Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
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Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020287
Identifier: 54020287
GI number: 54020287
Start: 826920
End: 829757
Strand: Direct
Name: 54020287
Synonym: mhp655
Alternate gene names: NA
Gene position: 826920-829757 (Clockwise)
Preceding gene: 54020286
Following gene: 54020288
Centisome position: 92.63
GC content: 24.07
Gene sequence:
>2838_bases ATGAAACTAGGTCAAATTAGTGCCAAAACTACTTTTGAAGAACAAAAATTTATTTTTTTTAATCAAGATTTTCCGCTTGA GATAACTAATTCAAAAATTATTGGTTTTATTTCAAACCAGTCAAATTCAATTAACGAAAGTTACATTTCTAGTATTGGAT TAGTGATAGCAGAGTTTTTAAAGCAAAATAATTTGAAAAAAATTCTTATAAATAACAGTGATAATAATTTTGGAATTGCT TTTGGTTTAATTTTTTATAATATTTTAGCACATAATTCTGAAATAAAAGTTGAAATTTTTGATGAAAGCTGAGGTTATTC CCAAAAACTTGCCCACCATTATTTTATTAACAATGATTTTGATTTTTTTATTAATATTGAAGTTAATTTAACAGATAAAA ATTCAAGTCTTGCAATTTTGTCATTTTTCAAAAAAAATTTGACCTTTTTAAGCGCTGATGACGAAAAATTAATTAACAAA GCCGAAAAATGTCCTTTTTTATCCCAAAATAGTCAAATTAAAAAACCAAAAAAATTCAGAATTAATTGAAATGATATTAT CGAATTCCAAAAAAGCATAAATTTAGACTTGCAAAAGTTAGAAAAATTCTATCAATTTTATGAACCTGAATCGACATTTT TAACTAATTTTTTAAAGCAAAACTTTGACCTAAAAACAGCTAAATTTCTGCCAATCAGAAAAAATGCTCCAATCGAAAAC ATAATGAAAAAAATTAGCGATAATTCGATAATATGGAAAAAAATCACAACAAGCGCTAAATTCAAAACAAATGTAGTTTT TTGACTTAAACAGAATAAAATTCTTGCTGGCTTTCGCAAAAATTTTAATTTTAATATCATAAAAGAAAAAGATTTACAAC TATTATTTCTAGATTACCTTCGAAAAAATTGACAAAATGGTAGACATTTTTTAATTAGCAAACAAAGTGATAGTTATATT TTTGAGTTTGTTCAAAAAAATTTTAATGCAAAAATTAAAAGTTTTTGTGAATATACAGAAAATCCTGAAACTGAAATTAT CAAAATTCAATCACAAGAACAGCAAGAAATTGTAATTATAATGGAAAAAAGTTTTTATTTTATCCCAAAAAGTGCTGAAA AATCAACTGTTTTTGGCCTAAGTTCACATTTTTCAGTGCTTTGATATATAAAAGTTTTTGACTTTTATCTTAAAAATAAC CAAAATATTCTTGAGATAATCCAAACAATCAAAACCGAGATTAACTATGTCTTCCATCACAAATTTAAGTTAAAAATTGA TCCAGTAAAACTTGATAATATCATAAATCTACTTATTTCCGAAAAAGATGGTGAATTTAAACCTCAAGGCTTTAAAATTA AAAATTTTTCTAATGATAAAAATGTTATAAATCTTAAAGTTAATCTTAAAAAAAAGGATTTTTACACGCTAACTTATTTT AAACCAAAAAAACAACTGACATTATCGACTAATTTTTTAGCAAAAAATCACACCGAAAAACAAGCTGTTTTTCTCGAAAA TTCTCTAATTGATAAAATAAGGCTTGTAAATAAAGATTCAATTTTAACAAAAACAAACCAGAAAAAAAATATAATTAAAT TTTCTTGTTTTATTACAACAATTATTGTAATCTTAATAATTTTGTTTTATAATTTTTATAATTCTAGTTTTTCTGATGGC TCGACAACAAGAATTTTTGAAAAATTCTACGAATTTTTCTTTAAACCTAGGAAAAATCGACTAGTTTTCTTAGGAGTTTT TGGCCATTTTCTTTTATGAAATATTAGTACAACCTTTCAATTACGGCAAATTTTTAAGAATCAAGGGATTAAAACAAAAT TTAGGCACCTGTTTATTGGTACTTTTATTGCCCTTTTTATGCAGTTTTCCACACCATTTTCATTTGGGGGAGAAATAAGT TATTACTGGTATTTGCAACGAAAACAATACCCATTAAAAAATATTAGCGCGACTTTAACTTACAACGCTTTACTTCATCA AGTTTTTAATTTGTTAATTGCTATTATTTTTTTACCAGTTGGTTTTGTTTTTTATCCTGAGCTTTTTGTTTTTGATTCCT GGGAAAAAATTGCCTTTTTTACTTGATTAATTACAAATATTATTCTAAATGTGTTTGTTTTGTTGATAATTATAATAATT TCACTTTGAAAAAAATTACAATATTCCTTAATTAAGATGCTTGTCTGGCTTTTAAACCTCAATTTTTTTAAAAAAATCGA GGACAAAAAAAGAGTTGAATACCGTTTCCAATTTTTAATTGACAATTTTAAAAATCATTTTATTAAAATACTTTCCAATA AGGCTTTATTAACAAAAATTCTTTTAATTTATAAATTGCCACTGTTTTTTCTTAATTTTTCTTTTGTTATTTTAATAACA GCGATGGAAAAAGGAGGATTTAATCTAAAAAACCTTAGTTTTATACATTATTTGAAATTTATTTCAGGATTTACAATCCT GCAAATTTCAAATAATTTATCGCCCTCACCAGGAGGAGTTGGTTCGGTTGATGTTATTACAAAATTAATTTTTCAAAGTT TTTTTAATGAAAAAACAACTATAACATTGGATATTTTTAACTTTGCAAACAGAATTTATACCTGATTTTTGCCTTATTTT ATCTCAGCACTCGGAATTCTCACTGTCTGAATTGGAGAAAAAAGAATTGACTATTACCAGCAAATTCGCCAAACTATGAA AAATAATTCAATTCTAAATCTTGAACTTAAAAAACAGAATACTAATTTTTTCAAGTATGCTTTATTTTTTTGGACTTTAG TTATATTTTCTTTAATTTTATTTATTTTTCTTCATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTCAAGAATTTGATCTTTTTAGTCATGAAGACCAAAATTCACAGGTAGATAATTTTGATCTTTTTTCATCCCAACGCG AAAACCAAAAATAGTTCAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTAAGAAAAATTTGAGCTGCTTTTGCTATCATTGCCCCATTATCAGTACAGAATTCTTTTTTTGGAATAACCACTTTA TATTTATTTTCATATGTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Phosphoglucomutase/Phosphomannomutase Domain Protein
Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 945
Protein sequence:
>945_residues MKLGQISAKTTFEEQKFIFFNQDFPLEITNSKIIGFISNQSNSINESYISSIGLVIAEFLKQNNLKKILINNSDNNFGIA FGLIFYNILAHNSEIKVEIFDESWGYSQKLAHHYFINNDFDFFINIEVNLTDKNSSLAILSFFKKNLTFLSADDEKLINK AEKCPFLSQNSQIKKPKKFRINWNDIIEFQKSINLDLQKLEKFYQFYEPESTFLTNFLKQNFDLKTAKFLPIRKNAPIEN IMKKISDNSIIWKKITTSAKFKTNVVFWLKQNKILAGFRKNFNFNIIKEKDLQLLFLDYLRKNWQNGRHFLISKQSDSYI FEFVQKNFNAKIKSFCEYTENPETEIIKIQSQEQQEIVIIMEKSFYFIPKSAEKSTVFGLSSHFSVLWYIKVFDFYLKNN QNILEIIQTIKTEINYVFHHKFKLKIDPVKLDNIINLLISEKDGEFKPQGFKIKNFSNDKNVINLKVNLKKKDFYTLTYF KPKKQLTLSTNFLAKNHTEKQAVFLENSLIDKIRLVNKDSILTKTNQKKNIIKFSCFITTIIVILIILFYNFYNSSFSDG STTRIFEKFYEFFFKPRKNRLVFLGVFGHFLLWNISTTFQLRQIFKNQGIKTKFRHLFIGTFIALFMQFSTPFSFGGEIS YYWYLQRKQYPLKNISATLTYNALLHQVFNLLIAIIFLPVGFVFYPELFVFDSWEKIAFFTWLITNIILNVFVLLIIIII SLWKKLQYSLIKMLVWLLNLNFFKKIEDKKRVEYRFQFLIDNFKNHFIKILSNKALLTKILLIYKLPLFFLNFSFVILIT AMEKGGFNLKNLSFIHYLKFISGFTILQISNNLSPSPGGVGSVDVITKLIFQSFFNEKTTITLDIFNFANRIYTWFLPYF ISALGILTVWIGEKRIDYYQQIRQTMKNNSILNLELKKQNTNFFKYALFFWTLVIFSLILFIFLH
Sequences:
>Translated_945_residues MKLGQISAKTTFEEQKFIFFNQDFPLEITNSKIIGFISNQSNSINESYISSIGLVIAEFLKQNNLKKILINNSDNNFGIA FGLIFYNILAHNSEIKVEIFDES*GYSQKLAHHYFINNDFDFFINIEVNLTDKNSSLAILSFFKKNLTFLSADDEKLINK AEKCPFLSQNSQIKKPKKFRIN*NDIIEFQKSINLDLQKLEKFYQFYEPESTFLTNFLKQNFDLKTAKFLPIRKNAPIEN IMKKISDNSIIWKKITTSAKFKTNVVF*LKQNKILAGFRKNFNFNIIKEKDLQLLFLDYLRKN*QNGRHFLISKQSDSYI FEFVQKNFNAKIKSFCEYTENPETEIIKIQSQEQQEIVIIMEKSFYFIPKSAEKSTVFGLSSHFSVL*YIKVFDFYLKNN QNILEIIQTIKTEINYVFHHKFKLKIDPVKLDNIINLLISEKDGEFKPQGFKIKNFSNDKNVINLKVNLKKKDFYTLTYF KPKKQLTLSTNFLAKNHTEKQAVFLENSLIDKIRLVNKDSILTKTNQKKNIIKFSCFITTIIVILIILFYNFYNSSFSDG STTRIFEKFYEFFFKPRKNRLVFLGVFGHFLL*NISTTFQLRQIFKNQGIKTKFRHLFIGTFIALFMQFSTPFSFGGEIS YYWYLQRKQYPLKNISATLTYNALLHQVFNLLIAIIFLPVGFVFYPELFVFDSWEKIAFFT*LITNIILNVFVLLIIIII