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The map label for this gene is panF [H]

Identifier: 93006428

GI number: 93006428

Start: 1967118

End: 1968788

Strand: Direct

Name: panF [H]

Synonym: Pcryo_1604

Alternate gene names: 93006428

Gene position: 1967118-1968788 (Clockwise)

Preceding gene: 93006427

Following gene: 93006429

Centisome position: 64.29

GC content: 44.28

Gene sequence:

>1671_bases
TTGAAAACTGAGTCATTGTTCCAATTTTCAGCATTAACCATCATTTTGCTATTACTGGCATTTTATGGTGGTACTTATCT
GCTGTCTTTATTAATAAAAAAAGATAAGGAGACGACCTCAGGTTTTATGGTCGCCGGTCACAACGTCGGTTTTGGTATGG
GCGCTGCTAGTATGACCGCTACTTGGATCTGGGCAGCGTCATTTTATGCAGCTGCCACATCCGGCTATAAATATGGCGTC
TCAGGACCGTTACATTATGGTTTTTGGGGTGCCTTGATGATTTTATTCATCTACCCTTTTGGGATGCGATTTCGTGAACT
TGCCCCTAATGGACATACCTTGGGTGAACTTATTCACGCCCGCCACGGCTCATCAAGCCAATTAATTTTAGCCATATCTA
ACCTTATGGGCAGCTTAATTAGCTTGATGGTCAATTTCACCGCTGCTGGCGCATTGGTATCAGTATTATCACCTTTGTCA
TTCCAAACAGGGGTGATTATCGCTGGCGTCGGAGTGCTAAGCTATACCTTAACTTCTGGATTTCGTGCTTCAGTGTTCAC
CGATTTTGCCCAATTGGTCGCGTTAATGGCGATTGGTGTCATCATTATCCCAGCGGTACTGTTTTCCATGGGTGGTCCTT
CTGCCATGGTAAGCGGACTTTCAAATCTAACCTTGCAGCAACAAGACTTCTTTTCATCTGAAGCCTTTTTTCAGCAAGGT
GCGCCCTATTTTGTCGCAGTATTGGCTTATGCCATCGGCAATCAAACCATTACCCAACGTCTATTTGCCATTGATAAAAG
CAAAATTAAAGCAACCTTTATTACTGCTACTGTCGGATATGCCGGTATTGTAATTGGTCTCGGCATGATTGGACTTATGG
CATTAACCATAGGTATTGAGCCGCTCAATGGCAATATGAATAATTTGATTCCGCAAATGGTCAGCACGTATCTACATCCG
GTATTCATCGCCTTATTCTTTATCTTGGTTATTGGTGCCCTGTCCTCAACGGCTGATTCAGATTTATCAGCACTATCTAC
CATTATGATGGCTGACATCTATGGCAAGAATATTGCCAAAAAAGGCGGCGTAAACCCAAAAACCATGATGCTTGTCGGTC
GGGGAACCATGATTGTCGCTACGGCTGCCGGATTGATTTTTGCCAGCTTTAAGCTTGATATTCTCGTGATGTTAGTCTTT
GTCGGTGCGTTATGGGGTGCGATTGTATTTCCAGTGATTGCCAGTGTGTTCTGGAATCGCGTGACAAACACTGCCTTTAC
CTCAGCCGTCATCGTCGGATTATTGTTATTCTGTATCGCTCGCTTTGAGCTCATACCTATCATTGGTGTTACGGCGCTAT
TTTTTGAAGTATTGGCAAGCGTTGGTGCTGCTGTGGTGATTGGCCTCATGGTATTTGGCTTTTTAGGTCGAAAAATGGCT
GTGGCAGCTGCTGCCCTTACACTGATACTGATGCTGATATTTGCCACTGGTTTCTTACGTCAATATATGGTGCTGCTTGC
ATCACTGACCGCTTATGGTGCCAGTACAATCGTCTGCGTCATTATCAGCCTTATGAGCAACGAGCATTTTGACTTTGATC
TTATTAAACAGCGCGTTGGCGACTATGACAATAAACCCAACATACCGCCGACCACCAACGTTCAAAACTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTGACCTATAGGCTGAATAGGTCGTTTTTGCATACCTCATAGTCTAGGAGAATACGTTTTAATCTATATTTTACTTAT
AACAATTGCGAGGTAGGAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTATATCTTATCGACGTTTTGATGAATTTTTTAATGGCTTGATGTATTCATCATTCATTTTTAATACCTAAAATAAAG
GAGTTAATATGGAAACCACG

Product: Na+/solute symporter

Products: Na (I) [Cytoplasm]; pantothenate [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: Pantothenate permease [H]

Number of amino acids: Translated: 556; Mature: 556

Protein sequence:

>556_residues
MKTESLFQFSALTIILLLLAFYGGTYLLSLLIKKDKETTSGFMVAGHNVGFGMGAASMTATWIWAASFYAAATSGYKYGV
SGPLHYGFWGALMILFIYPFGMRFRELAPNGHTLGELIHARHGSSSQLILAISNLMGSLISLMVNFTAAGALVSVLSPLS
FQTGVIIAGVGVLSYTLTSGFRASVFTDFAQLVALMAIGVIIIPAVLFSMGGPSAMVSGLSNLTLQQQDFFSSEAFFQQG
APYFVAVLAYAIGNQTITQRLFAIDKSKIKATFITATVGYAGIVIGLGMIGLMALTIGIEPLNGNMNNLIPQMVSTYLHP
VFIALFFILVIGALSSTADSDLSALSTIMMADIYGKNIAKKGGVNPKTMMLVGRGTMIVATAAGLIFASFKLDILVMLVF
VGALWGAIVFPVIASVFWNRVTNTAFTSAVIVGLLLFCIARFELIPIIGVTALFFEVLASVGAAVVIGLMVFGFLGRKMA
VAAAALTLILMLIFATGFLRQYMVLLASLTAYGASTIVCVIISLMSNEHFDFDLIKQRVGDYDNKPNIPPTTNVQN

Sequences:

>Translated_556_residues
MKTESLFQFSALTIILLLLAFYGGTYLLSLLIKKDKETTSGFMVAGHNVGFGMGAASMTATWIWAASFYAAATSGYKYGV
SGPLHYGFWGALMILFIYPFGMRFRELAPNGHTLGELIHARHGSSSQLILAISNLMGSLISLMVNFTAAGALVSVLSPLS
FQTGVIIAGVGVLSYTLTSGFRASVFTDFAQLVALMAIGVIIIPAVLFSMGGPSAMVSGLSNLTLQQQDFFSSEAFFQQG
APYFVAVLAYAIGNQTITQRLFAIDKSKIKATFITATVGYAGIVIGLGMIGLMALTIGIEPLNGNMNNLIPQMVSTYLHP
VFIALFFILVIGALSSTADSDLSALSTIMMADIYGKNIAKKGGVNPKTMMLVGRGTMIVATAAGLIFASFKLDILVMLVF
VGALWGAIVFPVIASVFWNRVTNTAFTSAVIVGLLLFCIARFELIPIIGVTALFFEVLASVGAAVVIGLMVFGFLGRKMA
VAAAALTLILMLIFATGFLRQYMVLLASLTAYGASTIVCVIISLMSNEHFDFDLIKQRVGDYDNKPNIPPTTNVQN
>Mature_556_residues
MKTESLFQFSALTIILLLLAFYGGTYLLSLLIKKDKETTSGFMVAGHNVGFGMGAASMTATWIWAASFYAAATSGYKYGV
SGPLHYGFWGALMILFIYPFGMRFRELAPNGHTLGELIHARHGSSSQLILAISNLMGSLISLMVNFTAAGALVSVLSPLS
FQTGVIIAGVGVLSYTLTSGFRASVFTDFAQLVALMAIGVIIIPAVLFSMGGPSAMVSGLSNLTLQQQDFFSSEAFFQQG
APYFVAVLAYAIGNQTITQRLFAIDKSKIKATFITATVGYAGIVIGLGMIGLMALTIGIEPLNGNMNNLIPQMVSTYLHP
VFIALFFILVIGALSSTADSDLSALSTIMMADIYGKNIAKKGGVNPKTMMLVGRGTMIVATAAGLIFASFKLDILVMLVF
VGALWGAIVFPVIASVFWNRVTNTAFTSAVIVGLLLFCIARFELIPIIGVTALFFEVLASVGAAVVIGLMVFGFLGRKMA
VAAAALTLILMLIFATGFLRQYMVLLASLTAYGASTIVCVIISLMSNEHFDFDLIKQRVGDYDNKPNIPPTTNVQN

Specific function: Catalyzes the sodium-dependent uptake of extracellular pantothenate [H]

COG id: COG0591

COG function: function code ER; Na+/proline symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:solute symporter (SSF) (TC 2.A.21) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87082237, Length=450, Percent_Identity=25.1111111111111, Blast_Score=80, Evalue=4e-16,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6321771, Length=211, Percent_Identity=29.8578199052133, Blast_Score=73, Evalue=1e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011849
- InterPro:   IPR001734
- InterPro:   IPR018212
- InterPro:   IPR019900 [H]

Pfam domain/function: PF00474 SSF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59199; Mature: 59199

Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41

Prosite motif: PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.7 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.7 %Met     (Mature Protein)
5.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKTESLFQFSALTIILLLLAFYGGTYLLSLLIKKDKETTSGFMVAGHNVGFGMGAASMTA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHH
TWIWAASFYAAATSGYKYGVSGPLHYGFWGALMILFIYPFGMRFRELAPNGHTLGELIHA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHH
RHGSSSQLILAISNLMGSLISLMVNFTAAGALVSVLSPLSFQTGVIIAGVGVLSYTLTSG
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCC
FRASVFTDFAQLVALMAIGVIIIPAVLFSMGGPSAMVSGLSNLTLQQQDFFSSEAFFQQG
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC
APYFVAVLAYAIGNQTITQRLFAIDKSKIKATFITATVGYAGIVIGLGMIGLMALTIGIE
CHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLNGNMNNLIPQMVSTYLHPVFIALFFILVIGALSSTADSDLSALSTIMMADIYGKNIAK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHH
KGGVNPKTMMLVGRGTMIVATAAGLIFASFKLDILVMLVFVGALWGAIVFPVIASVFWNR
CCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTNTAFTSAVIVGLLLFCIARFELIPIIGVTALFFEVLASVGAAVVIGLMVFGFLGRKMA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VAAAALTLILMLIFATGFLRQYMVLLASLTAYGASTIVCVIISLMSNEHFDFDLIKQRVG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHC
DYDNKPNIPPTTNVQN
CCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; pantothenate [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + pantothenate [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + pantothenate [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2193919; 9278503; 8226664 [H]