Definition Mycoplasma hyopneumoniae J chromosome, complete genome.
Accession NC_007295
Length 897,405

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The map label for this gene is 71893644

Identifier: 71893644

GI number: 71893644

Start: 342721

End: 343863

Strand: Reverse

Name: 71893644

Synonym: MHJ_0288

Alternate gene names: NA

Gene position: 343863-342721 (Counterclockwise)

Preceding gene: 71893645

Following gene: 71893643

Centisome position: 38.32

GC content: 24.85

Gene sequence:

>1143_bases
ATGCGTAATTTAATTAATTTAAAAATGAATACAAAATTTAATTATGATAATTCCATAAAATTTATATTAGTTTTTTTGTT
GTCAATTTTTAAAACAATAATTTTTATTTCACTTATTATTTTATATAGTGTTAACGATGTTGAGGGCAAACCAACAAATC
AATTGGATTTAGCGACACCAATTGGAAGATTAAAAGCCGCAATAGGTAGCATATTTTGATTATCATTTTTTGCCTCATTG
GTTTTGCGTATCATTTTTGCTTGAAATTTAAGGAATGATGAAGTATTTAGACAAACTGGGCTAGATGTTAAGCAATATTC
GATTGGTTTTAAATTTATTCCTTTAATTACTTCAATTTTATTAATTACTAAGTCACTTAGAGACAAAATTTCAATTGGCA
ATGATTGAACTACAAGACAATTAATACTTAAATGAAAAATTATTAACTTTATTAAGGATTTGGTTGTTTTTCTTTGACTT
TGCTCGATTGTACTTGCTATTGTTTCGTTAATTCTTCGCTTTGGCCTAGATAATACAATGTTTGAAAAATTTAAAGAGGT
TGTGATTATAACAATCTTTGTTGGGATTTTCTATTTTTTAATTCCATTTTATTTTTTGGCTTCCTATTCTCTTAAAATAT
ACAGATTAATCAGCAAAAGAGAAAAAACTTATTGAAAATCAGCTAGTTACGTTTTTTTCATGCCATTTTTTTACTTCAAT
GCTTGAAAAAATGTTTTGAGACTTTCTAAAAAATTAAAAATTGCAGAAAATACACTAGCAGGTCAAAATGAAGTAGAAAA
ACAAGTAATTAATAACAAAATTAGTCGACAATTTTATCAATTTACAGTTGTAAAAAATATATTCCATTTAATTTTTCTTA
TAGTTTTTACAACGACAATGTGGCTAGTTATAACTAAAAATGAAATTCTTCGTAACACCGGTGTTAGTCTAATTTTCTTT
AATTTATTTAATATTTCAACTATGACTTACCTTATATACATTGGGCCTCGTTATTTAGCAGATTCTGTTAATATGCATTC
CAAACGAACTTCACTAATTTTATATATTTTAGACATTTTTGTGCCTATAGTTTCTATTTATAACCTAATAGAATATAAAC
AAAACAAGACTATTTTAGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTGAGCAAATTACATCTATTATTACAATTTATATTGAGGGGTAAATAGGGAAAATTAATTAATATTCATAAGTGTA
TATTAAAAAATGGTGTAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTAATATTTACCGCTGTCTTTTGTGTTTTATTGAATTTAACAAACCATAAGCGCTGACAAAAGTCAAGTTATTATTA
GTTTTTTTTACTAAAGTTGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 380; Mature: 380

Protein sequence:

>380_residues
MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATPIGRLKAAIGSIFWLSFFASL
VLRIIFAWNLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLITKSLRDKISIGNDWTTRQLILKWKIINFIKDLVVFLWL
CSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFKEVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTYWKSASYVFFMPFFYFN
AWKNVLRLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKNEILRNTGVSLIFF
NLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIYNLIEYKQNKTILV

Sequences:

>Translated_380_residues
MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATPIGRLKAAIGSIF*LSFFASL
VLRIIFA*NLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLITKSLRDKISIGND*TTRQLILK*KIINFIKDLVVFL*L
CSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFKEVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTY*KSASYVFFMPFFYFN
A*KNVLRLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKNEILRNTGVSLIFF
NLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIYNLIEYKQNKTILV
>Mature_380_residues
MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATPIGRLKAAIGSIF*LSFFASL
VLRIIFA*NLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLITKSLRDKISIGND*TTRQLILK*KIINFIKDLVVFL*L
CSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFKEVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTY*KSASYVFFMPFFYFN
A*KNVLRLSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKNEILRNTGVSLIFF
NLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIYNLIEYKQNKTILV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43295; Mature: 43295

Theoretical pI: Translated: 10.49; Mature: 10.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATP
CCCEEEEEECCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHCH
IGRLKAAIGSIFLSFFASLVLRIIFANLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
TKSLRDKISIGNDTTRQLILKKIINFIKDLVVFLLCSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFK
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
EVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTYKSASYVFFMPFFYFNAKNVLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHCHHHHHH
LSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKN
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHH
EILRNTGVSLIFFNLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIY
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLIEYKQNKTILV
HHHHHCCCCEECC
>Mature Secondary Structure
MRNLINLKMNTKFNYDNSIKFILVFLLSIFKTIIFISLIILYSVNDVEGKPTNQLDLATP
CCCEEEEEECCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHCH
IGRLKAAIGSIFLSFFASLVLRIIFANLRNDEVFRQTGLDVKQYSIGFKFIPLITSILLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
TKSLRDKISIGNDTTRQLILKKIINFIKDLVVFLLCSIVLAIVSLILRFGLDNTMFEKFK
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
EVVIITIFVGIFYFLIPFYFLASYSLKIYRLISKREKTYKSASYVFFMPFFYFNAKNVLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHHHCHHHHHH
LSKKLKIAENTLAGQNEVEKQVINNKISRQFYQFTVVKNIFHLIFLIVFTTTMWLVITKN
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHH
EILRNTGVSLIFFNLFNISTMTYLIYIGPRYLADSVNMHSKRTSLILYILDIFVPIVSIY
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLIEYKQNKTILV
HHHHHCCCCEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA