Definition | Psychrobacter cryohalolentis K5 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007969 |
Length | 3,059,876 |
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The map label for this gene is 93006755
Identifier: 93006755
GI number: 93006755
Start: 2382594
End: 2383976
Strand: Direct
Name: 93006755
Synonym: Pcryo_1931
Alternate gene names: NA
Gene position: 2382594-2383976 (Clockwise)
Preceding gene: 93006754
Following gene: 93006756
Centisome position: 77.87
GC content: 43.67
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTGGCGATTAAAACTGCTAAGGATTACGGTCTAAATCTTCCTATGATTAAGTAATTCTCCATAGACACATAGATTACATG ATTTTATCAAGGAAGATAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GATAGATTGCACCTATTAATACAAGCACAACATCAATACCCCACCATATTATAAATACAGCTAATAACATTTAACACTAG GATTACCATCATGACTGCTA
Product: nucleoside recognition
Products: NA
Alternate protein names: ORF A [H]
Number of amino acids: Translated: 460; Mature: 459
Protein sequence:
>460_residues MTKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKSTILFDHGATYLVNQQHTLSVT LLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAVMYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILA FLVGFGLLEMVGVLMQPIMKPIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYELGLSTSRRASDFKQILWTNFR DGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPFTWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYV AGVISISSVLFFSAMIPCVLATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS
Sequences:
>Translated_460_residues MTKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKSTILFDHGATYLVNQQHTLSVT LLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAVMYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILA FLVGFGLLEMVGVLMQPIMKPIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYELGLSTSRRASDFKQILWTNFR DGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPFTWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYV AGVISISSVLFFSAMIPCVLATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS >Mature_459_residues TKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKSTILFDHGATYLVNQQHTLSVTL LFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAVMYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILAF LVGFGLLEMVGVLMQPIMKPIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIVA KTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYELGLSTSRRASDFKQILWTNFRD GLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPFTWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYVA GVISISSVLFFSAMIPCVLATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS
Specific function: Unknown
COG id: COG3314
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR011642 [H]
Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50358; Mature: 50227
Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 4.8 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 4.6 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKST CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE ILFDHGATYLVNQQHTLSVTLLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAV EEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILAFLVGFGLLEMVGVLMQPIMK HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV HHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH GLSTSRRASDFKQILWTNFRDGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPF CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYVAGVISISSVLFFSAMIPCVL HHHCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure TKQDTLQLEKTEQVVNTVSDTTTPETLLSKPIALLQLTVFSMIGLVMFFVPFTIGEKST CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCE ILFDHGATYLVNQQHTLSVTLLFMLMIFGVSKPFIDGSWRKNITHKILTVFKVLGLVLAV EEEECCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MYITGNAPAFMMEKDMLPFLFEKLALPVGMIVPLGALILAFLVGFGLLEMVGVLMQPIMK HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PIWKTPGASAIDAVASFVGSYSIGLLITNRVYLQKQYSAREAIIIATGFSTVSAAFMVIV HHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHEEHHHHHHHHHCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHH AKTLGLMEFWNLFFWSTLVITFIVTAITARIPPISQFDNEVERPNLDYKRGTRLKAAYEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH GLSTSRRASDFKQILWTNFRDGLTMAAAIVPSIIAVGLTGLLLAKYTPVFDALGLLLYPF CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TWLGGLPEPLVAAKGMSAGLAEMFLPALLLSEADMLTRYVAGVISISSVLFFSAMIPCVL HHHCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ATEIPISVGKMVIVWFQRVALSILLAAAFGHLAMSFGWIS HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA