| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13358006
GI number: 13358006
Start: 504656
End: 506542
Strand: Reverse
Name: Not Available
Synonym: UU443
Alternate gene names: NA
Gene position: 506542-504656 (Counterclockwise)
Preceding gene: 13358007
Following gene: 13358005
Centisome position: 67.38
GC content: 19.82
Gene sequence:
>1887_bases ATGAAACACAAAAAATACAAATGAATTTGATTAAAACTAAGTATGATTAGTGCTATACCTTTGTTAGCAACAATAATTAC AGCTTGTGCAAAAGTTGATACAAAACAAAAAGCTAAAGAAGAATTACAATCAAGTTTAAATAAAGCTGTTTTATTAAAAG AAATAGTTGATCAATCATCTTATGAAGATTTTAAAAAGATATATAATCAAACTCTTAAATCAAATTTAGAAAACATTAAT AAATTATCAGAGCAAAAATTAAAACAAGAACAACAAACAATTAAAAATTTAATTACACAAGTTAGTGTTTTAAATGAATT AGATTCAATCAAAAACATGAGTGATTTAATAGATGTTGTTGAATTAGAAAACACTAAAAAACAATTACAAGATTTTTTAA ATCAATATGAAAAATTACTTAATCAAGCAAGTGTTGATACTACAATAATTGATAAACTAAAATCTGATGCTCATCAAAAA AGATTGCACACTAAAGCTTTAATTCAAAAAACAATTTTAGATTTAGCTAATAAAATTAAAAATTTAATTAAAACATCTGG ATCAAATAAAAATATTGTCGAGATTGAAAGTGATATTCAAAAATTAGTTAATAATAACACAAAAGCTAATTTTAAAAAAC TATATGAAGATTTTAAATTAATTTACACTAAATTAAATGATATTAATGATTTAATTAACAAAGAACTAAAAGCTTTACCT TTTATTAAAAAATTAGATGATATTGTTAATGTTATTAATACTATTTACCAACAAAATTATAGTTTTTTATGATTTGATCA ATTAAAATTAACTAATTTAAAACAAAATCTAAACAAGAATATCACTAATATTGTTAATGTTAAAAAATCATTAGATATTG AACAAATTAAATCTTTAACTAATAAATTATTAAATGATTTACAAAATTATTTACAAGGTTTAAATACAATTGCATTAGAT AGTGAAAATAGTATTAATAAATTAATTAGTATTATTCAATCATTAAAACCAGACGATTACAATCCTTACTATAGTATTGA AAAACAACAAAATATCCAAAAAGACAAAAACAATAGTTCAAAAGCTACATATAATGGTTTAGAAAATCAAATTGAAAATT TACAATCAATTATTAGTTTATTTAGCTTTAATACAAATAGCTTAACGATTGATAGTGCAAATAATCTTAATAATGAATTA ACTAAAAAATTTGAAGATGCTAATACTAAAATTAGTTCAATTGTTGATCAAATCAAACAAACAATTCTATCAAACTTTAA AAAAACTTATTTATTCAAAGATTTCATTAAACATCTAAAAGAATTTAATACTAAAGTTAATAGTGAAAATGATCAAGCAA AGAAAACTAATAAAACCCAAACAATTCAAGATGTTTTAAATAGTTATAAAAATGATCCTTGAATAAATACTAAAGTCAGT TTAAAACTTAGTGCAAATCAAACATTAACAATTGATAATCTAGAAAATATTGATTTAGCTTATTCTAATGATTTTTTATT AAAACCAAAAGAGTTAATTAACTATTTAAAATTAGATAATAATCAAGAAAGGGTGTTCACAAAAGATATTGAAAATTTTA GTGTTAAGATTTTTACGATTGTTGATAAAAAATTATATATTCCTGAAGCTAAAGAATTAATTGAAGAAAGTAAGAAAATT ACTGAAACAAAAAATGGAAAAACAAATAACGAATCTAAAGTAGAAAGATTAAAAAAATTTACTAAATTTGTTGAACAAGG AATTAACAATAATAATGTGTCTTCTTATACGTTAGATCTTTATAATAAAAAACTAAAAAAACTAATTGAAGAAGTTAAAA AAATACAAAATGGAACTTCGCAAAAGATTGAAAATAATAGTAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTAATAATGTTAAAATATTTAAACGTTTAATTTGAATAATACTTAAATAACTAAGAAGTTAAGCTAGTAATTGAATAAT TAATTCTTGGAGTTTTAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGCGATTACACAAAACCATTTTTAGATTGTTTTAATAGTATTTATTTAAAAAAGTTATTTTATTTACTAAAAAGTATTA ATTTAAAGGTGTTTTTGCAT
Product: membrane lipoprotein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 628; Mature: 628
Protein sequence:
>628_residues MKHKKYKWIWLKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK RLHTKALIQKTILDLANKIKNLIKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP FIKKLDDIVNVINTIYQQNYSFLWFDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKLLNDLQNYLQGLNTIALD SENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKATYNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNEL TKKFEDANTKISSIVDQIKQTILSNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDPWINTKVS LKLSANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKKLYIPEAKELIEESKKI TETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKKLKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK
Sequences:
>Translated_628_residues MKHKKYK*I*LKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK RLHTKALIQKTILDLANKIKNLIKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP FIKKLDDIVNVINTIYQQNYSFL*FDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKLLNDLQNYLQGLNTIALD SENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKATYNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNEL TKKFEDANTKISSIVDQIKQTILSNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDP*INTKVS LKLSANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKKLYIPEAKELIEESKKI TETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKKLKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK >Mature_628_residues MKHKKYK*I*LKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYEDFKKIYNQTLKSNLENIN KLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVELENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQK RLHTKALIQKTILDLANKIKNLIKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALP FIKKLDDIVNVINTIYQQNYSFL*FDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKLLNDLQNYLQGLNTIALD SENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKATYNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNEL TKKFEDANTKISSIVDQIKQTILSNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDP*INTKVS LKLSANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKKLYIPEAKELIEESKKI TETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKKLKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71937; Mature: 71937
Theoretical pI: Translated: 9.89; Mature: 9.89
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 0.5 %Met (Translated Protein) 0.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 0.5 %Met (Mature Protein) 0.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKHKKYKILKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH DFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLHTKALIQKTILDLANKIKNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPFI HHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKLDDIVNVINTIYQQNYSFLFDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LNDLQNYLQGLNTIALDSENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKAT HHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHH YNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNELTKKFEDANTKISSIVDQIKQTIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH SNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDPINTKVSLKLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEE ANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKK CCCEEEECCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEECCH LYIPEAKELIEESKKITETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKK HCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH LKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MKHKKYKILKLSMISAIPLLATIITACAKVDTKQKAKEELQSSLNKAVLLKEIVDQSSYE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH DFKKIYNQTLKSNLENINKLSEQKLKQEQQTIKNLITQVSVLNELDSIKNMSDLIDVVEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ENTKKQLQDFLNQYEKLLNQASVDTTIIDKLKSDAHQKRLHTKALIQKTILDLANKIKNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IKTSGSNKNIVEIESDIQKLVNNNTKANFKKLYEDFKLIYTKLNDINDLINKELKALPFI HHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KKLDDIVNVINTIYQQNYSFLFDQLKLTNLKQNLNKNITNIVNVKKSLDIEQIKSLTNKL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH LNDLQNYLQGLNTIALDSENSINKLISIIQSLKPDDYNPYYSIEKQQNIQKDKNNSSKAT HHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHH YNGLENQIENLQSIISLFSFNTNSLTIDSANNLNNELTKKFEDANTKISSIVDQIKQTIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH SNFKKTYLFKDFIKHLKEFNTKVNSENDQAKKTNKTQTIQDVLNSYKNDPINTKVSLKLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEE ANQTLTIDNLENIDLAYSNDFLLKPKELINYLKLDNNQERVFTKDIENFSVKIFTIVDKK CCCEEEECCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCEEEEEEEECCH LYIPEAKELIEESKKITETKNGKTNNESKVERLKKFTKFVEQGINNNNVSSYTLDLYNKK HCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHH LKKLIEEVKKIQNGTSQKIENNSK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA