Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
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Accession | NC_002162 |
Length | 751,719 |
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Identifier: 13358084
GI number: 13358084
Start: 643446
End: 645281
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU520
Alternate gene names: NA
Gene position: 645281-643446 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358085
Following gene: 13358083
Centisome position: 85.84
GC content: 25.98
Gene sequence:
>1836_bases ATGGTGTTTTTATATAAAAGGGGGAGATTTAATTTGGAAGAACAGAAACAAATGAAAGTTATTAAAAAATCCGATTCTTA TTTTAAAAAAAATCTTACCGTTTTTAGAACACTTTTAGAACTTTTAAAAGAAAGCTCGCCATTTATCGCTGCAAGTGTTT TTACAGGACTATCATTAATTTTAATTGTTGTAATTGTTGCTCATCATAAAGATATTGGTGCTTATGCAGCAACTAGTATT AGTTATTTAACTATCTTTCAGTTAAGTTTTTTACAATTAGGAACAACCTTTGGCATTGTTTTTGCGATTTGGTCAAAAAG ATCATTTAAAGATGGTAAGTATAAGTTTGAACCTACAAATGATACAGTAAATGCTGCTAGTTTTTATTCATTTATCTTTG GTTTAGTAGTTTTATTAATTTATTTTACAACCTCTTACATTTATAATCATTTTGCAAATGATCACCAAAATACAGTGATT AATCAAAGTGTAGGTAGTGCATATATTGTTTCAGGATTAGCAGTTGTTGGTTTAGCACCTTTGCGAAACTATTTATTGAT GTTAATAAGATCAACCAAGTCCATTAATGTTTTATTAGCAATTGTTTTAGATTTTTGTACATGAACAACCGCATTAATTG CAGCTTTTTTATTAGGTAGTTATAGTGTTTTAAATTATTGGGGCTATGGCCTTGGTATGTCAATTGGTTTTGTTTTTTGA ACTATTATTATTGGTATGACTACAATTGAAAAAGCCCAAATTGTTTTACGTCCATTATATATTTCAAAAAGATTATTTGT TTTAAGTATTAAATTATTATGAATTCAAACGATTTTATCATCATTAAAATCAGTTGGTAAAATGTTTATTTTGTTAATTA CATTTGTGGTAATTAACTCACGTGTAGTTGGTTCATCATTATTAGATTTTCAATCAACGAGAATTCTAATGTACCAATCA ATGATTTTCATACAAATGTTAAATTTAGGATTGTCAGATTTTTTATTTTATTTATATCAAAAACAAGAAGTCAGAGACTG TCGTTATCATTCAAGACAATTATTTTTTTGAGTTTTTATATTAGGTATTTTATTTGCTTTAATTACTTCAGTTATTTTTG GTTTTTCTGTAAAACAATTAGTCCAATTGTATACAAGTGAACAAAGTCCATCTTATATATTTTTAGAAAAGCAAGTTCCC GAACATTTCTATCAATCTTTAAGAAAAATTTTAATTAATGATGAAAAATTATTAGATATTATTACTAGTCATGTGAATAT TGGTCGCCAAGAAGTTGTTAATGCTTTATCATCAAATGATAAAAATATTTGATTACCAATGGCGCAAAAAGTGATTGATC CAATATGAAAACTAGGTGATAAATTTGAAACGATATATCAAATGAAAAATCCTTTTACACATCGATTTGTTGATATTTCA GCTTCAAATATTTATAGTTATTTAATTAAAAATAATGCTTATATTTTATTATCATTCTTTTGTACATTCTTTTCTTTTTC TTCTATTTTAAGTCGTTATGTAGGATTAATTGCCCGACGACAACGTCCTCCATATGTAATGATTGTTATTCAATTAGTTA TGGTTGCGTTTACTTCTGGATTTGGGTTAACACACCAATCAGATCCACATTTCATTGGTTTAATGGCTTGATCATTTCCT TTATTTATATCAAGTATTTTTATTTTAGGATATAGCACTTATAAAATTTTACGTATTTATCGTAAATATTTAAAGAATCA TAAGTACAATGATGAAAAATTATCAATTATGCCTAAAAAACAATTAGAACAACAAATTAAGGTTCGTCAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAATTTTTAATAGTTGAATCGATGATTATATAAAAATAATTAAAAAATTTTTAATAAATAAAAAAATATAATTTTTAGTA TATTTTATGATATAATCTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TATTATTTAATATCCACATATTAAATAATATTTTTATATTAATGGTATAATTTTTAAATGTATTACTTATTTTGAAAAGG AGAAAATTATGACATCATCG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 611; Mature: 611
Protein sequence:
>611_residues MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSI SYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVI NQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTWTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFW TIIIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLWIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQS MIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFWVFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVP EHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNIWLPMAQKVIDPIWKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDIS ASNIYSYLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMAWSFP LFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN
Sequences:
>Translated_611_residues MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSI SYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVI NQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF* TIIIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQS MIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVP EHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDIS ASNIYSYLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFP LFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN >Mature_611_residues MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLILIVVIVAHHKDIGAYAATSI SYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTNDTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVI NQSVGSAYIVSGLAVVGLAPLRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCT*TTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVF* TIIIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLL*IQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVVGSSLLDFQSTRILMYQS MIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFF*VFILGILFALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVP EHFYQSLRKILINDEKLLDIITSHVNIGRQEVVNALSSNDKNI*LPMAQKVIDPI*KLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDIS ASNIYSYLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQSDPHFIGLMA*SFP LFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIKVRQN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69140; Mature: 69140
Theoretical pI: Translated: 10.17; Mature: 10.17
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLI CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTN HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCC DTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVSGLAVVGLAP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH LRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFTI HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH GSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFVFILGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDEKLLDIITSH HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VNIGRQEVVNALSSNDKNILPMAQKVIDPIKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYS HCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHEEECCHHHHHH YLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQ HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC SDPHFIGLMASFPLFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIK CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHH VRQN CCCC >Mature Secondary Structure MVFLYKRGRFNLEEQKQMKVIKKSDSYFKKNLTVFRTLLELLKESSPFIAASVFTGLSLI CEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH LIVVIVAHHKDIGAYAATSISYLTIFQLSFLQLGTTFGIVFAIWSKRSFKDGKYKFEPTN HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCC DTVNAASFYSFIFGLVVLLIYFTTSYIYNHFANDHQNTVINQSVGSAYIVSGLAVVGLAP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH LRNYLLMLIRSTKSINVLLAIVLDFCTTTALIAAFLLGSYSVLNYWGYGLGMSIGFVFTI HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IIGMTTIEKAQIVLRPLYISKRLFVLSIKLLIQTILSSLKSVGKMFILLITFVVINSRVV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHH GSSLLDFQSTRILMYQSMIFIQMLNLGLSDFLFYLYQKQEVRDCRYHSRQLFFVFILGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FALITSVIFGFSVKQLVQLYTSEQSPSYIFLEKQVPEHFYQSLRKILINDEKLLDIITSH HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH VNIGRQEVVNALSSNDKNILPMAQKVIDPIKLGDKFETIYQMKNPFTHRFVDISASNIYS HCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHEEECCHHHHHH YLIKNNAYILLSFFCTFFSFSSILSRYVGLIARRQRPPYVMIVIQLVMVAFTSGFGLTHQ HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC SDPHFIGLMASFPLFISSIFILGYSTYKILRIYRKYLKNHKYNDEKLSIMPKKQLEQQIK CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHH VRQN CCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA