Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020374
Identifier: 54020374
GI number: 54020374
Start: 195124
End: 201267
Strand: Reverse
Name: 54020374
Synonym: mhp165
Alternate gene names: NA
Gene position: 201267-195124 (Counterclockwise)
Preceding gene: 54020375
Following gene: 54020373
Centisome position: 22.54
GC content: 29.79
Gene sequence:
>6144_bases ATGAAAAAATCTAATATTTTGCTTAGTTATTTATTAGCAGGCGGAATTCTTGCTGGGGCTTCAGCCGGAATTATGGGTGG AATTAAAATCTATTCAGAAAATAATGAACTAGGTGTCTATGATATTGATGTCCAATCAGATGAAAAAGTTGATATTAAAG ATGATCAACTTGTCTATGCAAATTTTAAAAATGCCCAGGGCCAAACAGTTGCTGCTTTTGAGAATCTAAAAGATCCAAAA ACAATTTTACTTGATCCTAAAGTAAAATCTGAAAAAAGACGGTTTAATGAAGTCGAATTTGCCGATTGGTTTGCCGATAA TTACAATCGGCAAACACCAATTTTTGAACTAAAAATTGGATCAATGCGTTTTGTTAATGAATATTGAGATTCACTTTTAC CTTCAGAATTTATCAAATATGCCCAATGATTTAACAAAAATGTTGCTTGAGGACCAGATGCAATTACTCTTGAACATTTT GCCTTAAAAAAAGGGGTTACAAGATCTGGAAATAATTTATTATTAGGACAACATGCAACTGAAAGAAAAGAAGTGACAAA AATTGAGTTCTATCCTGATTCATTTTTTGGTTCTTTTCCAATTTATTCAGCCCTTACTGGAAAAGGAAATAGCGATGATA ATCTAACTTATAAAATTTTTCATAATCCAATTTCAAAAGAATCACTTGATAAGTATTTTGAATCAATTCCAACTCAGCAA GTTTTAGCAAATTATGATAAATCCAAAGTAAGTGCCGGAATTCCGGCAATTGATTTAGTCGAAAATGAAGATATTTATTT TTATGATTTAGTAAAAATTCTTAAAAAATCTTTTCCACAAAACAAAGAGATTCAGGATAAATTAGCCAAAATTACAAATG AGGAAAATTTTTTTGTCTTTGCCGATCCAAAGCAAAATCTTGATCAAGTCAAGAAAAAATTTGAATTAGCAATTCTAATG 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Upstream 100 bases:
>100_bases GATGAAAAAAATCAACCTCAATGAATTAATTTAGGAAATAATCACTATATTTTAGCAACTTTTGCCGAACTAAAAAGGTG AAAATTAGGAGACTATAATT
Downstream 100 bases:
>100_bases AGGGAAAATCATGAAAAAAATAAAAAAACTTTTAATTTTAAACACTTTTTTTCCAATTTCGCTGCTTTCATTAGTTTCTT GTAAAAGCGCCCTTGAAAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 2047; Mature: 2047
Protein sequence:
>2047_residues MKKSNILLSYLLAGGILAGASAGIMGGIKIYSENNELGVYDIDVQSDEKVDIKDDQLVYANFKNAQGQTVAAFENLKDPK TILLDPKVKSEKRRFNEVEFADWFADNYNRQTPIFELKIGSMRFVNEYWDSLLPSEFIKYAQWFNKNVAWGPDAITLEHF ALKKGVTRSGNNLLLGQHATERKEVTKIEFYPDSFFGSFPIYSALTGKGNSDDNLTYKIFHNPISKESLDKYFESIPTQQ VLANYDKSKVSAGIPAIDLVENEDIYFYDLVKILKKSFPQNKEIQDKLAKITNEENFFVFADPKQNLDQVKKKFELAILM LADEKDIQLPQNFQLIFPEDFTKTRKIKWIRSALSPFNQQIKHDANKIPQGVFLLKLEDLMPENPSEQPKDLQNQAQKPT QTSDQGKKPQVQQPNQSQAQTKDFRFSINQQMKANRVALIVGELTTKIHQKAEKIAKEGFFDLYNINHPVGKIIAIYQNS PENRLFLPVDSKNPALEAENEFITQFDASKFSTYEIKTAKKLSNYKLEIELVDQKDKKSIKKIIFDLDPKGKNYQSQLEE