Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_001318 |
Length | 910,724 |
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The map label for this gene is mviN
Identifier: 15595155
GI number: 15595155
Start: 855971
End: 857509
Strand: Direct
Name: mviN
Synonym: BB0810
Alternate gene names: 15595155
Gene position: 855971-857509 (Clockwise)
Preceding gene: 15595154
Following gene: 15595156
Centisome position: 93.99
GC content: 27.1
Gene sequence:
>1539_bases ATGAAGAGGAAAATTTCGATGAATAAATATGTTGTTTCTACAATTTTGGTCATGATTTCCACTTTTTTTTCAAGAATAAT GGGCTTTGTAAAGATAAAGATTTTCTCTTATTATTTTGGTGCAAATCTTGATGCTGATATTTTTAACTATGTTTTCAATA TTCCTAATAATTTGCGCAAAATTCTTTCAGAGGGCGCGATGACCTCGGCTTTTTTGCCTGAATTTACACATGAAAAAAAC AAATCGCACGAAAAAGCTGTTTCTTTTTTCAGAACTGTCATAACCTTTAACATTATTTCTATTGGGTTAATTGTTTTAGT TATGATTATTTTTGCAAAGCCTATTATGTATTTTATATCTTATTATAGGGGAGAAAACTTAATTTTTGCAAGTTCTGTAT TTGGTTATTTGGTATTATATATTTTACTAATAAGCCTATCATCAATCTTCGTGTCTGTTCTAAATTCATATAAAATTTTT TTCATTCCTTCGTTTTCGCCCATTATGCTTTCTTTTGGAATAATATTGAGCATATTCTTATTTTATGGTCGTTTTGGAAT ATATAGTGCTGTTATTGGCGTAATTTTTGGGGGGTTTTTACAATTTTTAATTCCGTTTGCAAATTGCCTTATGATTGGTT TTGCCTGGAAGCCAACATTTTATTTCAGAGAAAAAGTGTTTTTAAATTTTTTAACCAGATGGCTTCGTATGATTTTTGGA TTTTCCATTTCAATTATTACTCAGCAGATTTCATTTGCATTAGCATCTACTCTTGAGATAGGAAGTGTTTCTATCCTTAG TAATGCTGTAGTTTATTATCAGCTTCCTGTAGGAATTTTTTATATTTCTATTGCAACAGTGATTTTCCCCAAAATGGCAG AGCATGCTGTTTTGGGGAATAATATAAAATTAAATGCCCTTTTAGTAGATGGAATTAAAATTTTATTGTTAATTTTTATT CCAGTGTCTTTTTTAATGTTTATTTGGTCTGATTATATTTTAAATTTATTTCTTATGGGAGGCAAGTTTTCTATTTATGA TACTCAAAAAACAGCGAGTGTTTTGAAATGTTTTCTTTTAGGTCTGCTTTTTTATTCAATGTTTGGTTTTTTCCAAAAAT ATTATTTTTCTATTCGTGATGCAAAAACACCGTTTTATTTGAGTGTTTTATTTTCTATTCTTGATATTGCAATATCTGTT TTTGGTATTAATTATTATGGTTTGAACGCTTTAGCATTAGCTCAATCTATTTCTTTTATGATTTGTGTAATTGTTTTTTA TTTTATAATATTGAAAAGAGGAGTTAAAATTGATTTAATTGAAATTTTATTTGTTCTTTTAAAGTCAATTATTACACTTT TTCCTTTATATGCAATTTATTTCTTTTTTGAAAAGTTTCAGTGGGATGTGGGGTTTAGTTTTAAAAATCTTTATTTTTTA ATGGCAGCTGGAATTGTTAGTATTTTTGTTTTGTTTATTTGTTATTCTGTTTTAGGAATAAATAAGCTTTTTAGATATAT TAGAAGGGATGCTTTATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAACATAATATCCACTATATGTTTCGATTGATTTCAAAGATCAGAGCCGCAATTCTAAATGATGATTTTTTAAATTTTAG AACTTCATATTTAAAAAAGT
Downstream 100 bases:
>100_bases AATACTTTTATTTTTTATTTTTTTTACTTATTTTTAATGTGTATGCTCAAAATGTTAATTCTCCAGCTCTTCCTAGTCCG CCTTTGTTGCCCGAAATTAC
Product: virulence factor mviN protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 512; Mature: 512
Protein sequence:
>512_residues MKRKISMNKYVVSTILVMISTFFSRIMGFVKIKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGAMTSAFLPEFTHEKN KSHEKAVSFFRTVITFNIISIGLIVLVMIIFAKPIMYFISYYRGENLIFASSVFGYLVLYILLISLSSIFVSVLNSYKIF FIPSFSPIMLSFGIILSIFLFYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFANCLMIGFAWKPTFYFREKVFLNFLTRWLRMIFG FSISIITQQISFALASTLEIGSVSILSNAVVYYQLPVGIFYISIATVIFPKMAEHAVLGNNIKLNALLVDGIKILLLIFI PVSFLMFIWSDYILNLFLMGGKFSIYDTQKTASVLKCFLLGLLFYSMFGFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDIAISV FGINYYGLNALALAQSISFMICVIVFYFIILKRGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYAIYFFFEKFQWDVGFSFKNLYFL MAAGIVSIFVLFICYSVLGINKLFRYIRRDAL
Sequences:
>Translated_512_residues MKRKISMNKYVVSTILVMISTFFSRIMGFVKIKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGAMTSAFLPEFTHEKN KSHEKAVSFFRTVITFNIISIGLIVLVMIIFAKPIMYFISYYRGENLIFASSVFGYLVLYILLISLSSIFVSVLNSYKIF FIPSFSPIMLSFGIILSIFLFYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFANCLMIGFAWKPTFYFREKVFLNFLTRWLRMIFG FSISIITQQISFALASTLEIGSVSILSNAVVYYQLPVGIFYISIATVIFPKMAEHAVLGNNIKLNALLVDGIKILLLIFI PVSFLMFIWSDYILNLFLMGGKFSIYDTQKTASVLKCFLLGLLFYSMFGFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDIAISV FGINYYGLNALALAQSISFMICVIVFYFIILKRGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYAIYFFFEKFQWDVGFSFKNLYFL MAAGIVSIFVLFICYSVLGINKLFRYIRRDAL >Mature_512_residues MKRKISMNKYVVSTILVMISTFFSRIMGFVKIKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGAMTSAFLPEFTHEKN KSHEKAVSFFRTVITFNIISIGLIVLVMIIFAKPIMYFISYYRGENLIFASSVFGYLVLYILLISLSSIFVSVLNSYKIF FIPSFSPIMLSFGIILSIFLFYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFANCLMIGFAWKPTFYFREKVFLNFLTRWLRMIFG FSISIITQQISFALASTLEIGSVSILSNAVVYYQLPVGIFYISIATVIFPKMAEHAVLGNNIKLNALLVDGIKILLLIFI PVSFLMFIWSDYILNLFLMGGKFSIYDTQKTASVLKCFLLGLLFYSMFGFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDIAISV FGINYYGLNALALAQSISFMICVIVFYFIILKRGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYAIYFFFEKFQWDVGFSFKNLYFL MAAGIVSIFVLFICYSVLGINKLFRYIRRDAL
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=382, Percent_Identity=27.4869109947644, Blast_Score=137, Evalue=1e-33,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): MVIN_BORBU (O51750)
Other databases:
- EMBL: AE000783 - PIR: A70201 - RefSeq: NP_212944.1 - EnsemblBacteria: EBBORT00000008868 - GeneID: 1195668 - GenomeReviews: AE000783_GR - KEGG: bbu:BB0810 - NMPDR: fig|224326.1.peg.1194 - TIGR: BB_0810 - GeneTree: EBGT00050000006828 - HOGENOM: HBG354511 - OMA: VITFNII - PhylomeDB: O51750 - ProtClustDB: CLSK507854 - BioCyc: BBUR224326:BB_0810-MONOMER - InterPro: IPR004268 - PRINTS: PR01806 - TIGRFAMs: TIGR01695
Pfam domain/function: PF03023 MVIN
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58904; Mature: 58904
Theoretical pI: Translated: 9.97; Mature: 9.97
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
HASH(0xd7220ec)-; HASH(0xd6cba58)-; HASH(0xd6d99d0)-; HASH(0xc8427e4)-; HASH(0xd1a02c0)-; HASH(0xd0384d0)-; HASH(0xc8cad0c)-; HASH(0xd7e9b4c)-; HASH(0xd5ab9e8)-; HASH(0xcd1f1e8)-; HASH(0xd6aa950)-; HASH(0xc9c9c98)-; HASH(0xd1f9be8)-; HASH(0xc6bfa14)-;
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.1 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRKISMNKYVVSTILVMISTFFSRIMGFVKIKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRK CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH ILSEGAMTSAFLPEFTHEKNKSHEKAVSFFRTVITFNIISIGLIVLVMIIFAKPIMYFIS HHHCCCHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YYRGENLIFASSVFGYLVLYILLISLSSIFVSVLNSYKIFFIPSFSPIMLSFGIILSIFL HHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH FYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFANCLMIGFAWKPTFYFREKVFLNFLTRWLRMIFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC FSISIITQQISFALASTLEIGSVSILSNAVVYYQLPVGIFYISIATVIFPKMAEHAVLGN CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NIKLNALLVDGIKILLLIFIPVSFLMFIWSDYILNLFLMGGKFSIYDTQKTASVLKCFLL CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH GLLFYSMFGFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDIAISVFGINYYGLNALALAQSISFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHHHHHHHHH ICVIVFYFIILKRGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYAIYFFFEKFQWDVGFSFKNLYFL HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH MAAGIVSIFVLFICYSVLGINKLFRYIRRDAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH >Mature Secondary Structure MKRKISMNKYVVSTILVMISTFFSRIMGFVKIKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRK CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH ILSEGAMTSAFLPEFTHEKNKSHEKAVSFFRTVITFNIISIGLIVLVMIIFAKPIMYFIS HHHCCCHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YYRGENLIFASSVFGYLVLYILLISLSSIFVSVLNSYKIFFIPSFSPIMLSFGIILSIFL HHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH FYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFANCLMIGFAWKPTFYFREKVFLNFLTRWLRMIFG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC FSISIITQQISFALASTLEIGSVSILSNAVVYYQLPVGIFYISIATVIFPKMAEHAVLGN CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NIKLNALLVDGIKILLLIFIPVSFLMFIWSDYILNLFLMGGKFSIYDTQKTASVLKCFLL CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH GLLFYSMFGFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDIAISVFGINYYGLNALALAQSISFM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHHHHHHHHH ICVIVFYFIILKRGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYAIYFFFEKFQWDVGFSFKNLYFL HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH MAAGIVSIFVLFICYSVLGINKLFRYIRRDAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9403685