Definition Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome.
Accession NC_007969
Length 3,059,876

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The map label for this gene is 93006755

Identifier: 93006755

GI number: 93006755

Start: 2382594

End: 2383976

Strand: Direct

Name: 93006755

Synonym: Pcryo_1931

Alternate gene names: NA

Gene position: 2382594-2383976 (Clockwise)

Preceding gene: 93006754

Following gene: 93006756

Centisome position: 77.87

GC content: 43.67

Gene sequence:

>1383_bases
ATGACCAAGCAAGATACCCTACAACTAGAGAAAACTGAGCAAGTTGTTAACACCGTGTCCGATACGACAACGCCAGAGAC
ATTACTGTCAAAACCCATTGCACTACTGCAATTGACTGTCTTCAGTATGATCGGTTTGGTGATGTTTTTTGTGCCATTTA
CCATTGGTGAAAAAAGTACAATTTTGTTCGACCATGGTGCAACTTATCTGGTCAATCAGCAACATACTTTATCTGTAACT
TTGTTATTTATGCTGATGATATTTGGAGTAAGTAAACCGTTTATTGATGGTTCATGGCGCAAAAACATCACCCATAAAAT
CCTAACTGTCTTTAAAGTACTGGGACTGGTATTAGCTGTGATGTATATCACTGGTAACGCTCCAGCCTTTATGATGGAAA
AGGATATGCTGCCATTTTTATTTGAAAAACTGGCGCTACCCGTTGGTATGATTGTGCCGCTTGGGGCTTTGATTCTGGCG
TTTTTAGTGGGTTTTGGTTTGCTTGAGATGGTTGGCGTGCTGATGCAGCCGATTATGAAACCTATCTGGAAAACGCCGGG
TGCATCAGCGATTGATGCAGTTGCCTCTTTTGTTGGCAGTTATTCGATTGGGCTGTTAATTACCAATCGTGTGTATCTGC
AAAAGCAATATTCTGCGCGTGAAGCCATTATCATTGCGACCGGTTTTTCGACTGTATCAGCCGCGTTTATGGTAATTGTT
GCCAAAACACTGGGATTGATGGAATTTTGGAATCTGTTTTTTTGGTCAACGCTAGTGATTACCTTTATTGTCACCGCTAT
CACTGCCCGTATTCCACCAATTAGTCAGTTTGATAATGAGGTTGAGCGTCCAAATTTAGACTACAAAAGAGGCACGCGTC
TAAAAGCGGCATATGAGCTAGGTTTGTCTACGTCACGCCGTGCATCAGATTTTAAACAGATTCTATGGACCAACTTTCGT
GATGGCTTGACAATGGCAGCCGCTATTGTGCCCTCTATTATCGCCGTTGGACTCACTGGTTTATTATTGGCCAAGTACAC
GCCAGTATTTGACGCTTTAGGTTTACTGCTTTACCCCTTTACCTGGTTGGGCGGTTTGCCAGAGCCGCTCGTCGCTGCCA
AAGGCATGTCTGCGGGATTGGCTGAGATGTTCTTGCCCGCATTATTGCTCAGTGAAGCGGATATGTTGACCCGTTATGTC
GCAGGCGTCATCTCTATTAGCAGTGTGCTGTTCTTTTCTGCCATGATTCCTTGTGTCCTAGCAACTGAGATTCCTATCTC
TGTTGGAAAAATGGTCATCGTTTGGTTCCAGCGTGTAGCACTTAGTATCTTACTGGCAGCAGCTTTTGGACATTTGGCAA
TGTCTTTTGGTTGGATAAGTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGGCGATTAAAACTGCTAAGGATTACGGTCTAAATCTTCCTATGATTAAGTAATTCTCCATAGACACATAGATTACATG
ATTTTATCAAGGAAGATAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATAGATTGCACCTATTAATACAAGCACAACATCAATACCCCACCATATTATAAATACAGCTAATAACATTTAACACTAG
GATTACCATCATGACTGCTA

Product: nucleoside recognition

Products: NA

Alternate protein names: ORF A [H]

Number of amino acids: Translated: 460; Mature: 459

Protein sequence:

>460_residues
MTKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKSTILFDHGATYLVNQQHTLSVT
LLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAVMYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILA
FLVGFGLLEMVGVLMQPIMKPIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV
AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYELGLSTSRRASDFKQILWTNFR
DGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPFTWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYV
AGVISISSVLFFSAMIPCVLATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS

Sequences:

>Translated_460_residues
MTKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKSTILFDHGATYLVNQQHTLSVT
LLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAVMYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILA
FLVGFGLLEMVGVLMQPIMKPIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV
AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYELGLSTSRRASDFKQILWTNFR
DGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPFTWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYV
AGVISISSVLFFSAMIPCVLATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS
>Mature_459_residues
TKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKSTILFDHGATYLVNQQHTLSVTL
LFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAVMYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILAF
LVGFGLLEMVGVLMQPIMKPIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIVA
KTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYELGLSTSRRASDFKQILWTNFRD
GLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPFTWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYVA
GVISISSVLFFSAMIPCVLATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS

Specific function: Unknown

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50358; Mature: 50227

Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.8 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.6 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKST
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
ILFDHGATYLVNQQHTLSVTLLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAV
EEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILAFLVGFGLLEMVGVLMQPIMK
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH
AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
GLSTSRRASDFKQILWTNFRDGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYVAGVISISSVLFFSAMIPCVL
HHHCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
TKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKST
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
ILFDHGATYLVNQQHTLSVTLLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAV
EEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILAFLVGFGLLEMVGVLMQPIMK
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH
AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
GLSTSRRASDFKQILWTNFRDGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPF
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYVAGVISISSVLFFSAMIPCVL
HHHCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA