Definition Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome.
Accession NC_006840
Length 2,897,536

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The map label for this gene is ampG [H]

Identifier: 59711327

GI number: 59711327

Start: 787211

End: 788554

Strand: Reverse

Name: ampG [H]

Synonym: VF_0720

Alternate gene names: 59711327

Gene position: 788554-787211 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59711328

Following gene: 59711326

Centisome position: 27.21

GC content: 39.51

Gene sequence:

>1344_bases
ATGTCTCATTCCATGCAATGGAAAACAGCCATAAAAAGCTACATGGATAAACGTTTACTTTGGGTTTTCATGCTAGGTTG
TTCTAGTGGTTTTCCTTGGGTGCTTATTGGCTCAAATATGTCAGGTTGGCTAAAAGATGCAGGACTGACTCGAGCTGCCA
TTGGTTATTTTGGTTCTGTATTTGCTGTATATGCCATTAATTTTATGTGGGCACCGCTGGTTGATCGTGTAAAACTTCCT
TTTATTGGAAATAAACTTGGTCAACGTCGCAGTTGGATCTTCGTTTGCCAAGCTATTGTTTTCTTCTGCACATTACAAAT
TGCGGGCTTAGATCCATCCAAAAATTTAATGCTAACATCAATGTTTGCACTCGCTATTGCAACAGCATCAGCGACACAAG
ATGTTGCCATTGATGCATTTCGTATTGATACTTTCCCAAAATCAGAATCAACTAAAATGCCTCAAGCATCAGCAATGGCC
GTCATTGGTTGGTGGACAGGCTATTCATTACCTGGTTATCTCGCTTTTATTAATGCAGACAGCATCGGATGGAATGGCGT
TTACTATGGTATGGCAGGAATTGTTGGCTTATTAATGGTATTCACTCTATTAGTTGGTGAACCAAAAACCAAACGTGATG
AGCTACAGCACGAAGCCGAAGAGCGTCACAATAAATTGGTTGGTTCTAAAGTTGCCGCTTGGTTTACTGTAACAGTAATT
GAGCCATTTTATGATTTCTTTAACCGAAATGGAGTAAAGACAGCCTGTACCCTTCTACTATTTGTTTTCTTATTTAAAAT
TGGTGAGGCTTTTCTGGGAAGAATGTCGATCACTTTTTATAAAGAAATCGGATTTAGTAACGAACAAATTGGCTATTACT
CTAAACTGATCGGCTGGGGAGCAACCGTATTCTTCACCCTATTAGGCAGCTTAATCAACGTTCGTTTTGGGGTTGTAAAA
GGCTTAATGATTGGCGGTGTCGCTATGGCTGCAAGTAATCTAATGTTTGCGCTTATCGCCAATGTCGGTCCTAATGAACA
TTTATTCCTAGCAACGATTATTGTTGATAACTTCACAACGGCGTTTTCAACCGTCGCCTTTGTATCCTTCTTAACCATAC
TTACTGGAGAAGCATTCTCTGCGACTCAATATGCATTACTGGCTTCATTAGGCAACTTAGGTAGAACAACATTAGCGTCT
TTTAGTGGTGAGTTAGCCGACTATTTAAATAGCTGGCCTTTATTCTTTATATTAACAGCGGTAATGGTTATCCCTAGTCT
AATTATGCTGCTTATGCTTAAAGGGTATTTCAAAGCGCTTCTTGATAAGCATCAAAGCTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTAATTAAATAATTTAGTTAATATAGCACTACTCTAAAGCAGCTTTCGGGCTGCTTTTTCTATCTATTTCAATAAGAA
CAAATAACAAGGAGCGTTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGTTCTTATACGTAACAACTGTGCTACCAAAGCCTCCTAATCTAGGAGGCCTTTTTGTTTCTGTTCACATTTTTACGTCA
GAGTTTTGTCAAGTAAGTGA

Product: muropeptide transporter AmpG

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 447; Mature: 446

Protein sequence:

>447_residues
MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLKDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLP
FIGNKLGQRRSWIFVCQAIVFFCTLQIAGLDPSKNLMLTSMFALAIATASATQDVAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMA
VIGWWTGYSLPGYLAFINADSIGWNGVYYGMAGIVGLLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERHNKLVGSKVAAWFTVTVI
EPFYDFFNRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATVFFTLLGSLINVRFGVVK
GLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLAS
FSGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKGYFKALLDKHQSS

Sequences:

>Translated_447_residues
MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLKDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLP
FIGNKLGQRRSWIFVCQAIVFFCTLQIAGLDPSKNLMLTSMFALAIATASATQDVAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMA
VIGWWTGYSLPGYLAFINADSIGWNGVYYGMAGIVGLLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERHNKLVGSKVAAWFTVTVI
EPFYDFFNRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATVFFTLLGSLINVRFGVVK
GLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLAS
FSGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKGYFKALLDKHQSS
>Mature_446_residues
SHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLKDAGLTRAAIGYFGSVFAVYAINFMWAPLVDRVKLPF
IGNKLGQRRSWIFVCQAIVFFCTLQIAGLDPSKNLMLTSMFALAIATASATQDVAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAV
IGWWTGYSLPGYLAFINADSIGWNGVYYGMAGIVGLLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERHNKLVGSKVAAWFTVTVIE
PFYDFFNRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWGATVFFTLLGSLINVRFGVVKG
LMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTTAFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASF
SGELADYLNSWPLFFILTAVMVIPSLIMLLMLKGYFKALLDKHQSS

Specific function: Probably Acts As A Permease In The Beta-Lactamase Induction System And In Peptidoglycan Recycling. [C]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786636, Length=426, Percent_Identity=29.1079812206573, Blast_Score=187, Evalue=1e-48,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020846
- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49314; Mature: 49182

Theoretical pI: Translated: 9.32; Mature: 9.32

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
5.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLKDAGLTRAAIGYFGSV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FAVYAINFMWAPLVDRVKLPFIGNKLGQRRSWIFVCQAIVFFCTLQIAGLDPSKNLMLTS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
MFALAIATASATQDVAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAVIGWWTGYSLPGYLAFINAD
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEECC
SIGWNGVYYGMAGIVGLLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERHNKLVGSKVAAWFTVTVI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EPFYDFFNRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWG
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
ATVFFTLLGSLINVRFGVVKGLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
AFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASFSGELADYLNSWPLFFILTA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VMVIPSLIMLLMLKGYFKALLDKHQSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SHSMQWKTAIKSYMDKRLLWVFMLGCSSGFPWVLIGSNMSGWLKDAGLTRAAIGYFGSV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FAVYAINFMWAPLVDRVKLPFIGNKLGQRRSWIFVCQAIVFFCTLQIAGLDPSKNLMLTS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
MFALAIATASATQDVAIDAFRIDTFPKSESTKMPQASAMAVIGWWTGYSLPGYLAFINAD
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHEEEEEECCCCCCCCEEEEEECC
SIGWNGVYYGMAGIVGLLMVFTLLVGEPKTKRDELQHEAEERHNKLVGSKVAAWFTVTVI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EPFYDFFNRNGVKTACTLLLFVFLFKIGEAFLGRMSITFYKEIGFSNEQIGYYSKLIGWG
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
ATVFFTLLGSLINVRFGVVKGLMIGGVAMAASNLMFALIANVGPNEHLFLATIIVDNFTT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
AFSTVAFVSFLTILTGEAFSATQYALLASLGNLGRTTLASFSGELADYLNSWPLFFILTA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VMVIPSLIMLLMLKGYFKALLDKHQSS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11557893 [H]