FSSFKIAIDWKNRAIPRVIQEIETLKDGKSTTVYQLYAEVFDGLIDKVLNHRKTNGEKLVGTYIISEVDPKTGLKTYQTK QGSFIGYSQSSRIPYISLLKASSPFFKTTGINYLKYVGAHEYGHHQTLNYAQDISDPDSSIILDAISTNTGIGLQSFYNL DVLRKYLHARSSGLDLRKAGPSLEAQKNGIYPNFTFNRDNKFESEVDIYGSNENDEVDSLLTNKSRRFLQTIDGLKTAAD LRKLKLYDLFLLNSIDPESATINPSIKDSAKFFRNDWQTIEDQSKKGFINSTESKSLFGNSLTDAAGNLLEFDEKGKLIV AEFKESEDKRTFSDLKVKVFFANGRPAIDPTIFTKPNSLSELKAKIAEIQKAFSDNVVSNFDNNGWDTKAEGFSRFLPSN PFFAKSLSAILANNAEKEAFYGTKIADNPSKLEISVELPSSVFDPSQILSIVKRYIKDEEAIKLGEKLVQDSKSKLDFPT FLSILNKEELTNGNSLAINKLFEKIFLTPITEKKDLYTDLRNITYFRDSLVGKIDLAVEFIQNIYNIYFEWLQNQSLGIN QALNTPKPNTTPDRKALVLKSYWNFVVSDQIWNNLDKIFIIKGEKNPEKIPSRFFSAIRNFHRLTPNVYDKNFVNLTQGA VFASSHLGKLISINGNEYYQNPKYDFLATVTSGGKNYLVLDHSEFDVKIRSLMGRWISPLGNLLKFDKVLLEDKNTNTKL NPFFGIAQDFKFKIGPDQKIDTSKIYLDAWDKTLFGFDYNNNYFGFQNEQKETVFSSISDFIEFISIDPFALRVTKNGED FIRNWSLDYVNSKFDLYRYAFDRLQKEKFVLKSSTNNQLTWKKELKSTEIIGKLLANFEISSEKLLENLQKYANFLMEAF DKSTLNLLLKNSKIENKNIDPLFLSSIGFMGFKNYARKVDENSLPATKFGKLTNLDRIKTPETTWLTFSTFLKENSLVFD NEDFVNDDLNNSNKSLVYKWILNFLEDKKIEFKDLDLFRLQYLVGTKTFADYTQEDGLIKQIQRMDVDLGLSWLRSKNLA RFETRADDFFSNYVYSFPESLTRDFVQIHYSPSTEELDNISPLFKKMTEANTGNEYFVDGIYTRKWIKNFIPAFDISQAY AQNLISRFSNFFLTSFVITRNSENLEKLYQNLLKAFKNAQSKNLYQKFNDLSSQQEAEIKKIIGSQEIPSKFIDKVLQEI ENVDKINEISSKINRQKADLFSELTIEVNRIMQDYQGELGNYKNYHNLNIQPVVGNKTWINGYINKNVLTNNGFFKDRFQ RKVLNWELYDDNLESVKDPNIRITNLNGEKVDNRAEAFWYYSLKTQGVGQRSVSGIWRDSKHDKVAFWGFLKSQDANKAH FLTLEDESTGQKFYIQLATKGTNNIFYLKKQADLSSKWTLENEGYKSWVSAWSIIGEFKNALLRPGVSGIKRFRIYFSDQ KRQEIKGLFTLGNTKFIAENGKNYQTAPTYIEKTAKGNYLVIRPQFK
Sequences:
>Translated_2047_residues MKKSNILLSYLLAGGILAGASAGIMGGIKIYSENNELGVYDIDVQSDEKVDIKDDQLVYANFKNAQGQTVAAFENLKDPK TILLDPKVKSEKRRFNEVEFADWFADNYNRQTPIFELKIGSMRFVNEY*DSLLPSEFIKYAQ*FNKNVA*GPDAITLEHF ALKKGVTRSGNNLLLGQHATERKEVTKIEFYPDSFFGSFPIYSALTGKGNSDDNLTYKIFHNPISKESLDKYFESIPTQQ VLANYDKSKVSAGIPAIDLVENEDIYFYDLVKILKKSFPQNKEIQDKLAKITNEENFFVFADPKQNLDQVKKKFELAILM LADEKDIQLPQNFQLIFPEDFTKTRKIK*IRSALSPFNQQIKHDANKIPQGVFLLKLEDLMPENPSEQPKDLQNQAQKPT QTSDQGKKPQVQQPNQSQAQTKDFRFSINQQMKANRVALIVGELTTKIHQKAEKIAKEGFFDLYNINHPVGKIIAIYQNS PENRLFLPVDSKNPALEAENEFITQFDASKFSTYEIKTAKKLSNYKLEIELVDQKDKKSIKKIIFDLDPKGKNYQSQLEE FSSFKIAIDWKNRAIPRVIQEIETLKDGKSTTVYQLYAEVFDGLIDKVLNHRKTNGEKLVGTYIISEVDPKTGLKTYQTK QGSFIGYSQSSRIPYISLLKASSPFFKTTGINYLKYVGAHEYGHHQTLNYAQDISDPDSSIILDAISTNTGIGLQSFYNL DVLRKYLHARSSGLDLRKAGPSLEAQKNGIYPNFTFNRDNKFESEVDIYGSNENDEVDSLLTNKSRRFLQTIDGLKTAAD LRKLKLYDLFLLNSIDPESATINPSIKDSAKFFRNDWQTIEDQSKKGFINSTESKSLFGNSLTDAAGNLLEFDEKGKLIV AEFKESEDKRTFSDLKVKVFFANGRPAIDPTIFTKPNSLSELKAKIAEIQKAFSDNVVSNFDNNG*DTKAEGFSRFLPSN PFFAKSLSAILANNAEKEAFYGTKIADNPSKLEISVELPSSVFDPSQILSIVKRYIKDEEAIKLGEKLVQDSKSKLDFPT FLSILNKEELTNGNSLAINKLFEKIFLTPITEKKDLYTDLRNITYFRDSLVGKIDLAVEFIQNIYNIYFE*LQNQSLGIN QALNTPKPNTTPDRKALVLKSY*NFVVSDQIWNNLDKIFIIKGEKNPEKIPSRFFSAIRNFHRLTPNVYDKNFVNLTQGA VFASSHLGKLISINGNEYYQNPKYDFLATVTSGGKNYLVLDHSEFDVKIRSLMGR*ISPLGNLLKFDKVLLEDKNTNTKL NPFFGIAQDFKFKIGPDQKIDTSKIYLDAWDKTLFGFDYNNNYFGFQNEQKETVFSSISDFIEFISIDPFALRVTKNGED FIRN*SLDYVNSKFDLYRYAFDRLQKEKFVLKSSTNNQLT*KKELKSTEIIGKLLANFEISSEKLLENLQKYANFLMEAF DKSTLNLLLKNSKIENKNIDPLFLSSIGFMGFKNYARKVDENSLPATKFGKLTNLDRIKTPETTWLTFSTFLKENSLVFD NEDFVNDDLNNSNKSLVYKWILNFLEDKKIEFKDLDLFRLQYLVGTKTFADYTQEDGLIKQIQRMDVDLGLSWLRSKNLA RFETRADDFFSNYVYSFPESLTRDFVQIHYSPSTEELDNISPLFKKMTEANTGNEYFVDGIYTRK*IKNFIPAFDISQAY AQNLISRFSNFFLTSFVITRNSENLEKLYQNLLKAFKNAQSKNLYQKFNDLSSQQEAEIKKIIGSQEIPSKFIDKVLQEI ENVDKINEISSKINRQKADLFSELTIEVNRIMQDYQGELGNYKNYHNLNIQPVVGNKT*INGYINKNVLTNNGFFKDRFQ RKVLN*ELYDDNLESVKDPNIRITNLNGEKVDNRAEAFWYYSLKTQGVGQRSVSGIWRDSKHDKVAFWGFLKSQDANKAH FLTLEDESTGQKFYIQLATKGTNNIFYLKKQADLSSK*TLENEGYKS*VSAWSIIGEFKNALLRPGVSGIKRFRIYFSDQ KRQEIKGLFTLGNTKFIAENGKNYQTAPTYIEKTAKGNYLVIRPQFK >Mature_2047_residues MKKSNILLSYLLAGGILAGASAGIMGGIKIYSENNELGVYDIDVQSDEKVDIKDDQLVYANFKNAQGQTVAAFENLKDPK TILLDPKVKSEKRRFNEVEFADWFADNYNRQTPIFELKIGSMRFVNEY*DSLLPSEFIKYAQ*FNKNVA*GPDAITLEHF ALKKGVTRSGNNLLLGQHATERKEVTKIEFYPDSFFGSFPIYSALTGKGNSDDNLTYKIFHNPISKESLDKYFESIPTQQ VLANYDKSKVSAGIPAIDLVENEDIYFYDLVKILKKSFPQNKEIQDKLAKITNEENFFVFADPKQNLDQVKKKFELAILM LADEKDIQLPQNFQLIFPEDFTKTRKIK*IRSALSPFNQQIKHDANKIPQGVFLLKLEDLMPENPSEQPKDLQNQAQKPT QTSDQGKKPQVQQPNQSQAQTKDFRFSINQQMKANRVALIVGELTTKIHQKAEKIAKEGFFDLYNINHPVGKIIAIYQNS PENRLFLPVDSKNPALEAENEFITQFDASKFSTYEIKTAKKLSNYKLEIELVDQKDKKSIKKIIFDLDPKGKNYQSQLEE FSSFKIAIDWKNRAIPRVIQEIETLKDGKSTTVYQLYAEVFDGLIDKVLNHRKTNGEKLVGTYIISEVDPKTGLKTYQTK QGSFIGYSQSSRIPYISLLKASSPFFKTTGINYLKYVGAHEYGHHQTLNYAQDISDPDSSIILDAISTNTGIGLQSFYNL DVLRKYLHARSSGLDLRKAGPSLEAQKNGIYPNFTFNRDNKFESEVDIYGSNENDEVDSLLTNKSRRFLQTIDGLKTAAD LRKLKLYDLFLLNSIDPESATINPSIKDSAKFFRNDWQTIEDQSKKGFINSTESKSLFGNSLTDAAGNLLEFDEKGKLIV AEFKESEDKRTFSDLKVKVFFANGRPAIDPTIFTKPNSLSELKAKIAEIQKAFSDNVVSNFDNNG*DTKAEGFSRFLPSN PFFAKSLSAILANNAEKEAFYGTKIADNPSKLEISVELPSSVFDPSQILSIVKRYIKDEEAIKLGEKLVQDSKSKLDFPT FLSILNKEELTNGNSLAINKLFEKIFLTPITEKKDLYTDLRNITYFRDSLVGKIDLAVEFIQNIYNIYFE*LQNQSLGIN QALNTPKPNTTPDRKALVLKSY*NFVVSDQIWNNLDKIFIIKGEKNPEKIPSRFFSAIRNFHRLTPNVYDKNFVNLTQGA VFASSHLGKLISINGNEYYQNPKYDFLATVTSGGKNYLVLDHSEFDVKIRSLMGR*ISPLGNLLKFDKVLLEDKNTNTKL NPFFGIAQDFKFKIGPDQKIDTSKIYLDAWDKTLFGFDYNNNYFGFQNEQKETVFSSISDFIEFISIDPFALRVTKNGED FIRN*SLDYVNSKFDLYRYAFDRLQKEKFVLKSSTNNQLT*KKELKSTEIIGKLLANFEISSEKLLENLQKYANFLMEAF DKSTLNLLLKNSKIENKNIDPLFLSSIGFMGFKNYARKVDENSLPATKFGKLTNLDRIKTPETTWLTFSTFLKENSLVFD NEDFVNDDLNNSNKSLVYKWILNFLEDKKIEFKDLDLFRLQYLVGTKTFADYTQEDGLIKQIQRMDVDLGLSWLRSKNLA RFETRADDFFSNYVYSFPESLTRDFVQIHYSPSTEELDNISPLFKKMTEANTGNEYFVDGIYTRK*IKNFIPAFDISQAY AQNLISRFSNFFLTSFVITRNSENLEKLYQNLLKAFKNAQSKNLYQKFNDLSSQQEAEIKKIIGSQEIPSKFIDKVLQEI ENVDKINEISSKINRQKADLFSELTIEVNRIMQDYQGELGNYKNYHNLNIQPVVGNKT*INGYINKNVLTNNGFFKDRFQ RKVLN*ELYDDNLESVKDPNIRITNLNGEKVDNRAEAFWYYSLKTQGVGQRSVSGIWRDSKHDKVAFWGFLKSQDANKAH FLTLEDESTGQKFYIQLATKGTNNIFYLKKQADLSSK*TLENEGYKS*VSAWSIIGEFKNALLRPGVSGIKRFRIYFSDQ KRQEIKGLFTLGNTKFIAENGKNYQTAPTYIEKTAKGNYLVIRPQFK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 232571; Mature: 232571
Theoretical pI: Translated: 9.14; Mature: 9.14
Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.6 %Met (Translated Protein) 0.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.6 %Met (Mature Protein) 0.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKSNILLSYLLAGGILAGASAGIMGGIKIYSENNELGVYDIDVQSDEKVDIKDDQLVYA CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEE NFKNAQGQTVAAFENLKDPKTILLDPKVKSEKRRFNEVEFADWFADNYNRQTPIFELKIG ECCCCCCCEEHHHHCCCCCCEEEECCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEC SMRFVNEYDSLLPSEFIKYAQFNKNVAGPDAITLEHFALKKGVTRSGNNLLLGQHATERK CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCCC EVTKIEFYPDSFFGSFPIYSALTGKGNSDDNLTYKIFHNPISKESLDKYFESIPTQQVLA CCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH NYDKSKVSAGIPAIDLVENEDIYFYDLVKILKKSFPQNKEIQDKLAKITNEENFFVFADP CCCHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEECC KQNLDQVKKKFELAILMLADEKDIQLPQNFQLIFPEDFTKTRKIKIRSALSPFNQQIKHD CCCHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCEEEHHHHHCHHHHHHHHH ANKIPQGVFLLKLEDLMPENPSEQPKDLQNQAQKPTQTSDQGKKPQVQQPNQSQAQTKDF HHHCCCCEEEEEEHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHH RFSINQQMKANRVALIVGELTTKIHQKAEKIAKEGFFDLYNINHPVGKIIAIYQNSPENR 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