SL*KKLQYSLIKMLVWLLNLNFFKKIEDKKRVEYRFQFLIDNFKNHFIKILSNKALLTKILLIYKLPLFFLNFSFVILIT AMEKGGFNLKNLSFIHYLKFISGFTILQISNNLSPSPGGVGSVDVITKLIFQSFFNEKTTITLDIFNFANRIYT*FLPYF ISALGILTV*IGEKRIDYYQQIRQTMKNNSILNLELKKQNTNFFKYALFFWTLVIFSLILFIFLH >Mature_945_residues MKLGQISAKTTFEEQKFIFFNQDFPLEITNSKIIGFISNQSNSINESYISSIGLVIAEFLKQNNLKKILINNSDNNFGIA FGLIFYNILAHNSEIKVEIFDES*GYSQKLAHHYFINNDFDFFINIEVNLTDKNSSLAILSFFKKNLTFLSADDEKLINK AEKCPFLSQNSQIKKPKKFRIN*NDIIEFQKSINLDLQKLEKFYQFYEPESTFLTNFLKQNFDLKTAKFLPIRKNAPIEN IMKKISDNSIIWKKITTSAKFKTNVVF*LKQNKILAGFRKNFNFNIIKEKDLQLLFLDYLRKN*QNGRHFLISKQSDSYI FEFVQKNFNAKIKSFCEYTENPETEIIKIQSQEQQEIVIIMEKSFYFIPKSAEKSTVFGLSSHFSVL*YIKVFDFYLKNN QNILEIIQTIKTEINYVFHHKFKLKIDPVKLDNIINLLISEKDGEFKPQGFKIKNFSNDKNVINLKVNLKKKDFYTLTYF KPKKQLTLSTNFLAKNHTEKQAVFLENSLIDKIRLVNKDSILTKTNQKKNIIKFSCFITTIIVILIILFYNFYNSSFSDG STTRIFEKFYEFFFKPRKNRLVFLGVFGHFLL*NISTTFQLRQIFKNQGIKTKFRHLFIGTFIALFMQFSTPFSFGGEIS YYWYLQRKQYPLKNISATLTYNALLHQVFNLLIAIIFLPVGFVFYPELFVFDSWEKIAFFT*LITNIILNVFVLLIIIII SL*KKLQYSLIKMLVWLLNLNFFKKIEDKKRVEYRFQFLIDNFKNHFIKILSNKALLTKILLIYKLPLFFLNFSFVILIT AMEKGGFNLKNLSFIHYLKFISGFTILQISNNLSPSPGGVGSVDVITKLIFQSFFNEKTTITLDIFNFANRIYT*FLPYF ISALGILTV*IGEKRIDYYQQIRQTMKNNSILNLELKKQNTNFFKYALFFWTLVIFSLILFIFLH
Specific function: Unknown
COG id: COG0392
COG function: function code S; Predicted integral membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 110005; Mature: 110005
Theoretical pI: Translated: 10.28; Mature: 10.28
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 1.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 1.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKLGQISAKTTFEEQKFIFFNQDFPLEITNSKIIGFISNQSNSINESYISSIGLVIAEFL CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KQNNLKKILINNSDNNFGIAFGLIFYNILAHNSEIKVEIFDESGYSQKLAHHYFINNDFD HCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHEEECCCCE FFINIEVNLTDKNSSLAILSFFKKNLTFLSADDEKLINKAEKCPFLSQNSQIKKPKKFRI EEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEC NNDIIEFQKSINLDLQKLEKFYQFYEPESTFLTNFLKQNFDLKTAKFLPIRKNAPIENIM CCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHH KKISDNSIIWKKITTSAKFKTNVVFLKQNKILAGFRKNFNFNIIKEKDLQLLFLDYLRKN HHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCEEEHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCC QNGRHFLISKQSDSYIFEFVQKNFNAKIKSFCEYTENPETEIIKIQSQEQQEIVIIMEKS CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECC FYFIPKSAEKSTVFGLSSHFSVLYIKVFDFYLKNNQNILEIIQTIKTEINYVFHHKFKLK EEEEECCCCCCEEEEECCCHHEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEE IDPVKLDNIINLLISEKDGEFKPQGFKIKNFSNDKNVINLKVNLKKKDFYTLTYFKPKKQ ECCEEHHHHHHHHEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCEEEEEEECCCCC LTLSTNFLAKNHTEKQAVFLENSLIDKIRLVNKDSILTKTNQKKNIIKFSCFITTIIVIL EEEEECHHCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHH IILFYNFYNSSFSDGSTTRIFEKFYEFFFKPRKNRLVFLGVFGHFLLNISTTFQLRQIFK HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQGIKTKFRHLFIGTFIALFMQFSTPFSFGGEISYYWYLQRKQYPLKNISATLTYNALLH CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHH QVFNLLIAIIFLPVGFVFYPELFVFDSWEKIAFFTLITNIILNVFVLLIIIIISLKKLQY HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLIKMLVWLLNLNFFKKIEDKKRVEYRFQFLIDNFKNHFIKILSNKALLTKILLIYKLPL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH FFLNFSFVILITAMEKGGFNLKNLSFIHYLKFISGFTILQISNNLSPSPGGVGSVDVITK HHHHHHHHEEEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHH LIFQSFFNEKTTITLDIFNFANRIYTFLPYFISALGILTVIGEKRIDYYQQIRQTMKNNS HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ILNLELKKQNTNFFKYALFFWTLVIFSLILFIFLH EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKLGQISAKTTFEEQKFIFFNQDFPLEITNSKIIGFISNQSNSINESYISSIGLVIAEFL CCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH KQNNLKKILINNSDNNFGIAFGLIFYNILAHNSEIKVEIFDESGYSQKLAHHYFINNDFD HCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHEEECCCCE FFINIEVNLTDKNSSLAILSFFKKNLTFLSADDEKLINKAEKCPFLSQNSQIKKPKKFRI EEEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEC NNDIIEFQKSINLDLQKLEKFYQFYEPESTFLTNFLKQNFDLKTAKFLPIRKNAPIENIM CCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHH KKISDNSIIWKKITTSAKFKTNVVFLKQNKILAGFRKNFNFNIIKEKDLQLLFLDYLRKN HHHCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCEEEHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCC QNGRHFLISKQSDSYIFEFVQKNFNAKIKSFCEYTENPETEIIKIQSQEQQEIVIIMEKS CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECC FYFIPKSAEKSTVFGLSSHFSVLYIKVFDFYLKNNQNILEIIQTIKTEINYVFHHKFKLK EEEEECCCCCCEEEEECCCHHEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEE IDPVKLDNIINLLISEKDGEFKPQGFKIKNFSNDKNVINLKVNLKKKDFYTLTYFKPKKQ ECCEEHHHHHHHHEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCEEEEEEECCCCC LTLSTNFLAKNHTEKQAVFLENSLIDKIRLVNKDSILTKTNQKKNIIKFSCFITTIIVIL EEEEECHHCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHH IILFYNFYNSSFSDGSTTRIFEKFYEFFFKPRKNRLVFLGVFGHFLLNISTTFQLRQIFK HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NQGIKTKFRHLFIGTFIALFMQFSTPFSFGGEISYYWYLQRKQYPLKNISATLTYNALLH CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHH QVFNLLIAIIFLPVGFVFYPELFVFDSWEKIAFFTLITNIILNVFVLLIIIIISLKKLQY HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLIKMLVWLLNLNFFKKIEDKKRVEYRFQFLIDNFKNHFIKILSNKALLTKILLIYKLPL HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH FFLNFSFVILITAMEKGGFNLKNLSFIHYLKFISGFTILQISNNLSPSPGGVGSVDVITK HHHHHHHHEEEEEHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHH LIFQSFFNEKTTITLDIFNFANRIYTFLPYFISALGILTVIGEKRIDYYQQIRQTMKNNS HHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC ILNLELKKQNTNFFKYALFFWTLVIFSLILFIFLH EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA