Definition | Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_007295 |
Length | 897,405 |
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The map label for this gene is 71893644
Identifier: 71893644
GI number: 71893644
Start: 342721
End: 343863
Strand: Reverse
Name: 71893644
Synonym: MHJ_0288
Alternate gene names: NA
Gene position: 343863-342721 (Counterclockwise)
Preceding gene: 71893645
Following gene: 71893643
Centisome position: 38.32
GC content: 24.85
Gene sequence:
>1143_bases ATGCGTAATTTAATTAATTTAAAAATGAATACAAAATTTAATTATGATAATTCCATAAAATTTATATTAGTTTTTTTGTT GTCAATTTTTAAAACAATAATTTTTATTTCACTTATTATTTTATATAGTGTTAACGATGTTGAGGGCAAACCAACAAATC AATTGGATTTAGCGACACCAATTGGAAGATTAAAAGCCGCAATAGGTAGCATATTTTGATTATCATTTTTTGCCTCATTG GTTTTGCGTATCATTTTTGCTTGAAATTTAAGGAATGATGAAGTATTTAGACAAACTGGGCTAGATGTTAAGCAATATTC GATTGGTTTTAAATTTATTCCTTTAATTACTTCAATTTTATTAATTACTAAGTCACTTAGAGACAAAATTTCAATTGGCA ATGATTGAACTACAAGACAATTAATACTTAAATGAAAAATTATTAACTTTATTAAGGATTTGGTTGTTTTTCTTTGACTT TGCTCGATTGTACTTGCTATTGTTTCGTTAATTCTTCGCTTTGGCCTAGATAATACAATGTTTGAAAAATTTAAAGAGGT TGTGATTATAACAATCTTTGTTGGGATTTTCTATTTTTTAATTCCATTTTATTTTTTGGCTTCCTATTCTCTTAAAATAT ACAGATTAATCAGCAAAAGAGAAAAAACTTATTGAAAATCAGCTAGTTACGTTTTTTTCATGCCATTTTTTTACTTCAAT GCTTGAAAAAATGTTTTGAGACTTTCTAAAAAATTAAAAATTGCAGAAAATACACTAGCAGGTCAAAATGAAGTAGAAAA ACAAGTAATTAATAACAAAATTAGTCGACAATTTTATCAATTTACAGTTGTAAAAAATATATTCCATTTAATTTTTCTTA TAGTTTTTACAACGACAATGTGGCTAGTTATAACTAAAAATGAAATTCTTCGTAACACCGGTGTTAGTCTAATTTTCTTT AATTTATTTAATATTTCAACTATGACTTACCTTATATACATTGGGCCTCGTTATTTAGCAGATTCTGTTAATATGCATTC CAAACGAACTTCACTAATTTTATATATTTTAGACATTTTTGTGCCTATAGTTTCTATTTATAACCTAATAGAATATAAAC AAAACAAGACTATTTTAGTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAATTTGAGCAAATTACATCTATTATTACAATTTATATTGAGGGGTAAATAGGGAAAATTAATTAATATTCATAAGTGTA TATTAAAAAATGGTGTAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTTAATATTTACCGCTGTCTTTTGTGTTTTATTGAATTTAACAAACCATAAGCGCTGACAAAAGTCAAGTTATTATTA GTTTTTTTTACTAAAGTTGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 380; Mature: 380
Protein sequence:
>380_residues MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATPIGRLKAAIGSIFWLSFFASL VLRIIFAWNLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLITKSLRDKISIGNDWTTRQLILKWKIINFIKDLVVFLWL CSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFKEVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTYWKSASYVFFMPFFYFN AWKNVLRLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKNEILRNTGVSLIFF NLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIYNLIEYKQNKTILV
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 43295; Mature: 43295
Theoretical pI: Translated: 10.49; Mature: 10.49
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.8 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATP CCCEEEEEECCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHCH IGRLKAAIGSIFLSFFASLVLRIIFANLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH TKSLRDKISIGNDTTRQLILKKIINFIKDLVVFLLCSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFK HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH EVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTYKSASYVFFMPFFYFNAKNVLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHCHHHHHH LSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKN HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHH EILRNTGVSLIFFNLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIY HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLIEYKQNKTILV HHHHHCCCCEECC >Mature Secondary Structure MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATP CCCEEEEEECCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHCH IGRLKAAIGSIFLSFFASLVLRIIFANLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH TKSLRDKISIGNDTTRQLILKKIINFIKDLVVFLLCSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFK HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH EVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTYKSASYVFFMPFFYFNAKNVLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHCHHHHHH LSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKN HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHH EILRNTGVSLIFFNLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIY HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NLIEYKQNKTILV HHHHHCCCCEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA