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The map label for this gene is 57237832

Identifier: 57237832

GI number: 57237832

Start: 1014980

End: 1016551

Strand: Reverse

Name: 57237832

Synonym: CJE1087

Alternate gene names: NA

Gene position: 1016551-1014980 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57237833

Following gene: 57237831

Centisome position: 57.18

GC content: 27.23

Gene sequence:

>1572_bases
ATGAAAAAAATTATTATTTTAACCTTTTTTGTTGTTTTTGCTTTTGGTGATGTAAATCGGACTATTATTAATAATATAAA
TGAGAAAATTAATACTTTAAATACTGTAATCAGTGCTAGTATTTGGAATATACGTTATGAAAATTTTATAAAATATCAAG
ATATAAATGATGAATTAATCATTTTAAATCTTAATTTAAAAAAGACTTCCGATATTCACCAACAAGAAGAACTTAAACGC
AAGATAGCAAATTTAGAAGAGCAATTGAACTTGCTTAAAGAATATAAAGATTTAAATTTTGCACAAAGTCTTAGTGCCCC
TGATAATATAGAAACTTTATCTAAGCTTACTAATCCTTTGGCTATTATAGGAGCTTTTTCTCATATTAAGAAATTAAAAG
GAGAAAAGGAAGAGTATATATTTAAATTTAATGATTTTAAAAATTTAGTAGATAAAATCAGGGAAAAAAATTCAGAACTT
AAGGAATTAGTTGAGCTTAAACCAAGTGTTGAGAATATAGAAGCTTTAAAAGCTTCGGATAAAAAGCTGGAAGAATTTGA
GCAAGCTTTAAATTTTGCTAGTGTTTCTTATTCTGTTTATGAGAAAAAAATTGATGAAGAGCTTTCTCGAGTAAGTGCTG
AGATTAAAGTTCAAAGCTTAAGGGCTGTAAATATACTTGTTGCTATTGTTATTGTTATAGCTATAGCTTTTATGTTGAAA
TTTATTGCTAAAAAATACATTAAAGATAGTGAAAGATATTATACTGCTACGAAGATTATTAATTTTATTAATATAAATAT
TATTTTTCTTATTTTGCTCTTTGCTTATATAGAAAATATTACTTATCTTGTAACTATACTTGGTTTTGCTTCTGCAGGCT
TAGCTATTGCTATGAAAGATATGTTTATGTCTATGCTTGGATGGTGTGTGATTATTTTTGGCGGAAGTTTTAGAGTAGGG
GATCGTGTAAAAGTTTTTCAAAATGATACTACCTATATAGGAGATATTATAGATATTTCTTTTTTACGCGTTACTCTTTA
TGAAGAACTTACGCTTGAAACTTATAGTAAAAATCGTCGTAGTGGACGTATTATATTTATTCCTAATAACTATGTTTTTA
CAAATTTGCTTGCTAATTATACTCATCATGGTATGAAAACCGTGCTTGATGGCATTGATATAAGTGTTACTTTTGATAGC
AATCTTGATAAGGCACAAGAAATTGTGGAAAATATTGTTACACGCCATGCCAAAGGTTATACTGAGCTTGCTAGAAAAAA
TATAGCTCGTTTACAACATGAATATAGTATTAAAAATCCTAAAGTGGAGCCAAGGTTTTTTATGTTTTTTGAACATTGGG
GAATGCGAATTTCTGCATGGTATATGACTAATGCTTATGCGGCTTTGGTATTAAGAAGTACGATTAGCAAAGAGATTATA
AAAGAATTTAATAAGCATAAAGATATAAAAATTGCTTATCCATCGCAAAATTTATATTTAGGAAATTTAAATCAAAATCA
TTTTGAACAACATCATGAAAATATGTATTTTCATGCAAGGAATAAGGATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAAAATCAATTTTGTTCTTGCTAGTCCTTTGGGTAAGGGTTTGATAAAAGGTGATATTTCTAAAGAAGATATAATT
GCAACTTTAAGAGAATTCCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGAAAAAGTTTTTTTTAAAACCTTTGGATGTCGCACAAATATTTATGATACAGAGCTTTTAAAAAGTTATGTAAAAGAT
TATGAGATTATAAATGATGA

Product: mechanosensitive ion channel family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 523; Mature: 523

Protein sequence:

>523_residues
MKKIIILTFFVVFAFGDVNRTIINNINEKINTLNTVISASIWNIRYENFIKYQDINDELIILNLNLKKTSDIHQQEELKR
KIANLEEQLNLLKEYKDLNFAQSLSAPDNIETLSKLTNPLAIIGAFSHIKKLKGEKEEYIFKFNDFKNLVDKIREKNSEL
KELVELKPSVENIEALKASDKKLEEFEQALNFASVSYSVYEKKIDEELSRVSAEIKVQSLRAVNILVAIVIVIAIAFMLK
FIAKKYIKDSERYYTATKIINFININIIFLILLFAYIENITYLVTILGFASAGLAIAMKDMFMSMLGWCVIIFGGSFRVG
DRVKVFQNDTTYIGDIIDISFLRVTLYEELTLETYSKNRRSGRIIFIPNNYVFTNLLANYTHHGMKTVLDGIDISVTFDS
NLDKAQEIVENIVTRHAKGYTELARKNIARLQHEYSIKNPKVEPRFFMFFEHWGMRISAWYMTNAYAALVLRSTISKEII
KEFNKHKDIKIAYPSQNLYLGNLNQNHFEQHHENMYFHARNKD

Sequences:

>Translated_523_residues
MKKIIILTFFVVFAFGDVNRTIINNINEKINTLNTVISASIWNIRYENFIKYQDINDELIILNLNLKKTSDIHQQEELKR
KIANLEEQLNLLKEYKDLNFAQSLSAPDNIETLSKLTNPLAIIGAFSHIKKLKGEKEEYIFKFNDFKNLVDKIREKNSEL
KELVELKPSVENIEALKASDKKLEEFEQALNFASVSYSVYEKKIDEELSRVSAEIKVQSLRAVNILVAIVIVIAIAFMLK
FIAKKYIKDSERYYTATKIINFININIIFLILLFAYIENITYLVTILGFASAGLAIAMKDMFMSMLGWCVIIFGGSFRVG
DRVKVFQNDTTYIGDIIDISFLRVTLYEELTLETYSKNRRSGRIIFIPNNYVFTNLLANYTHHGMKTVLDGIDISVTFDS
NLDKAQEIVENIVTRHAKGYTELARKNIARLQHEYSIKNPKVEPRFFMFFEHWGMRISAWYMTNAYAALVLRSTISKEII
KEFNKHKDIKIAYPSQNLYLGNLNQNHFEQHHENMYFHARNKD
>Mature_523_residues
MKKIIILTFFVVFAFGDVNRTIINNINEKINTLNTVISASIWNIRYENFIKYQDINDELIILNLNLKKTSDIHQQEELKR
KIANLEEQLNLLKEYKDLNFAQSLSAPDNIETLSKLTNPLAIIGAFSHIKKLKGEKEEYIFKFNDFKNLVDKIREKNSEL
KELVELKPSVENIEALKASDKKLEEFEQALNFASVSYSVYEKKIDEELSRVSAEIKVQSLRAVNILVAIVIVIAIAFMLK
FIAKKYIKDSERYYTATKIINFININIIFLILLFAYIENITYLVTILGFASAGLAIAMKDMFMSMLGWCVIIFGGSFRVG
DRVKVFQNDTTYIGDIIDISFLRVTLYEELTLETYSKNRRSGRIIFIPNNYVFTNLLANYTHHGMKTVLDGIDISVTFDS
NLDKAQEIVENIVTRHAKGYTELARKNIARLQHEYSIKNPKVEPRFFMFFEHWGMRISAWYMTNAYAALVLRSTISKEII
KEFNKHKDIKIAYPSQNLYLGNLNQNHFEQHHENMYFHARNKD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mscS (TC 1.A.23) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010920
- InterPro:   IPR006685
- InterPro:   IPR011014 [H]

Pfam domain/function: PF00924 MS_channel [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60820; Mature: 60820

Theoretical pI: Translated: 9.16; Mature: 9.16

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKIIILTFFVVFAFGDVNRTIINNINEKINTLNTVISASIWNIRYENFIKYQDINDELI
CCEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHEEEEECCCCCEE
ILNLNLKKTSDIHQQEELKRKIANLEEQLNLLKEYKDLNFAQSLSAPDNIETLSKLTNPL
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHH
AIIGAFSHIKKLKGEKEEYIFKFNDFKNLVDKIREKNSELKELVELKPSVENIEALKASD
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCH
KKLEEFEQALNFASVSYSVYEKKIDEELSRVSAEIKVQSLRAVNILVAIVIVIAIAFMLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIAKKYIKDSERYYTATKIINFININIIFLILLFAYIENITYLVTILGFASAGLAIAMKD
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
MFMSMLGWCVIIFGGSFRVGDRVKVFQNDTTYIGDIIDISFLRVTLYEELTLETYSKNRR
HHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SGRIIFIPNNYVFTNLLANYTHHGMKTVLDGIDISVTFDSNLDKAQEIVENIVTRHAKGY
CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
TELARKNIARLQHEYSIKNPKVEPRFFMFFEHWGMRISAWYMTNAYAALVLRSTISKEII
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHEEEEHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEFNKHKDIKIAYPSQNLYLGNLNQNHFEQHHENMYFHARNKD
HHHHCCCCEEEEECCCCEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEECCCC
>Mature Secondary Structure
MKKIIILTFFVVFAFGDVNRTIINNINEKINTLNTVISASIWNIRYENFIKYQDINDELI
CCEEHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHEEEEECCCCCEE
ILNLNLKKTSDIHQQEELKRKIANLEEQLNLLKEYKDLNFAQSLSAPDNIETLSKLTNPL
EEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHCCHH
AIIGAFSHIKKLKGEKEEYIFKFNDFKNLVDKIREKNSELKELVELKPSVENIEALKASD
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCH
KKLEEFEQALNFASVSYSVYEKKIDEELSRVSAEIKVQSLRAVNILVAIVIVIAIAFMLK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIAKKYIKDSERYYTATKIINFININIIFLILLFAYIENITYLVTILGFASAGLAIAMKD
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
MFMSMLGWCVIIFGGSFRVGDRVKVFQNDTTYIGDIIDISFLRVTLYEELTLETYSKNRR
HHHHHHHHHHHHCCCCEEECCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SGRIIFIPNNYVFTNLLANYTHHGMKTVLDGIDISVTFDSNLDKAQEIVENIVTRHAKGY
CCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCH
TELARKNIARLQHEYSIKNPKVEPRFFMFFEHWGMRISAWYMTNAYAALVLRSTISKEII
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHEEEEHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEFNKHKDIKIAYPSQNLYLGNLNQNHFEQHHENMYFHARNKD
HHHHCCCCEEEEECCCCEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]