Definition | Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence. |
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Accession | NC_006156 |
Length | 904,246 |
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The map label for this gene is mviN [H]
Identifier: 51599062
GI number: 51599062
Start: 857879
End: 859399
Strand: Direct
Name: mviN [H]
Synonym: BG0836
Alternate gene names: 51599062
Gene position: 857879-859399 (Clockwise)
Preceding gene: 51599061
Following gene: 51599063
Centisome position: 94.87
GC content: 25.18
Gene sequence:
>1521_bases ATGAATAAATATGTTATTTCTACAGTTTTGGTCATGATTTCTACCTTTTTTTCAAGAATAATGGGGTTTATAAAGGTAAA GATTTTCTCTTATTATTTTGGAGCAAATCTTGATGCTGATATTTTTAACTATGTTTTCAATATTCCTAACAATTTGCGCA AAATTCTTTCAGAGGGCGCAATGACTTCAGCTTTTTTGCCTGAATTTACATGTGAAAAAAATAAATCGCACGAAAAAGCT GTTTCTTTTTTTAGAACCGTTATAACTTTTAATGTTATTGCTATTGGTTTAATTGTATTAGTCATGATTATTTTTGCAAA GCCTATTATGTATTTTCTGTCTTATTATAGGGGAGAAAACTTAATTTTTGCAAGTTCTGTATTTAGTTATTTGGTATTAT ATATTTTACTAATAAGTTTATCATCAATCTTCATATCTGTTCTAAATTCATATAAAATTTTTTTTATTCCTTCATTTTCA CCTATTATGTTTTCTTTTGGAATAATATTGAGCATATTTTTATTTTATGGCCGTTTTGGAATATATAGTGCTGTTATTGG CGTAATTTTTGGGGGGTTTTTACAATTTCTAATTCCGTTTGTAAATTGTCTTATGATTGGTTTTGTCTTTAAGCCAACAT TTTATTTTAGAGAAAAGGTATTTTTAAATTTTTTAAGTAGATGGGTTCGTATGATTTTTGGATTTTCTATTTCAATTATT ACTCAGCAGATTTCATTTGCATTAGCATCTACCCTTGACATAGGAAGTGTTTCTATTCTTAGTAATGCTATAGTTTATTA TCAGCTTCCTATAGGAATTTTTTATATTTCTATTGCAACGGTAATTTTTCCTAAAATGGCAGAGTATGCTGTTTTGGGAA ATAATATAAAATTAAATACCCTTTTAGTGGATGGAATTAAAATTTTATTGTTAATTTTTATTCCGGTGTCTTTTTTGATG TTTATTTGGTCTGATTATATTTTAAATTTACTTCTTATGGGAGGTAAGTTTTCTATTTATGATACTCAAAAAACAGCGGG TGTTTTGAAATGTTTTCTTTTAGGTTTACTTTTTTATTCTATGTTTAGTTTTTTTCAAAAATATTATTTTTCTATTCGTG ATGCAAAAACACCATTTTATTTGAGTGTTTTATTTTCTATTCTTGATATTTTACTTTCTGTTTTTGGTATTAAGCATTAT GGTTTGAATGCTTTGGCATTGGCTCAATCTATTTCTTTTATGATTTGTGTAATTGTTTTTTATTTTATAATATTGAAAAG TGGAGTTAAAATTGATTTAATTGAAATTTTATTTGTTCTTCTAAAGTCAATTATTACACTTTTCCCTTTGTATTTAATTT ATTTCTTTTTTGAAAAGTTTCAGTGGAATGTGGGTTTTAGTTTTAAAAATCTTTATTTTTTAATTACGGCAGGAATTGTT AGTATTTTAACTTTATTTATTTGTTATTCTGTTTTAGGAATAAATAAACTTTTTAGGTTTATTAGGAGGGATGTTTTATG A
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTTCCGATTGATTTCAAAGATCAGAACCGCAATTCTAAATGATAATTTTTTAAACTTTAGAACTTCATATTTAAAAAA GTATGAAGAGGAAAATTTCG
Downstream 100 bases:
>100_bases AATACTTAAATTTTTTATTTTTTTTTCTTATTTTAAATGTGTATGCTCAAAATGTCAACTCTCTAACTCCCCCCAATCCC CCTTTGTTGCCCGAAATTAC
Product: virulence factor mviN protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 506; Mature: 506
Protein sequence:
>506_residues MNKYVISTVLVMISTFFSRIMGFIKVKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGAMTSAFLPEFTCEKNKSHEKA VSFFRTVITFNVIAIGLIVLVMIIFAKPIMYFLSYYRGENLIFASSVFSYLVLYILLISLSSIFISVLNSYKIFFIPSFS PIMFSFGIILSIFLFYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFVNCLMIGFVFKPTFYFREKVFLNFLSRWVRMIFGFSISII TQQISFALASTLDIGSVSILSNAIVYYQLPIGIFYISIATVIFPKMAEYAVLGNNIKLNTLLVDGIKILLLIFIPVSFLM FIWSDYILNLLLMGGKFSIYDTQKTAGVLKCFLLGLLFYSMFSFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDILLSVFGIKHY GLNALALAQSISFMICVIVFYFIILKSGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYLIYFFFEKFQWNVGFSFKNLYFLITAGIV SILTLFICYSVLGINKLFRFIRRDVL
Sequences:
>Translated_506_residues MNKYVISTVLVMISTFFSRIMGFIKVKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGAMTSAFLPEFTCEKNKSHEKA VSFFRTVITFNVIAIGLIVLVMIIFAKPIMYFLSYYRGENLIFASSVFSYLVLYILLISLSSIFISVLNSYKIFFIPSFS PIMFSFGIILSIFLFYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFVNCLMIGFVFKPTFYFREKVFLNFLSRWVRMIFGFSISII TQQISFALASTLDIGSVSILSNAIVYYQLPIGIFYISIATVIFPKMAEYAVLGNNIKLNTLLVDGIKILLLIFIPVSFLM FIWSDYILNLLLMGGKFSIYDTQKTAGVLKCFLLGLLFYSMFSFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDILLSVFGIKHY GLNALALAQSISFMICVIVFYFIILKSGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYLIYFFFEKFQWNVGFSFKNLYFLITAGIV SILTLFICYSVLGINKLFRFIRRDVL >Mature_506_residues MNKYVISTVLVMISTFFSRIMGFIKVKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGAMTSAFLPEFTCEKNKSHEKA VSFFRTVITFNVIAIGLIVLVMIIFAKPIMYFLSYYRGENLIFASSVFSYLVLYILLISLSSIFISVLNSYKIFFIPSFS PIMFSFGIILSIFLFYGRFGIYSAVIGVIFGGFLQFLIPFVNCLMIGFVFKPTFYFREKVFLNFLSRWVRMIFGFSISII TQQISFALASTLDIGSVSILSNAIVYYQLPIGIFYISIATVIFPKMAEYAVLGNNIKLNTLLVDGIKILLLIFIPVSFLM FIWSDYILNLLLMGGKFSIYDTQKTAGVLKCFLLGLLFYSMFSFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDILLSVFGIKHY GLNALALAQSISFMICVIVFYFIILKSGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYLIYFFFEKFQWNVGFSFKNLYFLITAGIV SILTLFICYSVLGINKLFRFIRRDVL
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=400, Percent_Identity=27.5, Blast_Score=140, Evalue=2e-34,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004268 [H]
Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58193; Mature: 58193
Theoretical pI: Translated: 9.86; Mature: 9.86
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKYVISTVLVMISTFFSRIMGFIKVKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCC MTSAFLPEFTCEKNKSHEKAVSFFRTVITFNVIAIGLIVLVMIIFAKPIMYFLSYYRGEN HHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LIFASSVFSYLVLYILLISLSSIFISVLNSYKIFFIPSFSPIMFSFGIILSIFLFYGRFG EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYSAVIGVIFGGFLQFLIPFVNCLMIGFVFKPTFYFREKVFLNFLSRWVRMIFGFSISII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQQISFALASTLDIGSVSILSNAIVYYQLPIGIFYISIATVIFPKMAEYAVLGNNIKLNT HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHH LLVDGIKILLLIFIPVSFLMFIWSDYILNLLLMGGKFSIYDTQKTAGVLKCFLLGLLFYS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH MFSFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDILLSVFGIKHYGLNALALAQSISFMICVIVF HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFIILKSGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYLIYFFFEKFQWNVGFSFKNLYFLITAGIV HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH SILTLFICYSVLGINKLFRFIRRDVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNKYVISTVLVMISTFFSRIMGFIKVKIFSYYFGANLDADIFNYVFNIPNNLRKILSEGA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCC MTSAFLPEFTCEKNKSHEKAVSFFRTVITFNVIAIGLIVLVMIIFAKPIMYFLSYYRGEN HHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC LIFASSVFSYLVLYILLISLSSIFISVLNSYKIFFIPSFSPIMFSFGIILSIFLFYGRFG EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYSAVIGVIFGGFLQFLIPFVNCLMIGFVFKPTFYFREKVFLNFLSRWVRMIFGFSISII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TQQISFALASTLDIGSVSILSNAIVYYQLPIGIFYISIATVIFPKMAEYAVLGNNIKLNT HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHH LLVDGIKILLLIFIPVSFLMFIWSDYILNLLLMGGKFSIYDTQKTAGVLKCFLLGLLFYS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH MFSFFQKYYFSIRDAKTPFYLSVLFSILDILLSVFGIKHYGLNALALAQSISFMICVIVF HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFIILKSGVKIDLIEILFVLLKSIITLFPLYLIYFFFEKFQWNVGFSFKNLYFLITAGIV HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH SILTLFICYSVLGINKLFRFIRRDVL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9403685 [H]