Definition | Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence. |
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Accession | NC_006156 |
Length | 904,246 |
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The map label for this gene is 51598766
Identifier: 51598766
GI number: 51598766
Start: 518806
End: 525294
Strand: Direct
Name: 51598766
Synonym: BG0523
Alternate gene names: NA
Gene position: 518806-525294 (Clockwise)
Preceding gene: 51598765
Following gene: 51598767
Centisome position: 57.37
GC content: 25.71
Gene sequence:
>6489_bases ATGATAGATTTTGCTACTATTTTAGTTAACCTTTTTTTGGTTTCAATAGTTTTGTTTATTTATAGGCAATATGACAAGCG TTCTAGGGCGTTAGATAAAATTAAAAAGTTCATCGATCTTGTGAAGGTTAATCTTGAAGATTTTATTGAAGATAAGACAA AAGAGATTAATGATCTTGCTGTTGATATGGAAGCTTATCAAAGATCTAGTATAGAAATAATAAAAAAGATTGATGAAGTT CAGCCAAAGATTAAAAACAAAAGCAATGATTTTGCAGAGGTTGAAAAAAAGATAGCTTATCATGATTCTATGCTCAAGGA TCTTGATGAAATGACCTTGAAAGTTCAAGAGAATATTCAAAGGTTGCAAGTTGATGGGAAAATAGTAGATAAACTTTCAA AAACTTTAAAAGGATTTAATACTCAGATTGATTCTGTTGAATCAAATTTGAATTCAGTGTTAGAAAAATTTGAAAAGTCC AATAAAGAAAATCTCGAGTCTATTAAAATTGCTAGTTGGGAAAAGTTTGATATTAATATTAAGGACCTTGTTTTTAAAAT GGATAATTTAAACAGAGAGATTGATCTTTATGAAAAAGATTTAGCAAATATTGAAGAGAGAAAAAAGGATATTTTAGATA AGGGTAATGAGAAATTAGATTTAGAATTTAATGATTTTCTTGAAAAGGTTGAATTTAATATTGGTAAATATAATAAAGAG ATAGAAAGTTCTTTTATTTTTTATGAAAACAAATATAAGTTAATAGAAGATTCTATAGAGCTTATTATGGAGAGCGTAAA GAATAAAATTAATGAGAAAGAAGATTTTATTTTAAATAGACTGAATGAGGAATTAGAAAATAAATTTAAAGATATCTTCA CATACGTTGATGATCGTTCTAGGGAAATTCAAGATAAACTTGAGGATAAATTGATTTTAGTGGACAATGAAATTTCTTCT 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Upstream 100 bases:
>100_bases AATATAAATTGGAAAGTAATGATTGATTTTATTTTTCATGATTATAAAGACTTAAGAGAATATATACGTTTAAATATATA GAATATGGGTAAAATATTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases GGGTTATATTTATGAAGGCAGATTTAAATTTAATAAAAACATTACATCCTCTTGAGATGAAAGTAATTTTAAACAATGGA GAAGAGGATGATATTTCTGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 2162; Mature: 2162
Protein sequence:
>2162_residues MIDFATILVNLFLVSIVLFIYRQYDKRSRALDKIKKFIDLVKVNLEDFIEDKTKEINDLAVDMEAYQRSSIEIIKKIDEV QPKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDEMTLKVQENIQRLQVDGKIVDKLSKTLKGFNTQIDSVESNLNSVLEKFEKS NKENLESIKIASWEKFDINIKDLVFKMDNLNREIDLYEKDLANIEERKKDILDKGNEKLDLEFNDFLEKVEFNIGKYNKE IESSFIFYENKYKLIEDSIELIMESVKNKINEKEDFILNRLNEELENKFKDIFTYVDDRSREIQDKLEDKLILVDNEISS MSSSFKDNVYSRINSLEESIRIEMGKYEEQVDDVFDKFRSQVELNLKNIYEDYEDKISQVDKNIRERVELSLLDLNSKME SVQTGAISLIKRLEDDSNRIYLEFKNKFESDIEIFSESFKDDINQLKRQLESQLLDVDSNMQEKLIKLNDNLISNFQEID GRFNNNYSNLTDNINSKYITLFESLDSSSSKFEDQMESKYKGFKDKLTAEMDEFSLVYSEKFDTLSQEAINNYQEFQDLN KKLENEIESLCNMFEENQEILKRDFNTNLINIKDEIDKNIVEFKDRYSDEVNNFVSKLEESKLQYSKWQGDMDSNLKNIE SQINKTNEEFLSLIQIQKDKGIELSENVFNDLSDHIQKKAIDIHGSWKDELIALNKSLLDIKISSEELLSSATLKIENLE RDVNDRIEYVLLKTGDIESLVIEKYKELKDMSYSQSDEAILGIKEFINRQTEIIKDKSVFMLEDLNKKFDDKNNFVISKI EECDYKLKDFKSESEDILNNFKSDLNEFIESKLQIVSNIKSDNQKQIDDFLDRISKDILNRKDSINNEVDSKLNDWQSKL NEITVKIENLLSSGKVDLDLIDSEVTTKIKELKFSIESLESYYLEKIDEFRNQGAIYSDELLQDIMNHFNKETRELEENL SKKFAVVLNNSEEFVKEVDSLLQDKRTDIASFQANIDITLDSLSVKFNDINKEINGKYNEVISNYRGYSENISSKLENEI MHEIENINRRLTDRIDNLSKGMDENLQKLKESFDVSKYQVEKFELKVKDLTDSGEAKISEFIKEIEQYYKSRLEEAIDYR RTIDSDIMQAKERFGEITNDLKNNIESKSEFLNDLYKERFKLIESNFEERYSTFLIESEGAISKIRDEIYKTLTINDENL QIKISEMDHNFEIIEQRSKDILEFEKELRDKIQDCYGIINSQFGEIKGSVEENIKNHFEVCIKKVNTLIDDDIVKYENEI HKRIDSLKSIENTFDSIEKNLNDKVNGCIDKISNDFNLKYIELEERCNEGQLNLESKIDNKIKAIDNLALSQYDGLEKKY ADMYDEFLERLNSHIATLSEEFKHSNKEMIFELESQLKNLKNLESDLNNVEKDVIRLKEESYHNVSSHLKLLEEDFFKDL KIRGEELKYSLENFIASHNDKIQNLEYDLSKNLENKTELIQSFRLDIEQKMKNDKETFYLDFTKEFSSKKKDMESEIALM ETNITERIDEFIDFVNNRQNIIDSWFLNIKDDVKNWQEKSYSAIEKKISLAELEIKSFENDILNVKIGLESFKDSFEIKA EEIFGNLQSEAKKFEQSVNLDFKNIGESLNLKVLDLEKFVDFKVEKIDERVNKKTEDILIQAEVKFLTQQKSLEDRIFEL NQKLENEFTTLSSNLDKVRREMIDVISSDKKSFEGQIELMHKNISEFSEKIGLYRNNIETSIENEYNAFSKSIKSEFGLL EDELKKNLKHSTLEIETVKNDLQEQIDKFEVEFKKNHKKLLKEVDTNILELESKILNCDTEFNKFISESKDNLVEYKSDL RKEFEDSYDKINFQIENFKKLDAELEKNNSIFLEAYSLKEKLEKLWETLKNEINLAQEYKNNFENVNKEFYNIQKETLGI IETFNELKLEQESIKAIKNDFNRFFEFYSSFDSRYKSLIESYDEMQIYKAKIKEIADEQRNILDNYERISNKEGILKSTI ESVDKNFDLINEMEKRFNNLSKESANFQNNLKDMENVVSNLLLNKGLSEEVLINAQNLKEMLLDIENRLKNTLTMREKVV KSETRLENLNIAAEERIKTLGILVKTDSKYQDNVGLNNETVRNSVIKLMRQGWSAEEISRATKLSIGEVELILELGISNK GD
Sequences:
>Translated_2162_residues MIDFATILVNLFLVSIVLFIYRQYDKRSRALDKIKKFIDLVKVNLEDFIEDKTKEINDLAVDMEAYQRSSIEIIKKIDEV QPKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDEMTLKVQENIQRLQVDGKIVDKLSKTLKGFNTQIDSVESNLNSVLEKFEKS NKENLESIKIASWEKFDINIKDLVFKMDNLNREIDLYEKDLANIEERKKDILDKGNEKLDLEFNDFLEKVEFNIGKYNKE IESSFIFYENKYKLIEDSIELIMESVKNKINEKEDFILNRLNEELENKFKDIFTYVDDRSREIQDKLEDKLILVDNEISS MSSSFKDNVYSRINSLEESIRIEMGKYEEQVDDVFDKFRSQVELNLKNIYEDYEDKISQVDKNIRERVELSLLDLNSKME SVQTGAISLIKRLEDDSNRIYLEFKNKFESDIEIFSESFKDDINQLKRQLESQLLDVDSNMQEKLIKLNDNLISNFQEID GRFNNNYSNLTDNINSKYITLFESLDSSSSKFEDQMESKYKGFKDKLTAEMDEFSLVYSEKFDTLSQEAINNYQEFQDLN KKLENEIESLCNMFEENQEILKRDFNTNLINIKDEIDKNIVEFKDRYSDEVNNFVSKLEESKLQYSKWQGDMDSNLKNIE SQINKTNEEFLSLIQIQKDKGIELSENVFNDLSDHIQKKAIDIHGSWKDELIALNKSLLDIKISSEELLSSATLKIENLE RDVNDRIEYVLLKTGDIESLVIEKYKELKDMSYSQSDEAILGIKEFINRQTEIIKDKSVFMLEDLNKKFDDKNNFVISKI EECDYKLKDFKSESEDILNNFKSDLNEFIESKLQIVSNIKSDNQKQIDDFLDRISKDILNRKDSINNEVDSKLNDWQSKL NEITVKIENLLSSGKVDLDLIDSEVTTKIKELKFSIESLESYYLEKIDEFRNQGAIYSDELLQDIMNHFNKETRELEENL SKKFAVVLNNSEEFVKEVDSLLQDKRTDIASFQANIDITLDSLSVKFNDINKEINGKYNEVISNYRGYSENISSKLENEI MHEIENINRRLTDRIDNLSKGMDENLQKLKESFDVSKYQVEKFELKVKDLTDSGEAKISEFIKEIEQYYKSRLEEAIDYR RTIDSDIMQAKERFGEITNDLKNNIESKSEFLNDLYKERFKLIESNFEERYSTFLIESEGAISKIRDEIYKTLTINDENL QIKISEMDHNFEIIEQRSKDILEFEKELRDKIQDCYGIINSQFGEIKGSVEENIKNHFEVCIKKVNTLIDDDIVKYENEI HKRIDSLKSIENTFDSIEKNLNDKVNGCIDKISNDFNLKYIELEERCNEGQLNLESKIDNKIKAIDNLALSQYDGLEKKY ADMYDEFLERLNSHIATLSEEFKHSNKEMIFELESQLKNLKNLESDLNNVEKDVIRLKEESYHNVSSHLKLLEEDFFKDL KIRGEELKYSLENFIASHNDKIQNLEYDLSKNLENKTELIQSFRLDIEQKMKNDKETFYLDFTKEFSSKKKDMESEIALM ETNITERIDEFIDFVNNRQNIIDSWFLNIKDDVKNWQEKSYSAIEKKISLAELEIKSFENDILNVKIGLESFKDSFEIKA EEIFGNLQSEAKKFEQSVNLDFKNIGESLNLKVLDLEKFVDFKVEKIDERVNKKTEDILIQAEVKFLTQQKSLEDRIFEL NQKLENEFTTLSSNLDKVRREMIDVISSDKKSFEGQIELMHKNISEFSEKIGLYRNNIETSIENEYNAFSKSIKSEFGLL EDELKKNLKHSTLEIETVKNDLQEQIDKFEVEFKKNHKKLLKEVDTNILELESKILNCDTEFNKFISESKDNLVEYKSDL RKEFEDSYDKINFQIENFKKLDAELEKNNSIFLEAYSLKEKLEKLWETLKNEINLAQEYKNNFENVNKEFYNIQKETLGI IETFNELKLEQESIKAIKNDFNRFFEFYSSFDSRYKSLIESYDEMQIYKAKIKEIADEQRNILDNYERISNKEGILKSTI ESVDKNFDLINEMEKRFNNLSKESANFQNNLKDMENVVSNLLLNKGLSEEVLINAQNLKEMLLDIENRLKNTLTMREKVV KSETRLENLNIAAEERIKTLGILVKTDSKYQDNVGLNNETVRNSVIKLMRQGWSAEEISRATKLSIGEVELILELGISNK GD >Mature_2162_residues MIDFATILVNLFLVSIVLFIYRQYDKRSRALDKIKKFIDLVKVNLEDFIEDKTKEINDLAVDMEAYQRSSIEIIKKIDEV QPKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDEMTLKVQENIQRLQVDGKIVDKLSKTLKGFNTQIDSVESNLNSVLEKFEKS NKENLESIKIASWEKFDINIKDLVFKMDNLNREIDLYEKDLANIEERKKDILDKGNEKLDLEFNDFLEKVEFNIGKYNKE IESSFIFYENKYKLIEDSIELIMESVKNKINEKEDFILNRLNEELENKFKDIFTYVDDRSREIQDKLEDKLILVDNEISS MSSSFKDNVYSRINSLEESIRIEMGKYEEQVDDVFDKFRSQVELNLKNIYEDYEDKISQVDKNIRERVELSLLDLNSKME SVQTGAISLIKRLEDDSNRIYLEFKNKFESDIEIFSESFKDDINQLKRQLESQLLDVDSNMQEKLIKLNDNLISNFQEID GRFNNNYSNLTDNINSKYITLFESLDSSSSKFEDQMESKYKGFKDKLTAEMDEFSLVYSEKFDTLSQEAINNYQEFQDLN KKLENEIESLCNMFEENQEILKRDFNTNLINIKDEIDKNIVEFKDRYSDEVNNFVSKLEESKLQYSKWQGDMDSNLKNIE SQINKTNEEFLSLIQIQKDKGIELSENVFNDLSDHIQKKAIDIHGSWKDELIALNKSLLDIKISSEELLSSATLKIENLE RDVNDRIEYVLLKTGDIESLVIEKYKELKDMSYSQSDEAILGIKEFINRQTEIIKDKSVFMLEDLNKKFDDKNNFVISKI EECDYKLKDFKSESEDILNNFKSDLNEFIESKLQIVSNIKSDNQKQIDDFLDRISKDILNRKDSINNEVDSKLNDWQSKL NEITVKIENLLSSGKVDLDLIDSEVTTKIKELKFSIESLESYYLEKIDEFRNQGAIYSDELLQDIMNHFNKETRELEENL SKKFAVVLNNSEEFVKEVDSLLQDKRTDIASFQANIDITLDSLSVKFNDINKEINGKYNEVISNYRGYSENISSKLENEI MHEIENINRRLTDRIDNLSKGMDENLQKLKESFDVSKYQVEKFELKVKDLTDSGEAKISEFIKEIEQYYKSRLEEAIDYR RTIDSDIMQAKERFGEITNDLKNNIESKSEFLNDLYKERFKLIESNFEERYSTFLIESEGAISKIRDEIYKTLTINDENL QIKISEMDHNFEIIEQRSKDILEFEKELRDKIQDCYGIINSQFGEIKGSVEENIKNHFEVCIKKVNTLIDDDIVKYENEI HKRIDSLKSIENTFDSIEKNLNDKVNGCIDKISNDFNLKYIELEERCNEGQLNLESKIDNKIKAIDNLALSQYDGLEKKY ADMYDEFLERLNSHIATLSEEFKHSNKEMIFELESQLKNLKNLESDLNNVEKDVIRLKEESYHNVSSHLKLLEEDFFKDL KIRGEELKYSLENFIASHNDKIQNLEYDLSKNLENKTELIQSFRLDIEQKMKNDKETFYLDFTKEFSSKKKDMESEIALM ETNITERIDEFIDFVNNRQNIIDSWFLNIKDDVKNWQEKSYSAIEKKISLAELEIKSFENDILNVKIGLESFKDSFEIKA EEIFGNLQSEAKKFEQSVNLDFKNIGESLNLKVLDLEKFVDFKVEKIDERVNKKTEDILIQAEVKFLTQQKSLEDRIFEL NQKLENEFTTLSSNLDKVRREMIDVISSDKKSFEGQIELMHKNISEFSEKIGLYRNNIETSIENEYNAFSKSIKSEFGLL EDELKKNLKHSTLEIETVKNDLQEQIDKFEVEFKKNHKKLLKEVDTNILELESKILNCDTEFNKFISESKDNLVEYKSDL RKEFEDSYDKINFQIENFKKLDAELEKNNSIFLEAYSLKEKLEKLWETLKNEINLAQEYKNNFENVNKEFYNIQKETLGI IETFNELKLEQESIKAIKNDFNRFFEFYSSFDSRYKSLIESYDEMQIYKAKIKEIADEQRNILDNYERISNKEGILKSTI ESVDKNFDLINEMEKRFNNLSKESANFQNNLKDMENVVSNLLLNKGLSEEVLINAQNLKEMLLDIENRLKNTLTMREKVV KSETRLENLNIAAEERIKTLGILVKTDSKYQDNVGLNNETVRNSVIKLMRQGWSAEEISRATKLSIGEVELILELGISNK GD
Specific function: Unknown
COG id: NA
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Gene ontology:
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Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
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Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
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Theoretical pI: Translated: 4.47; Mature: 4.47
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>Translated Secondary Structure MIDFATILVNLFLVSIVLFIYRQYDKRSRALDKIKKFIDLVKVNLEDFIEDKTKEINDLA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VDMEAYQRSSIEIIKKIDEVQPKIKNKSNDFAEVEKKIAYHDSMLKDLDEMTLKVQENIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLQVDGKIVDKLSKTLKGFNTQIDSVESNLNSVLEKFEKSNKENLESIKIASWEKFDINI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHEECCCCCCCCCH KDLVFKMDNLNREIDLYEKDLANIEERKKDILDKGNEKLDLEFNDFLEKVEFNIGKYNKE HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCHH IESSFIFYENKYKLIEDSIELIMESVKNKINEKEDFILNRLNEELENKFKDIFTYVDDRS HHHCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH REIQDKLEDKLILVDNEISSMSSSFKDNVYSRINSLEESIRIEMGKYEEQVDDVFDKFRS HHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QVELNLKNIYEDYEDKISQVDKNIRERVELSLLDLNSKMESVQTGAISLIKRLEDDSNRI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE YLEFKNKFESDIEIFSESFKDDINQLKRQLESQLLDVDSNMQEKLIKLNDNLISNFQEID 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