATTCTTA
TTTTAAAAAAAATCTTACCGTTTTTAGAACACTTTTAGAACTTTTAAAAGAAAGCTCGCCATTTATCGCTGCAAGTGTTT
TTACAGGACTATCATTAATTTTAATTGTTGTAATTGTTGCTCATCATAAAGATATTGGTGCTTATGCAGCAACTAGTATT
AGTTATTTAACTATCTTTCAGTTAAGTTTTTTACAATTAGGAACAACCTTTGGCATTGTTTTTGCGATTTGGTCAAAAAG
ATCATTTAAAGATGGTAAGTATAAGTTTGAACCTACAAATGATACAGTAAATGCTGCTAGTTTTTATTCATTTATCTTTG
GTTTAGTAGTTTTATTAATTTATTTTACAACCTCTTACATTTATAATCATTTTGCAAATGATCACCAAAATACAGTGATT
AATCAAAGTGTAGGTAGTGCATATATTGTTTCAGGATTAGCAGTTGTTGGTTTAGCACCTTTGCGAAACTATTTATTGAT
GTTAATAAGATCAACCAAGTCCATTAATGTTTTATTAGCAATTGTTTTAGATTTTTGTACATGAACAACCGCATTAATTG
CAGCTTTTTTATTAGGTAGTTATAGTGTTTTAAATTATTGGGGCTATGGCCTTGGTATGTCAATTGGTTTTGTTTTTTGA
ACTATTATTATTGGTATGACTACAATTGAAAAAGCCCAAATTGTTTTACGTCCATTATATATTTCAAAAAGATTATTTGT
TTTAAGTATTAAATTATTATGAATTCAAACGATTTTATCATCATTAAAATCAGTTGGTAAAATGTTTATTTTGTTAATTA
CATTTGTGGTAATTAACTCACGTGTAGTTGGTTCATCATTATTAGATTTTCAATCAACGAGAATTCTAATGTACCAATCA
ATGATTTTCATACAAATGTTAAATTTAGGATTGTCAGATTTTTTATTTTATTTATATCAAAAACAAGAAGTCAGAGACTG
TCGTTATCATTCAAGACAATTATTTTTTTGAGTTTTTATATTAGGTATTTTATTTGCTTTAATTACTTCAGTTATTTTTG
GTTTTTCTGTAAAACAATTAGTCCAATTGTATACAAGTGAACAAAGTCCATCTTATATATTTTTAGAAAAGCAAGTTCCC
GAACATTTCTATCAATCTTTAAGAAAAATTTTAATTAATGATGAAAAATTATTAGATATTATTACTAGTCATGTGAATAT
TGGTCGCCAAGAAGTTGTTAATGCTTTATCATCAAATGATAAAAATATTTGATTACCAATGGCGCAAAAAGTGATTGATC
CAATATGAAAACTAGGTGATAAATTTGAAACGATATATCAAATGAAAAATCCTTTTACACATCGATTTGTTGATATTTCA
GCTTCAAATATTTATAGTTATTTAATTAAAAATAATGCTTATATTTTATTATCATTCTTTTGTACATTCTTTTCTTTTTC
TTCTATTTTAAGTCGTTATGTAGGATTAATTGCCCGACGACAACGTCCTCCATATGTAATGATTGTTATTCAATTAGTTA
TGGTTGCGTTTACTTCTGGATTTGGGTTAACACACCAATCAGATCCACATTTCATTGGTTTAATGGCTTGATCATTTCCT
TTATTTATATCAAGTATTTTTATTTTAGGATATAGCACTTATAAAATTTTACGTATTTATCGTAAATATTTAAAGAATCA
TAAGTACAATGATGAAAAATTATCAATTATGCCTAAAAAACAATTAGAACAACAAATTAAGGTTCGTCAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATTTTTAATAGTTGAATCGATGATTATATAAAAATAATTAAAAAATTTTTAATAAATAAAAAAATATAATTTTTAGTA
TATTTTATGATATAATCTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTATTTAATATCCACATATTAAATAATATTTTTATATTAATGGTATAATTTTTAAATGTATTACTTATTTTGAAAAGG
AGAAAATTATGACATCATCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 611; Mature: 611

Protein sequence:

>611_residues
MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSI
SYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVI
NQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTWTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFW
TIIIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLWIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQS
MIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFWVFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVP
EHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNIWLPMAQKVIDPIWKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDIS
ASNIYSYLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMAWSFP
LFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN

Sequences:

>Translated_611_residues
MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSI
SYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVI
NQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF*
TIIIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQS
MIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVP
EHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDIS
ASNIYSYLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFP
LFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN
>Mature_611_residues
MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSI
SYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVI
NQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF*
TIIIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQS
MIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVP
EHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDIS
ASNIYSYLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFP
LFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 69140; Mature: 69140

Theoretical pI: Translated: 10.17; Mature: 10.17

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLI
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTN
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCC
DTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVSGLAVVGLAP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFTI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH
GSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFVFILGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDEKLLDIITSH
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VNIGRQEVVNALSSNDKNILPMAQKVIDPIKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYS
HCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHEEECCHHHHHH
YLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQ
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
SDPHFIGLMASFPLFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIK
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHH
VRQN
CCCC
>Mature Secondary Structure
MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLI
CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTN
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCC
DTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVSGLAVVGLAP
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFTI
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH
GSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFVFILGIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDEKLLDIITSH
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
VNIGRQEVVNALSSNDKNILPMAQKVIDPIKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYS
HCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHEEECCHHHHHH
YLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQ
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
SDPHFIGLMASFPLFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIK
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHH
VRQN
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA