Definition | Methanosphaera stadtmanae DSM 3091 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007681 |
Length | 1,767,403 |
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The map label for this gene is 84489424
Identifier: 84489424
GI number: 84489424
Start: 719072
End: 720880
Strand: Direct
Name: 84489424
Synonym: Msp_0615
Alternate gene names: NA
Gene position: 719072-720880 (Clockwise)
Preceding gene: 84489423
Following gene: 84489425
Centisome position: 40.69
GC content: 25.21
Gene sequence:
>1809_bases ATGATAAATAGTTTTAAAAAAGTTATTAAAGATAATAAAATAGAATTATTCTACATTACATTTCTAATAATTTCTCTACT AGTTATTAGTATTCCTAGATTATTTACACAATACTCTATAGGAATTGGTAATTGGGATACGTATCTTTATTTAGAAAATG CTCGTAGTTTTGCTAGTATGGGATGGGGTGATGTTGCTAGTATTTCACCTGTTGTTCCATATATATTATCATTATTCTTT AGAATAATAAATAGTACACCTCAAGAGGCAATATTTAATCTAAGTGTATTGATGTACATAGTAGGAACTGTTAGTTTATA TTTAATATTTAGATTCAAGTTTAATCATATGATAAGTTATGTTGGAAGTATAATTTATGCAACATTTACCCTACTTTATT CATGGGTTGCCATTGGAGGTAATGATATAACAGGTGTTTCATTAACATTACTTACAATATATCTTATATTATTAGCACAT GAAAAAAACAATAAATACTATTATATTGCCATGCCAATAGCGGCATTTGCATTTTTATCAAGATACACAGCAGGAGTAAT GATTTTTGCAATAATCTTTTATTTATTAATTAATAAAATAAGTAAAAATGAATTTAAAACCTTCATTAAAGGTAGTGTTC TTGGAGTATTATGTGTTAGTCCATTTCTGTATCATTTCTATAGAATTTTATCCACACCTTTTCCATTTCTGGGACAATTT AGTGGTACTGTAAATAATACAAAAGTTCTTGATGCAGGATATCTTCCAGATACAATGTATTATATTAAACATATACCTAA CTACATTACAAGTTATATACCACATACTGGTGCTACCTTTGAAAATGTAGTAAATCCTATGGGTAACATTCCATCTGTTA TAAGCTATGTTTTTATAATATTATGTATAATTGGAATTTTTTTAATATTCTACAATAGTTATAAATATGTAATTAAAAGT AATAGAAGACTTTTAACAGGAAATAATCAAATCAATATAATAATAGCACTAATACTTACAATAATATGTCTTATTAGTAT TAACAGTGTATCATATATCATTACAACAATACTTACACTTTCAGTATTATACATAATAAAGCATATACTGGAGGATTATG ATATTTGGTACTTAAATTATGATTTATTGATGTTATCCTTGCTACTGGTTTATATAATATTCCAATCAATACTCTCTACT AAAAATGATCGTTACTTTATCACAGTATTACCATTTATAGCATACTTCATTACAAATGCCCTATATTATATCTATAATTT CATTGACTTTAAAATTGAAATAAAAAATATTAAAATATCAACAATAATATCTATAGTGATTGTATTGTTCCTTCTTGGAA ATTCATTATGTTATAATAATAATATTCCAGAAGAAAATCATTTTAATAACATTCAACAGGCATGTAAATGGTTTGATGAT AATTGTGAATTTGATAATACAACAGTAATTTATTCTGATAATTGGCCTGCAGTATCATGGTATTTGAATGTGTATTGTCG TAGAGGTGTTCCTGATGTTACTATGGAAAATACTACATGGACATTTACTAAGAATATATTAAAAAGTAATGATGAGCATG AACCTGCATCATTTTATATTGATACAAATAATGAAAATAAGATGGATTATGTTGGACTTAGTAAGATTAAAAGTATTAAT GATGTGCAAATCTATCAAAATACCTATGAAAAGGAATATAACATACGAAGTCGTGGTTTACTAGAATATAAAGATTATTA TAACATGCTATTTAAAGAACATATGAATGAAAGTGATTATTATGATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CATATTAAAAAATATAATTTCAATTAGAAACATATGTATAATATAATAAAAAAGAAAAATGTCTTTTGACATTTTAATAA TTTTTTAGGAGTTTATCTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAACTTTAATTTAAAAAATAAATTATTGATTTTACTTATTATAATATCAAGTATATATACAGCAATTCTAGTACATATTC AATCAATTATTGGTGTTAGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 602; Mature: 602
Protein sequence:
>602_residues MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASMGWGDVASISPVVPYILSLFF RIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISYVGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAH EKNNKYYYIAMPIAAFAFLSRYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFIILCIIGIFLIFYNSYKYVIKS NRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTLSVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILST KNDRYFITVLPFIAYFITNALYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYIDTNNENKMDYVGLSKIKSIN DVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDYYD
Sequences:
>Translated_602_residues MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASMGWGDVASISPVVPYILSLFF RIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISYVGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAH EKNNKYYYIAMPIAAFAFLSRYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFIILCIIGIFLIFYNSYKYVIKS NRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTLSVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILST KNDRYFITVLPFIAYFITNALYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYIDTNNENKMDYVGLSKIKSIN DVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDYYD >Mature_602_residues MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASMGWGDVASISPVVPYILSLFF RIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISYVGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAH EKNNKYYYIAMPIAAFAFLSRYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFIILCIIGIFLIFYNSYKYVIKS NRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTLSVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILST KNDRYFITVLPFIAYFITNALYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYIDTNNENKMDYVGLSKIKSIN DVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDYYD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70035; Mature: 70035
Theoretical pI: Translated: 7.22; Mature: 7.22
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 3.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASM CCCHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHC GWGDVASISPVVPYILSLFFRIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISY CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAHEKNNKYYYIAMPIAAFAFLS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHH RYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCC SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFII CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LCIIGIFLIFYNSYKYVIKSNRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTL HHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH SVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILSTKNDRYFITVLPFIAYFITNA HHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH LYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD HHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYI CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE DTNNENKMDYVGLSKIKSINDVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDY ECCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC YD CC >Mature Secondary Structure MINSFKKVIKDNKIELFYITFLIISLLVISIPRLFTQYSIGIGNWDTYLYLENARSFASM CCCHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHC GWGDVASISPVVPYILSLFFRIINSTPQEAIFNLSVLMYIVGTVSLYLIFRFKFNHMISY CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGSIIYATFTLLYSWVAIGGNDITGVSLTLLTIYLILLAHEKNNKYYYIAMPIAAFAFLS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEHHHHHHHHH RYTAGVMIFAIIFYLLINKISKNEFKTFIKGSVLGVLCVSPFLYHFYRILSTPFPFLGQF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCC SGTVNNTKVLDAGYLPDTMYYIKHIPNYITSYIPHTGATFENVVNPMGNIPSVISYVFII CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH LCIIGIFLIFYNSYKYVIKSNRRLLTGNNQINIIIALILTIICLISINSVSYIITTILTL HHHHHHHHHHHCCHHEEEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH SVLYIIKHILEDYDIWYLNYDLLMLSLLLVYIIFQSILSTKNDRYFITVLPFIAYFITNA HHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH LYYIYNFIDFKIEIKNIKISTIISIVIVLFLLGNSLCYNNNIPEENHFNNIQQACKWFDD HHHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCC NCEFDNTTVIYSDNWPAVSWYLNVYCRRGVPDVTMENTTWTFTKNILKSNDEHEPASFYI CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEE DTNNENKMDYVGLSKIKSINDVQIYQNTYEKEYNIRSRGLLEYKDYYNMLFKEHMNESDY ECCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC YD CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA